EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000008134 (Gene tree)
Gene ID: 100933322
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 33306 bases
Position: chrGL856830.1:388126-421431
Accession: 100933322
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000009401	GTP_EFTU	PF00009.27	2.2e-45	1	1
ENSSHAP00000009401	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	8.8e-13	1	1
ENSSHAP00000009401	EFG_IV	PF03764.18	1.8e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000009482	EFTUD2-201	3456	XM_003768407	ENSSHAP00000009401	938 (aa)	XP_003768455	G3W1U6

Gene Model

Click here to download ENSSHAG00000008134's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSHAG00000008134's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	80	31.420	ENSSHAG00000018863	EFL1	83	31.420
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	90	38.717	ENSSHAG00000007539	EEF2	99	38.717

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.574	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.913	ENSAPOG00000002433	eftud2	95	93.913	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.467	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	97	99.467	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	90.109	ENSACIG00000009096	eftud2	95	90.109	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	91	88.235	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.235	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.022	ENSAPEG00000003321	eftud2	95	94.022	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.239	ENSATEG00000000457	eftud2	95	94.239	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.902	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	95	94.908	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	97.974	ENSACAG00000007637	EFTUD2	97	97.974	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSANAG00000025320	EFTUD2	97	99.680	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.804	ENSACLG00000001296	eftud2	95	93.804	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.336	ENSAMXG00000000568	eftud2	94	94.342	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	97	99.147	Bos_taurus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	99	70.430	WBGene00001166	eftu-2	94	71.084	Caenorhabditis_elegans
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	97	99.680	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.467	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	97	99.467	Canis_familiaris
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.467	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	97	99.467	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	97	99.147	Capra_hircus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.254	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	97	99.254	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.827	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	97	98.827	Cavia_aperea
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.827	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	97	98.827	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	97	99.680	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSCATG00000035809	EFTUD2	97	99.680	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.721	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	97	98.721	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	97	99.680	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	95	86.599	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.599	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.934	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	97	98.934	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	99	77.778	ENSCING00000009372	-	95	79.826	Ciona_intestinalis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	80.435	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.599	Ciona_savignyi
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSCANG00000026557	EFTUD2	97	99.680	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	ENSCGRG00001009904	Eftud2	97	99.147	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	ENSCGRG00000003825	Eftud2	97	99.147	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.370	ENSCSEG00000016775	eftud2	95	93.370	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.913	ENSCVAG00000012537	eftud2	95	93.913	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.464	ENSDARG00000012261	eftud2	95	93.471	Danio_rerio
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.041	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	97	99.041	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.041	ENSDORG00000011566	Eftud2	97	99.041	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	75.264	FBgn0039566	CG4849	94	76.772	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	91	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	88	99.457	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	77	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.467	ENSEASG00005010321	EFTUD2	97	99.467	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.360	ENSECAG00000019363	EFTUD2	90	99.360	Equus_caballus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	86	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.152	ENSELUG00000017169	eftud2	95	93.152	Esox_lucius
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.360	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	97	99.360	Felis_catus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	97.974	ENSFALG00000007551	EFTUD2	97	97.974	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	97	99.147	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.913	ENSFHEG00000013479	eftud2	95	93.913	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.370	ENSGMOG00000014277	eftud2	95	93.370	Gadus_morhua
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.294	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	Gallus_gallus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.022	ENSGAFG00000002263	eftud2	95	94.022	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.370	ENSGACG00000009163	eftud2	95	93.370	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	97	99.680	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.804	ENSHBUG00000023546	eftud2	95	93.804	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.721	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	97	98.721	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.721	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	97	98.721	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.261	ENSHCOG00000017689	eftud2	95	93.261	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.906	ENSIPUG00000023182	Eftud2	95	93.906	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	96	98.007	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	98.007	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	99	99.252	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.252	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.261	ENSKMAG00000021027	eftud2	95	93.261	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	93	93.371	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.824	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	95.874	ENSLACG00000012918	EFTUD2	95	95.874	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.457	ENSLOCG00000011460	eftud2	95	94.457	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.041	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	96	99.041	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	97	99.680	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	97	99.680	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	97	99.680	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.022	ENSMAMG00000022190	eftud2	95	94.022	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.804	ENSMZEG00005022885	eftud2	95	93.804	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.191	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	96	98.191	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	ENSMAUG00000021178	Eftud2	97	99.147	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSMICG00000016592	EFTUD2	97	99.680	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.254	ENSMOCG00000009039	-	97	99.254	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	89	80.907	ENSMOCG00000017653	-	84	80.930	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	91	94.000	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	94.000	Mola_mola
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.787	ENSMODG00000011347	EFTUD2	97	99.787	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	91	92.235	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.235	Monopterus_albus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.934	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	97	98.934	Mus_caroli
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.934	ENSMUSG00000020929	Eftud2	97	98.934	Mus_musculus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.934	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	97	98.934	Mus_pahari
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.934	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	97	98.934	Mus_spretus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	97	99.231	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	87	99.231	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.467	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	96	99.467	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	ENSNGAG00000017834	Eftud2	97	99.147	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.696	ENSNBRG00000020081	eftud2	95	93.696	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	97	97.795	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	93	96.913	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	96.055	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	97	96.055	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	91.097	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	95	91.097	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	91	79.885	ENSODEG00000003385	-	94	79.885	Octodon_degus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.401	ENSODEG00000018041	-	97	98.401	Octodon_degus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.804	ENSONIG00000000912	eftud2	95	93.804	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.467	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	97	99.467	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.478	ENSORLG00000003109	eftud2	95	93.478	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.478	ENSORLG00020009865	eftud2	95	93.478	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.478	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.464	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	97.335	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	96	97.335	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	ENSOARG00000009078	EFTUD2	94	99.147	Ovis_aries
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.574	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	97	99.574	Pan_paniscus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.467	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	97	99.467	Panthera_pardus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.467	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	97	99.467	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.574	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	97	99.574	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSPANG00000021284	EFTUD2	97	99.680	Papio_anubis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	93	97.365	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	96	97.365	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	85.978	ENSPMGG00000007281	eftud2	95	85.978	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	ENSPEMG00000005129	Eftud2	97	99.147	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.893	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	97	99.893	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.022	ENSPFOG00000008515	eftud2	95	94.022	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.022	ENSPLAG00000010393	eftud2	95	94.022	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.022	ENSPMEG00000005087	eftud2	95	94.022	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.188	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	97	98.188	Pongo_abelii
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	95.548	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	95	95.548	Procavia_capensis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.574	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	97	99.574	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.680	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	95	94.680	Pteropus_vampyrus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.696	ENSPNYG00000012448	eftud2	95	93.696	Pundamilia_nyererei
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.124	ENSPNAG00000012490	eftud2	95	94.124	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	99	99.145	ENSRNOG00000002818	Eftud2	96	99.145	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.574	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	97	99.574	Rhinopithecus_bieti
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.574	ENSRROG00000042925	EFTUD2	97	99.574	Rhinopithecus_roxellana
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	96	33.746	YKL173W	SNU114	91	34.461	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	97	99.680	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.804	ENSSFOG00015023272	eftud2	95	93.804	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.370	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	90.471	Scophthalmus_maximus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.913	ENSSDUG00000022675	eftud2	95	93.913	Seriola_dumerili
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.022	ENSSLDG00000001595	eftud2	95	94.022	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	90.512	ENSSARG00000008664	EFTUD2	96	90.512	Sorex_araneus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	99	97.863	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	96	97.863	Sphenodon_punctatus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.913	ENSSPAG00000016235	eftud2	94	93.913	Stegastes_partitus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.254	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	97	99.254	Sus_scrofa
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	87	97.445	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	Taeniopygia_guttata
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	92.935	ENSTRUG00000016422	eftud2	95	92.935	Takifugu_rubripes
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	88.203	ENSTNIG00000005346	eftud2	94	88.095	Tetraodon_nigroviridis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	93.817	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	97	93.817	Tupaia_belangeri
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	94	96.141	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	96.141	Tursiops_truncatus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.507	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	97	98.507	Ursus_americanus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.467	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	97	99.467	Ursus_maritimus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	85	100.000	Vicugna_pacos
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.467	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	97	99.467	Vulpes_vulpes
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	95.203	ENSXETG00000003394	eftud2	98	96.083	Xenopus_tropicalis
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	84	93.622	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	Xiphophorus_couchianus
ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.022	ENSXMAG00000008494	eftud2	95	94.022	Xiphophorus_maculatus