EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015021428 (Gene tree)
Gene ID: 108940539
Gene Symbol: cse1l
Alias: bao|baobab|cas|cellular apoptosis susceptibility gene
Full Name: chromosome segregation 1 like
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15356 bases
Position: chrKV410798.1:7886242-7901597
Accession: 108940539
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015033606	IBN_N	PF03810.19	2.6e-12	1	1
ENSSFOP00015033570	IBN_N	PF03810.19	2.9e-12	1	1
ENSSFOP00015033642	IBN_N	PF03810.19	3.4e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015033947	-	3232	-	ENSSFOP00015033570	1016 (aa)	-	-
ENSSFOT00015034020	-	2748	-	ENSSFOP00015033642	915 (aa)	-	-
ENSSFOT00015033983	-	5623	XM_018762786	ENSSFOP00015033606	971 (aa)	XP_018618302	A0A1W5AYJ4

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015021428's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015021428's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSG00000124207	CSE1L	100	87.642	Homo_sapiens
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	92.173	ENSAPOG00000015943	cse1l	100	92.173	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.436	ENSAMEG00000013717	CSE1L	100	87.436	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	90.055	ENSACIG00000020004	cse1l	100	90.055	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	92.379	ENSAOCG00000004356	cse1l	100	92.379	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	92.482	ENSAPEG00000016588	cse1l	100	92.482	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	92.482	ENSATEG00000005414	cse1l	100	92.482	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.539	ENSAPLG00000010368	CSE1L	100	87.539	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.024	ENSACAG00000015951	CSE1L	100	87.024	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	85.479	ENSANAG00000023526	CSE1L	100	85.479	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	88.054	ENSACLG00000023214	cse1l	99	88.260	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.246	ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.246	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.436	ENSBTAG00000005957	CSE1L	100	87.436	Bos_taurus
ENSSFOG00015021428	cse1l	99	30.872	WBGene00002079	xpo-2	100	30.872	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSCJAG00000016296	CSE1L	100	87.642	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSCAFG00000011260	CSE1L	99	87.654	Canis_familiaris
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	86.921	ENSCAFG00020016114	CSE1L	100	86.667	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.333	ENSCHIG00000016579	CSE1L	100	87.333	Capra_hircus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSTSYG00000013400	CSE1L	100	87.642	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	78.167	ENSCAPG00000004349	-	100	78.167	Cavia_aperea
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	70.492	ENSCAPG00000000237	-	100	70.492	Cavia_aperea
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.436	ENSCPOG00000005554	-	100	87.436	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	78.064	ENSCPOG00000023180	-	100	78.064	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSCCAG00000014373	CSE1L	100	87.642	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSCATG00000039153	CSE1L	100	87.642	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	85.582	ENSCLAG00000006169	CSE1L	100	85.582	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSCSAG00000014977	CSE1L	100	87.642	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	84.346	ENSCHOG00000004640	CSE1L	100	84.346	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.745	ENSCPBG00000026743	CSE1L	100	87.745	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015021428	cse1l	99	63.196	ENSCING00000002277	-	99	62.680	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015021428	cse1l	99	62.565	ENSCSAVG00000003299	-	99	62.565	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	85.788	ENSCANG00000041300	CSE1L	100	85.788	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.745	ENSCGRG00001005670	Cse1l	100	87.745	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.745	ENSCGRG00000012164	Cse1l	100	87.745	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.349	ENSCSEG00000002471	cse1l	100	91.349	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	90.731	ENSCVAG00000004319	cse1l	100	90.731	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.452	ENSDARG00000006963	cse1l	100	91.452	Danio_rerio
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSDNOG00000014906	CSE1L	100	87.642	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015021428	cse1l	91	90.451	ENSDORG00000013960	Cse1l	100	90.451	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015021428	cse1l	99	52.085	FBgn0022213	Cse1	99	52.085	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015021428	cse1l	73	79.192	ENSEBUG00000011135	cse1l	92	79.192	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.230	ENSEASG00005023345	CSE1L	100	86.667	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.230	ENSECAG00000015543	CSE1L	97	87.243	Equus_caballus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.967	ENSELUG00000001309	cse1l	100	91.967	Esox_lucius
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSFCAG00000001446	CSE1L	100	87.642	Felis_catus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.436	ENSFALG00000012932	CSE1L	98	87.001	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.436	ENSFDAG00000005180	CSE1L	100	87.436	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015021428	cse1l	85	93.506	ENSFHEG00000005939	cse1l	92	93.506	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	89.804	ENSGMOG00000007944	cse1l	100	89.804	Gadus_morhua
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.436	ENSGALG00000004707	CSE1L	100	87.436	Gallus_gallus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.143	ENSGAFG00000021631	cse1l	100	91.143	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.555	ENSGACG00000000963	cse1l	100	91.555	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015021428	cse1l	97	87.911	ENSGAGG00000012815	CSE1L	99	87.911	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.539	ENSGGOG00000010875	CSE1L	100	87.539	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.761	ENSHBUG00000013599	cse1l	100	91.761	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.333	ENSHGLG00000009067	CSE1L	100	87.333	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	79.712	ENSHGLG00000014944	-	100	79.712	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	79.609	ENSHGLG00100014942	-	100	79.609	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.333	ENSHGLG00100001243	CSE1L	100	87.333	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	90.929	ENSHCOG00000005034	cse1l	100	90.929	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.555	ENSIPUG00000023752	cse1l	100	91.555	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.333	ENSSTOG00000003600	CSE1L	100	87.333	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.436	ENSJJAG00000016509	Cse1l	100	87.436	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.555	ENSKMAG00000021099	cse1l	100	91.555	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.040	ENSLBEG00000012480	cse1l	100	90.710	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	90.319	ENSLACG00000015970	CSE1L	100	90.319	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	93.203	ENSLOCG00000003099	cse1l	100	93.203	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	86.831	ENSLAFG00000006607	CSE1L	100	87.551	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSMFAG00000034230	CSE1L	100	87.642	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.104	ENSMMUG00000019636	CSE1L	100	87.104	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSMNEG00000031340	CSE1L	100	87.642	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015021428	cse1l	92	86.994	ENSMLEG00000042388	CSE1L	100	84.371	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.967	ENSMAMG00000023931	cse1l	100	91.967	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.555	ENSMZEG00005010674	cse1l	100	91.555	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.848	ENSMAUG00000001362	Cse1l	100	87.848	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.333	ENSMICG00000001988	CSE1L	100	87.333	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.745	ENSMOCG00000013597	Cse1l	100	87.745	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	85.685	ENSMMOG00000021787	cse1l	100	85.685	Mola_mola
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.230	ENSMODG00000016269	CSE1L	100	87.230	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.246	ENSMALG00000017385	cse1l	100	91.246	Monopterus_albus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.539	MGP_CAROLIEiJ_G0024698	Cse1l	100	87.539	Mus_caroli
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.745	ENSMUSG00000002718	Cse1l	100	87.745	Mus_musculus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.848	MGP_PahariEiJ_G0026140	Cse1l	100	87.848	Mus_pahari
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.745	MGP_SPRETEiJ_G0025618	Cse1l	100	87.745	Mus_spretus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.436	ENSMPUG00000017586	CSE1L	99	87.449	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	85.788	ENSMLUG00000008368	CSE1L	100	85.788	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.449	ENSNGAG00000001115	Cse1l	100	87.449	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.658	ENSNBRG00000005053	cse1l	100	91.658	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	86.509	ENSNLEG00000006945	CSE1L	100	86.509	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015021428	cse1l	75	78.222	ENSMEUG00000005658	-	73	78.222	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015021428	cse1l	95	85.691	ENSOPRG00000014530	CSE1L	90	85.691	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.539	ENSODEG00000006918	-	100	87.539	Octodon_degus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	92.173	ENSONIG00000018970	cse1l	100	92.173	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.745	ENSOANG00000006402	CSE1L	99	87.745	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.140	ENSOCUG00000005459	CSE1L	100	87.140	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.143	ENSORLG00000000603	cse1l	100	91.143	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	88.415	ENSORLG00020007653	cse1l	100	88.415	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015021428	cse1l	57	90.346	ENSORLG00015003694	cse1l	98	90.346	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.349	ENSOMEG00000014357	cse1l	100	91.349	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	85.421	ENSOGAG00000002126	CSE1L	100	85.421	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.346	ENSOARG00000012031	CSE1L	100	87.346	Ovis_aries
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSPPAG00000038391	CSE1L	100	87.642	Pan_paniscus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSPPRG00000022681	CSE1L	100	87.642	Panthera_pardus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSPTIG00000011919	CSE1L	100	87.104	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSPTRG00000013599	CSE1L	100	87.642	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	84.655	ENSPANG00000026147	CSE1L	100	84.655	Papio_anubis
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	94.336	ENSPKIG00000024520	cse1l	100	94.336	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.745	ENSPSIG00000010864	CSE1L	99	87.745	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.745	ENSPEMG00000000944	Cse1l	100	87.745	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.230	ENSPCIG00000023472	CSE1L	100	87.230	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.555	ENSPFOG00000001989	cse1l	100	91.555	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.658	ENSPLAG00000015012	cse1l	100	91.658	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.555	ENSPMEG00000022671	cse1l	100	91.555	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.761	ENSPREG00000009081	cse1l	100	91.761	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSPPYG00000011110	CSE1L	100	87.642	Pongo_abelii
ENSSFOG00015021428	cse1l	75	88.624	ENSPCAG00000007508	CSE1L	80	88.624	Procavia_capensis
ENSSFOG00015021428	cse1l	92	88.705	ENSPCOG00000026411	CSE1L	100	88.705	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015021428	cse1l	98	84.293	ENSPVAG00000015014	CSE1L	99	84.293	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.864	ENSPNYG00000007058	cse1l	100	91.864	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.452	ENSPNAG00000012903	cse1l	100	91.452	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.024	ENSRNOG00000007665	Cse1l	100	87.024	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSRBIG00000029361	CSE1L	100	87.642	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSRROG00000021686	CSE1L	100	87.642	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015021428	cse1l	94	36.472	YGL238W	CSE1	95	36.364	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSSBOG00000021396	CSE1L	100	87.642	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.246	ENSSMAG00000000580	cse1l	100	88.114	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	92.791	ENSSDUG00000012110	cse1l	100	92.791	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	92.791	ENSSLDG00000022083	cse1l	100	92.791	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	88.054	ENSSPUG00000017941	CSE1L	100	88.054	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	92.173	ENSSPAG00000008182	cse1l	100	92.173	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.745	ENSSSCG00000025534	CSE1L	97	89.834	Sus_scrofa
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.230	ENSTGUG00000008823	CSE1L	100	87.230	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015021428	cse1l	96	88.544	ENSTRUG00000005496	cse1l	97	88.544	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	89.495	ENSTNIG00000014631	cse1l	100	89.495	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	79.197	ENSTBEG00000008338	CSE1L	100	79.197	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015021428	cse1l	91	85.526	ENSTTRG00000004279	CSE1L	91	85.526	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.333	ENSUAMG00000025448	CSE1L	99	87.346	Ursus_americanus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.333	ENSUMAG00000024476	CSE1L	99	87.346	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	84.140	ENSVPAG00000001312	CSE1L	100	84.140	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	87.642	ENSVVUG00000022322	CSE1L	99	87.654	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	84.655	ENSXETG00000001784	cse1l	100	84.655	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.038	ENSXCOG00000000805	cse1l	100	91.038	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.658	ENSXMAG00000001306	cse1l	100	91.658	Xiphophorus_maculatus