EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000017438 (Gene tree)
Gene ID: 100933512
Gene Symbol: CELF1
Alias: BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50
Full Name: CUGBP Elav-like family member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16329 bases
Position: chrGL864893.1:2720035-2736363
Accession: 100933512
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000020563	RRM_1	PF00076.22	2.9e-52	1	3
ENSSHAP00000020563	RRM_1	PF00076.22	2.9e-52	2	3
ENSSHAP00000020563	RRM_1	PF00076.22	2.9e-52	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000020727	CELF1-201	2081	-	ENSSHAP00000020563	487 (aa)	XP_023362129	G3WYQ8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000017438	CELF1	56	40.741	ENSSHAG00000013832	-	70	40.741
ENSSHAG00000017438	CELF1	97	43.662	ENSSHAG00000015744	CELF3	72	54.891
ENSSHAG00000017438	CELF1	67	35.714	ENSSHAG00000003431	-	53	34.884
ENSSHAG00000017438	CELF1	56	77.174	ENSSHAG00000009688	-	61	77.419
ENSSHAG00000017438	CELF1	55	45.679	ENSSHAG00000008109	ELAVL1	81	45.679
ENSSHAG00000017438	CELF1	97	43.069	ENSSHAG00000008823	CELF5	58	62.500
ENSSHAG00000017438	CELF1	58	34.615	ENSSHAG00000005583	ELAVL3	76	35.065
ENSSHAG00000017438	CELF1	55	41.975	ENSSHAG00000006756	ELAVL2	72	41.975
ENSSHAG00000017438	CELF1	53	39.506	ENSSHAG00000001657	-	70	39.506

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSG00000149187	CELF1	100	98.718	Homo_sapiens
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	86.410	ENSAPOG00000024000	celf1	100	86.410	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.741	ENSAMEG00000007596	CELF1	95	97.741	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	84.016	ENSACIG00000023843	celf1	100	82.992	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	86.410	ENSAOCG00000001252	celf1	100	86.410	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	86.613	ENSAPEG00000002340	celf1	97	86.613	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	83.197	ENSATEG00000010871	celf1	100	82.582	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	96.933	ENSACAG00000002114	CELF1	95	96.933	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.357	ENSANAG00000031770	CELF1	95	98.357	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	85.656	ENSACLG00000010181	-	100	81.967	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	84.325	ENSAMXG00000020576	celf1	93	83.929	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.125	ENSBTAG00000002520	CELF1	100	97.125	Bos_taurus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSCJAG00000020133	CELF1	95	98.563	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.947	ENSCAFG00000008452	CELF1	95	97.947	Canis_familiaris
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.947	ENSCAFG00020025487	CELF1	100	93.061	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.331	ENSCHIG00000024582	CELF1	95	97.331	Capra_hircus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.357	ENSTSYG00000003866	CELF1	100	98.357	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000017438	CELF1	99	71.518	ENSCAPG00000006787	CELF1	94	70.894	Cavia_aperea
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.357	ENSCPOG00000036381	CELF1	100	98.357	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSCCAG00000033487	CELF1	100	98.357	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSCATG00000040143	CELF1	100	98.563	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.357	ENSCLAG00000011791	CELF1	100	94.045	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.152	ENSCSAG00000005786	CELF1	95	98.152	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000017438	CELF1	62	100.000	ENSCHOG00000004196	-	68	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.751	ENSCPBG00000022914	CELF1	100	97.751	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.152	ENSCANG00000032689	CELF1	100	97.741	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.741	ENSCGRG00001011274	Celf1	95	97.741	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.741	ENSCGRG00000015357	Celf1	95	97.741	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	75.205	ENSCSEG00000008675	celf1	100	72.746	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	84.752	ENSDARG00000005315	celf1	100	89.349	Danio_rerio
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSDNOG00000009523	CELF1	100	98.563	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	87.064	ENSDORG00000013721	Celf1	96	87.064	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000017438	CELF1	73	97.756	ENSETEG00000004507	CELF1	83	97.756	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	90.554	ENSEASG00005010831	CELF1	94	90.554	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.947	ENSECAG00000007741	CELF1	100	97.125	Equus_caballus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	79.466	ENSEEUG00000009782	CELF1	100	79.877	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	85.119	ENSELUG00000023173	celf1	100	84.524	Esox_lucius
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.947	ENSFCAG00000002535	CELF1	100	97.947	Felis_catus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	96.524	ENSFALG00000006402	CELF1	95	96.524	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.152	ENSFDAG00000008517	CELF1	100	98.152	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	84.694	ENSGMOG00000012783	celf1	98	84.286	Gadus_morhua
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	96.933	ENSGALG00000008097	CELF1	100	96.933	Gallus_gallus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	79.563	ENSGACG00000014226	celf1	94	79.563	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.546	ENSGAGG00000011562	CELF1	100	96.728	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSGGOG00000004106	CELF1	95	98.563	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	85.656	ENSHBUG00000017881	celf1	95	86.066	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.357	ENSHGLG00000006909	-	100	98.357	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	89.754	ENSHGLG00000019214	-	100	89.344	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.357	ENSHGLG00100013863	-	100	98.357	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	92.213	ENSHGLG00100017423	-	100	92.213	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	85.685	ENSHCOG00000000258	celf1	100	85.481	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	84.158	ENSIPUG00000023708	celf1	100	83.168	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSSTOG00000000613	CELF1	100	98.563	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.947	ENSJJAG00000020280	Celf1	95	97.947	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000017438	CELF1	70	84.706	ENSLBEG00000002047	-	98	82.941	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	86.680	ENSLBEG00000018296	celf1	93	85.859	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000017438	CELF1	69	80.938	ENSLACG00000018990	CELF1	85	80.938	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	88.048	ENSLOCG00000005966	celf1	94	87.649	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.947	ENSLAFG00000003484	CELF1	95	97.947	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSMFAG00000003505	CELF1	100	98.563	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.152	ENSMMUG00000011657	CELF1	99	97.741	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSMNEG00000022558	CELF1	100	98.563	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.357	ENSMLEG00000040834	CELF1	100	97.741	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	84.631	ENSMAMG00000010052	celf1	100	83.607	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	85.656	ENSMZEG00005018307	celf1	100	81.967	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	96.735	ENSMGAG00000010629	CELF1	96	96.735	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.947	ENSMAUG00000009468	Celf1	100	97.947	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSMICG00000045113	CELF1	95	98.563	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.152	ENSMOCG00000012633	Celf1	100	98.152	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	84.016	ENSMMOG00000015460	celf1	95	83.607	Mola_mola
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	99.589	ENSMODG00000019913	CELF1	100	99.589	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.152	MGP_CAROLIEiJ_G0023949	Celf1	100	98.152	Mus_caroli
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.152	ENSMUSG00000005506	Celf1	100	98.152	Mus_musculus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.152	MGP_PahariEiJ_G0025385	Celf1	100	98.152	Mus_pahari
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.947	MGP_SPRETEiJ_G0024859	Celf1	100	97.947	Mus_spretus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.947	ENSMPUG00000003960	CELF1	88	97.947	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.347	ENSMLUG00000016631	CELF1	95	97.347	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	96.509	ENSNGAG00000017390	Celf1	95	96.509	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000017438	CELF1	99	55.967	ENSNBRG00000023547	-	85	55.967	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.152	ENSNLEG00000014638	CELF1	100	97.741	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	99.384	ENSMEUG00000007763	CELF1	100	99.384	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.536	ENSOPRG00000003239	-	100	97.536	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.357	ENSODEG00000015204	CELF1	95	98.357	Octodon_degus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	85.041	ENSONIG00000008300	celf1	95	83.845	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.973	ENSOANG00000007896	CELF1	94	98.973	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.947	ENSOCUG00000001311	CELF1	95	97.947	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	79.513	ENSOMEG00000002381	celf1	100	79.796	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.551	ENSOGAG00000011600	CELF1	95	97.551	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.331	ENSOARG00000006924	CELF1	100	97.331	Ovis_aries
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSPPAG00000033870	CELF1	100	98.563	Pan_paniscus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.947	ENSPPRG00000002376	CELF1	100	97.947	Panthera_pardus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	97.947	ENSPTIG00000003974	CELF1	100	97.947	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSPTRG00000052299	CELF1	100	98.563	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.563	ENSPANG00000021676	CELF1	95	98.563	Papio_anubis
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	88.525	ENSPKIG00000012324	celf1	100	87.705	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	95.092	ENSPSIG00000003922	CELF1	95	95.092	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	88.696	ENSPMGG00000013192	celf1	95	76.892	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.152	ENSPEMG00000015644	Celf1	100	98.152	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000017438	CELF1	100	99.589	ENSPCIG00000022947	CELF1	97	99.589	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000017438	CELF1	70	70.206	ENSPFOG00000000961	-	100	67.257	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000017438	CELF1	88	70.845	ENSPLAG00000019373	-	82	70.640	Poecilia_latipinna
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