EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015019587 (Gene tree)
Gene ID: 108920247
Gene Symbol: EHD1
Alias: FLJ42622|FLJ44618|H-PAST|HPAST1|PAST1
Full Name: EH domain-containing protein 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15083 bases
Position: chrKV411287.1:1069866-1084948
Accession: 108920247
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015030534	MMR_HSR1	PF01926.23	9.3e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015030881	EHD1-201	1467	XM_018728864	ENSSFOP00015030534	488 (aa)	XP_018584380	-

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015019587's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm04144	Endocytosis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015019587's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	70.161	ENSSFOG00015023056	ehd2	92	70.281
ENSSFOG00015019587	EHD1	91	64.240	ENSSFOG00015006753	ehd2a	85	76.190
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	88.912	ENSSFOG00015014110	ehd3	93	88.912
ENSSFOG00015019587	EHD1	71	32.964	ENSSFOG00015009773	srl	77	32.782
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	93.661	ENSSFOG00015006481	-	92	93.661

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSG00000110047	EHD1	100	92.593	Homo_sapiens
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.947	ENSAPOG00000013440	ehd1a	91	90.947	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.321	ENSAMEG00000017785	EHD1	88	87.321	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.947	ENSACIG00000022182	ehd1a	92	90.947	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.947	ENSAOCG00000016322	ehd1a	91	90.947	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.947	ENSAPEG00000010363	ehd1a	91	90.947	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.741	ENSATEG00000013980	ehd1a	91	90.741	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSANAG00000034810	EHD1	92	87.526	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.358	ENSACLG00000016016	ehd1a	92	91.358	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	89.571	ENSAMXG00000039344	ehd1a	92	89.571	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	89.571	ENSAMXG00000031892	-	92	89.959	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSBTAG00000050712	EHD1	92	87.526	Bos_taurus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	68.072	WBGene00004373	rme-1	90	68.072	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSCJAG00000002660	EHD1	92	87.526	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015019587	EHD1	77	87.268	ENSCAFG00000014128	EHD1	83	87.147	Canis_familiaris
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSCAFG00020014846	EHD1	92	87.526	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSCHIG00000020707	-	92	87.526	Capra_hircus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSCPOG00000008157	EHD1	92	87.526	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSCCAG00000004590	EHD1	92	87.526	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSCATG00000010658	EHD1	89	87.730	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSCLAG00000016412	EHD1	92	87.526	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSCSAG00000007397	EHD1	92	87.730	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	86.570	ENSCPBG00000023692	EHD1	90	86.570	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSCANG00000042123	EHD1	92	87.730	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.321	ENSCGRG00001019701	Ehd1	92	87.321	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	86.094	ENSCGRG00000000662	Ehd1	97	86.094	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	88.889	ENSCSEG00000006078	ehd1a	92	88.889	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.947	ENSCVAG00000012152	ehd1a	91	90.947	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	93.238	ENSDARG00000014793	ehd1b	92	93.238	Danio_rerio
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	87.705	ENSDARG00000098853	ehd1a	92	87.705	Danio_rerio
ENSSFOG00015019587	EHD1	64	90.159	ENSDNOG00000017834	EHD1	84	90.159	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSDORG00000030186	Ehd1	92	87.526	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	70.612	FBgn0016693	Past1	92	70.612	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015019587	EHD1	55	83.895	ENSEBUG00000010829	EHD1	78	83.895	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	78.528	ENSEBUG00000009968	EHD1	91	78.528	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSEASG00005018250	EHD1	92	87.526	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSECAG00000011638	EHD1	92	87.526	Equus_caballus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	89.980	ENSELUG00000007973	-	91	89.980	Esox_lucius
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	94.033	ENSELUG00000016093	ehd1b	92	94.033	Esox_lucius
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.321	ENSFCAG00000027734	EHD1	89	87.321	Felis_catus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSFDAG00000007697	EHD1	92	87.526	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.358	ENSFHEG00000002690	ehd1a	91	91.358	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.535	ENSGMOG00000012192	ehd1a	92	90.535	Gadus_morhua
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.152	ENSGAFG00000000730	ehd1a	91	91.152	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.123	ENSGACG00000017605	ehd1a	92	90.123	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	86.912	ENSGAGG00000001677	-	84	86.912	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.358	ENSHBUG00000012087	ehd1a	92	91.358	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSHGLG00000010254	EHD1	92	87.526	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSHGLG00100014206	EHD1	92	87.526	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	89.095	ENSHCOG00000006825	ehd1a	91	89.095	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	89.571	ENSIPUG00000017390	EHD1	91	89.733	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	90.593	ENSIPUG00000002819	ehd1a	92	90.593	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSSTOG00000009829	EHD1	92	87.730	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSJJAG00000022299	Ehd1	92	87.526	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.535	ENSKMAG00000004764	ehd1a	91	90.535	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.123	ENSLBEG00000004390	ehd1a	91	90.123	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	86.762	ENSLACG00000018148	EHD1	92	86.762	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	84.805	ENSLOCG00000000924	ehd1b	87	84.805	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	84.458	ENSLAFG00000011643	EHD1	92	84.458	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSMFAG00000032608	EHD1	92	87.730	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSMMUG00000003972	EHD1	89	87.730	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSMNEG00000031673	EHD1	92	87.730	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSMLEG00000031992	EHD1	92	87.730	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.329	ENSMAMG00000021737	ehd1a	91	90.329	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.358	ENSMZEG00005004305	ehd1a	92	91.358	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.321	ENSMAUG00000013823	Ehd1	92	87.321	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSMICG00000001239	EHD1	89	87.730	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSMOCG00000015517	Ehd1	92	87.526	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	89.528	ENSMMOG00000003005	ehd1a	92	89.528	Mola_mola
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.123	ENSMALG00000012679	ehd1a	91	90.123	Monopterus_albus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.321	MGP_CAROLIEiJ_G0022603	Ehd1	92	87.321	Mus_caroli
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.321	ENSMUSG00000024772	Ehd1	92	87.321	Mus_musculus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.117	MGP_PahariEiJ_G0014097	Ehd1	92	87.117	Mus_pahari
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.321	MGP_SPRETEiJ_G0023514	Ehd1	92	87.321	Mus_spretus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSMPUG00000012497	EHD1	92	87.730	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSNGAG00000020358	Ehd1	92	87.526	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.358	ENSNBRG00000002933	ehd1a	92	91.358	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSNLEG00000005375	EHD1	92	87.730	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.321	ENSOPRG00000011350	EHD1	92	87.321	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSODEG00000014527	EHD1	92	87.730	Octodon_degus
ENSSFOG00015019587	EHD1	57	92.115	ENSOCUG00000029532	EHD1	82	92.115	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.123	ENSORLG00000022561	ehd1a	91	90.123	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	89.918	ENSORLG00020018451	ehd1a	91	89.918	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	89.918	ENSORLG00015017672	ehd1a	91	89.918	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.329	ENSOMEG00000019329	ehd1a	91	90.329	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSOGAG00000009351	EHD1	92	87.526	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	87.090	ENSOARG00000010447	EHD1	99	87.090	Ovis_aries
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSPPAG00000037178	EHD1	92	87.730	Pan_paniscus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	84.867	ENSPPRG00000006031	EHD1	89	84.867	Panthera_pardus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSPTRG00000003851	EHD1	89	87.730	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSPANG00000023358	EHD1	89	87.730	Papio_anubis
ENSSFOG00015019587	EHD1	64	94.286	ENSPKIG00000020297	-	77	94.286	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	92.638	ENSPKIG00000023165	-	92	92.638	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	86.912	ENSPSIG00000005727	EHD1	92	86.912	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.123	ENSPMGG00000017810	ehd1a	91	90.123	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSPEMG00000010917	Ehd1	92	87.526	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSPCIG00000014850	EHD1	92	87.526	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015019587	EHD1	71	73.699	ENSPCIG00000017053	-	85	73.699	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.358	ENSPFOG00000010613	ehd1a	91	91.358	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.358	ENSPLAG00000023296	ehd1a	91	91.358	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.358	ENSPMEG00000003397	ehd1a	91	91.358	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.358	ENSPREG00000015893	ehd1a	91	91.358	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSPPYG00000003093	EHD1	92	87.730	Pongo_abelii
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSPCOG00000010309	EHD1	91	87.526	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSPVAG00000007890	EHD1	92	87.526	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.358	ENSPNYG00000015448	ehd1a	92	91.358	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	94.262	ENSPNAG00000007408	EHD1	92	94.262	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	90.389	ENSPNAG00000023091	ehd1a	92	90.389	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.321	ENSRNOG00000043503	Ehd1	92	87.321	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSRBIG00000039111	EHD1	92	87.730	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.730	ENSRROG00000026366	EHD1	92	87.730	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSSBOG00000023399	EHD1	92	87.526	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015019587	EHD1	73	72.394	ENSSHAG00000007430	-	86	70.161	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	89.506	ENSSMAG00000018210	ehd1a	91	89.506	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.152	ENSSDUG00000016436	ehd1a	91	91.152	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.152	ENSSLDG00000015328	ehd1a	91	91.152	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.741	ENSSPAG00000008682	ehd1a	91	90.741	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	87.269	ENSSSCG00000013017	EHD1	91	87.269	Sus_scrofa
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.947	ENSTRUG00000025890	ehd1a	91	90.947	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	90.535	ENSTNIG00000016792	ehd1a	90	90.535	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015019587	EHD1	76	78.706	ENSTBEG00000007057	EHD1	89	78.706	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	86.912	ENSTTRG00000008887	EHD1	92	86.912	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSUAMG00000012071	EHD1	92	87.526	Ursus_americanus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	86.207	ENSUMAG00000007890	EHD1	94	86.207	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	87.526	ENSVVUG00000027552	EHD1	77	87.526	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015019587	EHD1	100	86.708	ENSXETG00000001638	ehd1	92	86.708	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.358	ENSXCOG00000001781	ehd1a	91	91.358	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015019587	EHD1	99	91.564	ENSXMAG00000005301	ehd1a	91	91.564	Xiphophorus_maculatus