EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015023647 (Gene tree)
Gene ID: 108931283
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4167 bases
Position: chrKV410955.1:656441-660607
Accession: 108931283
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015037157	SYF2	PF08231.12	7.1e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015037562	-	1597	XM_018746956	ENSSFOP00015037157	237 (aa)	XP_018602472	A0A1W4ZFH1

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015023647's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015023647's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.259	ENSG00000117614	SYF2	93	81.057	Homo_sapiens
ENSSFOG00015023647	syf2	93	89.140	ENSAPOG00000001174	syf2	93	89.140	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015023647	syf2	82	84.103	ENSAMEG00000010134	-	100	84.103	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015023647	syf2	97	81.385	ENSAMEG00000010115	-	93	81.385	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015023647	syf2	97	84.716	ENSACIG00000023688	syf2	92	84.716	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015023647	syf2	93	83.258	ENSAOCG00000010912	syf2	69	83.258	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015023647	syf2	100	84.454	ENSAOCG00000022046	syf2	94	88.688	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015023647	syf2	100	84.454	ENSAPEG00000018858	syf2	92	84.454	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015023647	syf2	92	89.401	ENSATEG00000007745	syf2	93	89.593	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015023647	syf2	84	82.412	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.412	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015023647	syf2	86	83.333	ENSACAG00000013653	-	100	83.333	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015023647	syf2	70	71.856	ENSACAG00000026777	-	100	71.856	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015023647	syf2	91	85.185	ENSANAG00000032473	SYF2	90	84.862	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015023647	syf2	93	87.330	ENSACLG00000019916	syf2	97	84.052	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015023647	syf2	100	84.519	ENSAMXG00000004051	syf2	100	84.519	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015023647	syf2	95	83.482	ENSBTAG00000001651	SYF2	95	83.482	Bos_taurus
ENSSFOG00015023647	syf2	88	50.711	WBGene00019402	syf-2	90	50.237	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015023647	syf2	91	85.185	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	84.862	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015023647	syf2	97	74.348	ENSCAFG00000030331	-	98	74.348	Canis_familiaris
ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.722	ENSCAFG00000012895	-	100	77.236	Canis_familiaris
ENSSFOG00015023647	syf2	76	74.725	ENSCAFG00020021094	-	95	74.725	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.722	ENSCAFG00020021091	-	100	77.236	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015023647	syf2	95	83.036	ENSCHIG00000020874	SYF2	93	83.036	Capra_hircus
ENSSFOG00015023647	syf2	100	78.601	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	78.601	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015023647	syf2	84	84.343	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.343	Cavia_aperea
ENSSFOG00015023647	syf2	100	77.459	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	77.459	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015023647	syf2	91	85.185	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	84.862	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015023647	syf2	97	80.087	ENSCATG00000026917	SYF2	93	80.087	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015023647	syf2	99	79.661	ENSCLAG00000008474	SYF2	97	79.661	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015023647	syf2	96	80.617	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	76.955	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015023647	syf2	69	67.485	ENSCHOG00000005273	-	89	67.485	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015023647	syf2	95	83.482	ENSCPBG00000025073	SYF2	90	83.482	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015023647	syf2	93	53.363	ENSCING00000003017	-	89	55.140	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015023647	syf2	89	50.467	ENSCSAVG00000006627	-	98	50.467	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015023647	syf2	95	71.556	ENSCANG00000037322	SYF2	91	71.556	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015023647	syf2	100	79.339	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	79.339	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015023647	syf2	83	84.694	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	84.422	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015023647	syf2	92	83.105	ENSCSEG00000000117	syf2	92	83.258	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015023647	syf2	94	85.135	ENSCVAG00000019543	syf2	96	82.969	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015023647	syf2	93	90.498	ENSDARG00000004706	syf2	93	90.498	Danio_rerio
ENSSFOG00015023647	syf2	95	82.667	ENSDNOG00000047605	SYF2	92	82.667	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015023647	syf2	100	78.689	ENSDORG00000001274	Syf2	100	78.689	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015023647	syf2	92	55.455	FBgn0033556	CG12343	97	55.455	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015023647	syf2	89	69.194	ENSETEG00000015729	SYF2	100	65.939	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015023647	syf2	83	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015023647	syf2	92	84.862	ENSEASG00005004224	-	89	84.862	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015023647	syf2	95	74.222	ENSEASG00005004232	-	93	74.222	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015023647	syf2	95	82.667	ENSECAG00000012023	-	92	82.667	Equus_caballus
ENSSFOG00015023647	syf2	92	84.862	ENSECAG00000010440	-	91	84.862	Equus_caballus
ENSSFOG00015023647	syf2	69	71.951	ENSEEUG00000015084	SYF2	90	71.951	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015023647	syf2	100	86.920	ENSELUG00000003465	syf2	99	86.920	Esox_lucius
ENSSFOG00015023647	syf2	100	78.776	ENSFCAG00000010324	-	85	78.776	Felis_catus
ENSSFOG00015023647	syf2	92	84.862	ENSFCAG00000043095	-	89	84.862	Felis_catus
ENSSFOG00015023647	syf2	86	81.373	ENSFALG00000000460	SYF2	91	79.821	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015023647	syf2	100	78.189	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	78.189	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015023647	syf2	93	71.171	ENSFHEG00000007238	syf2	98	71.171	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015023647	syf2	91	88.372	ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.372	Gadus_morhua
ENSSFOG00015023647	syf2	96	81.498	ENSGALG00000013639	SYF2	90	81.498	Gallus_gallus
ENSSFOG00015023647	syf2	93	84.163	ENSGAFG00000019435	syf2	93	84.163	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015023647	syf2	93	85.973	ENSGACG00000007305	syf2	100	82.008	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015023647	syf2	95	83.929	ENSGAGG00000010670	SYF2	90	83.929	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.722	ENSGGOG00000012796	SYF2	93	82.222	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015023647	syf2	93	87.330	ENSHBUG00000020477	syf2	98	84.716	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015023647	syf2	93	83.710	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	83.710	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015023647	syf2	93	72.398	ENSHGLG00000004304	-	92	72.851	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015023647	syf2	93	83.710	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	83.710	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015023647	syf2	100	83.613	ENSHCOG00000012904	syf2	78	83.613	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015023647	syf2	96	86.147	ENSIPUG00000019859	syf2	99	84.746	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015023647	syf2	62	80.137	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	80.137	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015023647	syf2	84	84.925	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	84.925	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015023647	syf2	100	81.435	ENSKMAG00000013856	syf2	100	81.435	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015023647	syf2	92	90.323	ENSLBEG00000014425	syf2	100	84.874	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015023647	syf2	93	81.900	ENSLACG00000012064	SYF2	93	81.900	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015023647	syf2	100	82.353	ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.353	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015023647	syf2	77	55.435	ENSLAFG00000030814	-	100	55.435	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015023647	syf2	100	77.959	ENSLAFG00000023150	-	100	77.959	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015023647	syf2	96	80.617	ENSMFAG00000041831	SYF2	93	80.617	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015023647	syf2	91	83.796	ENSMMUG00000002968	SYF2	93	81.057	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015023647	syf2	96	80.617	ENSMNEG00000030180	SYF2	93	80.617	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015023647	syf2	97	80.087	ENSMLEG00000030248	SYF2	93	80.087	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015023647	syf2	92	88.018	ENSMAMG00000010403	syf2	92	87.783	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015023647	syf2	93	87.330	ENSMZEG00005006429	syf2	93	87.330	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015023647	syf2	84	82.412	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.412	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015023647	syf2	100	80.165	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	80.165	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015023647	syf2	84	84.925	ENSMICG00000016191	SYF2	100	84.925	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015023647	syf2	100	80.165	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	80.165	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015023647	syf2	93	87.330	ENSMMOG00000002396	syf2	92	87.330	Mola_mola
ENSSFOG00015023647	syf2	95	80.176	ENSMODG00000013951	-	99	80.176	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015023647	syf2	95	84.279	ENSMALG00000010706	syf2	95	84.716	Monopterus_albus
ENSSFOG00015023647	syf2	100	80.247	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	80.247	Mus_caroli
ENSSFOG00015023647	syf2	100	80.247	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	80.247	Mus_musculus
ENSSFOG00015023647	syf2	100	80.247	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	80.247	Mus_pahari
ENSSFOG00015023647	syf2	100	80.247	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	80.247	Mus_spretus
ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.722	ENSMPUG00000015802	-	91	82.222	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015023647	syf2	95	82.222	ENSMPUG00000015801	-	91	82.222	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015023647	syf2	95	81.778	ENSMLUG00000001885	SYF2	92	81.778	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015023647	syf2	100	78.455	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.455	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015023647	syf2	93	77.376	ENSNBRG00000010720	syf2	92	77.376	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.722	ENSNLEG00000035185	SYF2	93	82.222	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015023647	syf2	100	77.366	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	77.366	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015023647	syf2	99	70.763	ENSODEG00000014338	-	99	70.763	Octodon_degus
ENSSFOG00015023647	syf2	99	78.390	ENSODEG00000017664	-	99	78.390	Octodon_degus
ENSSFOG00015023647	syf2	93	87.330	ENSONIG00000008213	syf2	97	84.052	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015023647	syf2	85	83.663	ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.663	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015023647	syf2	100	78.689	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	78.689	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015023647	syf2	95	82.895	ENSORLG00000028820	syf2	98	82.895	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015023647	syf2	100	79.325	ENSORLG00020018333	syf2	100	79.325	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015023647	syf2	98	81.116	ENSORLG00015014665	syf2	98	81.116	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015023647	syf2	100	81.933	ENSOMEG00000013911	syf2	100	81.933	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015023647	syf2	99	80.252	ENSOGAG00000009962	SYF2	98	80.252	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015023647	syf2	82	59.487	ENSOARG00000006269	-	100	59.487	Ovis_aries
ENSSFOG00015023647	syf2	95	82.301	ENSOARG00000006348	-	91	82.301	Ovis_aries
ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.722	ENSPPAG00000036579	SYF2	93	82.222	Pan_paniscus
ENSSFOG00015023647	syf2	92	84.862	ENSPPRG00000001651	-	89	84.862	Panthera_pardus
ENSSFOG00015023647	syf2	92	84.862	ENSPPRG00000001638	-	89	84.862	Panthera_pardus
ENSSFOG00015023647	syf2	91	85.185	ENSPTIG00000005711	-	80	84.545	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015023647	syf2	92	84.862	ENSPTIG00000007036	-	89	84.862	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.722	ENSPTRG00000000352	SYF2	93	82.222	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015023647	syf2	96	80.617	ENSPANG00000008139	SYF2	93	80.617	Papio_anubis
ENSSFOG00015023647	syf2	100	88.235	ENSPKIG00000008130	syf2	100	88.235	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015023647	syf2	95	81.034	ENSPSIG00000011816	SYF2	90	81.034	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015023647	syf2	95	87.946	ENSPMGG00000008755	syf2	88	87.946	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015023647	syf2	100	79.752	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	79.752	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015023647	syf2	100	76.400	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	76.400	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015023647	syf2	93	85.068	ENSPFOG00000004116	syf2	91	85.068	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015023647	syf2	93	84.615	ENSPLAG00000006691	syf2	95	84.615	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015023647	syf2	95	81.416	ENSPMEG00000011684	syf2	95	82.353	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015023647	syf2	91	86.111	ENSPREG00000003009	syf2	93	85.520	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015023647	syf2	92	84.404	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	84.404	Pongo_abelii
ENSSFOG00015023647	syf2	100	55.738	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	55.738	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015023647	syf2	95	73.333	ENSPVAG00000005841	SYF2	92	73.333	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015023647	syf2	93	87.330	ENSPNYG00000004979	syf2	93	87.330	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015023647	syf2	100	86.975	ENSPNAG00000015570	syf2	100	86.975	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015023647	syf2	100	80.247	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	80.247	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015023647	syf2	96	78.414	ENSRBIG00000042970	SYF2	93	78.414	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015023647	syf2	96	80.617	ENSRROG00000001347	SYF2	93	80.617	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015023647	syf2	91	85.185	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	84.862	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015023647	syf2	100	75.904	ENSSHAG00000015630	-	100	75.904	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015023647	syf2	86	83.495	ENSSHAG00000007152	-	100	83.495	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015023647	syf2	100	81.513	ENSSMAG00000009867	syf2	100	81.513	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015023647	syf2	92	88.584	ENSSDUG00000013072	syf2	100	83.613	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015023647	syf2	92	88.584	ENSSLDG00000012677	syf2	100	83.613	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015023647	syf2	100	61.633	ENSSARG00000012889	SYF2	100	61.633	Sorex_araneus
ENSSFOG00015023647	syf2	95	81.778	ENSSPUG00000005251	SYF2	89	81.778	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015023647	syf2	93	86.425	ENSSPAG00000009626	syf2	93	86.425	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015023647	syf2	94	83.408	ENSSSCG00000037481	SYF2	91	83.408	Sus_scrofa
ENSSFOG00015023647	syf2	63	54.967	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	54.857	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015023647	syf2	100	79.167	ENSTRUG00000001499	syf2	89	83.710	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015023647	syf2	93	84.615	ENSTNIG00000016912	syf2	99	84.615	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015023647	syf2	100	60.494	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	60.494	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.259	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	77.049	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015023647	syf2	95	82.222	ENSUAMG00000002897	SYF2	91	82.222	Ursus_americanus
ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.259	ENSUMAG00000013108	SYF2	91	81.778	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015023647	syf2	92	83.945	ENSVPAG00000005705	SYF2	89	83.945	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.722	ENSVVUG00000027175	-	100	77.236	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015023647	syf2	86	83.415	ENSVVUG00000027181	-	100	75.806	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015023647	syf2	99	76.695	ENSXETG00000022797	syf2	95	76.695	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015023647	syf2	91	86.047	ENSXMAG00000022698	syf2	99	81.013	Xiphophorus_maculatus