EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015022139 (Gene tree)
Gene ID: 108938027
Gene Symbol: srp19
Alias: zgc:63961
Full Name: signal recognition particle 19
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5936 bases
Position: chrKV411153.1:5636818-5642753
Accession: 108938027
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015034754	SRP19	PF01922.17	1.9e-29	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015035134	-	3228	XM_018758290	ENSSFOP00015034754	141 (aa)	XP_018613806	A0A1W5ALT4

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015022139's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015022139's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSG00000153037	SRP19	95	71.875	Homo_sapiens
ENSSFOG00015022139	srp19	94	83.459	ENSAPOG00000002199	srp19	94	83.459	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	74.419	ENSAMEG00000012623	SRP19	88	74.419	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015022139	srp19	94	79.699	ENSACIG00000005082	srp19	94	79.699	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015022139	srp19	94	82.707	ENSAOCG00000002718	srp19	94	82.707	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015022139	srp19	94	81.955	ENSAPEG00000022170	srp19	94	81.955	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015022139	srp19	94	84.962	ENSATEG00000012472	srp19	94	84.962	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015022139	srp19	79	72.566	ENSAPLG00000002624	SRP19	93	73.043	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015022139	srp19	90	70.312	ENSACAG00000007550	SRP19	92	69.630	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015022139	srp19	90	59.690	ENSANAG00000029862	-	88	68.750	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSANAG00000032576	-	90	72.093	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015022139	srp19	91	56.154	ENSANAG00000030287	-	91	56.000	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015022139	srp19	94	78.195	ENSACLG00000006259	srp19	94	78.195	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015022139	srp19	93	78.626	ENSAMXG00000043011	srp19	94	78.947	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSBTAG00000012803	SRP19	90	72.093	Bos_taurus
ENSSFOG00015022139	srp19	82	50.000	WBGene00018159	F37F2.2	82	50.000	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSCJAG00000038676	-	87	70.833	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015022139	srp19	88	54.400	ENSCJAG00000045531	-	82	54.264	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSCAFG00000031549	SRP19	90	72.093	Canis_familiaris
ENSSFOG00015022139	srp19	84	72.500	ENSCAFG00020022437	-	92	73.171	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015022139	srp19	65	70.652	ENSCAFG00020004285	-	85	71.579	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSCAFG00020014267	-	90	72.093	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSCHIG00000017551	SRP19	90	72.093	Capra_hircus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSTSYG00000007875	SRP19	90	72.868	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015022139	srp19	82	62.185	ENSCPOG00000036806	SRP19	89	62.185	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015022139	srp19	88	58.730	ENSCCAG00000023426	-	82	58.730	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015022139	srp19	88	56.000	ENSCCAG00000029821	-	62	56.000	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSCCAG00000035651	-	90	72.093	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	65.891	ENSCATG00000039250	-	89	65.891	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015022139	srp19	87	61.789	ENSCATG00000040513	-	77	62.400	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015022139	srp19	91	67.442	ENSCLAG00000016055	-	89	67.442	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSCLAG00000004791	-	90	72.093	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSCHOG00000013452	SRP19	90	72.868	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015022139	srp19	93	69.697	ENSCPBG00000013903	SRP19	94	70.149	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015022139	srp19	91	70.543	ENSCGRG00001020510	Srp19	90	70.543	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015022139	srp19	84	63.866	ENSCGRG00000008542	-	91	63.866	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015022139	srp19	67	69.000	ENSCGRG00000010716	-	88	69.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015022139	srp19	94	78.947	ENSCSEG00000010039	srp19	94	78.947	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015022139	srp19	94	81.203	ENSCVAG00000017621	srp19	94	81.203	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015022139	srp19	93	79.389	ENSDARG00000035699	srp19	94	79.699	Danio_rerio
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSDNOG00000013856	SRP19	90	72.868	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015022139	srp19	69	71.429	ENSDORG00000004746	Srp19	77	71.429	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015022139	srp19	88	50.806	FBgn0015298	Srp19	81	50.769	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015022139	srp19	91	70.543	ENSETEG00000017132	SRP19	90	70.543	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015022139	srp19	90	70.079	ENSEBUG00000006613	srp19	94	69.925	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSEASG00005015182	SRP19	90	72.868	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSEEUG00000007298	SRP19	90	72.093	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015022139	srp19	94	75.188	ENSELUG00000004594	srp19	94	75.188	Esox_lucius
ENSSFOG00015022139	srp19	93	83.969	ENSELUG00000007958	srp19	94	84.211	Esox_lucius
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSFCAG00000025895	SRP19	90	72.868	Felis_catus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	71.318	ENSFDAG00000013543	SRP19	90	71.318	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015022139	srp19	94	81.955	ENSFHEG00000000493	srp19	94	81.955	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015022139	srp19	85	77.500	ENSGMOG00000003264	srp19	94	77.500	Gadus_morhua
ENSSFOG00015022139	srp19	89	73.810	ENSGALG00000000218	SRP19	92	72.180	Gallus_gallus
ENSSFOG00015022139	srp19	94	78.788	ENSGAFG00000015815	srp19	64	78.788	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015022139	srp19	94	78.195	ENSGACG00000001093	srp19	90	78.195	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015022139	srp19	93	69.697	ENSGAGG00000025305	SRP19	94	70.149	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015022139	srp19	91	75.969	ENSHBUG00000006131	srp19	90	75.969	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015022139	srp19	91	71.318	ENSHGLG00000006075	SRP19	90	71.318	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015022139	srp19	91	71.318	ENSHGLG00100015859	SRP19	90	71.318	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015022139	srp19	94	76.692	ENSHCOG00000013231	srp19	94	76.692	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015022139	srp19	93	78.626	ENSIPUG00000025084	srp19	94	78.947	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSSTOG00000000348	SRP19	90	72.868	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	71.318	ENSJJAG00000017185	Srp19	90	71.318	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015022139	srp19	94	83.459	ENSKMAG00000011155	srp19	94	83.459	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015022139	srp19	94	81.955	ENSLBEG00000026727	srp19	94	81.955	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015022139	srp19	93	73.485	ENSLACG00000004459	SRP19	87	73.881	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015022139	srp19	93	80.916	ENSLOCG00000010302	srp19	94	81.203	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	71.318	ENSLAFG00000002564	SRP19	90	71.318	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015022139	srp19	86	66.393	ENSMFAG00000000554	-	93	64.122	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015022139	srp19	84	56.303	ENSMFAG00000040055	-	90	57.025	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015022139	srp19	87	60.976	ENSMMUG00000032515	-	92	61.600	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015022139	srp19	86	68.033	ENSMMUG00000049186	-	93	65.649	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSMNEG00000038714	SRP19	90	72.868	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015022139	srp19	84	55.462	ENSMNEG00000040117	-	90	56.198	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015022139	srp19	94	83.459	ENSMAMG00000018346	srp19	94	83.459	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015022139	srp19	94	78.195	ENSMZEG00005001765	srp19	94	78.195	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015022139	srp19	84	72.500	ENSMGAG00000006762	SRP19	93	72.951	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSMICG00000000399	SRP19	90	72.093	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015022139	srp19	65	66.667	ENSMICG00000049202	-	86	67.708	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015022139	srp19	67	71.875	ENSMOCG00000010532	-	88	71.875	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSMOCG00000006534	Srp19	90	72.093	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015022139	srp19	89	82.400	ENSMMOG00000010417	srp19	81	82.400	Mola_mola
ENSSFOG00015022139	srp19	93	71.970	ENSMODG00000013278	SRP19	94	72.388	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015022139	srp19	94	85.714	ENSMALG00000003858	srp19	94	85.714	Monopterus_albus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	73.643	MGP_CAROLIEiJ_G0022086	Srp19	90	73.643	Mus_caroli
ENSSFOG00015022139	srp19	91	73.643	ENSMUSG00000014504	Srp19	90	73.643	Mus_musculus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	MGP_PahariEiJ_G0018820	Srp19	90	72.868	Mus_pahari
ENSSFOG00015022139	srp19	91	73.643	MGP_SPRETEiJ_G0022998	Srp19	90	73.643	Mus_spretus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	73.643	ENSMPUG00000012695	SRP19	88	73.643	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015022139	srp19	87	68.548	ENSMLUG00000024549	-	91	69.048	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSMLUG00000014793	-	90	72.093	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSNGAG00000003440	-	90	72.093	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015022139	srp19	88	66.400	ENSNGAG00000014524	-	96	66.400	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015022139	srp19	89	64.286	ENSNLEG00000035364	-	88	67.708	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015022139	srp19	84	72.269	ENSMEUG00000012529	SRP19	93	72.727	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015022139	srp19	82	71.795	ENSOPRG00000010549	SRP19	93	71.901	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015022139	srp19	89	67.460	ENSODEG00000019119	-	90	67.442	Octodon_degus
ENSSFOG00015022139	srp19	67	71.875	ENSODEG00000005538	-	84	71.875	Octodon_degus
ENSSFOG00015022139	srp19	87	57.724	ENSODEG00000013862	-	87	58.730	Octodon_degus
ENSSFOG00015022139	srp19	94	77.444	ENSONIG00000000542	srp19	94	77.444	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015022139	srp19	93	72.727	ENSOANG00000011139	SRP19	77	73.134	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	70.000	ENSOCUG00000015639	SRP19	90	70.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015022139	srp19	94	84.211	ENSORLG00000028267	srp19	95	84.211	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015022139	srp19	94	84.211	ENSORLG00020015201	srp19	95	84.211	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015022139	srp19	94	84.211	ENSORLG00015007525	srp19	95	84.211	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015022139	srp19	94	81.203	ENSOMEG00000009178	srp19	95	81.203	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015022139	srp19	90	72.656	ENSOGAG00000008579	SRP19	89	72.656	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015022139	srp19	91	71.318	ENSOARG00000016066	SRP19	90	71.318	Ovis_aries
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSPPAG00000037062	SRP19	90	72.868	Pan_paniscus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSPPRG00000015591	SRP19	90	72.868	Panthera_pardus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSPTIG00000021474	SRP19	90	72.868	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSPTRG00000017136	SRP19	90	72.868	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015022139	srp19	91	65.116	ENSPANG00000034740	-	89	65.116	Papio_anubis
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSPANG00000004370	-	90	72.868	Papio_anubis
ENSSFOG00015022139	srp19	94	80.451	ENSPKIG00000018671	srp19	94	80.451	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015022139	srp19	84	70.000	ENSPSIG00000013811	SRP19	93	70.492	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015022139	srp19	94	81.955	ENSPMGG00000015313	srp19	94	81.955	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015022139	srp19	85	73.554	ENSPEMG00000004412	-	88	73.554	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015022139	srp19	95	67.164	ENSPMAG00000002685	srp19	93	68.702	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015022139	srp19	93	71.212	ENSPCIG00000010250	SRP19	93	71.642	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015022139	srp19	94	82.707	ENSPFOG00000015887	srp19	94	82.707	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015022139	srp19	94	82.707	ENSPLAG00000007784	srp19	94	82.707	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015022139	srp19	94	83.459	ENSPMEG00000003056	srp19	94	83.459	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015022139	srp19	94	82.707	ENSPREG00000017307	srp19	94	82.707	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSPPYG00000029584	SRP19	88	72.868	Pongo_abelii
ENSSFOG00015022139	srp19	91	56.589	ENSPCAG00000000228	SRP19	90	56.589	Procavia_capensis
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSPCOG00000023239	SRP19	90	72.093	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSPVAG00000004895	SRP19	90	72.093	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015022139	srp19	93	77.273	ENSPNAG00000009392	srp19	94	77.612	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSRNOG00000020204	Srp19	90	72.868	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015022139	srp19	90	63.780	ENSRBIG00000040440	-	90	64.341	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015022139	srp19	52	69.333	ENSRBIG00000031651	-	83	69.333	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSRBIG00000015627	-	90	72.868	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015022139	srp19	90	63.780	ENSRROG00000037054	-	90	64.341	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015022139	srp19	87	58.065	ENSRROG00000037316	-	91	59.016	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015022139	srp19	91	55.039	ENSSBOG00000032685	-	85	63.158	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSSBOG00000028071	-	90	72.093	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015022139	srp19	94	79.699	ENSSMAG00000016803	srp19	94	79.699	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015022139	srp19	94	71.528	ENSSDUG00000012930	srp19	94	71.528	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015022139	srp19	68	59.375	ENSSLDG00000021916	-	51	80.645	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSSARG00000000615	SRP19	90	72.093	Sorex_araneus
ENSSFOG00015022139	srp19	87	73.984	ENSSPUG00000015769	SRP19	92	72.932	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	ENSSSCG00000026230	SRP19	90	72.093	Sus_scrofa
ENSSFOG00015022139	srp19	87	73.171	ENSTGUG00000001019	SRP19	91	72.180	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015022139	srp19	94	81.752	ENSTRUG00000023119	srp19	94	81.752	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015022139	srp19	94	81.203	ENSTNIG00000018880	srp19	94	81.203	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015022139	srp19	91	71.318	ENSTTRG00000001690	SRP19	89	71.318	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015022139	srp19	89	73.016	ENSUAMG00000000111	SRP19	90	73.643	Ursus_americanus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	73.643	ENSUMAG00000016997	SRP19	90	73.643	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.868	ENSVPAG00000006001	SRP19	90	72.868	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015022139	srp19	69	72.449	ENSVVUG00000012423	SRP19	87	75.000	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015022139	srp19	86	72.951	ENSXETG00000011993	srp19	86	72.951	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015022139	srp19	96	65.441	ENSXCOG00000012530	srp19	86	70.732	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015022139	srp19	94	83.459	ENSXMAG00000029788	srp19	94	83.459	Xiphophorus_maculatus