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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000006834 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 29571 bases
Position: chrGL841444.1:262004-291574
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000007874	RRM_1	PF00076.22	3.4e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000007937	MSI1-201	921	-	ENSSHAP00000007874	306 (aa)	-	G3VXG9

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	59.804	ENSSHAG00000008672	MSI2	100	62.581

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSG00000135097	MSI1	94	87.255	Homo_sapiens
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	76.144	ENSAPOG00000023458	-	94	76.144	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	ENSAPOG00000003191	MSI1	94	74.837	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	70.704	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	70.704	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000006834	MSI1	96	71.672	ENSACIG00000017754	-	64	90.110	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	ENSAOCG00000003804	MSI1	94	74.837	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	66.667	ENSAOCG00000009031	-	95	66.993	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	76.144	ENSAPEG00000006857	-	79	76.144	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	ENSAPEG00000003245	MSI1	94	74.837	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	75.817	ENSATEG00000017059	MSI1	95	75.817	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	71.661	ENSATEG00000023779	-	93	71.661	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	86.601	ENSACAG00000002762	MSI1	94	86.601	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSANAG00000027151	MSI1	94	87.255	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000006834	MSI1	79	80.579	ENSANAG00000027901	-	86	80.579	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	ENSACLG00000011230	MSI1	94	74.837	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	75.490	ENSACLG00000000117	-	100	75.490	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	ENSAMXG00000038960	msi1	76	74.837	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	87.255	Bos_taurus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSCJAG00000008578	MSI1	94	87.255	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	86.928	ENSCAFG00000010283	MSI1	94	86.928	Canis_familiaris
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSCAFG00020020585	MSI1	97	87.255	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	81.150	ENSCHIG00000024304	MSI1	95	81.150	Capra_hircus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	87.255	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000006834	MSI1	99	78.481	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	78.481	Cavia_aperea
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	87.255	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSCCAG00000035567	MSI1	94	87.255	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSCATG00000030019	MSI1	94	87.255	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	87.255	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000006834	MSI1	69	79.817	ENSCSAG00000002265	MSI1	89	79.817	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	84.641	ENSCPBG00000011349	MSI1	94	84.641	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSCANG00000040651	MSI1	99	87.255	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSCGRG00001018883	Msi1	94	87.255	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	87.255	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	73.856	ENSCSEG00000005834	-	94	73.856	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.510	ENSCSEG00000008352	-	94	74.510	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	67.647	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	67.647	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	76.144	ENSCVAG00000009100	MSI1	94	76.144	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000006834	MSI1	76	66.667	ENSCVAG00000017463	-	89	66.667	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	71.569	ENSDARG00000010710	msi1	100	70.870	Danio_rerio
ENSSHAG00000006834	MSI1	76	68.966	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	68.966	Danio_rerio
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	77.124	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	77.124	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSDORG00000005610	Msi1	93	87.255	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	82.680	ENSETEG00000004756	MSI1	99	82.680	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSEASG00005004736	MSI1	94	87.255	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSECAG00000017526	MSI1	94	87.255	Equus_caballus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	70.552	ENSELUG00000023219	MSI1	92	70.552	Esox_lucius
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	70.588	ENSELUG00000023280	-	100	69.935	Esox_lucius
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSFCAG00000011007	MSI1	94	87.255	Felis_catus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	84.967	ENSFALG00000007574	MSI1	97	84.967	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSFDAG00000019586	MSI1	99	87.255	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	ENSFHEG00000003560	-	94	74.837	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	76.471	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	76.471	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000006834	MSI1	90	72.826	ENSGMOG00000017838	-	75	72.826	Gadus_morhua
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	73.529	ENSGMOG00000001006	MSI1	94	72.876	Gadus_morhua
ENSSHAG00000006834	MSI1	99	77.711	ENSGALG00000007227	MSI1	93	77.711	Gallus_gallus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.183	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	74.183	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	57.980	ENSGAFG00000005860	-	89	57.980	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	70.915	ENSGACG00000008674	-	94	70.915	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	ENSGACG00000012679	MSI1	94	74.837	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	84.641	ENSGAGG00000016037	MSI1	94	84.641	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSGGOG00000010328	MSI1	96	87.255	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	ENSHBUG00000021921	MSI1	94	74.837	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	75.490	ENSHBUG00000011841	-	94	75.490	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSHGLG00000012782	MSI1	94	87.255	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSHGLG00100016848	MSI1	99	87.255	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.510	ENSHCOG00000012067	-	77	94.565	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	70.261	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	70.261	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	ENSIPUG00000001976	msi1	99	70.915	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSSTOG00000009799	MSI1	97	87.255	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	69.608	ENSJJAG00000010643	-	94	69.281	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSJJAG00000010463	Msi1	94	87.255	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	75.163	ENSKMAG00000011251	MSI1	94	75.163	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	71.242	ENSKMAG00000019877	-	100	71.242	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	75.490	ENSLBEG00000008789	MSI1	94	75.490	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	ENSLBEG00000001375	-	94	74.837	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	78.247	ENSLACG00000018287	MSI1	100	78.247	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	76.547	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	76.547	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	87.255	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSMMUG00000031527	MSI1	96	87.255	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSMNEG00000040034	MSI1	94	87.255	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSMLEG00000003921	MSI1	99	87.255	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.510	ENSMAMG00000018426	-	94	74.510	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	ENSMAMG00000002279	MSI1	94	74.837	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	75.490	ENSMZEG00005000340	-	94	75.490	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	ENSMZEG00005026892	MSI1	94	74.837	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000006834	MSI1	55	82.249	ENSMGAG00000016518	-	100	82.249	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000006834	MSI1	67	83.333	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	83.333	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSMICG00000033181	MSI1	94	87.255	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	86.928	ENSMOCG00000002286	Msi1	94	86.928	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	71.242	ENSMMOG00000012265	-	96	71.242	Mola_mola
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	65.359	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	65.359	Mola_mola
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	65.161	ENSMODG00000003189	-	100	65.161	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	73.856	ENSMALG00000001426	-	100	73.856	Monopterus_albus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	75.490	ENSMALG00000017889	MSI1	94	75.490	Monopterus_albus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	86.601	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	94	86.601	Mus_caroli
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	86.601	ENSMUSG00000054256	Msi1	99	83.660	Mus_musculus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	86.275	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	94	86.275	Mus_pahari
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	86.601	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	94	86.601	Mus_spretus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSMPUG00000003168	MSI1	97	87.255	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	79.677	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	79.677	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	87.255	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000006834	MSI1	85	65.769	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	65.769	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	75.490	ENSNBRG00000000841	-	94	75.490	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	76.144	ENSNLEG00000015636	MSI1	92	76.144	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000006834	MSI1	90	84.420	ENSMEUG00000015759	MSI1	83	84.420	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000006834	MSI1	96	78.840	ENSOPRG00000016879	MSI1	99	78.840	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSODEG00000006328	MSI1	99	87.255	Octodon_degus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	75.490	ENSONIG00000011182	MSI1	94	75.490	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	75.490	ENSONIG00000019452	-	94	75.490	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	87.255	ENSOCUG00000027716	MSI1	97	87.255	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.510	ENSORLG00000029593	MSI1	94	74.510	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	76.144	ENSORLG00000019978	-	94	76.144	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	76.144	ENSORLG00020001208	-	67	76.144	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.510	ENSORLG00020008266	MSI1	99	71.242	Oryzias_latipes_hni
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