EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000002619 (Gene tree)
Gene ID: 100917370
Gene Symbol: IPO4
Alias: FLJ23338|Imp4
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16932 bases
Position: chrGL834498.1:37187-54118
Accession: 100917370
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000002959	IBN_N	PF03810.19	2.1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000002992	IPO4-201	3366	XM_012545044	ENSSHAP00000002959	1121 (aa)	XP_012400498	G3VIF5

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000002619	IPO4	95	73.758	ENSG00000196497	IPO4	99	73.383	Homo_sapiens
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.158	ENSAPOG00000019018	ipo4	99	44.158	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000002619	IPO4	100	69.492	ENSAMEG00000016271	IPO4	88	69.313	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.556	ENSACIG00000004246	ipo4	99	44.638	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	45.188	ENSAOCG00000004773	ipo4	99	45.280	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	45.005	ENSAPEG00000002112	ipo4	99	45.096	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000002619	IPO4	89	46.177	ENSATEG00000017082	ipo4	99	46.475	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000002619	IPO4	83	52.311	ENSACAG00000003973	-	99	52.854	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000002619	IPO4	95	72.233	ENSANAG00000037973	IPO4	99	71.970	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	43.974	ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.535	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.608	ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.793	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	73.247	ENSBTAG00000002707	IPO4	100	73.339	Bos_taurus
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	72.248	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	72.155	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	74.054	ENSCAFG00000012049	IPO4	100	74.054	Canis_familiaris
ENSSHAG00000002619	IPO4	95	73.433	ENSCAFG00020002873	IPO4	100	71.671	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	72.551	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	72.643	Capra_hircus
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	72.878	ENSTSYG00000002643	IPO4	100	72.878	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	71.745	ENSCPOG00000014783	IPO4	100	71.653	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	72.803	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	72.710	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	73.937	ENSCATG00000040395	IPO4	99	73.845	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	72.392	ENSCLAG00000012817	IPO4	100	72.299	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000002619	IPO4	88	52.280	ENSCPBG00000025757	IPO4	94	52.284	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000002619	IPO4	89	35.798	ENSCING00000008639	-	99	35.630	Ciona_intestinalis
ENSSHAG00000002619	IPO4	87	34.940	ENSCSAVG00000011482	-	96	34.940	Ciona_savignyi
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	73.383	ENSCANG00000029513	IPO4	99	73.475	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	69.557	ENSCGRG00001001217	Ipo4	100	69.649	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	69.465	ENSCGRG00000014404	Ipo4	100	69.557	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.118	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	43.934	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000002619	IPO4	95	43.566	ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.573	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	46.961	ENSDARG00000041493	ipo4	99	46.869	Danio_rerio
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	72.761	ENSDNOG00000000366	IPO4	100	72.576	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	72.576	ENSDORG00000009274	Ipo4	100	72.484	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	70.849	ENSETEG00000018381	IPO4	99	70.849	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000002619	IPO4	88	75.483	ENSEASG00005011954	IPO4	96	75.381	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	74.515	ENSECAG00000009909	IPO4	100	74.515	Equus_caballus
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	46.789	ENSELUG00000020628	ipo4	99	46.514	Esox_lucius
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	75.069	ENSFCAG00000005587	IPO4	100	74.792	Felis_catus
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	66.421	ENSFDAG00000000725	IPO4	100	65.461	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	38.178	ENSFHEG00000009351	ipo4	99	38.270	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	46.366	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.041	Gadus_morhua
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.973	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	45.147	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	46.465	ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.458	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	73.567	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	73.475	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.526	ENSHBUG00000023269	ipo4	99	44.526	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	71.283	ENSHGLG00000002923	IPO4	100	71.191	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	70.914	ENSHGLG00100003725	IPO4	100	70.822	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	43.671	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.336	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	45.814	ENSIPUG00000001185	ipo4	99	45.991	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	72.946	ENSSTOG00000002288	IPO4	100	72.853	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	71.613	ENSJJAG00000019002	Ipo4	100	71.705	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.862	ENSKMAG00000004627	ipo4	99	44.862	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	46.090	ENSLBEG00000024952	ipo4	99	46.041	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	47.684	ENSLACG00000001428	IPO4	99	47.383	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000002619	IPO4	74	47.188	ENSLOCG00000001149	ipo4	83	46.699	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	71.258	ENSLAFG00000015852	IPO4	100	71.099	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	73.752	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	73.660	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	73.752	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	73.660	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	73.752	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	73.660	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	73.752	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	73.660	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	46.090	ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.906	Mastacembelus_armatus
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ENSSHAG00000002619	IPO4	97	69.621	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	99	70.711	Mus_pahari
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	69.742	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	71.359	Mus_spretus
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ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.894	ENSONIG00000014574	ipo4	99	44.802	Oreochromis_niloticus
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ENSSHAG00000002619	IPO4	95	44.754	ENSOMEG00000016203	ipo4	99	45.087	Oryzias_melastigma
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ENSSHAG00000002619	IPO4	96	47.842	ENSPKIG00000007830	ipo4	99	47.567	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	45.438	ENSPKIG00000007683	-	99	45.170	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	43.538	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	43.566	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000002619	IPO4	97	68.883	ENSPEMG00000016160	Ipo4	100	68.698	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000002619	IPO4	92	89.474	ENSPCIG00000010718	IPO4	98	89.474	Phascolarctos_cinereus
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ENSSHAG00000002619	IPO4	97	72.761	ENSPCOG00000015319	IPO4	100	72.669	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000002619	IPO4	96	73.636	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	73.636	Pteropus_vampyrus
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ENSSHAG00000002619	IPO4	96	46.175	ENSPNAG00000027964	ipo4	99	46.452	Pygocentrus_nattereri
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