EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000011230 (Gene tree)
Gene ID: 100928934
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 47127 bases
Position: chrGL834732.1:819235-866361
Accession: 100928934
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000013137	CRM1_C	PF08767.11	5.8e-135	1	1
ENSSHAP00000013137	Xpo1	PF08389.12	4.3e-41	1	1
ENSSHAP00000013137	IBN_N	PF03810.19	1.9e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000013243	XPO1-201	3477	-	ENSSHAP00000013137	1071 (aa)	XP_003758298	G3WCI2

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
shr03013	RNA transport	KEGG
shr05164	Influenza A	KEGG
shr05166	Human T-cell leukemia virus 1 infection	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.599	ENSG00000082898	XPO1	100	99.441	Homo_sapiens
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.265	ENSAPOG00000004984	-	100	96.265	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000011230	XPO1	88	90.532	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.532	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.627	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	99.627	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000011230	XPO1	88	96.702	ENSACIG00000010818	-	100	96.702	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000011230	XPO1	88	92.872	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.265	ENSAOCG00000010121	-	100	96.265	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	92.063	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	92.063	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000011230	XPO1	91	92.688	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.688	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.265	ENSAPEG00000007038	-	100	96.265	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	91.690	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.690	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.265	ENSATEG00000008816	-	100	96.265	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.627	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	99.627	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.440	ENSACAG00000002501	XPO1	100	99.440	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.599	ENSANAG00000020802	XPO1	100	98.599	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.078	ENSACLG00000015192	-	100	96.078	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000011230	XPO1	88	93.191	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	93.191	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000011230	XPO1	88	94.068	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	94.068	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.639	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	96.639	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.720	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	99.720	Bos_taurus
ENSSHAG00000011230	XPO1	99	51.982	WBGene00002078	xpo-1	99	51.982	Caenorhabditis_elegans
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.599	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.599	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.720	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	99.720	Canis_familiaris
ENSSHAG00000011230	XPO1	93	99.699	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	99.699	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.720	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	99.720	Capra_hircus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.720	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	99.720	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000011230	XPO1	53	95.390	ENSCAPG00000006454	-	100	95.390	Cavia_aperea
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.226	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	98.226	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	79.499	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.685	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.834	ENSCATG00000032674	XPO1	100	98.511	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.440	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.440	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.599	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.599	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000011230	XPO1	83	99.611	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.611	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.533	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.533	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	81.285	ENSCING00000024562	-	100	81.285	Ciona_intestinalis
ENSSHAG00000011230	XPO1	99	80.299	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.299	Ciona_savignyi
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	94.398	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.413	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.413	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.413	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	98.413	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000011230	XPO1	88	95.532	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	91.410	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	91.410	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.172	ENSCVAG00000016788	-	100	96.172	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	97.012	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	97.012	Danio_rerio
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	93.277	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.356	Danio_rerio
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.813	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	99.813	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000011230	XPO1	92	96.081	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.081	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000011230	XPO1	99	71.321	FBgn0020497	emb	99	71.321	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000011230	XPO1	94	98.155	ENSETEG00000018045	XPO1	94	98.155	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000011230	XPO1	90	79.772	ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.720	ENSEASG00005007223	XPO1	100	99.720	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.720	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.720	Equus_caballus
ENSSHAG00000011230	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000011230	XPO1	87	93.148	ENSELUG00000014306	-	99	93.148	Esox_lucius
ENSSHAG00000011230	XPO1	88	95.319	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.319	Esox_lucius
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.720	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	99.720	Felis_catus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.346	ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.346	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	97.852	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	97.852	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	91.783	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	91.783	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	92.904	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.904	Gadus_morhua
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	90.196	ENSGMOG00000019063	-	100	90.196	Gadus_morhua
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.627	ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.627	Gallus_gallus
ENSSHAG00000011230	XPO1	91	96.395	ENSGAFG00000003355	-	98	96.395	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000011230	XPO1	88	92.766	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	91.597	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.597	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	95.985	ENSGACG00000002743	-	100	95.985	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.440	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.440	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.599	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	98.599	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	92.250	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.250	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.172	ENSHBUG00000020037	-	100	96.172	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.346	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	99.346	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.346	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	99.346	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000011230	XPO1	88	95.532	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.532	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	94.118	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.118	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.639	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	96.639	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.533	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.533	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.440	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	99.440	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	91.690	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	91.690	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	95.705	ENSKMAG00000016218	-	100	95.705	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.265	ENSLBEG00000005740	-	100	96.265	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000011230	XPO1	88	90.254	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	90.254	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	77.655	ENSLACG00000018213	XPO1	100	77.655	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	97.292	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	97.292	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.346	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	99.346	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.599	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	98.599	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.599	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	98.599	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.599	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	98.599	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.837	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	96.837	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	91.970	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.970	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.172	ENSMAMG00000010568	-	100	96.172	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	96.078	ENSMZEG00005018158	-	98	96.395	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	92.250	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	92.250	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000011230	XPO1	68	99.449	ENSMGAG00000001496	-	100	99.449	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.413	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	98.413	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.720	ENSMICG00000027770	XPO1	100	99.720	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.693	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	98.693	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000011230	XPO1	88	92.872	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	92.872	Mola_mola
ENSSHAG00000011230	XPO1	87	96.371	ENSMMOG00000008001	-	99	96.371	Mola_mola
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.973	ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.973	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	95.798	ENSMALG00000007085	-	100	95.798	Monopterus_albus
ENSSHAG00000011230	XPO1	88	91.923	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	91.923	Monopterus_albus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.786	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.786	Mus_caroli
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ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.786	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.786	Mus_pahari
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	98.880	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	98.880	Mus_spretus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.720	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	99.720	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.627	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	99.627	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	99.533	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	99.533	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000011230	XPO1	100	92.250	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	92.250	Neolamprologus_brichardi
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