EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000007884 (Gene tree)
Gene ID: 100926980
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 225781 bases
Position: chrGL841519.1:363449-589229
Accession: 100926980
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000009102	ResIII	PF04851.15	1.7e-08	1	1
ENSSHAP00000009101	ResIII	PF04851.15	1.7e-08	1	1
ENSSHAP00000009102	BRK	PF07533.16	1.1e-17	1	1
ENSSHAP00000009101	BRK	PF07533.16	1.2e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000009179	SMARCA2-202	6562	-	ENSSHAP00000009102	1569 (aa)	XP_012398378	G3W0Z7
ENSSHAT00000009178	SMARCA2-201	6643	-	ENSSHAP00000009101	1596 (aa)	-	G3W0Z6

Gene Model

Click here to download ENSSHAG00000007884's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr04714	Thermogenesis	KEGG
shr05225	Hepatocellular carcinoma	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSHAG00000007884's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	96	76.282	ENSSHAG00000001642	SMARCA4	98	76.560

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	93.702	ENSG00000080503	SMARCA2	99	99.441	Homo_sapiens
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	80.854	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.876	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	91	86.916	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	96.166	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	79.373	ENSACIG00000015607	SMARCA2	96	79.753	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	80.502	ENSAOCG00000009647	-	97	80.514	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	80.665	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	97	80.747	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	81.286	ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	81.693	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	98	85.171	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	90.870	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.420	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	92.357	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.077	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	91.846	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	80.603	ENSACLG00000004248	SMARCA2	96	81.143	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	82.405	ENSAMXG00000012404	smarca2	100	82.819	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.196	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	92.637	Bos_taurus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	93.464	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	93.464	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.516	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	92.893	Canis_familiaris
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	74	95.361	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	95.275	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.196	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	92.637	Capra_hircus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	89.949	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	90.780	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	88.176	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	100	88.302	Cavia_aperea
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	91.630	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	91.818	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.269	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	92.269	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	93.456	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	93.456	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.689	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	91.283	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	94	91.984	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	93.831	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	86	87.564	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	87.564	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	94.017	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	94.271	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	93.957	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	93.957	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	84.726	ENSCGRG00001002323	Smarca2	94	93.002	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	77.159	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	95	76.816	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	85	78.164	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	94	78.096	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	82.595	ENSDARG00000008904	smarca2	97	82.846	Danio_rerio
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	91.912	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	92.790	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	91.708	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	91.459	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	78	62.327	FBgn0000212	brm	90	54.756	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	87	62.527	ENSEBUG00000002449	-	95	64.488	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	94	70.733	ENSEBUG00000011442	-	97	68.668	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.264	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	92.642	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	67	97.222	ENSEEUG00000015540	-	69	97.222	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	92	81.973	ENSELUG00000010318	smarca2	95	80.720	Esox_lucius
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.264	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	93.575	Felis_catus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	94.017	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	94.791	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	91.249	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	96	95.100	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	80.535	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.612	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	98	77.592	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.763	Gadus_morhua
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	94.271	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	94.080	Gallus_gallus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	95	76.013	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	91	75.704	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	79.593	ENSGACG00000014488	SMARCA2	97	79.261	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	94.080	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	94.335	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	90	97.304	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	85.060	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	80.702	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.784	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	91.772	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	96	95.712	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.200	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	92.327	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	79	86.053	ENSHCOG00000015348	-	88	85.757	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	82.364	ENSIPUG00000011060	smarca2	97	81.730	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.035	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	91.848	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	91.765	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	91.516	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	79.503	ENSKMAG00000015844	-	98	79.554	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	50	76.060	ENSLACG00000000270	SMARCA2	99	75.948	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	98	85.147	ENSLOCG00000011499	smarca2	97	84.891	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	91.452	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	92.502	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	89.926	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	92.293	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	93.830	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	93.830	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	93.520	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	93.520	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	91.233	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	98.163	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	80.920	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.880	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	80.854	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	97	80.940	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	77	77.822	ENSMGAG00000005160	-	100	76.892	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	91.855	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	93.575	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	91.250	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	91.334	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	77.099	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	96	77.246	Mola_mola
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	98.726	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	98.726	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	79.897	ENSMALG00000009611	SMARCA2	95	78.810	Monopterus_albus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	90.347	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	90.397	Mus_caroli
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	90.341	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	99.441	Mus_musculus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	90.932	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	90.689	Mus_pahari
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	90.161	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	96	100.000	Mus_spretus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	80	96.097	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	96.097	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	88.616	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	88.917	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	90.068	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	89.820	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	95	68.833	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	96	96.991	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	96.991	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	88.287	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	88.287	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	88.071	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	88.194	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	89.782	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	90.343	Octodon_degus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	80.820	ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.861	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.970	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	92.970	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	79.674	ENSORLG00000020820	SMARCA2	96	79.301	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	79.687	ENSORLG00015006289	SMARCA2	97	79.196	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	80.424	ENSOMEG00000009736	-	97	79.974	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	91.006	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	91.006	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	91.509	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	91.562	Ovis_aries
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	95	97.354	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	97	96.364	Pan_paniscus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.327	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	93.639	Panthera_pardus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	93.710	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	93.710	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	85.919	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	86.089	Papio_anubis
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	83.577	ENSPKIG00000018469	-	100	81.882	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	93.710	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	94.028	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	98	73.977	ENSPMGG00000013696	-	97	74.238	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	90.100	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	90.286	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	98	71.570	ENSPMAG00000005337	-	95	71.909	Petromyzon_marinus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	98.854	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	98.854	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	80.375	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	79.734	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	80.138	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	94	79.860	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	80.063	ENSPMEG00000001815	-	97	79.607	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	79.926	ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.747	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	93.511	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	93.511	Pongo_abelii
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	79	79.298	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	79.298	Procavia_capensis
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	89.862	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	100	90.232	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	91	92.041	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	94	92.435	Pteropus_vampyrus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	78.058	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	96	78.193	Pundamilia_nyererei
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	83.887	ENSPNAG00000014635	smarca2	96	83.974	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	89.687	ENSRNOG00000011931	Smarca2	100	90.476	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	90.670	ENSRBIG00000038618	SMARCA2	98	98.265	Rhinopithecus_bieti
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	90.728	ENSRROG00000019271	SMARCA2	100	92.405	Rhinopithecus_roxellana
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	90.136	ENSSBOG00000034827	SMARCA2	100	92.739	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	91	83.871	ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	84.926	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	80.113	ENSSMAG00000013707	SMARCA2	98	78.513	Scophthalmus_maximus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	79.169	ENSSDUG00000008852	-	96	79.531	Seriola_dumerili
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	79.477	ENSSLDG00000025449	SMARCA2	95	77.849	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	95	90.230	ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	91.379	Sorex_araneus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	95	89.920	ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	90.254	Sphenodon_punctatus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	81.027	ENSSPAG00000020091	-	96	80.949	Stegastes_partitus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.259	ENSSSCG00000005232	SMARCA2	100	92.700	Sus_scrofa
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	92.807	ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	94.060	Taeniopygia_guttata
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	99	79.280	ENSTRUG00000015619	SMARCA2	96	80.013	Takifugu_rubripes
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	64	100.000	ENSTBEG00000008767	SMARCA2	69	100.000	Tupaia_belangeri
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	95	91.344	ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	92.369	Tursiops_truncatus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	89	92.066	ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	91.360	Ursus_americanus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	85	93.103	ENSVPAG00000001204	SMARCA2	95	93.103	Vicugna_pacos
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	74	95.193	ENSVVUG00000004598	SMARCA2	96	95.107	Vulpes_vulpes
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	84.201	ENSXETG00000015299	smarca2	100	84.577	Xenopus_tropicalis
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	85	83.815	ENSXCOG00000011073	SMARCA2	97	78.536	Xiphophorus_couchianus
ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	79.654	ENSXMAG00000015611	SMARCA2	99	80.143	Xiphophorus_maculatus