EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000017490 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24475 bases
Position: chrGL834417.1:2752744-2777218
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000020622	Aconitase	PF00330.20	1.9e-151	1	2
ENSSHAP00000020622	Aconitase	PF00330.20	1.9e-151	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000020787	-	2094	-	ENSSHAP00000020622	698 (aa)	-	G3WYW7

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000017490	-	87	62.190	ENSSHAG00000008924	ACO1	68	62.190

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000017490	-	99	86.994	ENSG00000136381	IREB2	100	86.842	Homo_sapiens
ENSSHAG00000017490	-	97	68.705	ENSAPOG00000015501	-	70	68.705	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000017490	-	97	68.705	ENSAPOG00000020564	ireb2	70	68.705	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000017490	-	97	69.400	ENSAPOG00000016684	ireb2	72	69.400	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000017490	-	99	85.591	ENSAMEG00000012645	IREB2	72	85.591	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000017490	-	97	68.228	ENSACIG00000012557	ireb2	70	68.228	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000017490	-	97	69.400	ENSAOCG00000000407	ireb2	70	69.693	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000017490	-	99	68.293	ENSAPEG00000009121	ireb2	71	68.580	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000017490	-	97	68.421	ENSATEG00000021145	ireb2	71	68.421	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000017490	-	97	66.813	ENSATEG00000021210	ireb2	71	66.813	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000017490	-	99	82.200	ENSAPLG00000016388	IREB2	71	82.200	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000017490	-	99	87.717	ENSANAG00000021994	IREB2	71	87.717	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000017490	-	97	69.514	ENSACLG00000024688	ireb2	70	69.514	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000017490	-	97	69.706	ENSAMXG00000008756	ireb2	69	69.706	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000017490	-	99	86.888	ENSBTAG00000002504	IREB2	72	86.888	Bos_taurus
ENSSHAG00000017490	-	99	87.572	ENSCJAG00000010259	IREB2	71	87.572	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000017490	-	99	85.116	ENSCAFG00000001766	IREB2	71	85.116	Canis_familiaris
ENSSHAG00000017490	-	99	85.341	ENSCAFG00020021072	IREB2	71	86.989	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000017490	-	99	86.888	ENSCHIG00000023111	IREB2	72	86.888	Capra_hircus
ENSSHAG00000017490	-	99	87.644	ENSTSYG00000011729	IREB2	94	81.991	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000017490	-	81	79.574	ENSCAPG00000011854	IREB2	67	79.505	Cavia_aperea
ENSSHAG00000017490	-	81	84.331	ENSCPOG00000013905	IREB2	67	84.331	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000017490	-	99	87.717	ENSCCAG00000021202	IREB2	71	87.717	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000017490	-	99	87.572	ENSCATG00000033462	IREB2	71	87.572	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000017490	-	99	84.971	ENSCLAG00000008985	IREB2	71	84.971	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000017490	-	99	87.572	ENSCSAG00000014904	IREB2	71	87.572	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000017490	-	97	83.676	ENSCHOG00000004107	IREB2	71	83.676	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000017490	-	99	84.827	ENSCPBG00000024247	IREB2	82	79.048	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000017490	-	99	87.428	ENSCANG00000029420	IREB2	71	87.428	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000017490	-	99	85.303	ENSCGRG00001019234	Ireb2	72	85.303	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000017490	-	99	85.631	ENSCGRG00000016786	Ireb2	72	85.303	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000017490	-	97	67.988	ENSCSEG00000003080	ireb2	70	67.836	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000017490	-	97	67.894	ENSCVAG00000010739	ireb2	68	67.889	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000017490	-	97	65.839	ENSDARG00000021466	ireb2	69	65.985	Danio_rerio
ENSSHAG00000017490	-	95	88.351	ENSDNOG00000009614	IREB2	71	88.351	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000017490	-	87	85.974	ENSDORG00000014339	Ireb2	74	78.757	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000017490	-	77	87.918	ENSETEG00000012717	IREB2	55	87.918	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000017490	-	99	86.744	ENSEASG00005015622	IREB2	72	86.744	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000017490	-	99	86.744	ENSECAG00000016731	IREB2	76	86.744	Equus_caballus
ENSSHAG00000017490	-	95	77.912	ENSEEUG00000007999	IREB2	74	77.912	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000017490	-	97	68.971	ENSELUG00000023666	ireb2	70	68.971	Esox_lucius
ENSSHAG00000017490	-	99	85.260	ENSFCAG00000001921	IREB2	71	85.260	Felis_catus
ENSSHAG00000017490	-	99	68.596	ENSFALG00000010640	IREB2	69	68.596	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000017490	-	99	84.538	ENSFDAG00000009355	IREB2	71	84.538	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000017490	-	97	68.328	ENSFHEG00000017905	ireb2	70	68.328	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000017490	-	97	66.910	ENSGMOG00000009184	ireb2	70	66.910	Gadus_morhua
ENSSHAG00000017490	-	99	81.268	ENSGALG00000035462	IREB2	72	81.268	Gallus_gallus
ENSSHAG00000017490	-	99	64.876	ENSGAFG00000005145	ireb2	70	64.876	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000017490	-	99	67.098	ENSGACG00000007341	ireb2	71	67.098	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000017490	-	99	84.393	ENSGAGG00000006117	IREB2	69	84.393	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000017490	-	99	86.994	ENSGGOG00000015650	IREB2	71	86.994	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000017490	-	97	69.514	ENSHBUG00000007184	ireb2	70	69.514	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000017490	-	99	84.682	ENSHGLG00000000783	Ireb2	71	84.682	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000017490	-	99	84.682	ENSHGLG00100019429	Ireb2	71	84.682	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000017490	-	98	66.428	ENSHCOG00000007424	ireb2	73	66.428	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000017490	-	99	66.476	ENSIPUG00000014808	Ireb2	71	66.476	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000017490	-	99	87.608	ENSSTOG00000009273	IREB2	72	87.608	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000017490	-	99	86.357	ENSJJAG00000019768	Ireb2	75	86.357	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000017490	-	97	67.690	ENSKMAG00000016020	ireb2	68	67.690	Kryptolebias_marmoratus
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ENSSHAG00000017490	-	99	65.522	ENSLACG00000001182	IREB2	71	65.522	Latimeria_chalumnae
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ENSSHAG00000017490	-	99	87.157	ENSLAFG00000012839	IREB2	72	87.157	Loxodonta_africana
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ENSSHAG00000017490	-	99	87.428	ENSMMUG00000045680	IREB2	71	87.428	Macaca_mulatta
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ENSSHAG00000017490	-	97	69.253	ENSMAMG00000023095	ireb2	71	69.253	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000017490	-	97	69.514	ENSMZEG00005010935	ireb2	70	69.514	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000017490	-	99	81.097	ENSMGAG00000003688	IREB2	72	81.097	Meleagris_gallopavo
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ENSSHAG00000017490	-	99	85.116	MGP_PahariEiJ_G0015103	Ireb2	71	85.116	Mus_pahari
ENSSHAG00000017490	-	99	85.159	MGP_SPRETEiJ_G0033375	Ireb2	72	85.159	Mus_spretus
ENSSHAG00000017490	-	99	84.892	ENSMPUG00000010978	IREB2	68	84.892	Mustela_putorius_furo
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ENSSHAG00000017490	-	97	69.208	ENSNBRG00000017676	ireb2	67	73.013	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000017490	-	99	87.572	ENSNLEG00000008549	IREB2	71	87.572	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000017490	-	77	96.117	ENSMEUG00000001630	-	55	96.117	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000017490	-	99	80.519	ENSOPRG00000000340	IREB2	71	80.519	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000017490	-	99	83.599	ENSODEG00000015993	IREB2	71	83.599	Octodon_degus
ENSSHAG00000017490	-	97	69.310	ENSONIG00000012838	ireb2	70	69.310	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000017490	-	99	86.975	ENSOANG00000013218	-	71	86.994	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000017490	-	92	87.793	ENSOCUG00000009907	IREB2	70	87.793	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000017490	-	97	68.521	ENSORLG00000001943	ireb2	64	68.521	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000017490	-	97	68.521	ENSORLG00020000623	ireb2	68	68.521	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000017490	-	97	68.521	ENSORLG00015014057	ireb2	68	68.521	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000017490	-	97	68.029	ENSOMEG00000005120	ireb2	71	65.702	Oryzias_melastigma
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