EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000014942 (Gene tree)
Gene ID: 100932572
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 39720 bases
Position: chrGL834732.1:1633630-1673349
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000017592	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.9e-27	1	2
ENSSHAP00000017592	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.9e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000017737	PAPOLG-201	2296	-	ENSSHAP00000017592	709 (aa)	-	G3WQ87

Gene Model

Click here to download ENSSHAG00000014942's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
shr03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSHAG00000014942's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	58.230	ENSSHAG00000015211	PAPOLA	94	58.368

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.660	ENSG00000115421	PAPOLG	100	97.436	Homo_sapiens
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	71.849	ENSAPOG00000004798	papolg	93	68.592	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.369	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	94	88.369	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	67.376	ENSACIG00000010546	papolg	93	68.201	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	71.849	ENSAOCG00000010254	papolg	84	72.006	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	71.989	ENSAPEG00000006944	papolg	84	72.145	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	71.589	ENSATEG00000009007	papolg	92	71.888	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	75.316	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	95	75.316	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	85	63.889	ENSACAG00000015048	-	100	63.889	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.376	ENSANAG00000024627	PAPOLG	94	87.376	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.315	ENSACLG00000015592	papolg	84	70.000	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	73.370	ENSAMXG00000004611	papolg	94	73.370	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.227	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	94	88.227	Bos_taurus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.518	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	94	87.518	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.819	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	78.417	Canis_familiaris
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.201	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	94	87.201	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.801	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	94	87.801	Capra_hircus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.518	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	94	87.518	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	54	89.764	ENSCAPG00000014901	-	100	89.764	Cavia_aperea
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.943	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	94	87.943	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.801	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	94	87.801	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	90	96.791	ENSCATG00000044395	PAPOLG	93	96.791	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.369	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	94	88.369	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.376	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	94	87.376	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	94	85.307	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	85.307	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	67	63.312	ENSCING00000024664	-	89	63.312	Ciona_intestinalis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	64	64.551	ENSCSAVG00000009085	-	92	64.551	Ciona_savignyi
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.376	ENSCANG00000038120	PAPOLG	94	87.376	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	86.525	ENSCGRG00001014951	Papolg	95	86.525	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	86.525	ENSCGRG00000005552	-	95	86.525	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.339	ENSCSEG00000000771	papolg	94	69.915	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	68.536	ENSCVAG00000016602	papolg	83	86.207	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	73.810	ENSDARG00000012141	papolg	94	73.810	Danio_rerio
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	85.532	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	94	85.532	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	54	97.403	ENSDORG00000016228	Papolg	90	97.403	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	67.847	ENSETEG00000011815	PAPOLG	94	68.079	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	54	70.157	ENSEBUG00000004020	papolg	77	70.157	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	65	58.315	ENSEBUG00000005042	-	79	58.315	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.085	ENSEASG00005002038	PAPOLG	94	88.085	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.119	ENSECAG00000009859	PAPOLG	93	88.085	Equus_caballus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	77.305	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	94	77.305	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	72.810	ENSELUG00000014497	papolg	94	65.866	Esox_lucius
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.801	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	94	87.801	Felis_catus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	67.039	ENSFALG00000011079	PAPOLG	92	67.039	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.801	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	91	87.801	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	71	62.646	ENSFHEG00000019080	papolg	90	63.035	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	84	85.119	ENSGMOG00000018772	papolg	86	85.119	Gadus_morhua
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	71.669	ENSGALG00000007853	PAPOLG	94	71.669	Gallus_gallus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.038	ENSGAFG00000003263	papolg	94	68.880	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	70.990	ENSGACG00000002718	papolg	94	71.488	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.518	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	94	87.518	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.315	ENSHBUG00000004882	papolg	85	70.137	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.369	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	94	88.369	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.369	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	94	88.369	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.553	ENSHCOG00000006782	papolg	83	69.888	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	72.740	ENSIPUG00000021642	papolg	95	73.056	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.369	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	94	88.369	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	54	97.143	ENSJJAG00000015601	Papolg	90	97.143	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	100	68.985	ENSKMAG00000016439	papolg	90	67.090	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	68.280	ENSLBEG00000023218	papolg	94	68.792	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	71.186	ENSLACG00000009543	PAPOLG	94	71.186	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	73.416	ENSLOCG00000016130	papolg	94	73.416	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	86.667	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	90	97.143	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.660	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	94	87.660	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.660	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	94	87.660	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	78.732	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	94	78.732	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.518	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	94	87.518	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	72.191	ENSMAMG00000010667	papolg	94	69.547	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.315	ENSMZEG00005018140	papolg	95	69.456	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	72.958	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	94	72.958	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	86.809	ENSMAUG00000009088	Papolg	94	86.809	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.227	ENSMICG00000010042	PAPOLG	94	88.227	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	86.809	ENSMOCG00000006857	Papolg	94	86.809	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	70.391	ENSMMOG00000008020	papolg	94	70.613	Mola_mola
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	98.156	ENSMODG00000002160	PAPOLG	94	98.156	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	71.108	ENSMALG00000007012	papolg	84	71.269	Monopterus_albus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.376	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	90	97.656	Mus_caroli
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.252	ENSMUSG00000020273	Papolg	90	97.656	Mus_musculus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	86.950	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	95	86.950	Mus_pahari
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.252	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	90	97.656	Mus_spretus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.244	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	85	88.244	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.801	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	94	87.801	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	86.809	ENSNGAG00000001120	Papolg	94	86.809	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	62.901	ENSNBRG00000011943	papolg	94	63.738	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	54	97.922	ENSNLEG00000009507	-	90	97.922	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	80	77.451	ENSMEUG00000013605	-	81	77.451	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.376	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	94	87.376	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	54	93.766	ENSODEG00000012424	PAPOLG	90	93.766	Octodon_degus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	64.937	ENSONIG00000002985	papolg	94	65.358	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	90.819	ENSOANG00000012403	PAPOLG	94	90.819	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.943	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	94	87.943	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.114	ENSORLG00000001577	papolg	92	69.391	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.306	ENSORLG00020002482	papolg	83	69.583	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	68.975	ENSORLG00015008836	papolg	92	69.252	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	70.251	ENSOMEG00000001406	papolg	84	70.407	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	62	79.680	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	79.680	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.977	ENSOARG00000001563	PAPOLG	85	87.977	Ovis_aries
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.660	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	94	87.660	Pan_paniscus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.801	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	94	87.801	Panthera_pardus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.660	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	94	87.660	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.660	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	94	87.660	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	83.310	ENSPANG00000014543	PAPOLG	94	83.310	Papio_anubis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	91	70.615	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	90	70.615	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	72.269	ENSPKIG00000003313	papolg	94	72.269	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	80.395	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	94	80.395	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	86.241	ENSPEMG00000008960	-	95	86.241	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	52.646	ENSPMAG00000002961	papolg	94	52.925	Petromyzon_marinus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	65	64.130	ENSPMAG00000004864	-	91	64.130	Petromyzon_marinus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	100	98.166	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	94	98.166	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	71	84.661	ENSPFOG00000012909	papolg	94	68.603	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	71	84.661	ENSPLAG00000018445	papolg	84	68.741	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	68.750	ENSPMEG00000003961	papolg	84	68.733	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	71	84.462	ENSPREG00000010358	papolg	84	68.560	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.518	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	94	87.518	Pongo_abelii
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	76.454	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	95	76.454	Procavia_capensis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	78.440	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	93	78.440	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	86	92.115	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	83	92.115	Pteropus_vampyrus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.350	ENSPNYG00000006729	papolg	93	69.350	Pundamilia_nyererei
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	73.174	ENSPNAG00000015521	papolg	94	73.174	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	86.544	ENSRNOG00000006261	Papolg	94	86.544	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	80.993	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	94	80.993	Rhinopithecus_bieti
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.092	ENSRROG00000035954	PAPOLG	94	87.092	Rhinopithecus_roxellana
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.801	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	94	87.801	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.735	ENSSFOG00015002383	papolg	94	69.735	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	62.958	ENSSFOG00015011874	papolg	94	62.958	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	74	82.197	ENSSMAG00000015598	papolg	89	68.218	Scophthalmus_maximus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	70.927	ENSSDUG00000000912	papolg	92	71.089	Seriola_dumerili
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	70.365	ENSSLDG00000001217	papolg	92	70.531	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	79.408	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	94	79.408	Sphenodon_punctatus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	70.492	ENSSPAG00000009004	papolg	93	68.697	Stegastes_partitus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.260	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	94	88.227	Sus_scrofa
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	71	77.579	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	93	77.579	Taeniopygia_guttata
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	70.538	ENSTRUG00000006410	papolg	94	70.538	Takifugu_rubripes
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	65.284	ENSTNIG00000017106	papolg	94	65.284	Tetraodon_nigroviridis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	79.716	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	95	79.716	Tupaia_belangeri
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	83.262	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	94	83.262	Tursiops_truncatus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.227	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	95	88.227	Ursus_americanus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.244	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	86	88.244	Ursus_maritimus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	83.972	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	95	83.972	Vicugna_pacos
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.960	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	93	87.943	Vulpes_vulpes
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	75.843	ENSXETG00000002208	papolg	94	75.843	Xenopus_tropicalis
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	65	85.961	ENSXCOG00000006611	papolg	68	85.961	Xiphophorus_couchianus
ENSSHAG00000014942	PAPOLG	72	83.190	ENSXMAG00000007383	papolg	89	83.190	Xiphophorus_maculatus