EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015022085 (Gene tree)
Gene ID: 108942378
Gene Symbol: ireb2
Alias: IRP2|im:7153062
Full Name: iron responsive element binding protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15794 bases
Position: chrKV411245.1:2701093-2716886
Accession: 108942378
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015034676	Aconitase	PF00330.20	1.9e-147	1	2
ENSSFOP00015034676	Aconitase	PF00330.20	1.9e-147	2	2
ENSSFOP00015034676	Aconitase_C	PF00694.19	4.9e-40	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015035055	-	6994	XM_018765701	ENSSFOP00015034676	1001 (aa)	XP_018621217	A0A1W5B0Q1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015022085	ireb2	88	60.963	ENSSFOG00015018941	aco1	99	60.963

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	68.998	ENSG00000136381	IREB2	100	68.421	Homo_sapiens
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	77.778	ENSAPOG00000016684	ireb2	99	79.025	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	77.778	ENSAPOG00000020564	ireb2	99	77.778	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	77.778	ENSAPOG00000015501	-	99	77.778	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	68.640	ENSAMEG00000012645	IREB2	99	68.640	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	77.536	ENSACIG00000012557	ireb2	99	77.536	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	78.099	ENSAOCG00000000407	ireb2	99	78.099	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	77.971	ENSAPEG00000009121	ireb2	100	77.971	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	75.517	ENSATEG00000021145	ireb2	99	75.517	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	73.967	ENSATEG00000021210	ireb2	99	73.967	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015022085	ireb2	94	68.638	ENSAPLG00000016388	IREB2	98	68.638	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.311	ENSANAG00000021994	IREB2	99	69.311	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	77.160	ENSACLG00000024688	ireb2	100	77.160	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	78.247	ENSAMXG00000008756	ireb2	99	78.247	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.311	ENSBTAG00000002504	IREB2	99	69.311	Bos_taurus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.199	ENSCJAG00000010259	IREB2	99	69.199	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	68.933	ENSCAFG00000001766	IREB2	99	68.933	Canis_familiaris
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	68.933	ENSCAFG00020021072	IREB2	99	70.378	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.311	ENSCHIG00000023111	IREB2	99	69.311	Capra_hircus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	68.958	ENSTSYG00000011729	IREB2	99	68.958	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015022085	ireb2	83	65.171	ENSCAPG00000011854	IREB2	99	65.179	Cavia_aperea
ENSSFOG00015022085	ireb2	83	74.157	ENSCPOG00000013905	IREB2	99	74.157	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.167	ENSCCAG00000021202	IREB2	99	69.167	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.207	ENSCATG00000033462	IREB2	99	69.207	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.520	ENSCLAG00000008985	IREB2	99	69.520	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.207	ENSCSAG00000014904	IREB2	99	69.207	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	66.353	ENSCHOG00000004107	IREB2	99	66.353	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	69.854	ENSCPBG00000024247	IREB2	99	71.254	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.311	ENSCANG00000029420	IREB2	99	69.311	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.207	ENSCGRG00001019234	Ireb2	99	69.207	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.207	ENSCGRG00000016786	Ireb2	99	69.207	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	73.156	ENSCSEG00000003080	ireb2	100	73.463	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	75.259	ENSCVAG00000010739	ireb2	97	75.466	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015022085	ireb2	97	74.233	ENSDARG00000021466	ireb2	100	74.411	Danio_rerio
ENSSFOG00015022085	ireb2	92	68.925	ENSDNOG00000009614	IREB2	99	68.925	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015022085	ireb2	87	64.840	ENSDORG00000014339	Ireb2	99	60.540	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015022085	ireb2	71	70.732	ENSETEG00000012717	IREB2	74	70.732	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.624	ENSEASG00005015622	IREB2	99	69.624	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.624	ENSECAG00000016731	IREB2	99	69.624	Equus_caballus
ENSSFOG00015022085	ireb2	89	66.256	ENSEEUG00000007999	IREB2	99	66.256	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.639	ENSELUG00000023666	ireb2	100	76.844	Esox_lucius
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.102	ENSFCAG00000001921	IREB2	99	69.102	Felis_catus
ENSSFOG00015022085	ireb2	94	62.791	ENSFALG00000010640	IREB2	98	62.791	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.937	ENSFDAG00000009355	IREB2	99	69.937	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015022085	ireb2	97	76.477	ENSFHEG00000017905	ireb2	98	77.590	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	73.009	ENSGMOG00000009184	ireb2	99	73.009	Gadus_morhua
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	67.987	ENSGALG00000035462	IREB2	99	67.987	Gallus_gallus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	73.146	ENSGAFG00000005145	ireb2	98	73.146	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	75.362	ENSGACG00000007341	ireb2	99	75.362	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	69.647	ENSGAGG00000006117	IREB2	96	69.647	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	68.998	ENSGGOG00000015650	IREB2	99	68.998	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	77.058	ENSHBUG00000007184	ireb2	100	77.058	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.729	ENSHGLG00000000783	Ireb2	99	69.729	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.729	ENSHGLG00100019429	Ireb2	99	69.729	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015022085	ireb2	94	74.524	ENSHCOG00000007424	ireb2	99	74.524	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.550	ENSIPUG00000014808	Ireb2	99	76.550	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.311	ENSSTOG00000009273	IREB2	99	69.311	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	64.405	ENSJJAG00000019768	Ireb2	99	64.405	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.127	ENSKMAG00000016020	ireb2	98	76.127	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.205	ENSLBEG00000020371	ireb2	100	76.205	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	61.467	ENSLACG00000001182	IREB2	99	61.467	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	78.888	ENSLOCG00000015029	ireb2	99	78.888	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.488	ENSLAFG00000012839	IREB2	99	69.488	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.207	ENSMFAG00000039630	IREB2	99	69.207	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.207	ENSMMUG00000045680	IREB2	99	69.207	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	67.119	ENSMNEG00000039698	IREB2	99	67.119	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.207	ENSMLEG00000031047	IREB2	99	69.207	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.766	ENSMAMG00000023095	ireb2	99	77.813	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	77.160	ENSMZEG00005010935	ireb2	100	77.160	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	68.054	ENSMGAG00000003688	IREB2	99	68.054	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.415	ENSMICG00000005757	IREB2	99	69.415	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	68.789	ENSMOCG00000010784	Ireb2	99	68.789	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.446	ENSMMOG00000001385	ireb2	97	76.446	Mola_mola
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	70.219	ENSMODG00000011768	IREB2	99	70.219	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	74.664	ENSMALG00000015314	ireb2	99	74.664	Monopterus_albus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	69.095	MGP_CAROLIEiJ_G0032235	Ireb2	99	69.095	Mus_caroli
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	68.991	ENSMUSG00000032293	Ireb2	99	68.991	Mus_musculus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	68.783	MGP_PahariEiJ_G0015103	Ireb2	99	68.783	Mus_pahari
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	68.991	MGP_SPRETEiJ_G0033375	Ireb2	99	68.991	Mus_spretus
ENSSFOG00015022085	ireb2	97	68.103	ENSMPUG00000010978	IREB2	96	68.103	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	67.772	ENSMLUG00000006783	IREB2	99	67.772	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.207	ENSNGAG00000017333	Ireb2	99	69.207	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.797	ENSNBRG00000017676	ireb2	99	78.828	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.102	ENSNLEG00000008549	IREB2	99	69.102	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015022085	ireb2	71	76.471	ENSMEUG00000001630	-	74	76.471	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	65.099	ENSOPRG00000000340	IREB2	99	65.099	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.311	ENSODEG00000015993	IREB2	99	69.311	Octodon_degus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.876	ENSONIG00000012838	ireb2	100	76.876	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.874	ENSOANG00000013218	-	98	69.874	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015022085	ireb2	90	69.834	ENSOCUG00000009907	IREB2	99	69.834	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.362	ENSORLG00000001943	ireb2	92	76.362	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.259	ENSORLG00020000623	ireb2	97	76.259	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.230	ENSORLG00015014057	ireb2	98	76.230	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	75.951	ENSOMEG00000005120	ireb2	98	75.951	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	66.493	ENSOGAG00000010622	IREB2	99	66.493	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	68.983	ENSOARG00000000881	IREB2	99	68.983	Ovis_aries
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	68.894	ENSPPAG00000038956	IREB2	99	68.894	Pan_paniscus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.102	ENSPPRG00000003145	IREB2	99	69.102	Panthera_pardus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	68.530	ENSPTIG00000021418	IREB2	86	68.530	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	68.998	ENSPTRG00000007342	IREB2	99	68.998	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.207	ENSPANG00000015813	IREB2	99	69.207	Papio_anubis
ENSSFOG00015022085	ireb2	97	81.874	ENSPKIG00000012755	ireb2	99	81.874	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSSFOG00015022085	ireb2	96	74.896	ENSPMGG00000016828	ireb2	99	74.896	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.207	ENSPEMG00000020204	Ireb2	99	69.207	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015022085	ireb2	95	69.624	ENSPCIG00000019022	IREB2	87	69.624	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.000	ENSPFOG00000014509	ireb2	98	76.000	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015022085	ireb2	96	76.264	ENSPLAG00000002220	ireb2	98	76.127	Poecilia_latipinna
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