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Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000012614 (Gene tree)
Gene ID: 100925220
Gene Symbol: ETF1
Alias: ERF|ERF1|RF1|SUP45L1|TB3-1
Full Name: eukaryotic translation termination factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16559 bases
Position: chrGL834594.1:1068263-1084821
Accession: 100925220
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000014776	eRF1_2	PF03464.15	1.7e-46	1	1
ENSSHAP00000014775	eRF1_2	PF03464.15	2.2e-46	1	1
ENSSHAP00000014776	eRF1_3	PF03465.15	5.3e-39	1	1
ENSSHAP00000014775	eRF1_3	PF03465.15	3.2e-38	1	1
ENSSHAP00000014775	eRF1_1	PF03463.15	1.4e-18	1	1
ENSSHAP00000014776	eRF1_1	PF03463.15	2.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000014900	ETF1-201	4752	-	ENSSHAP00000014775	427 (aa)	-	G3WH70
ENSSHAT00000014901	ETF1-202	4696	-	ENSSHAP00000014776	404 (aa)	XP_023360593	G3WH71

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSG00000120705	ETF1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	94.987	ENSAPOG00000004622	etf1a	93	94.878	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	98.762	ENSAMEG00000016547	ETF1	93	97.800	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	96.692	ENSACIG00000014875	etf1a	93	95.599	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	94.987	ENSAOCG00000015573	etf1a	93	94.878	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	94.987	ENSAPEG00000015124	etf1a	93	94.878	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	94.987	ENSATEG00000009599	etf1a	93	94.878	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSAPLG00000009740	ETF1	100	99.024	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	99.752	ENSACAG00000015818	ETF1	93	98.778	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSANAG00000025638	-	100	96.253	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000012614	ETF1	99	74.442	ENSANAG00000021905	-	92	73.775	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	89.851	ENSANAG00000014418	-	93	88.971	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	80.446	ENSANAG00000023525	-	93	79.707	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	95.238	ENSACLG00000010368	etf1a	93	95.122	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	94.236	ENSAMXG00000037774	etf1a	93	93.902	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	95.238	ENSAMXG00000040685	etf1b	93	94.878	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSBTAG00000011415	ETF1	93	99.022	Bos_taurus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	78.218	WBGene00020269	erfa-1	93	77.240	Caenorhabditis_elegans
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSCJAG00000006776	ETF1	100	96.019	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSCAFG00000015396	-	93	99.022	Canis_familiaris
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSCAFG00000001282	ETF1	93	99.022	Canis_familiaris
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSCAFG00020010400	ETF1	93	99.022	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSCHIG00000009685	-	93	99.022	Capra_hircus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSTSYG00000011754	ETF1	93	99.022	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000012614	ETF1	93	77.454	ENSTSYG00000036069	-	95	77.461	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	74.257	ENSCAPG00000009035	ETF1	99	73.253	Cavia_aperea
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSCPOG00000002361	ETF1	93	99.022	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	69.744	ENSCCAG00000024925	-	91	69.744	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSCCAG00000035658	-	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	78.713	ENSCATG00000030269	-	93	77.995	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000012614	ETF1	93	66.138	ENSCATG00000029533	-	96	66.138	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSCATG00000031628	-	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSCLAG00000007158	-	93	99.022	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000012614	ETF1	99	70.927	ENSCLAG00000001221	-	91	70.297	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000012614	ETF1	63	92.607	ENSCHOG00000007697	ETF1	59	92.607	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSCPBG00000021239	ETF1	93	99.022	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000012614	ETF1	99	87.250	ENSCING00000002292	-	93	86.420	Ciona_intestinalis
ENSSHAG00000012614	ETF1	99	86.250	ENSCSAVG00000003039	-	93	85.432	Ciona_savignyi
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	74.257	ENSCANG00000043675	-	83	74.328	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000012614	ETF1	94	74.219	ENSCANG00000037950	-	96	74.219	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000012614	ETF1	86	77.364	ENSCANG00000035977	-	96	77.364	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	84.406	ENSCGRG00001007046	Etf1	93	84.352	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	99.752	ENSCGRG00000008154	Etf1	99	99.752	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	94.987	ENSCSEG00000006451	etf1a	93	94.878	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	94.987	ENSCVAG00000011438	etf1a	93	94.878	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	85.919	ENSDARG00000105210	etf1a	100	85.343	Danio_rerio
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	95.844	ENSDARG00000043976	etf1b	93	95.844	Danio_rerio
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSDNOG00000010830	ETF1	93	99.022	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSDORG00000006134	Etf1	93	99.022	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	85.714	FBgn0036974	eRF1	93	84.915	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	88.119	ENSETEG00000007362	ETF1	93	87.286	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000012614	ETF1	63	69.498	ENSEBUG00000014212	-	57	70.076	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	66.912	ENSEBUG00000012821	-	100	66.912	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSEASG00005020814	ETF1	93	99.022	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSECAG00000013041	ETF1	93	99.022	Equus_caballus
ENSSHAG00000012614	ETF1	59	100.000	ENSEEUG00000012422	-	55	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	93.220	ENSELUG00000013149	etf1b	93	93.220	Esox_lucius
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	92.982	ENSELUG00000018668	etf1a	93	92.927	Esox_lucius
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSFCAG00000030132	ETF1	99	98.551	Felis_catus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	95.962	ENSFALG00000003225	ETF1	99	94.651	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSFDAG00000016056	ETF1	98	98.554	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	94.878	ENSFHEG00000002090	etf1a	93	94.878	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	94.015	ENSGMOG00000006876	etf1a	93	93.689	Gadus_morhua
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSGALG00000002262	ETF1	93	99.022	Gallus_gallus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	95.366	ENSGAFG00000015447	etf1a	93	95.366	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	95.929	ENSGACG00000017928	etf1a	93	94.866	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSGAGG00000022294	ETF1	93	99.022	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000012614	ETF1	64	100.000	ENSGGOG00000000657	-	96	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000012614	ETF1	99	78.660	ENSGGOG00000040995	-	93	77.995	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	95.238	ENSHBUG00000009074	etf1a	93	95.122	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	80.098	ENSHGLG00000003688	-	93	79.177	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	90.076	ENSHGLG00000004075	-	93	89.242	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	75.495	ENSHGLG00000014695	-	92	75.061	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000012614	ETF1	95	65.183	ENSHGLG00000015270	-	99	65.183	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	86.701	ENSHGLG00100014362	-	96	86.701	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	90.076	ENSHGLG00100008699	-	93	89.242	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	72.346	ENSHGLG00100012061	-	92	71.951	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000012614	ETF1	95	65.183	ENSHGLG00100007609	-	99	65.183	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	99.257	ENSHGLG00100015871	-	93	98.289	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	94.737	ENSHCOG00000014543	etf1a	93	94.634	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	92.439	ENSIPUG00000020217	etf1b	93	92.439	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	94.146	ENSIPUG00000008892	etf1	93	94.146	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSSTOG00000025996	ETF1	93	99.022	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	97.772	ENSJJAG00000017795	Etf1	93	96.822	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	95.366	ENSKMAG00000009423	etf1a	93	95.366	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000012614	ETF1	97	94.987	ENSLBEG00000001321	etf1a	93	94.878	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	97.525	ENSLACG00000004339	ETF1	93	96.577	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	97.772	ENSLOCG00000009715	etf1b	92	96.822	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSLAFG00000016509	ETF1	93	99.022	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSMFAG00000039900	ETF1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	79.703	ENSMMUG00000044828	-	93	78.973	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSMMUG00000005871	ETF1	100	96.253	Macaca_mulatta
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ENSSHAG00000012614	ETF1	100	80.198	ENSMLEG00000040356	-	93	79.462	Mandrillus_leucophaeus
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ENSSHAG00000012614	ETF1	97	95.238	ENSMZEG00005000459	etf1a	93	95.122	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	ENSMGAG00000001474	ETF1	94	99.024	Meleagris_gallopavo
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ENSSHAG00000012614	ETF1	97	94.987	ENSMALG00000001409	etf1a	93	94.878	Monopterus_albus
ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0022102	Etf1	93	99.022	Mus_caroli
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ENSSHAG00000012614	ETF1	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0018836	Etf1	93	99.022	Mus_pahari
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