EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000009168 (Gene tree)
Gene ID: 100925507
Gene Symbol: SRPRA
Alias: SR-alpha|SRP-alpha|SRPR|Sralpha
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5067 bases
Position: chrGL849684.1:512154-517220
Accession: 11307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000010625	SRP54	PF00448.22	2.6e-48	1	1
ENSSHAP00000010624	SRP54	PF00448.22	3.9e-48	1	1
ENSSHAP00000010624	SRP54_N	PF02881.19	5.5e-09	1	1
ENSSHAP00000010625	SRP54_N	PF02881.19	6.7e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000010718	SRPRA-202	1566	-	ENSSHAP00000010625	521 (aa)	-	G3W5C0
ENSSHAT00000010717	SRPRA-201	1806	-	ENSSHAP00000010624	601 (aa)	-	G3W5B9

Gene Model

Click here to download ENSSHAG00000009168's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSHAG00000009168's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.698	ENSG00000182934	SRPRA	94	91.030	Homo_sapiens
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.288	ENSAPOG00000017588	srpra	94	67.264	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.033	ENSAMEG00000000117	SRPRA	94	90.365	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.422	ENSACIG00000021588	srpra	94	66.558	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	67.099	ENSAOCG00000018884	srpra	94	67.857	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.883	ENSAPEG00000022286	srpra	93	66.722	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000009168	SRPRA	83	86.032	ENSATEG00000023578	srpra	86	85.802	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	77.430	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	78.418	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	75.000	ENSACAG00000000108	SRPRA	94	76.268	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.199	ENSANAG00000020346	SRPRA	94	90.532	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.559	ENSACLG00000000518	srpra	94	65.865	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	64.695	ENSAMXG00000009975	srpra	93	63.054	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.698	ENSBTAG00000014105	SRPRA	94	90.698	Bos_taurus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	51.963	WBGene00009521	F38A1.8	94	48.792	Caenorhabditis_elegans
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.365	ENSCJAG00000008752	SRPRA	94	90.365	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.037	ENSCAFG00000010474	SRPRA	94	89.369	Canis_familiaris
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.037	ENSCAFG00020010608	SRPRA	94	89.369	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.698	ENSCHIG00000012423	SRPRA	94	90.698	Capra_hircus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	80	95.251	ENSTSYG00000005187	SRPRA	93	95.251	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	85.050	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	93.985	Cavia_aperea
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.033	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	93.985	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.033	ENSCCAG00000025602	SRPRA	94	90.365	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.033	ENSCATG00000039354	SRPRA	94	91.030	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.698	ENSCLAG00000016839	SRPRA	94	91.030	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.365	ENSCSAG00000002271	SRPRA	94	90.698	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	67	96.429	ENSCHOG00000010015	-	73	96.429	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	77.541	ENSCPBG00000011128	SRPRA	94	78.560	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	58.015	ENSCING00000008954	-	94	56.997	Ciona_intestinalis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	57.869	ENSCSAVG00000005602	-	94	57.541	Ciona_savignyi
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.203	ENSCANG00000032337	SRPRA	94	90.199	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.701	ENSCGRG00001017670	Srpr	94	90.698	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.701	ENSCGRG00000009892	Srpr	94	90.698	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.722	ENSCSEG00000002374	srpra	94	67.095	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.667	ENSCVAG00000019881	srpra	94	67.695	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	64.895	ENSDARG00000061124	srpra	94	64.205	Danio_rerio
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.309	ENSDNOG00000010821	SRPRA	94	89.309	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.369	ENSDORG00000016719	Srpr	94	90.199	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	54.802	FBgn0010391	Gtp-bp	94	51.391	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	87.107	ENSETEG00000013956	SRPRA	94	87.107	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000009168	SRPRA	75	70.025	ENSEBUG00000002602	srpra	89	69.802	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.867	ENSEASG00005022980	SRPRA	94	89.369	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.701	ENSECAG00000014692	SRPRA	94	89.203	Equus_caballus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	87.140	ENSEEUG00000007920	SRPRA	94	81.954	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.667	ENSELUG00000017643	srpra	94	67.154	Esox_lucius
ENSSHAG00000009168	SRPRA	79	88.186	ENSFCAG00000030894	-	93	88.186	Felis_catus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.365	ENSFCAG00000011274	-	94	90.365	Felis_catus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	77.265	ENSFALG00000005048	SRPRA	95	78.089	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.532	ENSFDAG00000016229	SRPRA	94	90.864	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.236	ENSFHEG00000016959	srpra	94	67.367	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.833	ENSGMOG00000013244	srpra	94	66.612	Gadus_morhua
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	76.974	ENSGALG00000030759	SRPRA	94	78.289	Gallus_gallus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.775	ENSGAFG00000000453	srpra	94	67.099	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.359	ENSGACG00000006550	srpra	94	65.971	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	77.869	ENSGAGG00000021157	SRPRA	94	79.051	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.698	ENSGGOG00000012962	SRPRA	94	91.030	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.397	ENSHBUG00000000119	srpra	94	65.705	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.701	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	95.455	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.701	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	95.455	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.774	ENSHCOG00000010749	srpra	94	67.742	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	63.622	ENSIPUG00000000867	srpra	99	63.782	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.199	ENSSTOG00000009897	SRPRA	94	90.532	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.033	ENSJJAG00000020272	Srpr	94	90.365	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.828	ENSKMAG00000002280	srpra	94	67.794	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.019	ENSLBEG00000009608	srpra	94	66.505	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	69.481	ENSLACG00000017781	SRPRA	94	70.130	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.506	ENSLOCG00000002733	srpra	94	66.506	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	88.704	ENSLAFG00000010252	SRPRA	94	89.386	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.532	ENSMFAG00000032606	SRPRA	94	90.864	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.532	ENSMMUG00000007938	SRPRA	94	90.864	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.365	ENSMNEG00000030709	SRPRA	94	90.698	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.033	ENSMLEG00000043404	SRPRA	94	91.030	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.210	ENSMAMG00000000473	srpra	94	65.691	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.559	ENSMZEG00005013432	srpra	94	65.865	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	76.898	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	78.218	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.033	ENSMAUG00000015648	Srpr	94	90.365	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.535	ENSMICG00000015981	SRPRA	94	89.867	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.535	ENSMOCG00000008311	Srpr	94	90.532	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.281	ENSMMOG00000005019	srpra	94	66.722	Mola_mola
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	95.585	ENSMODG00000004576	-	94	95.341	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.396	ENSMALG00000011343	srpra	94	66.938	Monopterus_albus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.535	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	94	90.532	Mus_caroli
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.199	ENSMUSG00000032042	Srpr	94	90.199	Mus_musculus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.535	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	94	90.532	Mus_pahari
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	84.543	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	94	85.331	Mus_spretus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.203	ENSMPUG00000006626	SRPRA	94	89.535	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	88.372	ENSMLUG00000017334	SRPRA	94	89.867	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.701	ENSNGAG00000015686	Srpr	94	90.033	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.290	ENSNBRG00000017311	srpra	94	66.186	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.532	ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	90.864	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	97.701	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	96.833	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	87.885	ENSOPRG00000013160	SRPRA	94	82.919	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	88.704	ENSODEG00000004730	SRPRA	94	89.535	Octodon_degus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.829	ENSONIG00000005324	srpra	94	66.883	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.365	ENSOCUG00000017057	SRPRA	94	90.365	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	83	85.714	ENSORLG00000014676	srpra	94	66.830	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.579	ENSORLG00020009240	srpra	94	66.830	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.391	ENSORLG00015015405	srpra	94	67.103	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	68.272	ENSOMEG00000005872	srpra	94	68.106	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.199	ENSOGAG00000008926	SRPRA	94	90.199	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.701	ENSOARG00000012397	SRPRA	94	89.701	Ovis_aries
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.698	ENSPPAG00000030813	SRPRA	94	91.030	Pan_paniscus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.365	ENSPPRG00000001542	SRPRA	94	90.365	Panthera_pardus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.199	ENSPTIG00000006989	SRPRA	94	90.199	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.698	ENSPTRG00000028360	SRPRA	94	91.030	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.532	ENSPANG00000010858	SRPRA	94	90.864	Papio_anubis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	64.286	ENSPKIG00000016106	srpra	94	65.781	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	77.467	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	78.818	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.884	ENSPMGG00000001393	srpra	94	66.939	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.867	ENSPEMG00000018279	Srpr	94	90.864	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	59.804	ENSPMAG00000009559	srpra	94	60.656	Petromyzon_marinus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	96.743	ENSPCIG00000010207	SRPRA	94	96.179	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.613	ENSPFOG00000003114	srpra	94	68.277	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.613	ENSPLAG00000007323	srpra	94	68.277	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.613	ENSPMEG00000015658	srpra	94	68.277	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	67.690	ENSPREG00000004937	srpra	94	68.821	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000009168	SRPRA	88	96.053	ENSPPYG00000004045	SRPRA	93	96.053	Pongo_abelii
ENSSHAG00000009168	SRPRA	57	96.124	ENSPCAG00000003801	-	54	96.124	Procavia_capensis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.199	ENSPCOG00000025726	SRPRA	94	90.532	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.535	ENSPVAG00000000993	SRPRA	94	90.532	Pteropus_vampyrus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.559	ENSPNYG00000012371	srpra	94	65.865	Pundamilia_nyererei
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	63.252	ENSPNAG00000013476	srpra	94	64.065	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.867	ENSRNOG00000010543	Srpra	94	90.698	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.532	ENSRBIG00000008702	SRPRA	94	90.532	Rhinopithecus_bieti
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.050	ENSRROG00000029494	SRPRA	94	90.381	Rhinopithecus_roxellana
ENSSHAG00000009168	SRPRA	82	37.996	YDR292C	-	63	40.695	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.199	ENSSBOG00000035892	SRPRA	94	90.532	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	62.852	ENSSFOG00015008837	srpra	93	64.628	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.615	ENSSMAG00000002783	srpra	94	66.060	Scophthalmus_maximus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.223	ENSSDUG00000013920	srpra	93	65.557	Seriola_dumerili
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.478	ENSSLDG00000008601	srpra	88	66.613	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	92	85.744	ENSSARG00000012434	SRPRA	80	86.279	Sorex_araneus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	76.230	ENSSPUG00000018221	SRPRA	94	77.303	Sphenodon_punctatus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.909	ENSSPAG00000005103	srpra	94	66.775	Stegastes_partitus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.867	ENSSSCG00000015227	SRPRA	94	90.199	Sus_scrofa
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	73.864	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	75.288	Taeniopygia_guttata
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.643	ENSTRUG00000006856	srpra	94	66.882	Takifugu_rubripes
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	64.355	ENSTNIG00000010316	srpra	94	64.355	Tetraodon_nigroviridis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.867	ENSTTRG00000001558	SRPRA	94	89.867	Tursiops_truncatus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.718	ENSUAMG00000005510	SRPRA	94	90.050	Ursus_americanus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	83.415	ENSUMAG00000002269	SRPRA	98	83.744	Ursus_maritimus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	75	96.124	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	96.124	Vicugna_pacos
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	88.538	ENSVVUG00000020094	SRPRA	94	89.369	Vulpes_vulpes
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	60.386	ENSXETG00000003920	srpra	94	61.935	Xenopus_tropicalis
ENSSHAG00000009168	SRPRA	83	86.984	ENSXCOG00000001286	srpra	93	85.586	Xiphophorus_couchianus
ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	67.101	ENSXMAG00000028401	srpra	94	67.752	Xiphophorus_maculatus