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Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000017468 (Gene tree)
Gene ID: 100920633
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23078 bases
Position: chrGL849782.1:2737115-2760192
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000020596	PAZ	PF02170.22	1.4e-24	1	1
ENSSHAP00000020596	Piwi	PF02171.17	9.4e-111	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000020761	AGO1-201	2568	-	ENSSHAP00000020596	855 (aa)	-	G3WYU1

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	82.028	ENSSHAG00000017320	AGO4	100	82.028
ENSSHAG00000017468	AGO1	98	82.681	ENSSHAG00000009593	AGO2	97	82.681

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSG00000092847	AGO1	100	98.726	Homo_sapiens
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSAPOG00000024299	ago1	99	94.854	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSAMEG00000000504	AGO1	99	98.480	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000017468	AGO1	82	90.780	ENSACIG00000005298	ago1	98	90.780	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSAOCG00000017727	ago1	99	94.854	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSAPEG00000004458	ago1	99	95.412	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSATEG00000008523	ago1	99	94.854	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	92.757	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	92.757	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000017468	AGO1	92	98.854	ENSACAG00000029174	AGO1	100	98.854	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSANAG00000037711	AGO1	99	98.480	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.620	ENSACLG00000000890	ago1	99	94.620	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000017468	AGO1	81	97.533	ENSAMXG00000001917	ago1	98	97.533	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.363	ENSBTAG00000012253	AGO1	99	98.363	Bos_taurus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSCJAG00000032023	AGO1	99	98.480	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSCAFG00000003443	AGO1	99	98.480	Canis_familiaris
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	98.577	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	97.558	ENSCHIG00000011848	-	99	97.558	Capra_hircus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSTSYG00000009767	-	100	98.363	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000017468	AGO1	98	78.622	ENSTSYG00000032426	-	99	78.622	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000017468	AGO1	90	93.776	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	92.902	Cavia_aperea
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSCPOG00000011568	AGO1	99	98.480	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSCCAG00000011823	AGO1	99	98.480	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	98.476	ENSCATG00000031521	AGO1	100	98.726	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSCLAG00000011507	AGO1	99	98.709	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSCSAG00000001091	AGO1	99	98.480	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000017468	AGO1	86	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.713	ENSCPBG00000018594	AGO1	99	98.713	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSCANG00000039798	AGO1	99	98.480	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSCGRG00001022708	Ago1	99	98.710	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	98.710	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	98.707	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	93.642	ENSCSEG00000001051	ago1	99	93.642	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSCVAG00000018173	ago1	99	94.854	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	95.088	ENSDARG00000092644	ago1	99	95.088	Danio_rerio
ENSSHAG00000017468	AGO1	92	98.726	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	98.726	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000017468	AGO1	91	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	99	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000017468	AGO1	84	91.377	ENSETEG00000007626	AGO1	99	91.377	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSEASG00005012086	AGO1	99	98.480	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSECAG00000024353	AGO1	99	98.480	Equus_caballus
ENSSHAG00000017468	AGO1	92	91.013	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.013	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000017468	AGO1	92	95.796	ENSELUG00000016803	ago1	100	95.796	Esox_lucius
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSFCAG00000000746	AGO1	99	98.480	Felis_catus
ENSSHAG00000017468	AGO1	92	91.233	ENSFALG00000000790	AGO1	100	91.233	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSFDAG00000017210	AGO1	99	98.595	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	91.529	ENSFHEG00000017927	ago1	99	91.529	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000017468	AGO1	88	84.043	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.043	Gadus_morhua
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.596	ENSGALG00000002249	AGO1	99	98.596	Gallus_gallus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSGAFG00000009775	ago1	99	94.854	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000017468	AGO1	88	95.889	ENSGACG00000012443	ago1	100	95.889	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000017468	AGO1	92	98.854	ENSGAGG00000012893	-	100	98.854	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSGGOG00000003316	AGO1	99	98.592	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.620	ENSHBUG00000010459	ago1	99	94.620	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSHGLG00000011540	AGO1	99	98.709	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSHGLG00100005568	AGO1	99	98.709	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	95.412	ENSHCOG00000005708	ago1	99	95.412	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	95.088	ENSIPUG00000023216	ago1	99	95.088	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSSTOG00000010857	AGO1	99	98.480	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.596	ENSJJAG00000019449	Ago1	99	98.826	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSKMAG00000019464	ago1	99	94.854	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSLBEG00000007694	ago1	99	94.854	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	92.840	ENSLACG00000017009	AGO1	99	92.840	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	92.749	ENSLOCG00000000504	AGO1	99	92.749	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	98.710	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	98.710	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSMFAG00000002846	AGO1	99	98.480	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	93.684	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	94.090	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	95.188	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	98.726	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSMLEG00000038388	AGO1	99	98.480	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSMAMG00000008381	ago1	99	94.854	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.620	ENSMZEG00005007996	ago1	99	94.620	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	93.271	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	93.271	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSMAUG00000015189	Ago1	99	98.480	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSMICG00000016147	AGO1	99	98.480	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.363	ENSMOCG00000000537	Ago1	99	98.363	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000017468	AGO1	79	97.325	ENSMMOG00000018459	ago1	93	97.325	Mola_mola
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.830	ENSMODG00000023335	AGO1	99	98.830	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	95.294	ENSMALG00000011057	ago1	99	95.363	Monopterus_albus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	97.842	Mus_caroli
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	97.842	Mus_musculus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	97.842	Mus_pahari
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	97.842	Mus_spretus
ENSSHAG00000017468	AGO1	84	98.752	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	98.752	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000017468	AGO1	62	97.338	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	97.338	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.596	ENSNGAG00000017448	Ago1	99	98.824	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000017468	AGO1	92	95.796	ENSNBRG00000010867	ago1	100	95.796	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.363	ENSNLEG00000011181	AGO1	99	98.363	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000017468	AGO1	85	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000017468	AGO1	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	92	100.000	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSODEG00000005321	AGO1	99	98.480	Octodon_degus
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	94.842	ENSONIG00000016345	ago1	100	94.842	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	89.942	ENSOANG00000002080	AGO1	99	90.909	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.596	ENSOCUG00000023116	AGO1	99	98.596	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSORLG00000014965	ago1	99	94.854	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSORLG00020018253	ago1	99	94.854	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSORLG00015003287	ago1	99	94.854	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSOMEG00000020528	ago1	99	94.854	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	98.593	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	98.593	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.363	ENSOARG00000019591	AGO1	99	98.363	Ovis_aries
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSPPAG00000034838	AGO1	99	98.592	Pan_paniscus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSPPRG00000006475	AGO1	99	98.480	Panthera_pardus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.246	ENSPTIG00000020991	AGO1	99	98.246	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSPTRG00000000528	AGO1	99	98.592	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSPANG00000009060	AGO1	99	98.480	Papio_anubis
ENSSHAG00000017468	AGO1	99	98.107	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	98.107	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000017468	AGO1	81	96.093	ENSPMGG00000024099	ago1	98	96.093	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSPEMG00000023313	Ago1	99	98.592	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.830	ENSPCIG00000000172	AGO1	99	98.830	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSPFOG00000005867	ago1	99	94.854	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSPLAG00000002824	ago1	99	96.830	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSPMEG00000001787	ago1	99	96.830	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	ENSPREG00000006534	ago1	99	94.854	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSPPYG00000001551	AGO1	99	98.480	Pongo_abelii
ENSSHAG00000017468	AGO1	58	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	Procavia_capensis
ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	98.726	Propithecus_coquereli
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