EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000012099 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 396 bases
Position: chrGL849570.1:967513-967908
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000014156	zf-nanos	PF05741.13	1.3e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000014273	-	396	-	ENSSHAP00000014156	132 (aa)	-	G3WFF1

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000012099	-	100	90.909	ENSSHAG00000010756	-	100	90.909
ENSSHAG00000012099	-	94	44.118	ENSSHAG00000017034	NANOS2	93	44.118

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000012099	-	96	58.955	ENSG00000187556	NANOS3	76	58.955	Homo_sapiens
ENSSHAG00000012099	-	98	47.143	ENSG00000188425	NANOS2	99	47.143	Homo_sapiens
ENSSHAG00000012099	-	88	31.206	ENSAPOG00000020274	nanos2	78	34.351	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000012099	-	98	60.606	ENSAMEG00000012972	NANOS3	76	60.606	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000012099	-	79	44.444	ENSACIG00000007105	nanos2	68	44.444	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000012099	-	81	34.167	ENSAOCG00000009429	nanos2	78	34.426	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000012099	-	81	33.600	ENSAPEG00000019139	nanos2	79	35.200	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000012099	-	81	34.646	ENSATEG00000009393	nanos2	78	34.646	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000012099	-	57	56.000	ENSACAG00000021948	-	93	39.286	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000023823	-	95	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.855	ENSACAG00000005197	-	94	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000024568	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	80	41.509	ENSACAG00000022790	-	83	44.444	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000026757	-	95	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	95	38.298	ENSACAG00000027728	-	93	39.286	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.855	ENSACAG00000026350	-	94	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	45.669	ENSACAG00000023519	-	92	45.669	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	46.094	ENSACAG00000023813	-	95	46.094	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000022675	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000027995	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000024218	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	44.882	ENSACAG00000022207	-	94	44.882	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	41.600	ENSACAG00000025632	-	95	44.094	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000026317	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000023803	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000025307	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000026478	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000023855	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	57	56.000	ENSACAG00000026914	-	93	39.286	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000027265	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	43.548	ENSACAG00000022088	-	92	43.548	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000024274	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	41.935	ENSACAG00000022322	-	92	41.935	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	38.571	ENSACAG00000027212	-	93	39.286	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	58	55.263	ENSACAG00000023774	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.130	ENSACAG00000026660	-	94	39.286	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.855	ENSACAG00000024524	-	94	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	43.548	ENSACAG00000026716	-	92	43.548	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	95	42.400	ENSACAG00000022236	-	92	42.742	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000025093	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	38.571	ENSACAG00000026679	-	93	39.286	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	41.935	ENSACAG00000026334	-	92	41.935	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	45.669	ENSACAG00000026819	-	92	45.669	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000023391	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
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ENSSHAG00000012099	-	94	42.742	ENSACAG00000027983	-	92	42.742	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	40.876	ENSACAG00000025556	-	93	40.876	Anolis_carolinensis
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ENSSHAG00000012099	-	94	43.307	ENSACAG00000024432	-	94	43.307	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	57	44.000	ENSACAG00000027867	-	93	44.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	39.286	ENSACAG00000010268	-	93	40.000	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	94	41.600	ENSACAG00000024003	-	95	44.094	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012099	-	96	60.769	ENSANAG00000025042	NANOS3	76	60.769	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000012099	-	80	39.048	ENSACLG00000027005	nanos2	68	39.048	Astatotilapia_calliptera
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ENSSHAG00000012099	-	78	35.075	ENSAMXG00000042358	nanos2	76	35.075	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000012099	-	97	31.844	ENSAMXG00000030027	NANOS1	94	31.844	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000012099	-	98	45.714	ENSBTAG00000047505	NANOS2	99	45.714	Bos_taurus
ENSSHAG00000012099	-	96	61.654	ENSBTAG00000000399	NANOS3	76	61.654	Bos_taurus
ENSSHAG00000012099	-	98	45.324	ENSCJAG00000012141	NANOS2	96	46.763	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000012099	-	96	50.993	ENSCJAG00000004388	NANOS3	77	56.835	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000012099	-	98	46.324	ENSCAFG00000024541	NANOS2	98	46.324	Canis_familiaris
ENSSHAG00000012099	-	98	58.955	ENSCAFG00000016592	NANOS3	69	59.848	Canis_familiaris
ENSSHAG00000012099	-	98	58.955	ENSCAFG00020006694	NANOS3	69	59.848	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000012099	-	98	46.324	ENSCAFG00020001772	NANOS2	98	46.324	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000012099	-	96	61.654	ENSCHIG00000007837	NANOS3	74	61.654	Capra_hircus
ENSSHAG00000012099	-	98	45.714	ENSCHIG00000012637	NANOS2	99	45.714	Capra_hircus
ENSSHAG00000012099	-	58	57.895	ENSTSYG00000028873	NANOS2	54	57.895	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000012099	-	96	59.398	ENSTSYG00000026709	NANOS3	75	59.398	Carlito_syrichta
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ENSSHAG00000012099	-	96	60.305	ENSCAPG00000014339	NANOS3	83	62.879	Cavia_aperea
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ENSSHAG00000012099	-	96	60.000	ENSCPOG00000020727	NANOS3	75	61.029	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000012099	-	96	53.472	ENSCCAG00000036253	NANOS3	75	57.576	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000012099	-	96	49.673	ENSCATG00000034885	NANOS3	78	51.299	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000012099	-	98	43.796	ENSCATG00000018951	NANOS2	99	45.714	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000012099	-	96	59.259	ENSCLAG00000015139	NANOS3	74	58.519	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000012099	-	98	46.154	ENSCLAG00000001832	NANOS2	98	46.154	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000012099	-	98	45.714	ENSCSAG00000019629	NANOS2	99	47.143	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000012099	-	96	49.057	ENSCSAG00000006428	NANOS3	79	49.057	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000012099	-	98	44.928	ENSCHOG00000001937	NANOS2	98	44.286	Choloepus_hoffmanni
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ENSSHAG00000012099	-	59	47.436	ENSCPBG00000002172	NANOS1	63	47.436	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000012099	-	98	54.074	ENSCPBG00000023819	NANOS3	95	54.074	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000012099	-	98	47.143	ENSCANG00000012014	NANOS2	98	47.482	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000012099	-	96	59.701	ENSCANG00000034930	NANOS3	76	59.701	Colobus_angolensis_palliatus
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