EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000000671 (Gene tree)
Gene ID: 100916418
Gene Symbol: SRP54
Alias: -
Full Name: signal recognition particle 54
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19067 bases
Position: chrGL834565.1:2689-21755
Accession: 11301
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000000752	SRP54	PF00448.22	4.5e-47	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000000762	SRP54-201	1032	-	ENSSHAP00000000752	343 (aa)	-	G3VC48

Gene Model

Click here to download ENSSHAG00000000671's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSHAG00000000671's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSG00000100883	SRP54	78	100.000	Homo_sapiens
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.752	ENSAPOG00000011314	srp54	68	94.752	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSAMEG00000015544	SRP54	68	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000000671	SRP54	84	92.708	ENSACIG00000022831	srp54	62	92.708	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.752	ENSAOCG00000019401	srp54	68	94.752	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.752	ENSAPEG00000001977	srp54	72	94.752	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.335	ENSATEG00000013877	srp54	68	95.335	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000000671	SRP54	91	99.042	ENSAPLG00000010125	SRP54	63	99.042	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	98.834	ENSACAG00000002103	-	68	98.834	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.125	ENSACAG00000010631	-	79	99.125	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000000671	SRP54	95	81.873	ENSACAG00000001124	-	100	81.873	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSANAG00000022133	SRP54	68	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSACLG00000015866	srp54	68	95.044	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSAMXG00000032669	SRP54	68	95.044	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSBTAG00000019085	SRP54	68	100.000	Bos_taurus
ENSSHAG00000000671	SRP54	97	70.030	WBGene00009012	F21D5.7	68	70.030	Caenorhabditis_elegans
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSCJAG00000006581	SRP54	75	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSCAFG00000013331	SRP54	68	100.000	Canis_familiaris
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSCAFG00020023427	SRP54	68	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSCHIG00000026345	SRP54	68	100.000	Capra_hircus
ENSSHAG00000000671	SRP54	92	87.066	ENSTSYG00000035333	-	61	87.066	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSTSYG00000002680	-	75	100.000	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000000671	SRP54	91	67.378	ENSCAPG00000008780	SRP54	68	67.378	Cavia_aperea
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSCPOG00000003691	SRP54	68	100.000	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSCCAG00000024179	SRP54	82	100.000	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSCATG00000034083	SRP54	75	100.000	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSCLAG00000015076	SRP54	68	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSCSAG00000015575	SRP54	68	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000000671	SRP54	82	93.929	ENSCHOG00000008986	SRP54	58	93.929	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.417	ENSCPBG00000026195	SRP54	68	99.417	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	78.717	ENSCING00000007380	-	68	78.717	Ciona_intestinalis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSCANG00000028532	SRP54	75	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.417	ENSCGRG00001009525	-	68	99.417	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000000671	SRP54	65	99.107	ENSCGRG00000009453	-	51	99.107	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	93.878	ENSCSEG00000012392	srp54	68	93.878	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.752	ENSCVAG00000010395	srp54	68	94.752	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.627	ENSDARG00000098367	srp54	68	95.627	Danio_rerio
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSDNOG00000032525	SRP54	68	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000000671	SRP54	83	87.456	ENSDORG00000005159	-	63	87.456	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000000671	SRP54	94	76.235	FBgn0010747	Srp54k	66	75.668	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.417	ENSETEG00000016307	-	68	99.417	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000000671	SRP54	99	59.942	ENSETEG00000012102	-	85	59.942	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	86.589	ENSEBUG00000009437	-	68	86.589	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSEASG00005002057	SRP54	68	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000000671	SRP54	98	99.703	ENSECAG00000018042	SRP54	66	99.703	Equus_caballus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	84.840	ENSEEUG00000001511	SRP54	68	84.840	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.169	ENSELUG00000003395	srp54	68	94.169	Esox_lucius
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.708	ENSFCAG00000032033	SRP54	68	99.708	Felis_catus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.125	ENSFALG00000005995	SRP54	68	99.125	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSFDAG00000016767	SRP54	68	100.000	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.461	ENSFHEG00000004263	srp54	68	94.461	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	87.464	ENSGMOG00000011391	srp54	72	87.464	Gadus_morhua
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.125	ENSGALG00000023135	SRP54	68	99.125	Gallus_gallus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSGAFG00000011586	srp54	68	95.044	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.461	ENSGACG00000004181	srp54	68	94.461	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.417	ENSGAGG00000014766	SRP54	68	99.417	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSGGOG00000002926	SRP54	75	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSHBUG00000005678	srp54	68	95.044	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSHGLG00000002850	SRP54	68	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	69.096	ENSHGLG00100007281	-	67	69.096	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSHGLG00100005263	SRP54	68	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	93.294	ENSHCOG00000021127	srp54	68	93.294	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSIPUG00000001420	srp54	68	95.044	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSSTOG00000016023	SRP54	68	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	92.420	ENSJJAG00000013417	-	66	92.420	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	80.466	ENSJJAG00000016404	-	81	80.466	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.461	ENSKMAG00000007707	srp54	68	94.461	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.752	ENSLBEG00000021122	srp54	68	94.752	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.752	ENSLBEG00000018690	srp54	68	94.752	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.335	ENSLACG00000017890	SRP54	68	95.335	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	96.210	ENSLOCG00000009440	srp54	68	96.210	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSLAFG00000012007	SRP54	68	100.000	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSMFAG00000044371	SRP54	75	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSMMUG00000015073	FAM177A1	75	100.000	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSMNEG00000006947	SRP54	75	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSMLEG00000042251	SRP54	75	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSMAMG00000004803	srp54	68	95.044	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSMZEG00005027528	srp54	68	95.044	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.125	ENSMGAG00000012481	SRP54	68	99.125	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.708	ENSMAUG00000014447	-	68	99.708	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSMICG00000010270	SRP54	68	100.000	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.708	ENSMOCG00000000948	-	78	99.708	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000000671	SRP54	83	93.706	ENSMMOG00000020303	srp54	62	93.706	Mola_mola
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSMODG00000012925	-	68	100.000	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSMODG00000023150	-	68	100.000	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000000671	SRP54	84	93.031	ENSMALG00000009163	srp54	63	93.031	Monopterus_albus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.708	MGP_CAROLIEiJ_G0017754	-	68	99.708	Mus_caroli
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.708	ENSMUSG00000073079	Srp54a	68	99.708	Mus_musculus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.708	ENSMUSG00000112449	Srp54b	68	99.708	Mus_musculus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	98.542	ENSMUSG00000079108	Srp54c	68	98.542	Mus_musculus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.708	MGP_PahariEiJ_G0029510	-	68	99.708	Mus_pahari
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSMPUG00000016302	SRP54	68	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.125	ENSMLUG00000008958	SRP54	68	99.125	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000000671	SRP54	85	100.000	ENSNGAG00000019806	-	64	100.000	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSNBRG00000006000	srp54	78	95.044	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSNLEG00000003496	SRP54	75	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000000671	SRP54	82	100.000	ENSMEUG00000000138	-	63	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSODEG00000004865	SRP54	68	100.000	Octodon_degus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSONIG00000011768	srp54	68	95.044	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSOANG00000014051	SRP54	68	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.125	ENSOCUG00000007838	SRP54	68	99.125	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSORLG00000010027	srp54	68	95.044	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSORLG00020001878	srp54	68	95.044	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSORLG00015021866	srp54	68	95.044	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.752	ENSOMEG00000020952	srp54	68	94.752	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSOGAG00000012188	SRP54	68	100.000	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSOARG00000007160	SRP54	68	100.000	Ovis_aries
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSPPAG00000017434	SRP54	75	100.000	Pan_paniscus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	98.251	ENSPPRG00000014047	SRP54	75	98.251	Panthera_pardus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.708	ENSPTIG00000000744	SRP54	65	99.708	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSPTRG00000006259	FAM177A1	75	100.000	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSPANG00000023853	SRP54	75	100.000	Papio_anubis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSPKIG00000001953	srp54	68	95.044	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.125	ENSPSIG00000006476	SRP54	68	99.125	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000000671	SRP54	87	90.635	ENSPMGG00000004127	srp54	65	90.635	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	80.758	ENSPEMG00000019634	-	66	80.758	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	87.755	ENSPMAG00000006078	-	68	87.755	Petromyzon_marinus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSPCIG00000016175	SRP54	68	100.000	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSPFOG00000008870	srp54	68	95.044	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSPLAG00000009889	srp54	68	95.044	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSPMEG00000008601	srp54	68	95.044	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSPREG00000004505	srp54	68	95.044	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSPPYG00000005739	SRP54	68	100.000	Pongo_abelii
ENSSHAG00000000671	SRP54	94	100.000	ENSPCAG00000006268	SRP54	64	100.000	Procavia_capensis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSPCOG00000022473	SRP54	69	100.000	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000000671	SRP54	65	100.000	ENSPVAG00000010056	SRP54	58	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSPNYG00000009717	srp54	68	95.044	Pundamilia_nyererei
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.335	ENSPNAG00000008544	srp54	68	95.335	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.708	ENSRNOG00000032776	Srp54a	68	99.708	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSRROG00000041292	SRP54	75	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSSHAG00000000671	SRP54	79	51.838	YPR088C	SRP54	64	45.042	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSSBOG00000035145	SRP54	72	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.918	ENSSFOG00015013920	srp54	68	95.918	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	86.863	ENSSMAG00000002441	srp54	70	86.863	Scophthalmus_maximus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.461	ENSSDUG00000018586	srp54	68	94.461	Seriola_dumerili
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.169	ENSSLDG00000010476	srp54	68	94.169	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSSARG00000002744	SRP54	68	100.000	Sorex_araneus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	99.417	ENSSPUG00000013101	SRP54	68	99.417	Sphenodon_punctatus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	94.752	ENSSPAG00000002354	srp54	68	94.752	Stegastes_partitus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSSSCG00000001955	SRP54	68	100.000	Sus_scrofa
ENSSHAG00000000671	SRP54	91	99.042	ENSTGUG00000011945	-	63	99.042	Taeniopygia_guttata
ENSSHAG00000000671	SRP54	50	99.422	ENSTGUG00000013777	-	100	99.422	Taeniopygia_guttata
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	93.878	ENSTRUG00000007057	srp54	68	93.878	Takifugu_rubripes
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	93.294	ENSTNIG00000002589	srp54	68	93.294	Tetraodon_nigroviridis
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	89.213	ENSTBEG00000011409	SRP54	77	89.213	Tupaia_belangeri
ENSSHAG00000000671	SRP54	85	100.000	ENSTTRG00000000928	SRP54	58	100.000	Tursiops_truncatus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSUMAG00000011234	SRP54	68	100.000	Ursus_maritimus
ENSSHAG00000000671	SRP54	91	99.681	ENSVPAG00000005668	SRP54	66	99.681	Vicugna_pacos
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	ENSVVUG00000019962	SRP54	68	100.000	Vulpes_vulpes
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	74.855	ENSXETG00000012290	srp54	69	74.929	Xenopus_tropicalis
ENSSHAG00000000671	SRP54	82	94.681	ENSXCOG00000004658	srp54	61	94.681	Xiphophorus_couchianus
ENSSHAG00000000671	SRP54	100	95.044	ENSXMAG00000018315	srp54	68	95.044	Xiphophorus_maculatus