EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000003597 (Gene tree)
Gene ID: 100923829
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 41104 bases
Position: chrGL834730.1:68384-109487
Accession: 9758
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000004080	MMR_HSR1	PF01926.23	1.2e-05	1	1
ENSSHAP00000004079	MMR_HSR1	PF01926.23	1.5e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000004121	RAB1A-202	621	-	ENSSHAP00000004080	206 (aa)	-	G3VLM5
ENSSHAT00000004120	RAB1A-201	999	-	ENSSHAP00000004079	221 (aa)	-	G3VLM4

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr05134	Legionellosis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000003597	RAB1A	75	38.994	ENSSHAG00000012788	RAB9B	83	37.349
ENSSHAG00000003597	RAB1A	83	34.682	ENSSHAG00000004318	-	86	35.429
ENSSHAG00000003597	RAB1A	94	46.154	ENSSHAG00000007613	RAB18	93	46.154
ENSSHAG00000003597	RAB1A	79	31.395	ENSSHAG00000016468	RASL11A	76	31.522
ENSSHAG00000003597	RAB1A	94	43.590	ENSSHAG00000006787	RAB5A	90	43.590
ENSSHAG00000003597	RAB1A	94	38.974	ENSSHAG00000006085	RAB31	97	38.974
ENSSHAG00000003597	RAB1A	77	39.264	ENSSHAG00000016787	RAB7A	79	39.264
ENSSHAG00000003597	RAB1A	80	35.329	ENSSHAG00000009032	MRAS	80	35.329
ENSSHAG00000003597	RAB1A	58	33.884	ENSSHAG00000016060	RRAS2	69	33.884
ENSSHAG00000003597	RAB1A	83	48.276	ENSSHAG00000006816	-	80	48.276
ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	90.909	ENSSHAG00000010376	-	98	91.414
ENSSHAG00000003597	RAB1A	80	49.701	ENSSHAG00000018081	RAB30	81	49.701
ENSSHAG00000003597	RAB1A	95	45.673	ENSSHAG00000013149	-	98	45.673
ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	47.500	ENSSHAG00000007153	RAB3D	88	47.500
ENSSHAG00000003597	RAB1A	80	59.146	ENSSHAG00000011866	-	81	59.146
ENSSHAG00000003597	RAB1A	80	32.727	ENSSHAG00000001457	-	85	32.727
ENSSHAG00000003597	RAB1A	57	33.058	ENSSHAG00000003390	-	61	33.058
ENSSHAG00000003597	RAB1A	94	38.144	ENSSHAG00000016302	RAB22A	97	38.144
ENSSHAG00000003597	RAB1A	81	33.520	ENSSHAG00000017856	-	86	33.520
ENSSHAG00000003597	RAB1A	80	37.576	ENSSHAG00000006631	KRAS	96	35.233
ENSSHAG00000003597	RAB1A	97	43.333	ENSSHAG00000017800	RAB14	100	41.860
ENSSHAG00000003597	RAB1A	78	51.250	ENSSHAG00000013263	RAB15	75	51.250
ENSSHAG00000003597	RAB1A	90	35.638	ENSSHAG00000009306	RAB17	89	36.269
ENSSHAG00000003597	RAB1A	78	38.509	ENSSHAG00000006833	-	97	38.509
ENSSHAG00000003597	RAB1A	95	45.098	ENSSHAG00000006622	RAB11A	94	45.098
ENSSHAG00000003597	RAB1A	74	33.333	ENSSHAG00000006379	RAB23	69	33.333
ENSSHAG00000003597	RAB1A	69	30.323	ENSSHAG00000018738	ARL3	77	30.323
ENSSHAG00000003597	RAB1A	94	43.878	ENSSHAG00000007727	RAB5B	94	42.718
ENSSHAG00000003597	RAB1A	56	32.773	ENSSHAG00000016852	ARL14	59	32.773
ENSSHAG00000003597	RAB1A	83	46.243	ENSSHAG00000013327	RAB25	80	46.243
ENSSHAG00000003597	RAB1A	94	43.590	ENSSHAG00000005267	-	89	43.590
ENSSHAG00000003597	RAB1A	94	39.303	ENSSHAG00000008520	-	90	39.303
ENSSHAG00000003597	RAB1A	79	33.333	ENSSHAG00000000471	-	94	33.333
ENSSHAG00000003597	RAB1A	82	50.296	ENSSHAG00000001489	RAB12	77	50.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSG00000138069	RAB1A	97	99.083	Homo_sapiens
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	94.527	ENSAPOG00000008143	-	98	95.939	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSAMEG00000001127	RAB1A	98	99.497	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	94.527	ENSAOCG00000020606	-	99	95.939	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	94.527	ENSAPEG00000022488	-	98	95.939	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSANAG00000020929	RAB1A	98	98.010	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	95.025	ENSACLG00000003326	-	98	96.447	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	93.035	ENSAMXG00000034850	-	98	94.416	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	99.492	Bos_taurus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	99.492	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSCAFG00000003187	RAB1A	98	98.010	Canis_familiaris
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSCAFG00020026971	RAB1A	98	98.010	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000003597	RAB1A	97	98.500	ENSCHIG00000014060	RAB1A	99	98.030	Capra_hircus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	99.492	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	99.492	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSCPOG00000015437	RAB1A	98	98.010	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSCCAG00000021869	RAB1A	97	99.492	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSCATG00000030853	RAB1A	97	99.492	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000003597	RAB1A	99	97.044	ENSCLAG00000014766	RAB1A	98	98.010	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.507	ENSCPBG00000013243	RAB1A	98	98.507	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	95.522	ENSCANG00000035916	RAB1A	99	96.954	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSCGRG00001012691	-	97	99.492	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSCGRG00000008456	-	97	99.492	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSDNOG00000018236	RAB1A	98	98.010	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSDORG00000028628	-	98	98.010	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	83.168	FBgn0285937	Rab1	98	83.168	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSETEG00000002205	RAB1A	98	99.492	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSEASG00005007298	RAB1A	98	98.010	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSECAG00000009926	RAB1A	98	98.010	Equus_caballus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSEEUG00000011721	RAB1A	98	99.492	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	94.089	ENSELUG00000012166	RAB1A	95	94.089	Esox_lucius
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSFCAG00000002536	RAB1A	98	98.010	Felis_catus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	99.495	ENSFALG00000013624	RAB1A	97	100.000	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSFDAG00000019505	-	98	98.010	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	93.532	ENSFHEG00000014414	-	98	94.924	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.507	ENSGALG00000031582	RAB1A	98	98.507	Gallus_gallus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	93.532	ENSGAFG00000000918	-	98	94.924	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.507	ENSGAGG00000006802	RAB1A	98	98.507	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSGGOG00000026603	RAB1A	99	99.492	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSHGLG00000013585	RAB1A	97	99.492	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	98.990	ENSHGLG00100007994	RAB1A	97	99.492	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSSTOG00000020693	-	99	98.995	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	99.492	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	99.492	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	94.030	ENSLBEG00000028426	RAB1A	98	95.431	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	97.015	ENSLACG00000012869	RAB1A	98	97.015	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSLAFG00000016666	RAB1A	98	98.010	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSMFAG00000046246	RAB1A	98	98.010	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	98.990	ENSMMUG00000021721	RAB1A	92	99.497	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000003597	RAB1A	92	97.895	ENSMNEG00000028414	-	95	97.895	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSMLEG00000042535	RAB1A	97	99.492	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	95.025	ENSMZEG00005013959	-	98	96.447	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	99.495	ENSMGAG00000004611	RAB1A	99	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	97.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	97	98.985	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSMICG00000012587	RAB1A	98	98.010	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	97.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	99	98.000	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	92.537	ENSMMOG00000018709	RAB1A	99	92.537	Mola_mola
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.507	ENSMODG00000003340	RAB1A	98	98.507	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	98	98.010	Mus_caroli
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSMUSG00000020149	Rab1a	98	99.492	Mus_musculus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	98	98.010	Mus_pahari
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	98	99.492	Mus_spretus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSMPUG00000006139	RAB1A	80	98.010	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSMLUG00000009489	RAB1A	98	98.010	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSNGAG00000005838	Rab1a	98	98.010	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	95.025	ENSNBRG00000020492	-	98	96.447	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	99.492	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000003597	RAB1A	93	99.479	ENSODEG00000011248	-	96	99.479	Octodon_degus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	93.035	ENSONIG00000006819	-	99	93.035	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.507	ENSOANG00000012438	RAB1A	98	98.507	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSOCUG00000017003	RAB1A	98	98.010	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSOGAG00000026181	RAB1A	98	98.010	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	98.990	ENSOARG00000019997	RAB1A	98	99.497	Ovis_aries
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSPPAG00000030253	RAB1A	99	98.500	Pan_paniscus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSPPRG00000025077	RAB1A	98	98.010	Panthera_pardus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	96	98.990	ENSPTIG00000013471	RAB1A	98	99.497	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSPTRG00000011989	RAB1A	99	98.500	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSPANG00000010485	RAB1A	97	99.492	Papio_anubis
ENSSHAG00000003597	RAB1A	99	97.549	ENSPSIG00000008028	RAB1A	97	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	95.025	ENSPMGG00000021015	-	98	95.025	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	ENSPEMG00000009340	Rab1a	97	99.492	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.507	ENSPCIG00000023212	RAB1A	98	98.507	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	93.035	ENSPFOG00000000498	-	97	93.035	Poecilia_formosa
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