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Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000007120 (Gene tree)
Gene ID: 100918257
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 61309 bases
Position: chrGL841183.1:287152-348460
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000008216	IBN_N	PF03810.19	1.6e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000008283	TNPO1-201	2630	-	ENSSHAP00000008216	864 (aa)	-	G3VYG1

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	86.512	ENSSHAG00000015858	TNPO2	100	86.628

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSG00000083312	TNPO1	100	98.964	Homo_sapiens
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	94.854	ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	94.854	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	96.904	ENSAMEG00000007147	TNPO1	96	96.904	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000007120	TNPO1	86	94.181	ENSACIG00000003711	tnpo1	95	94.181	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	94.971	ENSAOCG00000008154	tnpo1	96	94.971	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	94.971	ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	94.971	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	94.620	ENSATEG00000010408	tnpo1	96	94.620	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	94.713	ENSAPLG00000009619	-	97	94.713	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.338	ENSACAG00000009599	TNPO1	97	97.338	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.338	ENSANAG00000022453	-	96	97.338	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	64.360	ENSANAG00000027118	-	97	64.129	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	89.591	ENSANAG00000025351	-	95	89.591	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	92.398	ENSACLG00000027223	tnpo1	96	92.398	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.349	ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	92.999	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.917	ENSBTAG00000007979	TNPO1	96	97.917	Bos_taurus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.454	ENSCJAG00000016409	TNPO1	96	97.454	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	98.250	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	98.250	Canis_familiaris
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	94.907	ENSCAFG00020017397	TNPO1	97	94.907	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSCHIG00000023462	TNPO1	96	97.801	Capra_hircus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	96.959	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	96.959	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.338	ENSCCAG00000026472	TNPO1	97	97.338	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSCATG00000043792	TNPO1	97	97.801	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.338	ENSCLAG00000016191	TNPO1	97	97.338	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSCSAG00000015616	TNPO1	96	97.801	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	94	84.748	ENSCHOG00000001746	TNPO1	96	84.748	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	98.148	ENSCPBG00000000260	TNPO1	92	98.148	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	75.698	ENSCSAVG00000010981	-	96	75.698	Ciona_savignyi
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSCANG00000004353	TNPO1	96	97.801	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.454	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	96	97.454	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	98.129	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	98.129	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.567	ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	93.567	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.801	ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	93.801	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.224	ENSDARG00000035390	tnpo1	96	92.757	Danio_rerio
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	91.465	ENSDNOG00000006647	TNPO1	97	91.465	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	96	98.313	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	98.311	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000007120	TNPO1	96	59.784	FBgn0035693	CG8219	96	59.184	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000007120	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	86	99.625	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000007120	TNPO1	97	85.357	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.357	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSEASG00005018055	TNPO1	97	97.801	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.569	ENSECAG00000024424	TNPO1	96	97.569	Equus_caballus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	87.089	ENSELUG00000002821	tnpo1	96	86.863	Esox_lucius
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSFCAG00000013181	TNPO1	97	97.801	Felis_catus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSFALG00000010292	TNPO1	97	97.801	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.454	ENSFDAG00000013345	TNPO1	96	97.454	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	94.159	ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	94.159	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	90.443	ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	90.443	Gadus_morhua
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	96.875	ENSGALG00000015014	TNPO1	97	96.875	Gallus_gallus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	92.999	ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	92.999	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.801	ENSGACG00000015841	tnpo1	96	93.801	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.917	ENSGAGG00000013419	TNPO1	97	97.917	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	81.481	ENSGGOG00000022535	-	95	81.481	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSGGOG00000026800	TNPO1	97	97.801	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	94.152	ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	94.152	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.338	ENSHGLG00000000970	-	96	97.338	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	97.672	ENSHGLG00100017090	-	99	97.672	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	76.815	ENSHGLG00100000963	-	99	75.550	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.685	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	94	97.685	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	94.269	ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	94.269	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	89	90.979	ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	90.464	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	89.988	ENSLACG00000012199	TNPO1	99	89.988	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	96.725	ENSLOCG00000011092	tnpo1	93	96.725	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	98.481	ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	98.481	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSMFAG00000003636	TNPO1	96	97.801	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.685	ENSMMUG00000020923	TNPO1	97	97.685	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSMNEG00000044581	TNPO1	96	97.801	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSMLEG00000030740	TNPO1	96	97.801	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	94.620	ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	94.620	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.801	ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	93.801	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.454	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	96	97.454	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	93.634	ENSMICG00000008468	TNPO1	96	93.634	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.454	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	96	97.454	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000007120	TNPO1	86	94.062	ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	94.062	Mola_mola
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	98.511	ENSMODG00000001721	TNPO1	77	98.511	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.450	ENSMALG00000009782	tnpo1	96	93.450	Monopterus_albus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.454	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	97	97.454	Mus_caroli
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.454	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	97	97.454	Mus_musculus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.569	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	97	97.567	Mus_pahari
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.222	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	97	97.183	Mus_spretus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.685	ENSMPUG00000014387	TNPO1	96	97.685	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	97.788	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	97.788	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.454	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	97	97.454	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000007120	TNPO1	86	94.046	ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	94.046	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSNLEG00000004572	TNPO1	97	97.801	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000007120	TNPO1	91	91.207	ENSOPRG00000012390	TNPO1	87	91.207	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.106	ENSODEG00000001771	TNPO1	96	97.106	Octodon_degus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.380	ENSONIG00000011151	tnpo1	95	93.380	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	95	99.146	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	99.146	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	91.939	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.939	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	86	93.911	ENSORLG00000003182	tnpo1	95	93.911	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.801	ENSORLG00020011559	tnpo1	96	93.801	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	94.035	ENSORLG00015019113	tnpo1	96	94.035	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.918	ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	93.918	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSOGAG00000000808	TNPO1	96	97.801	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.917	ENSOARG00000005038	TNPO1	81	97.917	Ovis_aries
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSPPAG00000042518	TNPO1	96	97.801	Pan_paniscus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSPPRG00000022336	TNPO1	97	97.801	Panthera_pardus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSPTIG00000018839	TNPO1	97	97.801	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSPTRG00000016972	TNPO1	96	97.801	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000007120	TNPO1	94	85.222	ENSPTRG00000047731	-	97	84.792	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSPANG00000006074	TNPO1	96	97.801	Papio_anubis
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	91.111	ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	91.111	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.801	ENSPSIG00000014366	TNPO1	96	97.801	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	91.355	ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	91.121	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	98.129	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	98.129	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.823	ENSPFOG00000011447	tnpo1	96	93.823	Poecilia_formosa
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