EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015018955 (Gene tree)
Gene ID: 108940393
Gene Symbol: TNPO2
Alias: FLJ12155|IPO3|KPNB2B|TRN2
Full Name: transportin-2
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19520 bases
Position: chrKV410798.1:5337493-5357012
Accession: 108940393
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015029552	IBN_N	PF03810.19	1.7e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015029888	TNPO2-201	6306	XM_018762548	ENSSFOP00015029552	889 (aa)	XP_018618064	A0A1W5AR05

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	95.726	ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.726
ENSSFOG00015018955	TNPO2	99	86.712	ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	86.712

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.813	ENSG00000105576	TNPO2	100	93.588	Homo_sapiens
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.625	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	96.625	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	82	94.621	ENSAPOG00000013185	-	96	94.621	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	91.212	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	90.990	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015018955	TNPO2	87	96.373	ENSACIG00000009586	-	100	96.373	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	87	95.979	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	95.979	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.625	ENSAOCG00000010152	-	100	96.625	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.175	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	96.175	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.175	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	96.175	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.625	ENSAPEG00000013268	-	100	96.625	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.400	ENSATEG00000019171	-	100	96.400	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	95.501	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	95.501	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	94.488	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	94.488	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.701	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	93.476	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	90.439	ENSACLG00000020672	-	100	90.439	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	95.951	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	95.951	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	94.235	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	94.235	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.701	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	93.476	Bos_taurus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	92.770	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	92.547	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.926	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	93.701	Canis_familiaris
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.926	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.701	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	89.099	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	88.988	Capra_hircus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.813	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	93.588	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015018955	TNPO2	93	91.439	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	91.201	Cavia_aperea
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.588	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	93.363	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.813	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	93.588	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	92.770	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	92.547	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.588	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	93.363	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.813	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	93.588	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	94.601	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	94.488	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015018955	TNPO2	96	93.816	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	93.582	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	92.881	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	92.659	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.926	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	93.701	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015018955	TNPO2	87	93.928	ENSCSEG00000011477	-	100	93.928	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	91.564	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	91.564	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.513	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	96.513	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.708	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	93.708	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	91.901	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	91.901	Danio_rerio
ENSSFOG00015018955	TNPO2	88	83.929	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	83.673	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	87.111	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	91.971	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	72.931	FBgn0024921	Tnpo	100	72.707	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015018955	TNPO2	91	85.930	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	85.930	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.813	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	93.588	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.813	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	93.588	Equus_caballus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	95.560	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	95.560	Esox_lucius
ENSSFOG00015018955	TNPO2	80	93.648	ENSELUG00000016542	-	99	85.531	Esox_lucius
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	92.770	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	92.547	Felis_catus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.588	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	93.363	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015018955	TNPO2	97	96.047	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	96.047	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	94.270	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	94.270	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	87.025	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	87.025	Gadus_morhua
ENSSFOG00015018955	TNPO2	80	96.296	ENSGMOG00000014237	-	90	96.296	Gadus_morhua
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.513	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	96.513	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	94.831	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	94.831	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	94.601	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	94.488	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.513	ENSHBUG00000018317	-	100	96.513	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	95.951	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	95.951	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.476	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	93.251	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	91.880	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	91.657	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.063	ENSHCOG00000020440	-	100	96.063	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.926	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	93.926	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	95.838	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	95.838	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	95.501	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	95.501	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.813	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	93.588	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	92.770	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	92.547	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.400	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	96.400	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	91.676	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	91.676	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.625	ENSLBEG00000005301	-	100	96.625	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	95.951	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	95.951	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	90.889	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	90.889	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.738	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.738	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	92.770	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	92.547	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	92.770	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	92.547	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.813	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	93.588	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.813	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	93.588	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015018955	TNPO2	97	91.926	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	92.503	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.625	ENSMAMG00000011862	-	100	96.625	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.785	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	93.785	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.513	ENSMZEG00005007408	-	100	96.513	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	91.685	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.685	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	95.951	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	95.951	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.813	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	93.588	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.926	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	93.701	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015018955	TNPO2	88	95.519	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	95.519	Mola_mola
ENSSFOG00015018955	TNPO2	87	90.827	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	90.827	Mola_mola
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.771	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	93.771	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.625	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	96.625	Monopterus_albus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	94.713	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	94.713	Monopterus_albus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.926	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	93.701	Mus_caroli
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.926	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	93.701	Mus_musculus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.926	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	93.701	Mus_pahari
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.926	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	93.701	Mus_spretus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.926	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	93.701	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015018955	TNPO2	96	93.816	ENSMLUG00000012669	TNPO2	100	93.582	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.926	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	93.701	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.513	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	96.513	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	90.776	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	90.776	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	83.667	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	83.444	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	87.987	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	87.987	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.588	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	93.363	Octodon_degus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	95.546	ENSONIG00000017706	-	100	95.546	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.063	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	96.063	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	93.926	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	93.926	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	91	93.250	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	93.564	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015018955	TNPO2	56	96.400	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	96.400	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	95.838	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	95.838	Oryzias_latipes
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