EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000018109 (Gene tree)
Gene ID: 100919590
Gene Symbol: MTRF1
Alias: MGC47721|MTTRF1|RF1
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29994 bases
Position: chrGL849885.1:3261753-3291746
Accession: 7469
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000021366	RF-1	PF00472.20	1.1e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000021539	MTRF1-201	1355	-	ENSSHAP00000021366	408 (aa)	-	G3X111

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSHAG00000018109	MTRF1	73	49.169	ENSSHAG00000017997	MTRF1L	74	49.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.966	ENSG00000120662	MTRF1	91	80.000	Homo_sapiens
ENSSHAG00000018109	MTRF1	85	57.835	ENSAPOG00000010181	mtrf1	86	58.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.236	ENSAMEG00000008696	MTRF1	92	73.236	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000018109	MTRF1	50	70.588	ENSACIG00000001495	mtrf1	81	70.588	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	87	58.263	ENSAOCG00000002832	mtrf1	80	58.427	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000018109	MTRF1	87	58.146	ENSAPEG00000014844	mtrf1	80	58.146	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000018109	MTRF1	84	58.140	ENSATEG00000017403	mtrf1	82	58.140	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	85	70.605	ENSAPLG00000009317	MTRF1	80	70.605	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	60.922	ENSACAG00000000897	MTRF1	90	60.922	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000018109	MTRF1	97	69.327	ENSANAG00000023063	-	92	69.327	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000018109	MTRF1	75	78.176	ENSANAG00000025310	-	84	78.176	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000018109	MTRF1	90	54.595	ENSACLG00000023945	mtrf1	80	54.595	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000018109	MTRF1	50	72.549	ENSAMXG00000031859	mtrf1	84	72.549	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	74.272	ENSBTAG00000012260	MTRF1	98	74.272	Bos_taurus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	71.533	ENSCJAG00000017739	MTRF1	92	71.533	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	71.671	ENSCAFG00000004795	MTRF1	92	71.671	Canis_familiaris
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	71.671	ENSCAFG00020018178	MTRF1	92	71.671	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.966	ENSCHIG00000011810	MTRF1	92	73.966	Capra_hircus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.236	ENSTSYG00000006976	MTRF1	92	73.236	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000018109	MTRF1	97	72.796	ENSCAPG00000013163	MTRF1	91	72.796	Cavia_aperea
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	71.776	ENSCPOG00000005264	MTRF1	92	71.776	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.263	ENSCCAG00000035116	MTRF1	92	72.263	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.723	ENSCATG00000009909	MTRF1	92	73.723	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	71.046	ENSCLAG00000000582	MTRF1	92	71.046	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.479	ENSCSAG00000017835	MTRF1	92	73.479	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	68.370	ENSCHOG00000011915	-	100	68.370	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000018109	MTRF1	95	67.179	ENSCPBG00000007969	MTRF1	86	67.179	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.993	ENSCANG00000040353	MTRF1	92	72.993	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	91	75.135	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	83	75.135	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000018109	MTRF1	91	75.135	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	83	75.135	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000018109	MTRF1	87	58.028	ENSCSEG00000005667	mtrf1	79	58.028	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000018109	MTRF1	96	53.435	ENSCVAG00000021729	mtrf1	88	53.435	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	74.939	ENSDNOG00000034196	MTRF1	88	85.091	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.263	ENSDORG00000016429	Mtrf1	92	72.263	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.749	ENSETEG00000014811	MTRF1	92	72.749	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.236	ENSEASG00005015715	MTRF1	92	73.236	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.749	ENSECAG00000014389	MTRF1	94	72.749	Equus_caballus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	94	57.364	ENSEEUG00000004450	-	86	57.881	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	87	55.807	ENSELUG00000006544	mtrf1	81	55.807	Esox_lucius
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	71.776	ENSFCAG00000031635	MTRF1	92	71.776	Felis_catus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	85	68.876	ENSFALG00000008036	MTRF1	86	68.876	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	71.046	ENSFDAG00000017881	MTRF1	92	71.046	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000018109	MTRF1	85	56.069	ENSFHEG00000019043	mtrf1	79	56.069	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	85	52.586	ENSGMOG00000008608	mtrf1	90	52.586	Gadus_morhua
ENSSHAG00000018109	MTRF1	87	70.423	ENSGALG00000016951	MTRF1	77	70.423	Gallus_gallus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	86	55.966	ENSGAFG00000007093	mtrf1	79	55.966	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000018109	MTRF1	85	58.333	ENSGACG00000013728	mtrf1	90	58.333	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	77	73.802	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	73.802	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.723	ENSGGOG00000002529	MTRF1	92	73.723	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	71.290	ENSHGLG00000003210	MTRF1	92	71.290	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	71.290	ENSHGLG00100011843	MTRF1	92	71.290	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000018109	MTRF1	91	49.495	ENSHCOG00000009449	mtrf1	89	49.495	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.263	ENSSTOG00000021682	MTRF1	92	72.263	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	70.803	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	92	70.803	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	86	57.627	ENSKMAG00000003231	mtrf1	78	57.062	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	50	70.588	ENSLBEG00000027169	-	81	70.588	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000018109	MTRF1	50	70.588	ENSLBEG00000023151	mtrf1	81	70.588	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000018109	MTRF1	89	66.849	ENSLACG00000010582	MTRF1	91	61.650	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000018109	MTRF1	88	60.056	ENSLOCG00000005937	MTRF1	80	60.056	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	99	57.843	ENSLAFG00000030499	-	90	56.265	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.993	ENSLAFG00000022177	-	92	72.993	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.479	ENSMFAG00000037972	MTRF1	92	73.479	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.723	ENSMNEG00000035487	MTRF1	92	73.723	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.723	ENSMLEG00000033582	MTRF1	92	73.723	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	84	59.012	ENSMAMG00000022048	mtrf1	77	59.012	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	90	54.595	ENSMZEG00005017922	mtrf1	80	54.595	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000018109	MTRF1	87	69.859	ENSMGAG00000014971	MTRF1	84	69.859	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000018109	MTRF1	99	72.139	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	90	72.139	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.723	ENSMICG00000033131	MTRF1	96	73.723	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	70.073	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	92	70.073	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000018109	MTRF1	50	63.235	ENSMMOG00000013394	mtrf1	82	63.235	Mola_mola
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	86.064	ENSMODG00000014772	MTRF1	92	86.064	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000018109	MTRF1	84	58.017	ENSMALG00000013274	mtrf1	78	58.017	Monopterus_albus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	68.613	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	91	68.932	Mus_caroli
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	69.586	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	92	69.586	Mus_musculus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	69.343	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	92	69.343	Mus_pahari
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	70.316	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	92	70.316	Mus_spretus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.506	ENSMPUG00000001874	MTRF1	92	72.506	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.966	ENSMLUG00000017237	MTRF1	92	73.966	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.506	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	92	72.506	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000018109	MTRF1	50	68.627	ENSNBRG00000004634	mtrf1	85	68.627	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	74.209	ENSNLEG00000001236	MTRF1	92	74.209	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	82.152	ENSMEUG00000001846	MTRF1	92	82.152	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000018109	MTRF1	66	84.615	ENSOPRG00000006450	-	82	84.615	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	70.803	ENSODEG00000005782	MTRF1	92	70.803	Octodon_degus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	86	56.497	ENSONIG00000012476	mtrf1	91	56.497	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	67	74.725	ENSOANG00000003383	-	87	74.725	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.506	ENSOCUG00000025207	MTRF1	92	72.506	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	86	56.215	ENSORLG00000003225	mtrf1	80	56.780	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000018109	MTRF1	86	56.497	ENSORLG00020021048	mtrf1	79	57.062	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000018109	MTRF1	86	56.215	ENSORLG00015020957	mtrf1	80	56.780	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000018109	MTRF1	86	56.941	ENSOMEG00000002022	mtrf1	80	57.102	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000018109	MTRF1	72	67.458	ENSOGAG00000026411	-	89	67.458	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.263	ENSOGAG00000009719	-	92	72.263	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	74.209	ENSOARG00000006994	MTRF1	92	74.209	Ovis_aries
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.966	ENSPPAG00000000050	MTRF1	92	73.966	Pan_paniscus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.019	ENSPPRG00000009511	MTRF1	92	72.019	Panthera_pardus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	72.019	ENSPTIG00000006673	MTRF1	92	72.019	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.966	ENSPTRG00000005815	MTRF1	92	73.966	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	73.723	ENSPANG00000010809	MTRF1	92	73.723	Papio_anubis
ENSSHAG00000018109	MTRF1	96	52.041	ENSPKIG00000015711	mtrf1	89	52.041	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000018109	MTRF1	94	67.792	ENSPSIG00000004773	MTRF1	85	67.792	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000018109	MTRF1	50	71.078	ENSPMGG00000006724	mtrf1	82	71.078	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	70.631	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	92	70.631	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000018109	MTRF1	78	54.627	ENSPMAG00000009849	mtrf1	95	54.627	Petromyzon_marinus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	88.264	ENSPCIG00000012940	MTRF1	92	88.264	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000018109	MTRF1	85	56.936	ENSPFOG00000000254	mtrf1	78	56.936	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000018109	MTRF1	85	57.514	ENSPLAG00000014280	mtrf1	78	57.514	Poecilia_latipinna
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