EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015019353 (Gene tree)
Gene ID: 108929054
Gene Symbol: celf1
Alias: Bruno-like|brul|cb920|cugbp1
Full Name: CUGBP Elav-like family member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26162 bases
Position: chrKV410895.1:785995-812156
Accession: 108929054
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015030159	RRM_1	PF00076.22	3.8e-51	1	3
ENSSFOP00015030159	RRM_1	PF00076.22	3.8e-51	2	3
ENSSFOP00015030159	RRM_1	PF00076.22	3.8e-51	3	3
ENSSFOP00015030193	RRM_1	PF00076.22	4e-51	1	3
ENSSFOP00015030193	RRM_1	PF00076.22	4e-51	2	3
ENSSFOP00015030193	RRM_1	PF00076.22	4e-51	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015030539	-	2306	-	ENSSFOP00015030193	525 (aa)	-	-
ENSSFOT00015030505	-	4795	XM_018743345	ENSSFOP00015030159	518 (aa)	XP_018598861	A0A1W4ZDP9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015019353	celf1	90	44.513	ENSSFOG00015022130	celf3a	83	43.505
ENSSFOG00015019353	celf1	91	46.377	ENSSFOG00015016756	-	60	75.789
ENSSFOG00015019353	celf1	57	34.091	ENSSFOG00015006662	pabpc1a	58	32.323
ENSSFOG00015019353	celf1	93	45.051	ENSSFOG00015002593	-	69	64.444
ENSSFOG00015019353	celf1	61	33.607	ENSSFOG00015015838	elavl4	76	33.607
ENSSFOG00015019353	celf1	55	45.679	ENSSFOG00015017503	-	77	45.122
ENSSFOG00015019353	celf1	93	46.371	ENSSFOG00015004376	celf5a	73	63.910
ENSSFOG00015019353	celf1	52	45.679	ENSSFOG00015021786	ELAVL1	77	45.679
ENSSFOG00015019353	celf1	92	43.064	ENSSFOG00015010315	celf5b	72	60.563
ENSSFOG00015019353	celf1	52	40.741	ENSSFOG00015018252	elavl2	65	40.741
ENSSFOG00015019353	celf1	94	69.014	ENSSFOG00015023817	-	100	69.262
ENSSFOG00015019353	celf1	57	34.884	ENSSFOG00015002752	-	55	32.323
ENSSFOG00015019353	celf1	53	45.070	ENSSFOG00015023630	elavl3	78	45.070
ENSSFOG00015019353	celf1	51	41.026	ENSSFOG00015001257	ELAVL2	67	41.026
ENSSFOG00015019353	celf1	94	72.379	ENSSFOG00015023981	-	99	74.239
ENSSFOG00015019353	celf1	65	30.526	ENSSFOG00015011413	tial1	80	30.328
ENSSFOG00015019353	celf1	93	46.000	ENSSFOG00015010874	celf4	96	44.701

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.855	ENSG00000149187	CELF1	100	89.474	Homo_sapiens
ENSSFOG00015019353	celf1	93	92.843	ENSAPOG00000024000	celf1	100	92.843	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	84.872	ENSAMEG00000007596	CELF1	98	85.462	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015019353	celf1	93	90.417	ENSACIG00000023843	celf1	100	90.417	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015019353	celf1	93	92.434	ENSAOCG00000001252	celf1	100	92.434	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015019353	celf1	95	91.054	ENSAPEG00000002340	celf1	99	91.054	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015019353	celf1	93	88.750	ENSATEG00000010871	celf1	100	88.958	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	86.588	ENSACAG00000002114	CELF1	98	86.759	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.069	ENSANAG00000031770	CELF1	98	85.658	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015019353	celf1	100	87.786	ENSACLG00000010181	-	100	89.792	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015019353	celf1	100	90.637	ENSAMXG00000020576	celf1	100	90.637	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	84.872	ENSBTAG00000002520	CELF1	100	87.705	Bos_taurus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.855	ENSCJAG00000020133	CELF1	98	86.248	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.069	ENSCAFG00000008452	CELF1	98	85.658	Canis_familiaris
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.069	ENSCAFG00020025487	CELF1	100	85.193	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.265	ENSCHIG00000024582	CELF1	98	85.855	Capra_hircus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	83.721	ENSTSYG00000003866	CELF1	100	87.910	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015019353	celf1	92	62.781	ENSCAPG00000006787	CELF1	94	64.523	Cavia_aperea
ENSSFOG00015019353	celf1	93	87.910	ENSCPOG00000036381	CELF1	100	88.320	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.855	ENSCCAG00000033487	CELF1	100	87.910	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015019353	celf1	93	88.115	ENSCATG00000040143	CELF1	100	88.525	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.069	ENSCLAG00000011791	CELF1	100	84.426	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.265	ENSCSAG00000005786	CELF1	98	85.855	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015019353	celf1	57	97.872	ENSCHOG00000004196	-	68	97.872	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015019353	celf1	97	87.574	ENSCPBG00000022914	CELF1	100	89.184	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015019353	celf1	93	89.256	ENSCANG00000032689	CELF1	100	89.256	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	84.676	ENSCGRG00001011274	Celf1	98	85.265	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015019353	celf1	97	84.676	ENSCGRG00000015357	Celf1	98	85.265	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015019353	celf1	93	79.876	ENSCSEG00000008675	celf1	100	78.675	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015019353	celf1	100	90.654	ENSDARG00000005315	celf1	100	96.491	Danio_rerio
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.069	ENSDNOG00000009523	CELF1	100	88.525	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	77.030	ENSDORG00000013721	Celf1	96	79.713	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015019353	celf1	68	93.023	ENSETEG00000004507	CELF1	83	93.023	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015019353	celf1	97	77.713	ENSEASG00005010831	CELF1	98	79.175	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	86.139	ENSECAG00000007741	CELF1	100	88.636	Equus_caballus
ENSSFOG00015019353	celf1	93	71.926	ENSEEUG00000009782	CELF1	100	72.131	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015019353	celf1	100	93.258	ENSELUG00000023173	celf1	100	94.153	Esox_lucius
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.069	ENSFCAG00000002535	CELF1	100	87.910	Felis_catus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	87.771	ENSFALG00000006402	CELF1	98	87.771	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015019353	celf1	93	87.705	ENSFDAG00000008517	CELF1	100	88.115	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015019353	celf1	94	91.278	ENSGMOG00000012783	celf1	100	91.278	Gadus_morhua
ENSSFOG00015019353	celf1	97	87.968	ENSGALG00000008097	CELF1	100	90.329	Gallus_gallus
ENSSFOG00015019353	celf1	99	82.176	ENSGACG00000014226	celf1	99	82.176	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015019353	celf1	93	89.095	ENSGAGG00000011562	CELF1	100	89.300	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.855	ENSGGOG00000004106	CELF1	98	86.248	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015019353	celf1	97	88.889	ENSHBUG00000017881	celf1	98	89.484	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015019353	celf1	93	82.680	ENSHGLG00000019214	-	100	82.680	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015019353	celf1	93	87.910	ENSHGLG00000006909	-	100	88.320	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015019353	celf1	93	84.742	ENSHGLG00100017423	-	100	84.742	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015019353	celf1	93	87.910	ENSHGLG00100013863	-	100	88.320	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015019353	celf1	93	90.309	ENSHCOG00000000258	celf1	100	90.103	Hippocampus_comes
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ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.069	ENSSTOG00000000613	CELF1	100	88.525	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.069	ENSJJAG00000020280	Celf1	98	85.658	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015019353	celf1	100	87.335	ENSLBEG00000018296	celf1	100	87.902	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015019353	celf1	64	90.179	ENSLBEG00000002047	-	98	89.286	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015019353	celf1	64	77.522	ENSLACG00000018990	CELF1	90	76.309	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015019353	celf1	94	92.829	ENSLOCG00000005966	celf1	95	92.800	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	84.676	ENSLAFG00000003484	CELF1	97	86.774	Loxodonta_africana
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ENSSFOG00015019353	celf1	95	88.259	ENSMMUG00000011657	CELF1	99	89.300	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.855	ENSMNEG00000022558	CELF1	100	89.256	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015019353	celf1	93	89.256	ENSMLEG00000040834	CELF1	100	89.256	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015019353	celf1	93	90.208	ENSMAMG00000010052	celf1	100	90.208	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	88.889	ENSMZEG00005018307	celf1	100	89.792	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015019353	celf1	93	89.796	ENSMGAG00000010629	CELF1	97	89.184	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015019353	celf1	97	84.676	ENSMAUG00000009468	Celf1	100	88.115	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.855	ENSMICG00000045113	CELF1	98	86.248	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	84.872	ENSMOCG00000012633	Celf1	100	88.320	Microtus_ochrogaster
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ENSSFOG00015019353	celf1	93	89.050	MGP_CAROLIEiJ_G0023949	Celf1	100	89.050	Mus_caroli
ENSSFOG00015019353	celf1	93	89.050	ENSMUSG00000005506	Celf1	100	89.050	Mus_musculus
ENSSFOG00015019353	celf1	93	89.050	MGP_PahariEiJ_G0025385	Celf1	100	89.050	Mus_pahari
ENSSFOG00015019353	celf1	93	88.843	MGP_SPRETEiJ_G0024859	Celf1	100	88.843	Mus_spretus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.069	ENSMPUG00000003960	CELF1	92	85.658	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.156	ENSMLUG00000016631	CELF1	98	85.547	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	82.171	ENSNGAG00000017390	Celf1	98	83.890	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015019353	celf1	92	59.834	ENSNBRG00000023547	-	85	59.711	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015019353	celf1	93	89.256	ENSNLEG00000014638	CELF1	100	89.256	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015019353	celf1	93	88.525	ENSMEUG00000007763	CELF1	100	89.139	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015019353	celf1	93	86.475	ENSOPRG00000003239	-	100	87.090	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.069	ENSODEG00000015204	CELF1	98	85.658	Octodon_degus
ENSSFOG00015019353	celf1	100	87.356	ENSONIG00000008300	celf1	98	87.921	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	86.811	ENSOANG00000007896	CELF1	98	86.220	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.069	ENSOCUG00000001311	CELF1	98	85.658	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015019353	celf1	93	83.402	ENSOMEG00000002381	celf1	100	85.481	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.547	ENSOGAG00000011600	CELF1	98	85.938	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015019353	celf1	97	85.547	ENSOARG00000006924	CELF1	100	88.115	Ovis_aries
ENSSFOG00015019353	celf1	93	88.115	ENSPPAG00000033870	CELF1	100	88.525	Pan_paniscus
ENSSFOG00015019353	celf1	97	83.721	ENSPPRG00000002376	CELF1	100	87.910	Panthera_pardus
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