EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000017320 (Gene tree)
Gene ID: 100925600
Gene Symbol: AGO4
Alias: EIF2C4|FLJ20033|KIAA1567|hAGO4
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 41843 bases
Position: chrGL849782.1:2640095-2681937
Accession: 18424
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000020420	PAZ	PF02170.22	5.5e-28	1	1
ENSSHAP00000020420	Piwi	PF02171.17	2.1e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000020581	AGO4-201	4398	-	ENSSHAP00000020420	861 (aa)	-	G3WYB5

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	82.028	ENSSHAG00000017468	AGO1	99	82.028
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	78.638	ENSSHAG00000009593	AGO2	97	78.638

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSG00000134698	AGO4	99	98.839	Homo_sapiens
ENSSHAG00000017320	AGO4	96	95.704	ENSAPOG00000023867	ago4	99	95.704	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	99.187	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	99.187	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000017320	AGO4	92	97.859	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.859	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000017320	AGO4	92	93.199	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.199	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.767	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.522	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.647	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	99.647	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.142	ENSACAG00000017275	AGO4	99	98.142	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.722	ENSANAG00000031428	AGO4	99	99.184	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	96.189	ENSACLG00000005181	ago4	100	94.836	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.881	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.599	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	98.250	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.250	Bos_taurus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.301	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000017320	AGO4	92	99.622	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.622	Canis_familiaris
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	99.071	ENSCHIG00000026564	AGO4	99	98.722	Capra_hircus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.300	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	99.300	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000017320	AGO4	94	95.100	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	95.100	Cavia_aperea
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	96.977	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	96.977	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.301	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	99.071	ENSCATG00000043421	AGO4	100	99.742	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.065	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	99.065	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSCSAG00000001090	AGO4	99	98.839	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000017320	AGO4	80	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.533	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.533	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.300	ENSCANG00000016914	AGO4	100	99.300	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.490	ENSCGRG00001002701	Ago4	99	98.490	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	98.949	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	98.949	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000017320	AGO4	92	91.709	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.709	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	97.103	ENSDARG00000100854	ago4	99	97.103	Danio_rerio
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.722	ENSDNOG00000015674	AGO4	99	98.722	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.070	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000017320	AGO4	60	99.507	ENSETEG00000018390	AGO4	83	99.507	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSEASG00005012079	AGO4	99	98.839	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSECAG00000024686	AGO4	99	98.839	Equus_caballus
ENSSHAG00000017320	AGO4	79	94.346	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	94.346	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.867	ENSELUG00000023873	ago4	99	95.867	Esox_lucius
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSFCAG00000006218	AGO4	99	98.839	Felis_catus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.299	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	99.299	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000017320	AGO4	97	88.663	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.663	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	97.093	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.093	Gadus_morhua
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	99.071	ENSGALG00000039713	AGO4	100	99.874	Gallus_gallus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.652	ENSGAFG00000017239	ago4	99	95.652	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	97.100	ENSGACG00000002683	ago4	99	97.100	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000017320	AGO4	92	99.874	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.874	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	96.014	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	96.014	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.652	ENSHBUG00000001525	ago4	99	95.652	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSHGLG00000010241	AGO4	99	98.839	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.413	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.413	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.538	ENSHCOG00000003725	ago4	99	95.538	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.767	ENSIPUG00000015600	ago4	99	95.767	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSSTOG00000004725	AGO4	99	98.839	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.767	ENSKMAG00000018602	ago4	99	95.767	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.114	ENSLBEG00000010670	ago4	99	95.114	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.142	ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.142	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	96.309	ENSLOCG00000000584	ago4	99	96.309	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000017320	AGO4	93	99.001	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	99.001	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	99.071	ENSMFAG00000035543	AGO4	99	99.071	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.184	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	99.603	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	99.603	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.299	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	99.299	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.652	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.356	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	96.189	ENSMZEG00005026346	ago4	99	95.652	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.183	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	99.183	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000017320	AGO4	82	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	97	98.000	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.067	ENSMICG00000033507	AGO4	100	99.067	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.374	ENSMOCG00000005772	Ago4	99	98.374	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000017320	AGO4	92	96.851	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.851	Mola_mola
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	99.187	ENSMODG00000017888	AGO4	99	99.187	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.465	ENSMALG00000011797	ago4	100	95.465	Monopterus_albus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	97.909	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	97.909	Mus_caroli
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	97.677	ENSMUSG00000042500	Ago4	99	97.677	Mus_musculus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	97.329	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	97.329	Mus_pahari
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	97.445	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	99	97.445	Mus_spretus
ENSSHAG00000017320	AGO4	92	99.622	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	99.622	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	98.133	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	98.133	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.299	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	99.299	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.652	ENSNBRG00000013492	ago4	99	95.652	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.299	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	99.299	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000017320	AGO4	90	98.165	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	98.165	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	92.056	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	92.056	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000017320	AGO4	94	98.637	ENSODEG00000006355	AGO4	98	98.637	Octodon_degus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	96.744	ENSONIG00000013603	ago4	98	96.744	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000017320	AGO4	92	100.000	ENSOANG00000002082	AGO4	100	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.722	ENSOCUG00000004076	AGO4	99	98.722	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.767	ENSORLG00000009865	ago4	92	95.767	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.767	ENSORLG00020016978	ago4	92	95.767	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.767	ENSORLG00015008800	ago4	92	95.767	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	96.305	ENSOMEG00000006399	ago4	99	96.305	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	91.080	ENSOGAG00000027107	-	99	91.080	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000017320	AGO4	93	98.248	ENSOGAG00000004233	-	100	98.248	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.606	ENSOARG00000019568	AGO4	98	98.606	Ovis_aries
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.299	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	99.299	Pan_paniscus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSPPRG00000006520	AGO4	99	98.839	Panthera_pardus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.299	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	99.299	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	ENSPTRG00000000527	AGO4	99	98.839	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000017320	AGO4	92	99.622	ENSPANG00000007232	AGO4	100	99.622	Papio_anubis
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.767	ENSPKIG00000022598	ago4	99	95.767	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.533	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	99.533	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000017320	AGO4	92	97.733	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.733	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	88.644	ENSPEMG00000022651	-	96	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000017320	AGO4	100	99.535	ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.187	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.767	ENSPFOG00000001935	ago4	99	95.767	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	96.987	ENSPLAG00000011534	ago4	99	96.987	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.767	ENSPMEG00000005049	ago4	99	95.767	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	96.305	ENSPREG00000010315	ago4	99	95.767	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.299	ENSPPYG00000001552	AGO4	100	99.299	Pongo_abelii
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	99.067	ENSPCOG00000015935	AGO4	100	99.067	Propithecus_coquereli
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ENSSHAG00000017320	AGO4	99	96.524	ENSPNAG00000005191	ago4	99	96.524	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000017320	AGO4	69	98.157	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	98.157	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000017320	AGO4	99	98.242	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	99.603	Rhinopithecus_bieti
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