EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015019025 (Gene tree)
Gene ID: 108934836
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17418 bases
Position: chrKV411083.1:2185307-2202724
Accession: 108934836
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015029675	ResIII	PF04851.15	1.6e-07	1	1
ENSSFOP00015029619	ResIII	PF04851.15	1.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015029956	-	5707	XM_018752984	ENSSFOP00015029619	1388 (aa)	XP_018608500	A0A1W5A696
ENSSFOT00015030011	-	5596	XM_018752985	ENSSFOP00015029675	1351 (aa)	XP_018608501	A0A1W5A6Y6

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015019025's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015019025's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015019025	sbno1	71	65.986	ENSSFOG00015005861	si:ch73-63e15.2	80	65.837

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.000	ENSG00000139697	SBNO1	99	79.357	Homo_sapiens
ENSSFOG00015019025	sbno1	85	87.273	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	86.234	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	79.829	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	79.900	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.114	ENSACIG00000008088	sbno1	99	80.753	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.471	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	81.131	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.471	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	81.131	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	82.815	ENSATEG00000006667	sbno1	99	82.107	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015019025	sbno1	98	80.554	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	80.228	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015019025	sbno1	98	80.681	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	80.029	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015019025	sbno1	94	86.364	ENSANAG00000029958	-	99	85.409	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	79.234	ENSACLG00000024913	sbno1	100	79.366	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	84.939	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	85.368	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	80.938	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	80.733	Bos_taurus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.000	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	79.357	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.029	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	87.897	Canis_familiaris
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	84.324	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	84.324	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	86.355	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	86.355	Capra_hircus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	81.043	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	80.543	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015019025	sbno1	97	81.208	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	86.486	Cavia_aperea
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	86.486	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	86.486	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	76.596	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	77.415	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015019025	sbno1	93	86.126	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	86.126	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	86.667	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	86.667	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015019025	sbno1	86	83.793	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	83.448	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015019025	sbno1	96	76.908	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	76.050	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015019025	sbno1	98	81.920	ENSCPBG00000025968	SBNO1	98	81.163	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	75.874	ENSCANG00000042688	-	99	75.303	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	84.740	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	84.740	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	84.740	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	84.740	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	79.831	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	79.901	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.369	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	81.581	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	84.362	ENSDARG00000099080	sbno1	99	84.720	Danio_rerio
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	81.107	ENSDNOG00000017147	SBNO1	95	83.698	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	73.157	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	72.409	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015019025	sbno1	93	76.656	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	76.656	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015019025	sbno1	74	64.729	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	63.854	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015019025	sbno1	51	77.292	ENSEASG00005012595	-	92	81.832	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.286	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	80.044	Equus_caballus
ENSSFOG00015019025	sbno1	83	81.967	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	81.967	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	83.357	ENSELUG00000002886	sbno1	99	83.709	Esox_lucius
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.286	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	80.214	Felis_catus
ENSSFOG00015019025	sbno1	98	80.772	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	80.514	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	78.658	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	82.616	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.670	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	81.883	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015019025	sbno1	97	83.308	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	82.990	Gadus_morhua
ENSSFOG00015019025	sbno1	88	81.164	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	80.710	Gallus_gallus
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	82.943	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	82.968	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015019025	sbno1	97	82.246	ENSGACG00000015633	sbno1	100	82.473	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015019025	sbno1	93	88.068	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	87.523	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	86.306	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	86.306	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	73.642	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	73.843	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015019025	sbno1	94	86.909	ENSHGLG00000014165	-	99	86.511	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015019025	sbno1	92	86.240	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	86.240	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	85.786	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	85.643	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	86.306	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	86.306	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.000	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	81.802	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	82.271	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	82.051	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.633	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	81.070	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	77.312	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	79.742	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	89.120	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	88.833	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	79.414	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	79.071	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.214	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	82.888	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.286	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	82.888	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	86.126	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	86.126	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.709	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	81.780	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015019025	sbno1	98	81.109	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	80.843	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015019025	sbno1	50	77.905	ENSMAUG00000004834	-	99	81.750	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	79.971	ENSMICG00000006573	-	99	82.918	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	85.637	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	85.637	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	79.401	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	79.723	Mola_mola
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	79.757	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	79.128	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	80.563	ENSMALG00000001056	sbno1	100	79.930	Monopterus_albus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	79.771	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	92.544	Mus_caroli
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.129	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	92.544	Mus_musculus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.714	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	92.544	Mus_pahari
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	79.986	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	92.544	Mus_spretus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.286	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	80.214	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	79.714	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	79.357	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015019025	sbno1	92	87.476	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	87.476	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	79.971	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	80.103	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	77.990	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	78.597	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015019025	sbno1	62	75.625	ENSMEUG00000008768	-	93	75.000	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	78.500	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	78.571	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	86.667	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	86.667	Octodon_degus
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	79.873	ENSONIG00000015348	sbno1	100	79.859	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015019025	sbno1	98	79.623	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	78.680	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.777	ENSORLG00000001593	sbno1	99	80.707	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	81.047	ENSORLG00020015216	sbno1	99	80.905	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	81.047	ENSORLG00015002726	sbno1	99	80.905	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	81.104	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	81.246	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015019025	sbno1	50	74.892	ENSOGAG00000010781	-	99	79.398	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	80.271	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	79.630	Ovis_aries
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	86.486	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	86.486	Pan_paniscus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.286	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	80.214	Panthera_pardus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.387	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	80.315	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	86.306	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	86.306	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	86.126	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	86.126	Papio_anubis
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	93.089	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	93.089	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015019025	sbno1	98	82.159	ENSPSIG00000009572	-	99	81.825	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015019025	sbno1	92	76.935	ENSPSIG00000009256	-	99	77.185	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	85.458	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	85.458	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.572	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	80.264	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.722	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	81.889	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.510	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	81.889	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.709	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	81.876	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.215	ENSPREG00000017746	sbno1	100	81.382	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	79.914	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	79.414	Pongo_abelii
ENSSFOG00015019025	sbno1	88	73.741	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	73.793	Procavia_capensis
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	86.314	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	86.314	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015019025	sbno1	87	87.450	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	87.450	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	79.563	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	79.619	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	85.267	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	84.626	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	85.946	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	85.946	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	86.126	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	86.126	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015019025	sbno1	97	77.434	ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	76.314	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.972	ENSSMAG00000013640	sbno1	100	81.901	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	82.511	ENSSDUG00000023480	sbno1	100	81.805	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	82.440	ENSSLDG00000007928	sbno1	100	81.735	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015019025	sbno1	89	83.037	ENSSARG00000002594	SBNO1	89	84.006	Sorex_araneus
ENSSFOG00015019025	sbno1	98	80.674	ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	80.103	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	82.241	ENSSPAG00000016244	sbno1	100	81.325	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.984	ENSSSCG00000009776	SBNO1	99	80.704	Sus_scrofa
ENSSFOG00015019025	sbno1	98	80.699	ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	80.443	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	81.905	ENSTRUG00000018490	sbno1	99	82.066	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015019025	sbno1	56	76.055	ENSTNIG00000013506	sbno1	99	76.808	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.214	ENSUAMG00000019671	SBNO1	99	80.143	Ursus_americanus
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.214	ENSUMAG00000004002	SBNO1	99	80.143	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015019025	sbno1	95	75.116	ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	74.419	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.143	ENSVVUG00000027807	SBNO1	99	80.214	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015019025	sbno1	99	76.743	ENSXETG00000031930	SBNO1	99	76.781	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015019025	sbno1	89	80.239	ENSXCOG00000011607	sbno1	99	78.824	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.685	ENSXMAG00000002140	sbno1	100	81.921	Xiphophorus_maculatus