EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015019355 (Gene tree)
Gene ID: 108932276
Gene Symbol: srprb
Alias: wu:fk57h10|zgc:111820|zgc:92746
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3470 bases
Position: chrKV410993.1:10236273-10239742
Accession: 108932276
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015030155	MMR_HSR1	PF01926.23	9.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015030501	-	1790	XM_018748529	ENSSFOP00015030155	268 (aa)	XP_018604045	A0A1W4ZTF5

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015019355's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015019355's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015019355	srprb	57	30.065	ENSSFOG00015015116	arf3	79	30.065
ENSSFOG00015019355	srprb	54	31.034	ENSSFOG00015007701	-	72	31.884
ENSSFOG00015019355	srprb	54	30.201	ENSSFOG00015004387	-	77	30.201
ENSSFOG00015019355	srprb	56	30.000	ENSSFOG00015009538	arf1	77	30.000
ENSSFOG00015019355	srprb	57	30.573	ENSSFOG00015021396	-	81	30.573

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015019355	srprb	95	75.591	ENSAPOG00000021219	srprb	91	75.591	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015019355	srprb	95	75.197	ENSACIG00000014621	srprb	95	75.197	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.016	ENSAOCG00000017265	srprb	91	74.016	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.016	ENSAPEG00000024541	srprb	81	74.016	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015019355	srprb	95	75.591	ENSATEG00000014016	srprb	92	75.591	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.902	ENSACLG00000016748	srprb	92	74.902	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015019355	srprb	96	69.767	ENSAMXG00000044118	srprb	95	71.146	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015019355	srprb	95	73.622	ENSCSEG00000017194	srprb	92	73.622	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015019355	srprb	97	73.563	ENSCVAG00000004221	srprb	97	73.563	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015019355	srprb	96	67.829	ENSDARG00000030949	srprb	97	67.829	Danio_rerio
ENSSFOG00015019355	srprb	98	70.722	ENSELUG00000009740	srprb	97	70.722	Esox_lucius
ENSSFOG00015019355	srprb	97	73.180	ENSFHEG00000006004	srprb	97	73.180	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015019355	srprb	94	72.332	ENSGMOG00000002081	srprb	94	72.047	Gadus_morhua
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.016	ENSGAFG00000012593	srprb	95	74.016	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015019355	srprb	95	72.835	ENSGACG00000009891	srprb	93	72.835	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.902	ENSHBUG00000002145	srprb	92	74.902	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015019355	srprb	96	71.875	ENSHCOG00000007732	srprb	96	73.047	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015019355	srprb	96	66.279	ENSIPUG00000004177	srprb	94	67.589	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015019355	srprb	95	72.835	ENSKMAG00000020736	srprb	95	72.835	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015019355	srprb	95	72.441	ENSLBEG00000021483	srprb	92	72.441	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015019355	srprb	96	77.344	ENSLOCG00000009740	srprb	86	76.172	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015019355	srprb	95	75.197	ENSMAMG00000011876	srprb	92	75.197	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.510	ENSMZEG00005016621	srprb	98	74.510	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015019355	srprb	99	70.037	ENSMMOG00000012550	srprb	98	70.037	Mola_mola
ENSSFOG00015019355	srprb	96	73.438	ENSMALG00000012595	srprb	94	73.438	Monopterus_albus
ENSSFOG00015019355	srprb	69	73.370	ENSNBRG00000004699	srprb	91	65.581	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.409	ENSONIG00000003788	srprb	75	74.409	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015019355	srprb	94	71.146	ENSORLG00000006430	srprb	92	71.146	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015019355	srprb	94	71.542	ENSORLG00020003413	srprb	92	71.542	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015019355	srprb	94	71.542	ENSORLG00015000166	srprb	92	71.542	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015019355	srprb	94	72.727	ENSOMEG00000012735	srprb	92	72.441	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015019355	srprb	94	76.587	ENSPKIG00000013147	srprb	95	76.587	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015019355	srprb	95	72.441	ENSPMGG00000014061	srprb	92	72.441	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.409	ENSPFOG00000011347	srprb	92	74.409	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.409	ENSPLAG00000001156	srprb	98	74.409	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.016	ENSPMEG00000012169	srprb	98	74.016	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015019355	srprb	95	73.228	ENSPREG00000001449	srprb	98	73.228	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.902	ENSPNYG00000005911	srprb	92	74.902	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015019355	srprb	94	71.937	ENSPNAG00000009983	srprb	95	71.937	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015019355	srprb	95	72.047	ENSSMAG00000013202	srprb	92	72.047	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.803	ENSSDUG00000018746	srprb	86	74.803	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.409	ENSSLDG00000020560	srprb	92	74.409	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.803	ENSSPAG00000008898	srprb	91	74.803	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015019355	srprb	99	71.536	ENSTRUG00000022463	srprb	97	71.536	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015019355	srprb	94	69.323	ENSTNIG00000007725	srprb	95	69.323	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.803	ENSXCOG00000012585	srprb	98	74.803	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.409	ENSXMAG00000028725	srprb	98	74.409	Xiphophorus_maculatus