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Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000005042 (Gene tree)
Gene ID: 100934328
Gene Symbol: REXO5
Alias: NEF-sp
Full Name: RNA exonuclease 5
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 31238 bases
Position: chrGL841495.1:136086-167323
Accession: 100934328
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000005781	RRM_1	PF00076.22	2.7e-14	1	1
ENSSHAP00000005780	RRM_1	PF00076.22	2.8e-14	1	1
ENSSHAP00000005781	RNase_T	PF00929.24	8.1e-09	1	1
ENSSHAP00000005780	RNase_T	PF00929.24	9.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000005834	REXO5-201	4785	-	ENSSHAP00000005780	794 (aa)	XP_012398207	G3VRH5
ENSSHAT00000005835	REXO5-202	4746	-	ENSSHAP00000005781	785 (aa)	-	G3VRH6

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.963	ENSG00000005189	REXO5	100	75.524	Homo_sapiens
ENSSHAG00000005042	REXO5	91	37.435	ENSAPOG00000008514	REXO5	91	37.435	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000005042	REXO5	99	58.065	ENSAMEG00000006178	REXO5	98	58.065	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000005042	REXO5	91	38.095	ENSAPEG00000010627	REXO5	91	38.095	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000005042	REXO5	72	40.140	ENSATEG00000004682	REXO5	95	41.082	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000005042	REXO5	94	51.788	ENSAPLG00000015740	REXO5	99	51.788	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000005042	REXO5	94	46.338	ENSACAG00000009744	REXO5	94	46.338	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	55.714	ENSANAG00000034379	REXO5	98	55.714	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000005042	REXO5	76	35.933	ENSACLG00000004778	REXO5	99	35.933	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000005042	REXO5	99	56.314	ENSBTAG00000006449	REXO5	97	56.314	Bos_taurus
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	55.802	ENSCJAG00000009363	REXO5	97	55.802	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	57.236	ENSCAFG00000017924	REXO5	99	57.123	Canis_familiaris
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	55.802	ENSCAFG00020021846	REXO5	97	55.802	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000005042	REXO5	99	57.290	ENSCHIG00000022443	REXO5	98	57.290	Capra_hircus
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	53.169	ENSCPOG00000008940	REXO5	92	55.762	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	56.789	ENSCCAG00000034936	REXO5	97	56.789	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.963	ENSCATG00000044063	REXO5	97	57.963	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000005042	REXO5	99	54.311	ENSCLAG00000008033	REXO5	93	54.311	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.963	ENSCSAG00000007562	REXO5	97	57.963	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000005042	REXO5	69	64.935	ENSCHOG00000009146	-	72	64.935	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000005042	REXO5	94	52.933	ENSCPBG00000019062	REXO5	94	52.933	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.702	ENSCANG00000035776	REXO5	97	57.702	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	53.737	ENSCGRG00001016179	-	99	53.737	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	53.816	ENSCGRG00000010868	-	99	53.816	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000005042	REXO5	68	34.429	ENSCSEG00000002060	-	99	34.602	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000005042	REXO5	93	57.945	ENSEASG00005007266	REXO5	98	62.832	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000005042	REXO5	99	56.830	ENSECAG00000018769	REXO5	88	56.830	Equus_caballus
ENSSHAG00000005042	REXO5	84	63.401	ENSEEUG00000003572	REXO5	88	63.401	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	56.901	ENSFCAG00000015160	REXO5	97	56.901	Felis_catus
ENSSHAG00000005042	REXO5	94	50.598	ENSFALG00000014026	REXO5	99	50.598	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	31.579	ENSFHEG00000013388	REXO5	99	32.169	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	50.191	ENSGALG00000002239	REXO5	99	50.191	Gallus_gallus
ENSSHAG00000005042	REXO5	91	33.627	ENSGAFG00000011045	REXO5	90	34.340	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000005042	REXO5	96	52.549	ENSGAGG00000008242	REXO5	95	52.549	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	58.094	ENSGGOG00000004539	REXO5	97	58.094	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000005042	REXO5	92	34.522	ENSHBUG00000017976	REXO5	92	35.188	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000005042	REXO5	86	52.655	ENSHGLG00000012652	REXO5	99	52.950	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	51.232	ENSHGLG00100013255	REXO5	99	56.044	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000005042	REXO5	64	38.039	ENSHCOG00000008648	REXO5	83	38.677	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000005042	REXO5	86	53.744	ENSSTOG00000007071	REXO5	95	55.303	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000005042	REXO5	93	53.689	ENSJJAG00000023821	-	94	53.689	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	33.692	ENSKMAG00000009488	REXO5	98	34.230	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000005042	REXO5	91	36.021	ENSLBEG00000009276	REXO5	92	36.541	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000005042	REXO5	77	45.746	ENSLACG00000001758	REXO5	100	45.746	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	57.588	ENSLAFG00000006157	REXO5	98	57.588	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.963	ENSMFAG00000036613	REXO5	97	57.963	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.963	ENSMMUG00000016748	REXO5	97	57.963	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.963	ENSMNEG00000045028	REXO5	97	57.963	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.963	ENSMLEG00000029851	REXO5	97	57.963	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000005042	REXO5	93	35.377	ENSMAMG00000006915	REXO5	90	35.504	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000005042	REXO5	92	34.140	ENSMZEG00005013657	REXO5	92	34.799	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000005042	REXO5	94	51.061	ENSMGAG00000010369	REXO5	99	51.061	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	56.977	ENSMICG00000014886	REXO5	98	56.977	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000005042	REXO5	59	55.365	ENSMOCG00000010062	-	98	56.763	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000005042	REXO5	100	85.342	ENSMODG00000007059	REXO5	95	85.342	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	51.232	MGP_CAROLIEiJ_G0030385	-	98	51.232	Mus_caroli
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	51.172	ENSMUSG00000030924	Rexo5	98	55.088	Mus_musculus
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	50.911	MGP_SPRETEiJ_G0031499	-	98	50.911	Mus_spretus
ENSSHAG00000005042	REXO5	99	57.935	ENSMPUG00000013643	REXO5	98	57.935	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000005042	REXO5	93	53.479	ENSNGAG00000002025	-	98	57.650	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000005042	REXO5	66	38.577	ENSNBRG00000006877	REXO5	82	38.577	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.833	ENSNLEG00000012334	REXO5	97	57.833	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000005042	REXO5	93	82.698	ENSMEUG00000015298	REXO5	99	82.698	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000005042	REXO5	87	53.191	ENSOPRG00000011398	REXO5	87	53.191	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000005042	REXO5	92	34.483	ENSONIG00000000148	REXO5	98	40.314	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000005042	REXO5	93	57.008	ENSOANG00000014291	REXO5	100	57.008	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	56.266	ENSOCUG00000009913	REXO5	96	56.266	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000005042	REXO5	91	36.939	ENSORLG00000009738	REXO5	92	36.939	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000005042	REXO5	91	36.828	ENSORLG00020010270	REXO5	92	36.828	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000005042	REXO5	91	37.022	ENSORLG00015009678	REXO5	92	37.022	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000005042	REXO5	92	36.714	ENSOMEG00000019491	REXO5	92	37.867	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	55.239	ENSOGAG00000011564	REXO5	98	55.239	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000005042	REXO5	99	56.977	ENSOARG00000013401	REXO5	99	56.830	Ovis_aries
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	58.094	ENSPPAG00000035005	REXO5	97	58.094	Pan_paniscus
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	55.614	ENSPPRG00000022345	REXO5	97	55.614	Panthera_pardus
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	56.792	ENSPTIG00000012096	REXO5	97	56.792	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	58.094	ENSPTRG00000007851	REXO5	97	58.094	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.833	ENSPANG00000006898	REXO5	97	57.833	Papio_anubis
ENSSHAG00000005042	REXO5	92	39.600	ENSPKIG00000014406	REXO5	94	40.325	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000005042	REXO5	94	52.870	ENSPSIG00000012172	REXO5	94	52.870	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000005042	REXO5	100	88.667	ENSPCIG00000029238	-	100	88.667	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	32.744	ENSPFOG00000012767	REXO5	98	32.536	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	32.627	ENSPLAG00000006408	REXO5	98	32.416	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	32.311	ENSPMEG00000007726	REXO5	98	32.775	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000005042	REXO5	95	33.574	ENSPREG00000000146	REXO5	96	33.782	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.963	ENSPPYG00000007163	REXO5	97	57.963	Pongo_abelii
ENSSHAG00000005042	REXO5	91	55.944	ENSPCAG00000006265	REXO5	100	55.944	Procavia_capensis
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	56.477	ENSPCOG00000018775	REXO5	98	56.477	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000005042	REXO5	93	56.421	ENSPVAG00000003293	REXO5	99	56.421	Pteropus_vampyrus
ENSSHAG00000005042	REXO5	73	37.801	ENSPNYG00000006922	REXO5	81	37.251	Pundamilia_nyererei
ENSSHAG00000005042	REXO5	90	39.124	ENSPNAG00000018866	-	91	39.124	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	51.675	ENSRNOG00000014513	Rexo5	99	51.675	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.572	ENSRBIG00000035163	REXO5	87	57.572	Rhinopithecus_bieti
ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.572	ENSRROG00000034741	REXO5	97	57.572	Rhinopithecus_roxellana
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	56.753	ENSSBOG00000029650	REXO5	98	57.051	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSHAG00000005042	REXO5	92	39.867	ENSSFOG00015007581	REXO5	93	40.736	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000005042	REXO5	91	36.126	ENSSMAG00000000709	REXO5	91	36.126	Scophthalmus_maximus
ENSSHAG00000005042	REXO5	91	35.631	ENSSDUG00000014528	REXO5	91	35.881	Seriola_dumerili
ENSSHAG00000005042	REXO5	91	35.156	ENSSLDG00000007641	REXO5	91	35.798	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	57.513	ENSSSCG00000007855	REXO5	98	57.560	Sus_scrofa
ENSSHAG00000005042	REXO5	94	50.866	ENSTGUG00000009219	REXO5	99	50.866	Taeniopygia_guttata
ENSSHAG00000005042	REXO5	92	36.294	ENSTRUG00000015295	-	90	37.124	Takifugu_rubripes
ENSSHAG00000005042	REXO5	88	55.615	ENSTBEG00000008797	REXO5	89	55.245	Tupaia_belangeri
ENSSHAG00000005042	REXO5	99	54.581	ENSTTRG00000016439	REXO5	98	54.710	Tursiops_truncatus
ENSSHAG00000005042	REXO5	87	55.865	ENSUAMG00000017756	REXO5	99	55.865	Ursus_americanus
ENSSHAG00000005042	REXO5	50	50.508	ENSUMAG00000010466	-	93	50.508	Ursus_maritimus
ENSSHAG00000005042	REXO5	99	52.129	ENSVPAG00000003459	REXO5	98	52.129	Vicugna_pacos
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	57.236	ENSVVUG00000023257	REXO5	97	57.236	Vulpes_vulpes
ENSSHAG00000005042	REXO5	93	45.528	ENSXETG00000016735	rexo5	98	45.528	Xenopus_tropicalis
ENSSHAG00000005042	REXO5	77	34.622	ENSXCOG00000015997	REXO5	72	34.622	Xiphophorus_couchianus
ENSSHAG00000005042	REXO5	98	32.660	ENSXMAG00000014770	REXO5	98	32.667	Xiphophorus_maculatus