EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000013011 (Gene tree)
Gene ID: 100933095
Gene Symbol: EHD3
Alias: PAST3
Full Name: EH domain containing 3
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 54995 bases
Position: chrGL834677.1:1147366-1202360
Accession: 100933095
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000015258	MMR_HSR1	PF01926.23	4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000015385	EHD3-201	5648	XM_003757820	ENSSHAP00000015258	535 (aa)	XP_003757868	G3WIK3

Gene Model

Click here to download ENSSHAG00000013011's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr04144	Endocytosis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSHAG00000013011's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000013011	EHD3	94	74.104	ENSSHAG00000007926	-	98	74.044
ENSSHAG00000013011	EHD3	75	69.077	ENSSHAG00000007430	-	96	66.507

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.636	ENSG00000013016	EHD3	100	96.636	Homo_sapiens
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.262	ENSAMEG00000004282	EHD3	100	96.262	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.150	ENSACIG00000015462	ehd3	100	92.150	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000013011	EHD3	76	90.172	ENSAOCG00000001953	-	86	90.172	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.776	ENSAPEG00000018380	ehd3	100	91.776	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.150	ENSATEG00000002224	ehd3	100	92.150	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.636	ENSAPLG00000010467	EHD3	100	96.636	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	89.907	ENSACAG00000007103	EHD3	100	89.907	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.262	ENSANAG00000020422	EHD3	100	96.262	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.150	ENSACLG00000007581	ehd3	100	92.150	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	86.980	ENSAMXG00000042972	ehd3	100	86.980	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	95.327	ENSBTAG00000001662	EHD3	100	95.327	Bos_taurus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.449	ENSCJAG00000003137	EHD3	100	96.449	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.383	ENSCAFG00000005348	EHD3	100	97.383	Canis_familiaris
ENSSHAG00000013011	EHD3	99	94.737	ENSCAFG00020023684	EHD3	98	94.737	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	95.327	ENSCHIG00000017794	EHD3	100	95.327	Capra_hircus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.262	ENSTSYG00000036583	EHD3	100	96.262	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.757	ENSCPOG00000034108	EHD3	100	97.757	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.449	ENSCCAG00000029860	EHD3	100	96.449	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	ENSCATG00000044604	EHD3	100	96.822	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.383	ENSCLAG00000010983	EHD3	100	97.383	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	ENSCSAG00000011254	EHD3	100	96.822	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.449	ENSCPBG00000011884	EHD3	100	96.449	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	ENSCANG00000024283	EHD3	100	96.822	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.196	ENSCGRG00001020979	Ehd3	100	97.196	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.196	ENSCGRG00000013157	Ehd3	100	97.196	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.215	ENSCSEG00000019195	ehd3	100	91.215	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.336	ENSCVAG00000016197	ehd3	100	92.336	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.523	ENSDARG00000007869	ehd3	100	92.523	Danio_rerio
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.009	ENSDNOG00000039339	EHD3	100	97.009	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.383	ENSDORG00000024162	Ehd3	100	97.383	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000013011	EHD3	99	92.642	ENSETEG00000013323	EHD3	98	92.642	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.262	ENSEASG00005008635	EHD3	100	96.262	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.262	ENSECAG00000015195	EHD3	100	96.262	Equus_caballus
ENSSHAG00000013011	EHD3	88	94.191	ENSEEUG00000010447	EHD3	86	94.191	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000013011	EHD3	99	91.932	ENSELUG00000023984	ehd3	99	91.932	Esox_lucius
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.196	ENSFCAG00000029627	EHD3	100	97.196	Felis_catus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.262	ENSFALG00000011448	EHD3	100	96.262	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.196	ENSFDAG00000017946	EHD3	100	97.196	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.150	ENSFHEG00000018572	ehd3	100	92.150	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000013011	EHD3	99	89.888	ENSGMOG00000006447	ehd3	100	89.888	Gadus_morhua
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.449	ENSGALG00000009086	EHD3	100	96.449	Gallus_gallus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.589	ENSGAFG00000005665	ehd3	100	91.589	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000013011	EHD3	99	91.386	ENSGACG00000013160	ehd3	96	91.386	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.449	ENSGAGG00000024938	EHD3	100	96.449	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	ENSGGOG00000003031	EHD3	100	96.822	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.150	ENSHBUG00000023210	ehd3	100	92.150	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.009	ENSHGLG00000014803	EHD3	100	97.009	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.009	ENSHGLG00100011636	EHD3	100	97.009	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.402	ENSHCOG00000018418	ehd3	100	91.402	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.963	ENSIPUG00000004603	Ehd3	100	91.963	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.262	ENSSTOG00000028279	EHD3	100	96.262	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	ENSJJAG00000013415	Ehd3	100	96.822	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.589	ENSKMAG00000018498	ehd3	100	91.589	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.028	ENSLBEG00000009464	ehd3	100	91.028	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.402	ENSLOCG00000016786	ehd3	100	91.402	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000013011	EHD3	99	94.944	ENSLAFG00000016215	EHD3	97	94.944	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.449	ENSMFAG00000033132	EHD3	100	96.449	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.449	ENSMMUG00000003476	EHD3	100	96.449	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.449	ENSMNEG00000041202	EHD3	100	96.449	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	ENSMLEG00000023912	EHD3	100	96.822	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.963	ENSMAMG00000014744	ehd3	100	91.963	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.150	ENSMZEG00005012558	ehd3	100	92.150	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.009	ENSMAUG00000013239	Ehd3	100	97.009	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	95.140	ENSMICG00000043744	EHD3	100	95.140	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.636	ENSMOCG00000012572	Ehd3	100	96.636	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	77.757	ENSMMOG00000015157	ehd3	100	78.505	Mola_mola
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	99.252	ENSMODG00000015505	EHD3	100	99.252	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.776	ENSMALG00000015586	ehd3	100	91.776	Monopterus_albus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	MGP_CAROLIEiJ_G0021870	Ehd3	100	96.822	Mus_caroli
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	ENSMUSG00000024065	Ehd3	100	96.822	Mus_musculus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.009	MGP_PahariEiJ_G0020857	Ehd3	100	97.009	Mus_pahari
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.636	MGP_SPRETEiJ_G0022782	Ehd3	100	96.636	Mus_spretus
ENSSHAG00000013011	EHD3	89	96.639	ENSMPUG00000005148	EHD3	100	96.639	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.897	ENSMLUG00000008050	EHD3	100	92.897	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.383	ENSNGAG00000014439	Ehd3	100	97.383	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.963	ENSNBRG00000022653	ehd3	100	91.963	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000013011	EHD3	89	96.862	ENSNLEG00000015546	EHD3	100	96.862	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	95.140	ENSOPRG00000012242	EHD3	98	95.140	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.196	ENSODEG00000008117	EHD3	100	97.196	Octodon_degus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.963	ENSONIG00000000693	ehd3	100	91.963	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.201	ENSOCUG00000001228	EHD3	100	97.201	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.215	ENSORLG00000017118	ehd3	100	91.215	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.215	ENSORLG00020002121	ehd3	100	91.215	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.215	ENSORLG00015020550	ehd3	100	91.215	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.589	ENSOMEG00000000506	ehd3	100	91.589	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	95.514	ENSOGAG00000000397	EHD3	100	95.514	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.150	ENSOARG00000019698	EHD3	100	93.645	Ovis_aries
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	ENSPPAG00000035288	EHD3	100	96.822	Pan_paniscus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.009	ENSPPRG00000002225	EHD3	100	97.009	Panthera_pardus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.196	ENSPTIG00000013343	EHD3	100	97.196	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	ENSPTRG00000011805	EHD3	100	96.822	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	ENSPANG00000023120	EHD3	100	96.822	Papio_anubis
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.589	ENSPKIG00000001422	ehd3	100	91.589	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.449	ENSPSIG00000017757	EHD3	100	96.449	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.215	ENSPMGG00000007882	ehd3	100	91.215	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	99.065	ENSPCIG00000008811	EHD3	100	99.065	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.150	ENSPFOG00000010935	ehd3	100	92.150	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.336	ENSPLAG00000001005	ehd3	100	92.336	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.150	ENSPMEG00000006514	ehd3	100	92.150	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.963	ENSPREG00000012884	ehd3	100	91.963	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.636	ENSPPYG00000012514	EHD3	100	96.636	Pongo_abelii
ENSSHAG00000013011	EHD3	89	95.816	ENSPCAG00000008166	EHD3	100	95.816	Procavia_capensis
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	95.701	ENSPCOG00000013548	EHD3	100	95.701	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000013011	EHD3	98	97.126	ENSPVAG00000002680	EHD3	100	97.126	Pteropus_vampyrus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.150	ENSPNYG00000003812	ehd3	100	92.150	Pundamilia_nyererei
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.523	ENSPNAG00000028984	ehd3	100	92.523	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.009	ENSRNOG00000007744	Ehd3	100	97.009	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000013011	EHD3	99	96.987	ENSRBIG00000033877	EHD3	100	91.323	Rhinopithecus_bieti
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	ENSRROG00000045782	EHD3	100	96.822	Rhinopithecus_roxellana
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.449	ENSSBOG00000030935	EHD3	100	96.449	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.589	ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.589	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.402	ENSSMAG00000008537	ehd3	100	91.402	Scophthalmus_maximus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	92.336	ENSSDUG00000010820	ehd3	100	92.336	Seriola_dumerili
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	90.654	ENSSLDG00000025510	ehd3	100	90.654	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSHAG00000013011	EHD3	99	97.004	ENSSPUG00000014730	EHD3	99	97.004	Sphenodon_punctatus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.776	ENSSPAG00000013275	ehd3	100	91.776	Stegastes_partitus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	95.701	ENSSSCG00000035987	EHD3	100	95.701	Sus_scrofa
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	94.590	ENSTGUG00000004572	EHD3	100	94.590	Taeniopygia_guttata
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.776	ENSTRUG00000014338	ehd3	100	91.776	Takifugu_rubripes
ENSSHAG00000013011	EHD3	99	91.745	ENSTNIG00000010948	ehd3	99	91.745	Tetraodon_nigroviridis
ENSSHAG00000013011	EHD3	99	95.104	ENSTBEG00000010371	EHD3	97	95.104	Tupaia_belangeri
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.963	ENSTTRG00000000167	EHD3	100	91.963	Tursiops_truncatus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	96.822	ENSUAMG00000022243	EHD3	100	96.822	Ursus_americanus
ENSSHAG00000013011	EHD3	99	95.880	ENSUMAG00000019931	EHD3	100	95.816	Ursus_maritimus
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	97.383	ENSVVUG00000007563	EHD3	98	97.383	Vulpes_vulpes
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	93.458	ENSXETG00000022070	ehd3	100	93.458	Xenopus_tropicalis
ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.776	ENSXMAG00000025261	ehd3	100	91.776	Xiphophorus_maculatus