EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000013864 (Gene tree)
Gene ID: 100913488
Gene Symbol: XPO6
Alias: FLJ22519|KIAA0370|RANBP20
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 115834 bases
Position: chrGL841556.1:1335936-1451769
Accession: 100913488
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000016294	Xpo1	PF08389.12	2.2e-25	1	1
ENSSHAP00000016293	Xpo1	PF08389.12	2.6e-25	1	1
ENSSHAP00000016294	IBN_N	PF03810.19	1.4e-09	1	1
ENSSHAP00000016293	IBN_N	PF03810.19	1.7e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000016429	XPO6-202	5377	-	ENSSHAP00000016294	1125 (aa)	XP_003762129	G3WLI9
ENSSHAT00000016428	XPO6-201	5380	-	ENSSHAP00000016293	1126 (aa)	-	G3WLI8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.933	ENSG00000169180	XPO6	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	76.797	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.910	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	94.929	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	94.929	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	77.394	ENSACIG00000008055	xpo6	99	77.394	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	78.222	ENSAOCG00000001326	xpo6	99	78.222	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	78.133	ENSAPEG00000016304	xpo6	99	78.133	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	78.191	ENSATEG00000002273	xpo6	100	78.191	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	96.085	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	96.085	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	80.936	ENSACAG00000016883	XPO6	100	80.936	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.756	ENSANAG00000031761	XPO6	100	94.756	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	77.986	ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.986	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	72.862	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.862	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.400	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	94.400	Bos_taurus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.022	ENSCJAG00000006014	XPO6	100	95.022	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	95.107	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	95.107	Canis_familiaris
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.200	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	95.200	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.489	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	94.489	Capra_hircus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	91.436	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	91.436	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.578	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	94.578	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.667	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	94.667	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.200	ENSCATG00000034030	XPO6	100	95.200	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	94.840	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	94.840	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000013864	XPO6	91	94.344	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	94.344	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000013864	XPO6	89	94.890	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	97.059	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	47.115	ENSCING00000006884	-	100	47.115	Ciona_intestinalis
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	46.367	ENSCSAVG00000000850	-	99	46.367	Ciona_savignyi
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.022	ENSCANG00000041578	XPO6	100	95.022	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	93.867	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	93.867	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	76.821	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	76.821	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	77.248	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	77.248	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000013864	XPO6	97	71.813	ENSDARG00000041217	xpo6	99	71.813	Danio_rerio
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.489	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	94.489	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.400	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	94.400	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000013864	XPO6	82	91.506	ENSETEG00000018768	XPO6	85	91.506	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	62.566	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	62.622	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.756	ENSEASG00005017296	XPO6	100	94.756	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.667	ENSECAG00000008601	XPO6	100	94.667	Equus_caballus
ENSSHAG00000013864	XPO6	97	88.726	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	88.726	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	79.108	ENSELUG00000009159	xpo6	100	79.108	Esox_lucius
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.289	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	95.289	Felis_catus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	93.551	ENSFALG00000004441	XPO6	98	93.551	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	94.484	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	94.484	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	76.862	ENSFHEG00000021190	xpo6	99	76.862	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.911	ENSGALG00000035360	XPO6	100	95.911	Gallus_gallus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	75.348	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.348	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000013864	XPO6	95	95.966	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	95.966	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.844	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	94.844	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	76.476	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	76.736	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.222	ENSHGLG00000009679	-	100	94.222	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000013864	XPO6	94	74.921	ENSHGLG00000003865	-	99	74.921	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000013864	XPO6	94	78.549	ENSHGLG00100001081	-	99	78.549	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.133	ENSHGLG00100003673	-	99	94.133	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	75.784	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	75.784	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	72.528	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	72.616	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.022	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	95.022	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.133	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	94.133	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	76.759	ENSKMAG00000010403	xpo6	99	76.759	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	77.898	ENSLBEG00000023039	xpo6	99	77.898	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	87.289	ENSLACG00000017930	XPO6	100	87.289	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000013864	XPO6	94	82.260	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.260	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	94.395	ENSLAFG00000011960	XPO6	98	98.077	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.200	ENSMFAG00000045067	XPO6	100	95.200	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.200	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	95.200	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.200	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	95.200	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.200	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	95.200	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	76.190	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	76.821	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	78.075	ENSMZEG00005010620	xpo6	99	78.075	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000013864	XPO6	97	95.169	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	95.169	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	84.046	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	83.779	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.289	ENSMICG00000001923	XPO6	100	95.289	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.133	ENSMOCG00000008015	Xpo6	100	94.133	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	77.620	ENSMMOG00000011992	xpo6	100	77.620	Mola_mola
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	99.022	ENSMODG00000015516	XPO6	100	99.022	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	71.391	ENSMALG00000020612	xpo6	99	71.656	Monopterus_albus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.667	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	96.986	Mus_caroli
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.489	ENSMUSG00000000131	Xpo6	100	94.489	Mus_musculus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.489	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	94.489	Mus_pahari
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.222	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	94.222	Mus_spretus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	94.306	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	94.306	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	94.306	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	94.306	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	94.751	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	94.751	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	76.389	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	76.649	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.933	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	94.933	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000013864	XPO6	87	96.124	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	96.124	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	94.133	ENSODEG00000012917	XPO6	100	94.133	Octodon_degus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	76.215	ENSONIG00000019366	xpo6	100	76.476	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	94.840	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	94.840	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	76.195	ENSORLG00000011231	xpo6	100	76.195	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	77.718	ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.718	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	76.108	ENSORLG00015003636	xpo6	100	76.108	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	76.261	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	76.261	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	95.463	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	95.463	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	94.484	ENSOARG00000000960	XPO6	100	94.484	Ovis_aries
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.022	ENSPPAG00000033668	XPO6	100	95.022	Pan_paniscus
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	95.230	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	95.230	Panthera_pardus
ENSSHAG00000013864	XPO6	97	94.383	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	94.383	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.022	ENSPTRG00000007919	XPO6	100	95.022	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	95.200	ENSPANG00000017103	XPO6	100	95.200	Papio_anubis
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	80.444	ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.444	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	92.896	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	92.896	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	77.498	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	77.498	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	93.956	ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	93.956	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000013864	XPO6	99	72.232	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	72.232	Petromyzon_marinus
ENSSHAG00000013864	XPO6	97	98.993	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	98.967	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	75.544	ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.544	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	75.523	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	75.523	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000013864	XPO6	100	75.436	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	75.436	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000013864	XPO6	97	75.112	ENSPREG00000016421	xpo6	96	75.112	Poecilia_reticulata
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