EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000018238 (Gene tree)
Gene ID: 100919113
Gene Symbol: PTRH1
Alias: C9orf115|PTH1
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4878 bases
Position: chrGL834651.1:3375562-3380439
Accession: 27039
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000021531	Pept_tRNA_hydro	PF01195.19	3.1e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000021705	PTRH1-201	636	-	ENSSHAP00000021531	205 (aa)	-	G3X1H6

Gene Model

Click here to download ENSSHAG00000018238's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSHAG00000018238's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	68.783	ENSG00000187024	PTRH1	86	68.783	Homo_sapiens
ENSSHAG00000018238	PTRH1	90	57.838	ENSAPOG00000000947	PTRH1	64	57.838	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	90	57.838	ENSAPOG00000003014	-	64	57.838	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	90	57.838	ENSAPOG00000010719	ptrh1	64	57.838	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	65.079	ENSAMEG00000016791	PTRH1	87	65.079	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000018238	PTRH1	86	58.523	ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.523	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	90	55.676	ENSAOCG00000009725	ptrh1	64	55.676	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000018238	PTRH1	90	55.676	ENSAPEG00000020993	ptrh1	64	55.676	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000018238	PTRH1	89	56.831	ENSATEG00000010003	ptrh1	64	56.831	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	67.725	ENSANAG00000025547	PTRH1	86	67.725	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000018238	PTRH1	85	56.897	ENSACLG00000025462	ptrh1	71	56.522	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000018238	PTRH1	89	54.396	ENSAMXG00000034117	ptrh1	66	54.396	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	74	68.153	ENSBTAG00000012736	PTRH1	54	68.153	Bos_taurus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	91	68.449	ENSCJAG00000019841	PTRH1	65	71.186	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.841	ENSCAFG00000020123	PTRH1	86	69.841	Canis_familiaris
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSCAFG00020015776	PTRH1	83	69.312	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	70.370	ENSCHIG00000008188	PTRH1	86	70.370	Capra_hircus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	52	69.811	ENSTSYG00000026891	-	94	69.811	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000018238	PTRH1	67	68.613	ENSCAPG00000015926	PTRH1	95	68.613	Cavia_aperea
ENSSHAG00000018238	PTRH1	90	68.649	ENSCPOG00000023968	PTRH1	84	68.649	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	68.783	ENSCCAG00000023134	PTRH1	86	68.783	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSCATG00000042852	PTRH1	86	69.312	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	67.196	ENSCLAG00000011155	PTRH1	86	67.196	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSCSAG00000013748	PTRH1	81	69.312	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	80	66.258	ENSCPBG00000025207	PTRH1	90	66.258	Chrysemys_picta_bellii
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSCANG00000039856	PTRH1	86	69.312	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	98	65.672	ENSCGRG00001013108	Ptrh1	96	65.672	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000018238	PTRH1	88	67.778	ENSCGRG00000016553	Ptrh1	96	67.778	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000018238	PTRH1	87	53.933	ENSCSEG00000010332	ptrh1	63	53.933	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000018238	PTRH1	65	44.776	ENSCVAG00000003873	-	82	53.571	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	91	51.075	ENSCVAG00000010701	ptrh1	71	50.761	Cyprinodon_variegatus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	88	52.778	ENSDARG00000098206	ptrh1	76	52.778	Danio_rerio
ENSSHAG00000018238	PTRH1	93	67.016	ENSDNOG00000024194	PTRH1	87	67.016	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	91	69.519	ENSDORG00000013321	Ptrh1	85	69.519	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000018238	PTRH1	97	66.667	ENSEASG00005020466	PTRH1	90	66.667	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSECAG00000007615	PTRH1	68	69.312	Equus_caballus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	88	57.222	ENSELUG00000015467	ptrh1	65	57.222	Esox_lucius
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	67.196	ENSFCAG00000001483	PTRH1	86	67.196	Felis_catus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	91	56.853	ENSFALG00000001352	PTRH1	91	56.853	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000018238	PTRH1	93	67.368	ENSFDAG00000020077	PTRH1	91	67.368	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000018238	PTRH1	96	54.592	ENSFHEG00000010590	ptrh1	73	54.592	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	59	51.240	ENSGMOG00000009801	PTRH1	86	51.240	Gadus_morhua
ENSSHAG00000018238	PTRH1	97	55.556	ENSGAFG00000016215	ptrh1	80	55.556	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000018238	PTRH1	85	55.747	ENSGACG00000014682	ptrh1	89	56.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	94	68.912	ENSGAGG00000022860	PTRH1	84	68.912	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	68.783	ENSGGOG00000011033	PTRH1	86	68.783	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000018238	PTRH1	85	56.897	ENSHBUG00000020824	ptrh1	65	56.216	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	68.085	ENSHGLG00000019147	PTRH1	90	68.085	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	65.426	ENSHGLG00100003681	PTRH1	92	65.426	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000018238	PTRH1	95	53.061	ENSHCOG00000014772	ptrh1	73	53.061	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	55.319	ENSIPUG00000015364	ptrh1	72	55.319	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	68.783	ENSSTOG00000008942	PTRH1	86	68.783	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	70.899	ENSJJAG00000014338	Ptrh1	89	70.899	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	88	56.354	ENSKMAG00000003253	ptrh1	64	56.354	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	64	54.962	ENSLBEG00000028842	ptrh1	75	54.962	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000018238	PTRH1	88	59.669	ENSLACG00000016741	PTRH1	73	59.669	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	63.684	ENSLAFG00000021934	PTRH1	91	63.684	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSMFAG00000001700	PTRH1	86	69.312	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSMMUG00000016424	PTRH1	86	69.312	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSMNEG00000033061	PTRH1	81	69.312	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000018238	PTRH1	52	68.868	ENSMLEG00000042412	-	94	68.868	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	84	55.491	ENSMAMG00000017386	ptrh1	65	55.191	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	85	56.897	ENSMZEG00005020001	ptrh1	71	56.522	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000018238	PTRH1	98	65.174	ENSMAUG00000006266	Ptrh1	96	65.174	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	97	67.662	ENSMICG00000005611	PTRH1	91	67.662	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	98	65.174	ENSMOCG00000013992	Ptrh1	96	65.174	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000018238	PTRH1	86	57.955	ENSMMOG00000014747	ptrh1	63	57.609	Mola_mola
ENSSHAG00000018238	PTRH1	93	90.576	ENSMODG00000005503	PTRH1	85	90.576	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000018238	PTRH1	65	57.143	ENSMALG00000005392	ptrh1	75	57.143	Monopterus_albus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	98	66.169	MGP_CAROLIEiJ_G0023450	Ptrh1	96	66.169	Mus_caroli
ENSSHAG00000018238	PTRH1	98	66.169	ENSMUSG00000053746	Ptrh1	96	66.169	Mus_musculus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	98	66.169	MGP_PahariEiJ_G0024907	Ptrh1	96	66.169	Mus_pahari
ENSSHAG00000018238	PTRH1	98	65.672	MGP_SPRETEiJ_G0024367	Ptrh1	96	65.672	Mus_spretus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	66.842	ENSMPUG00000013790	PTRH1	86	66.842	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	65.000	ENSMLUG00000013454	PTRH1	88	65.000	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	98	64.593	ENSNGAG00000014008	Ptrh1	97	64.593	Nannospalax_galili
ENSSHAG00000018238	PTRH1	85	56.322	ENSNBRG00000015590	ptrh1	65	55.676	Neolamprologus_brichardi
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	68.783	ENSNLEG00000017468	PTRH1	86	68.783	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000018238	PTRH1	93	61.579	ENSMEUG00000009694	-	91	61.579	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000018238	PTRH1	97	66.010	ENSODEG00000004012	PTRH1	93	66.010	Octodon_degus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	85	56.897	ENSONIG00000013912	ptrh1	69	56.216	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	91	78.075	ENSOANG00000011891	PTRH1	81	78.075	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	67.725	ENSOCUG00000006894	PTRH1	80	67.725	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	98	65.517	ENSOGAG00000008094	PTRH1	95	65.517	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	61.500	ENSOARG00000011808	PTRH1	87	61.500	Ovis_aries
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	68.783	ENSPPAG00000041782	PTRH1	86	68.783	Pan_paniscus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	67.196	ENSPPRG00000007889	PTRH1	86	67.196	Panthera_pardus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	58	66.949	ENSPTIG00000021082	-	88	66.949	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	68.783	ENSPTRG00000021394	PTRH1	86	68.783	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	56.250	ENSPANG00000031755	PTRH1	86	56.250	Papio_anubis
ENSSHAG00000018238	PTRH1	90	50.543	ENSPKIG00000005449	ptrh1	59	50.543	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	65.957	ENSPSIG00000013828	PTRH1	67	65.957	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	47.368	ENSPMGG00000002148	ptrh1	68	48.454	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	98	65.672	ENSPEMG00000014360	Ptrh1	96	65.672	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000018238	PTRH1	96	54.822	ENSPFOG00000003715	ptrh1	72	54.822	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000018238	PTRH1	90	57.065	ENSPLAG00000023354	ptrh1	72	57.065	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000018238	PTRH1	96	54.822	ENSPMEG00000000447	ptrh1	72	54.822	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000018238	PTRH1	96	55.330	ENSPREG00000012612	ptrh1	72	55.330	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	65.079	ENSPPYG00000019628	PTRH1	80	65.079	Pongo_abelii
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSPCAG00000007016	PTRH1	86	69.312	Procavia_capensis
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	70.370	ENSPCOG00000014541	PTRH1	85	70.370	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000018238	PTRH1	94	69.898	ENSPVAG00000000954	PTRH1	89	69.898	Pteropus_vampyrus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	85	56.322	ENSPNYG00000007789	ptrh1	65	55.676	Pundamilia_nyererei
ENSSHAG00000018238	PTRH1	90	55.135	ENSPNAG00000029930	ptrh1	68	55.135	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000018238	PTRH1	98	65.672	ENSRNOG00000049034	Ptrh1	96	65.672	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSRBIG00000027290	PTRH1	86	69.312	Rhinopithecus_bieti
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSRROG00000028799	PTRH1	81	69.312	Rhinopithecus_roxellana
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	68.254	ENSSBOG00000026699	PTRH1	81	68.254	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSHAG00000018238	PTRH1	98	49.254	ENSSFOG00015007053	ptrh1	90	52.406	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	86	53.672	ENSSMAG00000016747	ptrh1	75	52.128	Scophthalmus_maximus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	85	54.802	ENSSDUG00000013471	ptrh1	92	54.802	Seriola_dumerili
ENSSHAG00000018238	PTRH1	82	54.438	ENSSLDG00000024662	ptrh1	78	53.889	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSHAG00000018238	PTRH1	93	65.263	ENSSPUG00000000040	PTRH1	81	65.263	Sphenodon_punctatus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	90	55.135	ENSSPAG00000003298	ptrh1	88	55.000	Stegastes_partitus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	70.899	ENSSSCG00000005615	PTRH1	86	70.899	Sus_scrofa
ENSSHAG00000018238	PTRH1	68	68.345	ENSTGUG00000003648	PTRH1	100	68.345	Taeniopygia_guttata
ENSSHAG00000018238	PTRH1	85	56.322	ENSTRUG00000019801	PTRH1	65	56.354	Takifugu_rubripes
ENSSHAG00000018238	PTRH1	88	56.906	ENSTNIG00000016735	ptrh1	78	56.906	Tetraodon_nigroviridis
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	67.725	ENSTTRG00000016458	PTRH1	86	67.725	Tursiops_truncatus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSUAMG00000023948	-	83	69.312	Ursus_americanus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	88	53.333	ENSVPAG00000001805	PTRH1	96	53.333	Vicugna_pacos
ENSSHAG00000018238	PTRH1	92	69.312	ENSVVUG00000013198	PTRH1	83	69.312	Vulpes_vulpes
ENSSHAG00000018238	PTRH1	89	59.016	ENSXETG00000009980	ptrh1	95	59.016	Xenopus_tropicalis
ENSSHAG00000018238	PTRH1	87	57.303	ENSXCOG00000011498	ptrh1	74	57.303	Xiphophorus_couchianus
ENSSHAG00000018238	PTRH1	96	54.315	ENSXMAG00000009256	ptrh1	72	54.315	Xiphophorus_maculatus