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Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000010770 (Gene tree)
Gene ID: 100929706
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1253 bases
Position: chrGL841157.1:743977-745229
Accession: 8829
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000012583	eRF1_2	PF03464.15	5.1e-34	1	1
ENSSHAP00000012583	eRF1_3	PF03465.15	1.1e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000012687	PELO-201	832	-	ENSSHAP00000012583	244 (aa)	-	G3WAX8

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.902	ENSG00000152684	PELO	63	95.902	Homo_sapiens
ENSSHAG00000010770	PELO	100	77.869	ENSAPOG00000023072	pelo	63	77.869	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.492	ENSAMEG00000007734	PELO	63	95.492	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000010770	PELO	95	71.121	ENSACIG00000014386	pelo	57	77.157	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	78.279	ENSAOCG00000023717	pelo	63	78.279	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000010770	PELO	100	78.279	ENSAPEG00000011235	pelo	63	78.279	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000010770	PELO	100	78.689	ENSATEG00000019550	pelo	63	78.689	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000010770	PELO	91	90.541	ENSAPLG00000013265	PELO	82	90.541	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000010770	PELO	96	89.787	ENSACAG00000004352	PELO	63	89.344	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSANAG00000014096	PELO	63	96.311	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.639	ENSACLG00000010305	pelo	63	76.639	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000010770	PELO	95	77.586	ENSAMXG00000020299	pelo	63	75.918	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.902	ENSBTAG00000003268	PELO	63	95.902	Bos_taurus
ENSSHAG00000010770	PELO	96	58.298	WBGene00011280	pelo-1	62	58.298	Caenorhabditis_elegans
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.721	ENSCJAG00000035190	PELO	63	96.721	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.902	ENSCAFG00020023234	PELO	63	95.902	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.492	ENSCHIG00000016410	PELO	63	95.492	Capra_hircus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.492	ENSTSYG00000005203	PELO	63	95.492	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.492	ENSCPOG00000027406	PELO	63	95.492	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.721	ENSCCAG00000035600	PELO	63	96.721	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSCATG00000011829	PELO	63	96.311	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.082	ENSCLAG00000005043	PELO	63	95.082	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSCSAG00000016692	PELO	63	96.311	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	94.672	ENSCHOG00000000523	PELO	63	94.672	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000010770	PELO	96	92.766	ENSCPBG00000007544	PELO	63	92.213	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000010770	PELO	95	65.948	ENSCING00000001979	-	63	66.393	Ciona_intestinalis
ENSSHAG00000010770	PELO	100	65.984	ENSCSAVG00000006158	-	63	65.984	Ciona_savignyi
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSCANG00000023382	PELO	63	96.311	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000010770	PELO	95	92.672	ENSCGRG00001024665	Pelo	63	91.803	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000010770	PELO	95	94.828	ENSCGRG00000004570	Pelo	63	93.852	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.639	ENSCSEG00000008807	pelo	63	76.639	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000010770	PELO	100	77.869	ENSCVAG00000016082	pelo	63	77.869	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.230	ENSDARG00000055477	pelo	63	76.230	Danio_rerio
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.902	ENSDNOG00000036721	PELO	63	95.902	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.082	ENSDORG00000016689	Pelo	63	95.082	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000010770	PELO	94	67.391	FBgn0011207	pelo	60	66.525	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000010770	PELO	63	76.471	ENSEBUG00000004955	pelo	55	76.471	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.902	ENSEASG00005013348	PELO	63	95.902	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	77.459	ENSELUG00000023229	pelo	63	77.459	Esox_lucius
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.082	ENSFCAG00000032341	PELO	63	95.082	Felis_catus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	93.033	ENSFALG00000004559	PELO	63	93.033	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000010770	PELO	100	75.820	ENSFHEG00000009769	pelo	66	75.820	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000010770	PELO	97	76.695	ENSGMOG00000005849	pelo	63	75.820	Gadus_morhua
ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.230	ENSGAFG00000019350	pelo	63	76.230	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000010770	PELO	100	77.869	ENSGACG00000007245	pelo	63	77.869	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000010770	PELO	96	92.766	ENSGAGG00000004018	PELO	63	92.213	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSGGOG00000012635	PELO	63	96.311	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.639	ENSHBUG00000005866	pelo	63	76.639	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.492	ENSHGLG00000005932	PELO	63	95.492	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000010770	PELO	100	92.213	ENSHGLG00100017627	PELO	63	92.213	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000010770	PELO	100	74.590	ENSHCOG00000016782	pelo	63	74.590	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.230	ENSIPUG00000020627	pelo	63	76.230	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.492	ENSSTOG00000027378	PELO	63	95.492	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	91.393	ENSJJAG00000015032	Pelo	63	91.393	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	78.279	ENSKMAG00000021305	pelo	63	78.279	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000010770	PELO	99	78.189	ENSLBEG00000022399	pelo	63	78.189	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.082	ENSLAFG00000020551	PELO	63	95.082	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSMFAG00000000651	PELO	63	96.311	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSMMUG00000039101	PELO	63	96.311	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSMNEG00000035538	PELO	63	96.311	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSMLEG00000039113	PELO	63	96.311	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000010770	PELO	95	80.172	ENSMAMG00000013260	pelo	63	79.508	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.639	ENSMZEG00005014258	pelo	63	76.639	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000010770	PELO	100	93.443	ENSMAUG00000009770	Pelo	63	93.443	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.492	ENSMICG00000044040	PELO	63	95.492	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	94.672	ENSMOCG00000017554	Pelo	63	94.672	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.230	ENSMMOG00000001324	pelo	63	76.230	Mola_mola
ENSSHAG00000010770	PELO	100	77.459	ENSMALG00000008194	pelo	63	77.459	Monopterus_albus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	94.262	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	63	94.262	Mus_caroli
ENSSHAG00000010770	PELO	100	94.672	ENSMUSG00000042275	Pelo	63	94.672	Mus_musculus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	94.672	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	63	94.672	Mus_pahari
ENSSHAG00000010770	PELO	100	94.262	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	63	94.262	Mus_spretus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	93.852	ENSMLUG00000024132	PELO	63	93.852	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	93.852	ENSNGAG00000019331	Pelo	63	93.852	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.639	ENSNBRG00000011799	pelo	63	76.639	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSNLEG00000035970	PELO	63	96.311	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000010770	PELO	100	98.770	ENSMEUG00000005468	PELO	63	98.770	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000010770	PELO	97	94.915	ENSOPRG00000018793	PELO	62	94.915	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.082	ENSODEG00000017579	PELO	63	95.082	Octodon_degus
ENSSHAG00000010770	PELO	94	76.856	ENSONIG00000011511	pelo	63	76.230	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.902	ENSOCUG00000023902	PELO	63	95.902	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	79.098	ENSORLG00000005827	pelo	63	79.098	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000010770	PELO	100	79.508	ENSORLG00020016456	pelo	63	79.508	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000010770	PELO	100	79.508	ENSORLG00015014447	pelo	68	79.508	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000010770	PELO	100	79.918	ENSOMEG00000021567	pelo	69	79.918	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000010770	PELO	100	94.672	ENSOGAG00000027940	PELO	63	94.672	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.902	ENSOARG00000008324	PELO	63	95.902	Ovis_aries
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSPPAG00000038951	PELO	63	96.311	Pan_paniscus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.082	ENSPPRG00000018800	PELO	63	95.082	Panthera_pardus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.082	ENSPTIG00000019988	PELO	63	95.082	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSPTRG00000034409	PELO	63	96.311	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSPANG00000010902	PELO	63	96.311	Papio_anubis
ENSSHAG00000010770	PELO	100	78.689	ENSPKIG00000015190	pelo	63	78.689	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000010770	PELO	96	93.617	ENSPSIG00000004971	PELO	63	93.033	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000010770	PELO	100	93.852	ENSPEMG00000015584	Pelo	63	93.852	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000010770	PELO	100	97.951	ENSPCIG00000004880	PELO	63	97.951	Phascolarctos_cinereus
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ENSSHAG00000010770	PELO	100	77.459	ENSPREG00000023071	pelo	63	77.459	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000010770	PELO	95	96.552	ENSPPYG00000015451	PELO	61	95.902	Pongo_abelii
ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.492	ENSPCOG00000021178	PELO	63	95.492	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.639	ENSPNYG00000017325	pelo	63	76.639	Pundamilia_nyererei
ENSSHAG00000010770	PELO	95	76.293	ENSPNAG00000012458	pelo	63	74.590	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000010770	PELO	100	93.852	ENSRNOG00000061128	Pelo	63	93.852	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSRBIG00000007299	PELO	63	96.311	Rhinopithecus_bieti
ENSSHAG00000010770	PELO	100	96.311	ENSRROG00000035507	PELO	63	96.311	Rhinopithecus_roxellana
ENSSHAG00000010770	PELO	98	40.167	YNL001W	-	62	40.167	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSHAG00000010770	PELO	100	97.131	ENSSBOG00000036140	PELO	63	97.131	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSHAG00000010770	PELO	97	79.661	ENSSFOG00015013399	pelo	63	78.689	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	78.689	ENSSMAG00000017171	pelo	63	78.689	Scophthalmus_maximus
ENSSHAG00000010770	PELO	100	78.689	ENSSDUG00000022938	pelo	63	78.689	Seriola_dumerili
ENSSHAG00000010770	PELO	100	72.951	ENSSLDG00000017884	pelo	62	72.951	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSHAG00000010770	PELO	96	92.766	ENSSPUG00000005545	PELO	63	92.213	Sphenodon_punctatus
ENSSHAG00000010770	PELO	97	79.237	ENSSPAG00000008501	pelo	63	78.279	Stegastes_partitus
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