EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000008963 (Gene tree)
Gene ID: 100923697
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10642 bases
Position: chrGL856874.1:486973-497614
Accession: 100923697
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000010383	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.3e-38	1	1
ENSSHAP00000010382	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.4e-38	1	1
ENSSHAP00000010382	DEAD	PF00270.29	1.7e-16	1	1
ENSSHAP00000010383	DEAD	PF00270.29	3.4e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000010474	SKIV2L-201	3873	XM_003768913	ENSSHAP00000010382	1290 (aa)	XP_003768961	G3W4M7
ENSSHAT00000010475	SKIV2L-202	3870	-	ENSSHAP00000010383	1248 (aa)	-	G3W4M8

Gene Model

Click here to download ENSSHAG00000008963's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSHAG00000008963's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	81	33.591	ENSSHAG00000004600	MTREX	99	34.560

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.309	ENSG00000204351	SKIV2L	98	92.135	Homo_sapiens
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.317	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	61.190	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.389	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	87.430	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.295	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	59.696	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.397	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.270	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.635	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	61.223	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.032	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	60.526	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	65.255	ENSACAG00000011746	SKIV2L	100	66.066	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.950	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	87.990	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.935	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.429	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	98	58.574	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.447	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.389	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	87.430	Bos_taurus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	96	38.125	WBGene00008502	skih-2	78	44.467	Caenorhabditis_elegans
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.229	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	87.270	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	98	86.564	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	87.270	Canis_familiaris
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	98	86.564	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	87.270	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.229	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	87.270	Capra_hircus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.749	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	86.789	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	84.788	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	85.032	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.469	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	87.510	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.149	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	87.190	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.268	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	86.309	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.149	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	87.190	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	87	63.675	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	97	64.635	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	93	50.382	ENSCING00000005576	-	99	50.891	Ciona_intestinalis
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	86.378	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	87.420	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.160	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	87.200	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.920	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	61.195	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.304	ENSCVAG00000003072	skiv2l	96	67.011	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.559	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.537	Danio_rerio
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	94	86.718	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	94	88.378	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	93	43.834	FBgn0039117	tst	97	44.210	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	69	88.889	ENSETEG00000009522	SKIV2L	72	91.892	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	90	55.604	ENSEBUG00000013680	-	99	55.333	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	93	88.028	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	89.147	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	96	86.085	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	87.743	Equus_caballus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	52	94.466	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	94.466	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.269	ENSELUG00000000181	skiv2l	96	67.288	Esox_lucius
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	87.270	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	88.311	Felis_catus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	82.320	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	83.360	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	94	65.549	ENSFHEG00000008853	skiv2l	96	67.495	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	58.847	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	59.535	Gadus_morhua
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	77	60.603	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.920	Gallus_gallus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.301	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	60.983	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.380	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	60.064	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.389	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	87.430	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.777	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.270	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	83.693	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	84.732	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	81.146	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	82.180	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	98	58.211	ENSHCOG00000007191	skiv2l	96	66.908	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.184	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	60.417	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.709	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	87.750	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	68	59.233	ENSLACG00000002986	-	75	56.770	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.549	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	87.590	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.229	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	87.270	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.229	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	87.270	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.149	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	87.190	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.149	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	87.190	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.539	ENSMAMG00000002927	skiv2l	96	67.598	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.777	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.270	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	70	49.877	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	73	76.210	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.280	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	86.480	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.229	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	87.270	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	84.560	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	85.760	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.617	ENSMMOG00000014547	skiv2l	96	67.391	Mola_mola
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	95.516	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	96.557	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	58.876	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	59.646	Monopterus_albus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.440	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	86.480	Mus_caroli
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.520	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	86.560	Mus_musculus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.520	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	86.560	Mus_pahari
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.120	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	86.160	Mus_spretus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.629	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	87.670	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.588	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	86.629	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.176	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	60.734	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	98	83.955	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	84.831	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	78	100.000	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.989	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	87.030	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.028	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	86.069	Octodon_degus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	61.275	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.171	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	87.190	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	88.231	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.441	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	60.383	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.441	ENSORLG00020009462	skiv2l	97	65.365	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.190	ENSORLG00015016750	skiv2l	97	65.298	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.921	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	61.636	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.389	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	87.430	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	81.284	ENSOARG00000002411	-	100	82.302	Ovis_aries
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	98	85.761	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	86.699	Pan_paniscus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.950	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	87.990	Panthera_pardus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.458	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	87.430	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.309	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	87.350	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	98	85.182	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	86.127	Papio_anubis
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.245	ENSPKIG00000011876	skiv2l	95	66.494	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.440	ENSPMGG00000019707	skiv2l	95	67.288	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.840	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	86.880	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	96.400	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	97.440	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.301	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	60.983	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.349	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.921	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.380	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.063	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.486	ENSPREG00000002277	skiv2l	97	66.977	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.989	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	87.030	Pongo_abelii
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	77	88.560	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	88.560	Procavia_capensis
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	87.110	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	88.151	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.028	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	86.069	Pteropus_vampyrus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	93	65.977	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	67.218	Pundamilia_nyererei
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	98	60.208	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	61.129	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.000	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	87.040	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	98	84.317	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	85.212	Rhinopithecus_bieti
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.469	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	87.510	Rhinopithecus_roxellana
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	93	36.661	YLR398C	-	77	40.522	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.709	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	87.750	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	61.102	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.326	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.588	ENSSMAG00000020185	skiv2l	95	65.839	Scophthalmus_maximus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	61.094	ENSSDUG00000019977	skiv2l	96	68.116	Seriola_dumerili
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.372	ENSSLDG00000024382	skiv2l	96	66.667	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	62.248	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	62.131	Sphenodon_punctatus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	94	60.302	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	61.307	Stegastes_partitus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.950	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	87.990	Sus_scrofa
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	85	53.621	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.175	Takifugu_rubripes
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.044	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	59.761	Tetraodon_nigroviridis
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	94	87.975	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	87.975	Tupaia_belangeri
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	81.425	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	82.466	Tursiops_truncatus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.549	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	87.590	Ursus_americanus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	93	87.769	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	88.889	Ursus_maritimus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	98	86.401	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	87.208	Vulpes_vulpes
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	58.267	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	59.141	Xenopus_tropicalis
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.400	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	60.964	Xiphophorus_couchianus
ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.857	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	60.587	Xiphophorus_maculatus