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Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015022014 (Gene tree)
Gene ID: 108923951
Gene Symbol: prpf3
Alias: HPRP3|wu:fa11f05
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8918 bases
Position: chrKV410779.1:1043425-1052342
Accession: 108923951
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015034588	PRP3	PF08572.10	1.7e-77	1	1
ENSSFOP00015034559	PRP3	PF08572.10	2.1e-77	1	1
ENSSFOP00015034588	PWI	PF01480.17	5.1e-12	1	1
ENSSFOP00015034559	PWI	PF01480.17	6e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015034968	-	1887	-	ENSSFOP00015034588	628 (aa)	-	-
ENSSFOT00015034939	-	3189	XM_018735034	ENSSFOP00015034559	709 (aa)	XP_018590550	A0A1W4YG46

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03040	Spliceosome	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSG00000117360	PRPF3	100	73.662	Homo_sapiens
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	82.889	ENSAPOG00000015584	prpf3	100	83.450	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.380	ENSAMEG00000001630	PRPF3	100	73.803	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	81.564	ENSACIG00000007876	prpf3	100	81.564	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	82.468	ENSAOCG00000011449	prpf3	100	83.029	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	83.473	ENSATEG00000023583	prpf3	100	83.636	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	74.648	ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	74.648	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.596	ENSACAG00000003176	PRPF3	100	74.298	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	73.662	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	80.450	ENSACLG00000020127	prpf3	100	81.013	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	83.966	ENSAMXG00000007306	prpf3	100	83.966	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSBTAG00000013946	PRPF3	100	73.662	Bos_taurus
ENSSFOG00015022014	prpf3	86	38.339	WBGene00010844	prp-3	96	35.000	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	73.662	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSCAFG00000011820	PRPF3	100	73.662	Canis_familiaris
ENSSFOG00015022014	prpf3	81	71.603	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	72.125	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSCHIG00000015434	PRPF3	100	73.662	Capra_hircus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.380	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	73.803	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015022014	prpf3	92	67.599	ENSCAPG00000017812	PRPF3	95	67.928	Cavia_aperea
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.521	ENSCPOG00000008068	PRPF3	100	73.944	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSCCAG00000026380	PRPF3	100	73.662	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	61.399	ENSCATG00000041778	PRPF3	100	61.818	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.380	ENSCLAG00000015009	PRPF3	100	73.803	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015022014	prpf3	76	85.766	ENSCHOG00000011645	PRPF3	76	85.766	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSCPBG00000008216	PRPF3	100	73.662	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015022014	prpf3	66	59.286	ENSCING00000003312	-	100	59.286	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015022014	prpf3	85	55.678	ENSCSAVG00000008720	-	97	52.764	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	72.676	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	73.099	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSCGRG00001019100	Prpf3	100	73.662	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSCGRG00000007322	Prpf3	100	73.662	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	82.453	ENSCSEG00000002532	prpf3	100	82.453	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	80.839	ENSCVAG00000009318	prpf3	100	81.399	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	81.268	ENSDARG00000086425	prpf3	100	81.268	Danio_rerio
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	76.406	ENSDNOG00000005904	PRPF3	100	76.406	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015022014	prpf3	93	73.716	ENSDORG00000008664	Prpf3	100	74.169	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015022014	prpf3	86	53.501	FBgn0036915	Prp3	99	53.707	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.380	ENSETEG00000019124	PRPF3	100	73.803	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	62.249	ENSEBUG00000011680	prpf3	100	62.249	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.099	ENSEASG00005001566	PRPF3	100	73.521	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSECAG00000019840	PRPF3	100	73.662	Equus_caballus
ENSSFOG00015022014	prpf3	83	75.283	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	75.283	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	75.105	ENSELUG00000013624	prpf3	100	75.419	Esox_lucius
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSFCAG00000013940	PRPF3	100	73.662	Felis_catus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	72.958	ENSFDAG00000010365	PRPF3	100	73.380	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	80.000	ENSFHEG00000021746	prpf3	100	80.563	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	81.032	ENSGMOG00000008535	prpf3	100	81.032	Gadus_morhua
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	74.789	ENSGALG00000028205	PRPF3	100	74.789	Gallus_gallus
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	79.109	ENSGAFG00000012671	prpf3	100	79.666	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	89.130	ENSGACG00000011792	prpf3	100	82.048	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSGAGG00000013765	PRPF3	99	77.455	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015022014	prpf3	86	81.711	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	81.711	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	81.013	ENSHBUG00000003493	prpf3	100	81.575	Haplochromis_burtoni
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ENSSFOG00015022014	prpf3	99	55.267	ENSHGLG00000016033	-	100	55.267	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.099	ENSHGLG00100007590	PRPF3	100	73.521	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	55.267	ENSHGLG00100008951	-	100	55.215	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	75.872	ENSHCOG00000014058	prpf3	100	76.709	Hippocampus_comes
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ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSSTOG00000001889	PRPF3	100	73.662	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSSFOG00015022014	prpf3	100	85.873	ENSLBEG00000026310	prpf3	100	86.032	Labrus_bergylta
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ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSLAFG00000004713	PRPF3	100	73.662	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	73.662	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015022014	prpf3	90	72.075	ENSMMUG00000016301	PRPF3	98	72.543	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	73.662	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015022014	prpf3	86	81.711	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	81.711	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015022014	prpf3	98	49.575	ENSMLEG00000041065	-	97	49.858	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	91.304	ENSMAMG00000014968	prpf3	100	84.603	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	84.897	ENSMZEG00005015970	prpf3	100	84.897	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	74.789	ENSMGAG00000000707	PRPF3	100	74.789	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSMAUG00000017112	Prpf3	100	73.662	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.099	ENSMICG00000015386	PRPF3	99	77.818	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSMOCG00000000242	Prpf3	100	73.662	Microtus_ochrogaster
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ENSSFOG00015022014	prpf3	100	79.916	ENSMALG00000007257	prpf3	100	80.532	Monopterus_albus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	73.662	Mus_caroli
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	73.662	Mus_musculus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.558	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	73.980	Mus_pahari
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	73.662	Mus_spretus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	71.549	ENSMPUG00000005080	PRPF3	100	71.972	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	72.996	ENSMLUG00000004646	-	100	73.418	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSNGAG00000000910	Prpf3	100	73.662	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	82.263	ENSNBRG00000003462	prpf3	100	82.821	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015022014	prpf3	90	72.075	ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	72.543	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015022014	prpf3	83	67.257	ENSMEUG00000008733	PRPF3	89	67.257	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.558	ENSOPRG00000010139	PRPF3	100	73.980	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	55.340	ENSODEG00000014412	-	100	55.617	Octodon_degus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.803	ENSODEG00000011363	-	100	74.225	Octodon_degus
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	82.213	ENSONIG00000006394	prpf3	100	82.773	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	55.726	ENSOANG00000015441	PRPF3	100	55.726	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSOCUG00000011760	PRPF3	100	73.662	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	80.505	ENSORLG00000010330	prpf3	100	80.505	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	80.505	ENSORLG00020009054	prpf3	100	80.505	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	80.084	ENSORLG00015015016	prpf3	100	80.084	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	82.889	ENSOMEG00000000940	prpf3	100	83.359	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	69.242	ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	69.663	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSOARG00000020798	PRPF3	100	73.662	Ovis_aries
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ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSPTIG00000005516	PRPF3	100	73.662	Panthera_tigris_altaica
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ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.239	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	73.662	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015022014	prpf3	99	73.380	ENSPANG00000000499	PRPF3	100	73.803	Papio_anubis
ENSSFOG00015022014	prpf3	100	90.924	ENSPKIG00000010501	prpf3	100	90.924	Paramormyrops_kingsleyae
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