EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015023272 (Gene tree)
Gene ID: 108941530
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9811 bases
Position: chrKV411220.1:2180592-2190402
Accession: 108941530
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015036611	GTP_EFTU	PF00009.27	1.3e-44	1	1
ENSSFOP00015036611	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	7e-12	1	1
ENSSFOP00015036611	EFG_IV	PF03764.18	1.2e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015037005	-	3755	XM_018764266	ENSSFOP00015036611	970 (aa)	XP_018619782	A0A1W5AWA6

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015023272's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015023272's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015023272	eftud2	86	38.062	ENSSFOG00015018454	eef2l2	98	38.062
ENSSFOG00015023272	eftud2	86	38.497	ENSSFOG00015004255	-	98	38.497
ENSSFOG00015023272	eftud2	88	37.868	ENSSFOG00015010432	eef2b	99	37.868

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	96.189	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	96.189	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.770	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.040	ENSACIG00000009096	eftud2	100	91.349	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015023272	eftud2	88	91.176	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	91.176	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	96.395	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	96.395	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	96.395	ENSATEG00000000457	eftud2	100	96.395	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015023272	eftud2	99	88.489	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.363	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.049	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.255	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.667	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.984	ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.954	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.087	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	95.087	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.564	Bos_taurus
ENSSFOG00015023272	eftud2	99	69.938	WBGene00001166	eftu-2	99	69.318	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.667	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.770	Canis_familiaris
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.770	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.564	Capra_hircus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.770	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.770	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.255	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	91.564	Cavia_aperea
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.255	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.564	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.667	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.667	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.255	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.255	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.667	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015023272	eftud2	92	81.194	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.194	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.358	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.255	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	78.623	ENSCING00000009372	-	100	78.623	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015023272	eftud2	99	77.947	ENSCSAVG00000004985	-	100	79.741	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.667	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.461	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.461	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.336	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.748	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	93.718	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.130	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.742	ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.742	Danio_rerio
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.358	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.358	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.461	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	75.026	FBgn0039566	CG4849	100	74.872	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015023272	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015023272	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.204	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.770	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.564	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.667	Equus_caballus
ENSSFOG00015023272	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.773	ENSELUG00000017169	eftud2	100	95.773	Esox_lucius
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.770	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.872	Felis_catus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.358	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.975	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.255	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	96.087	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	96.087	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.954	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	95.160	Gadus_morhua
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.913	Gallus_gallus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.027	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	94.336	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	93.821	ENSGACG00000009163	eftud2	100	94.439	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	91.667	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.881	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.851	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.872	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	91.152	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.872	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.152	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.856	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	94.239	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.778	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	96.087	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015023272	eftud2	92	93.356	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.148	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015023272	eftud2	95	94.022	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.022	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	93.306	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	93.924	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015023272	eftud2	95	93.952	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.647	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	92.276	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.482	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.258	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	95.258	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.992	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.872	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.667	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.667	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.667	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	96.807	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	96.807	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.984	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	94.954	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.170	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.273	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.564	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.564	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.667	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015023272	eftud2	92	74.831	ENSMOCG00000017653	-	90	74.831	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.564	ENSMOCG00000009039	-	100	91.564	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015023272	eftud2	88	97.059	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	97.059	Mola_mola
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.684	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.461	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015023272	eftud2	88	95.059	ENSMALG00000014501	eftud2	100	95.059	Monopterus_albus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.358	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.358	Mus_caroli
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.761	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	92.070	Mus_musculus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.358	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.358	Mus_pahari
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.358	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.358	Mus_spretus
ENSSFOG00015023272	eftud2	97	91.419	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.525	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.770	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.564	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.564	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.881	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.851	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015023272	eftud2	97	89.586	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.586	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	87.988	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.757	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	83.539	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.642	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	62.857	ENSODEG00000003385	-	100	62.245	Octodon_degus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	ENSODEG00000018041	-	100	91.358	Octodon_degus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.984	ENSONIG00000000912	eftud2	100	94.954	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.564	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.564	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.233	ENSORLG00000003109	eftud2	100	94.439	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.130	ENSORLG00020009865	eftud2	100	94.336	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.130	ENSORLG00015002611	eftud2	100	96.514	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	89.815	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	89.815	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.564	Ovis_aries
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	91.667	Pan_paniscus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.770	Panthera_pardus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.770	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.667	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.667	Papio_anubis
ENSSFOG00015023272	eftud2	93	89.636	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.526	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	87.526	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	87.113	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.461	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.684	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	91.461	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	93.821	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	94.130	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	93.821	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	94.130	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	93.821	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	94.130	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	90.329	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.329	Pongo_abelii
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	88.193	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.066	Procavia_capensis
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.667	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	87.243	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.346	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.984	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	94.954	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.366	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	95.675	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.864	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.173	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.564	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	91.564	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.564	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.564	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015023272	eftud2	97	34.328	YKL173W	SNU114	91	34.857	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.667	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015023272	eftud2	95	93.804	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.804	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	93.615	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	94.027	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	96.189	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	96.189	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	96.292	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	96.292	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	83.539	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.539	Sorex_araneus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.255	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.947	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	96.292	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	96.292	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.770	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.770	Sus_scrofa
ENSSFOG00015023272	eftud2	83	92.910	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.910	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	93.512	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	93.924	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	89.128	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	89.538	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	86.317	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.317	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015023272	eftud2	91	90.125	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.125	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	90.834	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.937	Ursus_americanus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.770	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015023272	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.770	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015023272	eftud2	96	92.193	ENSXETG00000003394	eftud2	98	92.927	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015023272	eftud2	81	96.301	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.301	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.027	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	94.336	Xiphophorus_maculatus