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Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000006304 (Gene tree)
Gene ID: 100933932
Gene Symbol: POLR2H
Alias: RPB8
Full Name: RNA polymerase II subunit H
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6488 bases
Position: chrGL857020.1:219183-225670
Accession: 9195
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000007254	RNA_pol_Rpb8	PF03870.15	6.7e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000007316	POLR2H-201	1641	-	ENSSHAP00000007254	138 (aa)	-	G3VVP9

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr03020	RNA polymerase	KEGG
shr04623	Cytosolic DNA-sensing pathway	KEGG
shr05016	Huntington disease	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSG00000163882	POLR2H	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSAPOG00000023660	polr2h	84	96.825	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSAMEG00000017011	POLR2H	84	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000006304	POLR2H	83	94.737	ENSACIG00000013167	polr2h	100	94.737	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSAOCG00000003084	polr2h	84	96.825	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSAPEG00000002614	polr2h	84	96.825	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSATEG00000013227	polr2h	84	96.825	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	99.206	ENSACAG00000002828	POLR2H	84	99.206	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSANAG00000020244	POLR2H	84	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSACLG00000026253	polr2h	84	96.825	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.032	ENSAMXG00000001800	polr2h	84	96.032	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSBTAG00000040199	POLR2H	84	100.000	Bos_taurus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	61.905	WBGene00017830	rpb-8	84	61.905	Caenorhabditis_elegans
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSCJAG00000014959	POLR2H	84	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSCAFG00020002558	POLR2H	84	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSCHIG00000006695	POLR2H	84	100.000	Capra_hircus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSTSYG00000007705	-	84	100.000	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	94.444	ENSTSYG00000031691	-	69	94.444	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	90.551	ENSTSYG00000031988	-	84	90.551	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	99.206	ENSCPOG00000040303	POLR2H	84	99.206	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSCCAG00000035087	POLR2H	84	100.000	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSCATG00000045313	POLR2H	84	100.000	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	99.206	ENSCLAG00000013016	POLR2H	84	99.206	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSCSAG00000013724	POLR2H	67	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	63	100.000	ENSCHOG00000009216	POLR2H	78	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSCPBG00000001462	POLR2H	84	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	74.016	ENSCING00000011417	-	84	74.016	Ciona_intestinalis
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	73.228	ENSCSAVG00000006151	-	84	73.228	Ciona_savignyi
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSCANG00000023708	POLR2H	84	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSCGRG00001004900	Polr2h	84	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSCGRG00000014304	Polr2h	84	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	94.444	ENSCSEG00000015264	polr2h	84	94.444	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	97.619	ENSCVAG00000012410	polr2h	84	97.619	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	97.619	ENSDARG00000038505	polr2h	84	97.619	Danio_rerio
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSDNOG00000044402	POLR2H	84	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSDORG00000027475	Polr2h	84	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	76.190	FBgn0037121	Rpb8	84	76.190	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	85.714	ENSEBUG00000008233	POLR2H	77	85.714	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSEASG00005013088	POLR2H	84	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSECAG00000005828	POLR2H	84	100.000	Equus_caballus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.032	ENSELUG00000006347	polr2h	84	96.032	Esox_lucius
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSFCAG00000007797	POLR2H	84	100.000	Felis_catus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSFALG00000008177	POLR2H	84	100.000	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSFDAG00000008781	POLR2H	84	100.000	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	97.619	ENSFHEG00000017819	polr2h	84	97.619	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSGALG00000008534	POLR2H	84	100.000	Gallus_gallus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	97.619	ENSGAFG00000015424	polr2h	84	97.619	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	95.238	ENSGACG00000009019	polr2h	84	95.238	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSGAGG00000009016	POLR2H	84	100.000	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSGGOG00000002912	-	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSHBUG00000006685	polr2h	84	96.825	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSHGLG00000012488	POLR2H	84	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSHGLG00100009576	POLR2H	84	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.032	ENSHCOG00000010315	polr2h	84	96.032	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.032	ENSHCOG00000010338	polr2h	84	96.032	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	95.238	ENSIPUG00000024331	polr2h	84	95.238	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSSTOG00000008300	POLR2H	84	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSJJAG00000015574	Polr2h	84	100.000	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSKMAG00000008353	polr2h	84	96.825	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSLBEG00000018905	polr2h	84	96.825	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	97.619	ENSLACG00000015017	POLR2H	84	97.619	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000006304	POLR2H	64	96.591	ENSLOCG00000008946	polr2h	79	96.591	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSLAFG00000003573	POLR2H	84	100.000	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSMFAG00000038115	POLR2H	84	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSMMUG00000007524	POLR2H	84	100.000	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSMNEG00000037272	POLR2H	84	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSMLEG00000039827	POLR2H	84	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.032	ENSMAMG00000001923	polr2h	84	96.032	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSMZEG00005017494	polr2h	84	96.825	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSMAUG00000016338	Polr2h	84	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSMICG00000048991	-	84	100.000	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	98.413	ENSMICG00000027485	-	82	98.413	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	74	90.196	ENSMICG00000033578	-	78	90.196	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSMOCG00000004886	Polr2h	84	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSMMOG00000008575	polr2h	84	96.825	Mola_mola
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSMODG00000002570	POLR2H	84	100.000	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.032	ENSMALG00000015108	polr2h	84	96.032	Monopterus_albus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0020589	Polr2h	84	100.000	Mus_caroli
ENSSHAG00000006304	POLR2H	93	99.219	ENSMUSG00000021018	Polr2h	100	100.000	Mus_musculus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0021486	Polr2h	84	100.000	Mus_spretus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSMPUG00000002852	POLR2H	84	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSMLUG00000022295	POLR2H	84	100.000	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSNGAG00000023997	-	84	100.000	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000006304	POLR2H	86	80.508	ENSNGAG00000015806	-	83	80.508	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSNBRG00000001133	polr2h	84	96.825	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSNLEG00000029447	POLR2H	84	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000006304	POLR2H	65	100.000	ENSMEUG00000014141	-	100	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	99.206	ENSODEG00000013008	-	84	99.206	Octodon_degus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	99.206	ENSODEG00000020005	-	84	99.206	Octodon_degus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSONIG00000012493	polr2h	84	96.825	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSOANG00000010454	POLR2H	84	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSOCUG00000007078	POLR2H	84	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	95.238	ENSORLG00000023347	polr2h	84	95.238	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	95.238	ENSORLG00020017770	polr2h	84	95.238	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	95.238	ENSORLG00015013505	polr2h	84	95.238	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	95.238	ENSOMEG00000021100	polr2h	84	95.238	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSOGAG00000001599	POLR2H	84	100.000	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSOARG00000020584	POLR2H	84	100.000	Ovis_aries
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSPPAG00000035658	-	84	100.000	Pan_paniscus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSPPRG00000004001	POLR2H	84	100.000	Panthera_pardus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSPTIG00000010551	POLR2H	84	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSPTRG00000047600	-	64	100.000	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	100.000	ENSPANG00000020585	POLR2H	84	100.000	Papio_anubis
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSPKIG00000022836	polr2h	84	96.825	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000006304	POLR2H	83	100.000	ENSPSIG00000017108	POLR2H	100	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	96.825	ENSPMGG00000004693	polr2h	79	96.825	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	92.063	ENSPMAG00000008230	-	84	92.063	Petromyzon_marinus
ENSSHAG00000006304	POLR2H	91	97.619	ENSPFOG00000024200	polr2h	84	97.619	Poecilia_formosa
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