EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000013062 (Gene tree)
Gene ID: 100934359
Gene Symbol: FTSJ3
Alias: SPB1
Full Name: FtsJ RNA methyltransferase homolog 3
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6841 bases
Position: chrGL856832.1:1156245-1163085
Accession: 17136
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000015323	FtsJ	PF01728.19	1.5e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000015450	FTSJ3-201	2505	-	ENSSHAP00000015323	835 (aa)	-	G3WIR8

Gene Model

Click here to download ENSSHAG00000013062's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSHAG00000013062's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.658	ENSG00000108592	FTSJ3	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	71	69.000	ENSAPOG00000005543	ftsj3	87	68.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	78.665	ENSAMEG00000003148	FTSJ3	100	79.142	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	63	59.528	ENSACIG00000012880	ftsj3	67	61.101	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	66	62.500	ENSAOCG00000023196	ftsj3	98	61.227	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	66	65.719	ENSAPEG00000004250	ftsj3	99	61.227	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	92	60.026	ENSATEG00000010069	ftsj3	97	60.153	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	92	62.051	ENSAPLG00000010362	-	100	61.568	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	88	63.515	ENSACAG00000017930	FTSJ3	100	64.181	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	78.072	ENSANAG00000033774	FTSJ3	100	78.055	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	84	70.225	ENSACLG00000019137	ftsj3	97	70.225	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	60.967	ENSAMXG00000021571	ftsj3	95	61.053	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	79.614	ENSBTAG00000021060	FTSJ3	100	78.266	Bos_taurus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	39.745	WBGene00019168	H06I04.3	62	47.289	Caenorhabditis_elegans
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.630	ENSCJAG00000019631	FTSJ3	100	77.619	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	77.751	ENSCAFG00000012770	FTSJ3	100	79.004	Canis_familiaris
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	79.216	ENSCAFG00020026630	FTSJ3	100	79.548	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	79.106	ENSCHIG00000025676	FTSJ3	100	78.359	Capra_hircus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	96	74.222	ENSTSYG00000001393	FTSJ3	99	73.375	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	64	83.333	ENSCAPG00000016654	FTSJ3	93	82.464	Cavia_aperea
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	76.683	ENSCPOG00000011384	FTSJ3	100	76.596	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.911	ENSCCAG00000023533	-	97	82.331	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.338	ENSCATG00000018510	FTSJ3	100	76.824	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.952	ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	77.224	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	77.133	ENSCSAG00000003921	FTSJ3	100	76.387	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	67.574	ENSCPBG00000010032	FTSJ3	95	77.957	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	58	57.003	ENSCSAVG00000003607	-	99	41.637	Ciona_savignyi
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.617	ENSCANG00000042921	FTSJ3	100	77.150	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.670	ENSCGRG00001018068	FTSJ3	100	76.996	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.670	ENSCGRG00000010648	FTSJ3	100	76.996	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	60.422	ENSCSEG00000013468	ftsj3	97	60.492	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.574	ENSCVAG00000007484	ftsj3	98	62.738	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	63.020	ENSDARG00000104938	ftsj3	99	61.321	Danio_rerio
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	77.647	ENSDNOG00000002392	FTSJ3	100	77.882	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.119	ENSDORG00000004200	Ftsj3	100	77.473	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	64	42.553	FBgn0030720	CG8939	67	40.708	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	74.410	ENSETEG00000019228	FTSJ3	66	80.287	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	78.774	ENSEASG00005013565	FTSJ3	100	78.947	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	79.376	ENSECAG00000011995	FTSJ3	99	77.594	Equus_caballus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	59.791	ENSELUG00000013501	ftsj3	97	60.575	Esox_lucius
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	77.699	ENSFCAG00000013983	FTSJ3	100	78.081	Felis_catus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	68.639	ENSFALG00000013635	FTSJ3	99	68.501	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	76.300	ENSFDAG00000010274	FTSJ3	100	75.952	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.766	ENSFHEG00000007639	ftsj3	98	62.694	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	50	71.854	ENSGMOG00000017184	ftsj3	100	71.396	Gadus_morhua
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	70.406	ENSGALG00000032993	FTSJ3	100	70.000	Gallus_gallus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	50	71.429	ENSGACG00000009841	ftsj3	100	71.663	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	70.922	ENSGAGG00000006236	FTSJ3	100	70.235	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	78.417	ENSGGOG00000006794	FTSJ3	100	77.123	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.426	ENSHBUG00000022331	ftsj3	97	63.002	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.576	ENSHGLG00000012282	FTSJ3	100	76.492	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	76.998	ENSHGLG00100003578	FTSJ3	100	76.492	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.381	ENSHCOG00000018770	ftsj3	97	62.367	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.307	ENSIPUG00000024942	ftsj3	95	62.118	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	76.534	ENSSTOG00000021265	FTSJ3	100	77.078	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.576	ENSJJAG00000012822	Ftsj3	100	77.446	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.456	ENSKMAG00000021997	ftsj3	65	67.025	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.945	ENSLBEG00000027142	ftsj3	97	62.515	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	81	49.646	ENSLACG00000005523	FTSJ3	98	48.883	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.134	ENSLOCG00000008979	ftsj3	99	60.976	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	79.597	ENSLAFG00000003252	FTSJ3	100	79.454	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.404	ENSMFAG00000003764	FTSJ3	100	76.533	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	73.035	ENSMMUG00000016768	FTSJ3	92	84.524	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.311	ENSMNEG00000029254	FTSJ3	100	76.471	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.431	ENSMLEG00000029091	FTSJ3	100	76.796	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	61.098	ENSMAMG00000006408	ftsj3	67	67.159	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	63.615	ENSMZEG00005001992	ftsj3	97	63.270	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	66	71.880	ENSMGAG00000000953	FTSJ3	67	73.665	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.361	ENSMAUG00000015688	Ftsj3	100	76.777	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	78.700	ENSMICG00000045996	FTSJ3	100	77.976	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	77.924	ENSMOCG00000017809	Ftsj3	100	77.343	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	59.976	ENSMMOG00000019522	ftsj3	91	59.207	Mola_mola
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	89.524	ENSMODG00000009901	FTSJ3	99	89.048	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	78.554	MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	77.791	Mus_caroli
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	78.460	ENSMUSG00000020706	Ftsj3	100	77.817	Mus_musculus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	78.365	MGP_PahariEiJ_G0018445	Ftsj3	100	77.725	Mus_pahari
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.952	MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	77.316	Mus_spretus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	78.055	ENSMPUG00000014911	FTSJ3	100	77.435	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	79.739	ENSMLUG00000011667	FTSJ3	100	78.318	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	78.140	ENSNGAG00000005899	Ftsj3	100	77.208	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	85	71.658	ENSNBRG00000017453	ftsj3	98	71.658	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	78.072	ENSNLEG00000004188	FTSJ3	100	76.686	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	86.858	ENSMEUG00000013252	FTSJ3	99	86.738	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	76.591	ENSOPRG00000014985	FTSJ3	100	76.603	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	77.041	ENSODEG00000008167	FTSJ3	100	76.777	Octodon_degus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	60.660	ENSONIG00000001654	ftsj3	97	62.854	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	77.446	ENSOCUG00000004319	FTSJ3	100	77.804	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	61.475	ENSORLG00000005910	ftsj3	97	61.955	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	75	70.430	ENSORLG00020021255	ftsj3	91	70.430	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.000	ENSORLG00015018416	ftsj3	97	61.275	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.146	ENSOMEG00000014432	ftsj3	90	71.429	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	77.738	ENSOGAG00000032479	FTSJ3	100	78.622	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	79.469	ENSOARG00000013637	FTSJ3	100	78.835	Ovis_aries
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.685	ENSPPAG00000027297	FTSJ3	100	76.498	Pan_paniscus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	77.580	ENSPPRG00000003042	FTSJ3	100	77.962	Panthera_pardus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	77.005	ENSPTIG00000012576	FTSJ3	100	77.358	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.804	ENSPTRG00000009524	FTSJ3	100	75.496	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.404	ENSPANG00000020978	FTSJ3	100	76.769	Papio_anubis
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	62.545	ENSPKIG00000012838	ftsj3	98	62.280	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	59	82.955	ENSPSIG00000004632	FTSJ3	69	83.673	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	87	68.500	ENSPMGG00000012959	ftsj3	94	68.500	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	78.087	ENSPEMG00000000248	Ftsj3	100	77.658	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	93.070	ENSPCIG00000009088	FTSJ3	99	92.951	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	61.260	ENSPFOG00000023101	ftsj3	98	61.816	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	61.047	ENSPLAG00000003846	ftsj3	98	61.601	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	61.260	ENSPMEG00000012692	ftsj3	98	61.816	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	61.324	ENSPREG00000014874	ftsj3	98	62.310	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.845	ENSPPYG00000008532	FTSJ3	100	76.338	Pongo_abelii
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	76.100	ENSPCAG00000002560	FTSJ3	99	75.772	Procavia_capensis
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	78.916	ENSPCOG00000023921	FTSJ3	100	78.292	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	77.076	ENSPVAG00000000162	FTSJ3	100	77.568	Pteropus_vampyrus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	85	71.505	ENSPNYG00000005108	ftsj3	98	71.505	Pundamilia_nyererei
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	97	59.587	ENSPNAG00000022474	ftsj3	95	60.744	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	78.214	ENSRNOG00000009857	Ftsj3	100	77.910	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	76.988	ENSRBIG00000039259	FTSJ3	100	76.394	Rhinopithecus_bieti
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	76.988	ENSRROG00000045002	FTSJ3	100	76.512	Rhinopithecus_roxellana
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	54	40.598	YCL054W	-	53	40.773	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	77.284	ENSSBOG00000031794	FTSJ3	92	77.311	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.307	ENSSFOG00015018053	ftsj3	98	61.366	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	66	63.351	ENSSMAG00000002863	ftsj3	97	60.895	Scophthalmus_maximus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.130	ENSSDUG00000003385	ftsj3	97	61.837	Seriola_dumerili
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	61.475	ENSSLDG00000017970	ftsj3	97	61.170	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	92	68.678	ENSSPUG00000012959	FTSJ3	99	68.123	Sphenodon_punctatus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	60.517	ENSSPAG00000002390	ftsj3	97	60.465	Stegastes_partitus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	79.419	ENSSSCG00000017288	FTSJ3	100	79.261	Sus_scrofa
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	62.559	ENSTRUG00000017550	ftsj3	90	70.968	Takifugu_rubripes
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	61.484	ENSTNIG00000015549	ftsj3	99	61.995	Tetraodon_nigroviridis
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	72.343	ENSTBEG00000010295	FTSJ3	100	72.414	Tupaia_belangeri
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.201	ENSTTRG00000006973	FTSJ3	100	76.860	Tursiops_truncatus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	82	94.030	ENSUAMG00000007332	FTSJ3	95	91.830	Ursus_americanus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	78.095	ENSUMAG00000017450	FTSJ3	100	78.214	Ursus_maritimus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	100	79.691	ENSVVUG00000006106	FTSJ3	100	79.905	Vulpes_vulpes
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	97	58.314	ENSXETG00000006939	ftsj3	64	62.264	Xenopus_tropicalis
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	63	68.343	ENSXCOG00000002999	ftsj3	66	68.529	Xiphophorus_couchianus
ENSSHAG00000013062	FTSJ3	99	61.893	ENSXMAG00000018139	ftsj3	98	61.279	Xiphophorus_maculatus