EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSHAG00000018363 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TRIT1
Alias: FLJ20061|IPT
Full Name: tRNA isopentenyltransferase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sarcophilus_harrisii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30521 bases
Position: chrGL849783.1:3518541-3549061
Accession: 20286
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSHAP00000021685	IPPT	PF01715.17	5.8e-61	1	1
ENSSHAP00000021685	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	7.5e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSHAT00000021859	TRIT1-201	1269	-	ENSSHAP00000021685	422 (aa)	-	G3X1Y0

Gene Model

Click here to download ENSSHAG00000018363's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSHAG00000018363's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.698	ENSG00000043514	TRIT1	99	86.047	Homo_sapiens
ENSSHAG00000018363	TRIT1	92	60.459	ENSAPOG00000020918	trit1	86	59.204	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.978	ENSAMEG00000004342	TRIT1	88	76.978	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSHAG00000018363	TRIT1	87	60.870	ENSACIG00000017409	trit1	84	60.000	Amphilophus_citrinellus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	95	58.458	ENSAOCG00000009850	trit1	82	58.458	Amphiprion_ocellaris
ENSSHAG00000018363	TRIT1	95	58.706	ENSAPEG00000001481	trit1	82	58.706	Amphiprion_percula
ENSSHAG00000018363	TRIT1	96	56.757	ENSATEG00000005426	trit1	84	56.757	Anabas_testudineus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	80	66.857	ENSAPLG00000011421	TRIT1	99	66.857	Anas_platyrhynchos
ENSSHAG00000018363	TRIT1	93	68.020	ENSACAG00000002280	TRIT1	79	68.020	Anolis_carolinensis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.938	ENSANAG00000030732	TRIT1	98	78.961	Aotus_nancymaae
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	53.991	ENSACLG00000004920	trit1	88	54.009	Astatotilapia_calliptera
ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	60.052	ENSAMXG00000010959	trit1	83	60.052	Astyanax_mexicanus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	78.177	ENSBTAG00000013832	TRIT1	88	78.177	Bos_taurus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	87	32.300	WBGene00001740	gro-1	88	32.419	Caenorhabditis_elegans
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.458	ENSCJAG00000002620	TRIT1	93	73.026	Callithrix_jacchus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.218	ENSCAFG00000003048	TRIT1	88	77.218	Canis_familiaris
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	75.758	ENSCAFG00020003875	TRIT1	92	82.383	Canis_lupus_dingo
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.316	ENSCHIG00000013259	TRIT1	88	76.316	Capra_hircus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.739	ENSTSYG00000004363	TRIT1	93	72.368	Carlito_syrichta
ENSSHAG00000018363	TRIT1	84	73.521	ENSCAPG00000017001	TRIT1	91	73.521	Cavia_aperea
ENSSHAG00000018363	TRIT1	98	73.798	ENSCPOG00000012820	TRIT1	88	73.798	Cavia_porcellus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.850	ENSCCAG00000031271	TRIT1	94	83.799	Cebus_capucinus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	71.770	ENSCATG00000034344	TRIT1	83	78.231	Cercocebus_atys
ENSSHAG00000018363	TRIT1	98	75.000	ENSCLAG00000009828	TRIT1	88	75.000	Chinchilla_lanigera
ENSSHAG00000018363	TRIT1	96	77.451	ENSCSAG00000001137	TRIT1	98	77.451	Chlorocebus_sabaeus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	75.779	ENSCHOG00000000435	TRIT1	88	75.779	Choloepus_hoffmanni
ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	39.695	ENSCSAVG00000002050	-	85	39.695	Ciona_savignyi
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.259	ENSCANG00000043008	TRIT1	88	76.259	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	75.540	ENSCGRG00001001894	Trit1	88	75.540	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSHAG00000018363	TRIT1	97	76.585	ENSCGRG00000007059	Trit1	90	76.585	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSHAG00000018363	TRIT1	87	56.952	ENSCSEG00000009574	trit1	82	56.777	Cynoglossus_semilaevis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	59.067	ENSDARG00000032876	trit1	87	60.616	Danio_rerio
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	66.387	ENSDNOG00000001994	TRIT1	90	66.387	Dasypus_novemcinctus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	85	75.910	ENSDORG00000012449	Trit1	79	75.910	Dipodomys_ordii
ENSSHAG00000018363	TRIT1	93	35.629	FBgn0043799	CG31381	90	34.852	Drosophila_melanogaster
ENSSHAG00000018363	TRIT1	88	77.249	ENSETEG00000008733	TRIT1	88	77.249	Echinops_telfairi
ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	52.320	ENSEBUG00000012845	trit1	85	52.320	Eptatretus_burgeri
ENSSHAG00000018363	TRIT1	52	75.113	ENSEASG00005000884	-	100	75.113	Equus_asinus_asinus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.305	ENSECAG00000010597	TRIT1	82	77.305	Equus_caballus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	98	57.995	ENSEEUG00000009269	TRIT1	88	57.995	Erinaceus_europaeus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	49.763	ENSELUG00000017278	trit1	87	49.763	Esox_lucius
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.739	ENSFCAG00000006029	TRIT1	93	72.368	Felis_catus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	74.870	ENSFALG00000000532	TRIT1	96	74.870	Ficedula_albicollis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	92	74.185	ENSFDAG00000003098	TRIT1	87	74.185	Fukomys_damarensis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	56	59.149	ENSFHEG00000022274	trit1	73	59.149	Fundulus_heteroclitus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	58.673	ENSGMOG00000006522	trit1	90	58.163	Gadus_morhua
ENSSHAG00000018363	TRIT1	94	71.608	ENSGALG00000003851	TRIT1	86	71.608	Gallus_gallus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	69	60.274	ENSGAFG00000018636	trit1	96	60.674	Gambusia_affinis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	92	58.524	ENSGACG00000008493	trit1	90	58.524	Gasterosteus_aculeatus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	89	76.596	ENSGAGG00000000522	TRIT1	92	76.771	Gopherus_agassizii
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.698	ENSGGOG00000010070	TRIT1	93	74.342	Gorilla_gorilla
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	54.460	ENSHBUG00000018999	trit1	88	54.481	Haplochromis_burtoni
ENSSHAG00000018363	TRIT1	98	68.434	ENSHGLG00000009564	-	88	68.434	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000018363	TRIT1	98	75.181	ENSHGLG00000010308	-	89	75.181	Heterocephalus_glaber_female
ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	58.505	ENSHGLG00100018159	-	98	58.505	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000018363	TRIT1	98	75.181	ENSHGLG00100015382	-	89	75.181	Heterocephalus_glaber_male
ENSSHAG00000018363	TRIT1	87	58.777	ENSHCOG00000006755	trit1	83	58.333	Hippocampus_comes
ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	59.021	ENSIPUG00000021822	trit1	79	59.021	Ictalurus_punctatus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.739	ENSSTOG00000006446	TRIT1	86	76.739	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	70.743	ENSJJAG00000000316	-	91	70.743	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	68.106	ENSJJAG00000000300	-	88	68.106	Jaculus_jaculus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	95	58.354	ENSKMAG00000021788	trit1	83	58.354	Kryptolebias_marmoratus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	97	55.932	ENSLBEG00000024262	trit1	85	55.932	Labrus_bergylta
ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	64.467	ENSLACG00000013861	TRIT1	80	64.467	Latimeria_chalumnae
ENSSHAG00000018363	TRIT1	95	58.128	ENSLOCG00000002057	trit1	85	58.128	Lepisosteus_oculatus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.739	ENSLAFG00000016876	TRIT1	88	76.739	Loxodonta_africana
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.019	ENSMFAG00000001316	TRIT1	93	71.053	Macaca_fascicularis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.019	ENSMMUG00000016220	TRIT1	93	71.053	Macaca_mulatta
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.019	ENSMNEG00000023137	TRIT1	93	71.053	Macaca_nemestrina
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	75.779	ENSMLEG00000035296	TRIT1	88	75.779	Mandrillus_leucophaeus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	58.869	ENSMAMG00000005868	trit1	80	58.869	Mastacembelus_armatus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	53.756	ENSMZEG00005011506	trit1	88	53.774	Maylandia_zebra
ENSSHAG00000018363	TRIT1	89	74.599	ENSMGAG00000005516	TRIT1	99	74.599	Meleagris_gallopavo
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.259	ENSMAUG00000000399	Trit1	88	76.259	Mesocricetus_auratus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.218	ENSMICG00000016294	TRIT1	96	72.611	Microcebus_murinus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	75.540	ENSMOCG00000008173	Trit1	88	75.540	Microtus_ochrogaster
ENSSHAG00000018363	TRIT1	95	57.212	ENSMMOG00000021140	trit1	95	57.212	Mola_mola
ENSSHAG00000018363	TRIT1	94	88.806	ENSMODG00000017650	TRIT1	87	88.806	Monodelphis_domestica
ENSSHAG00000018363	TRIT1	92	57.436	ENSMALG00000017843	trit1	84	55.970	Monopterus_albus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	75.300	MGP_CAROLIEiJ_G0026428	Trit1	88	75.300	Mus_caroli
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	75.779	ENSMUSG00000028653	Trit1	88	75.779	Mus_musculus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	74.820	MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	88	74.820	Mus_pahari
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	75.540	MGP_SPRETEiJ_G0027408	Trit1	88	75.540	Mus_spretus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.978	ENSMPUG00000014291	TRIT1	88	76.978	Mustela_putorius_furo
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.088	ENSMLUG00000000334	TRIT1	88	77.088	Myotis_lucifugus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.458	ENSNLEG00000012038	TRIT1	93	73.684	Nomascus_leucogenys
ENSSHAG00000018363	TRIT1	100	80.378	ENSMEUG00000005217	TRIT1	90	80.378	Notamacropus_eugenii
ENSSHAG00000018363	TRIT1	68	66.216	ENSOPRG00000003205	-	61	66.216	Ochotona_princeps
ENSSHAG00000018363	TRIT1	98	72.249	ENSODEG00000006117	TRIT1	88	72.249	Octodon_degus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	53.846	ENSONIG00000015407	trit1	89	53.864	Oreochromis_niloticus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	89	75.798	ENSOANG00000002779	TRIT1	97	74.479	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	75.952	ENSOCUG00000002054	TRIT1	89	75.952	Oryctolagus_cuniculus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	95	57.463	ENSORLG00000005802	trit1	86	57.463	Oryzias_latipes
ENSSHAG00000018363	TRIT1	95	57.711	ENSORLG00020005519	trit1	86	57.711	Oryzias_latipes_hni
ENSSHAG00000018363	TRIT1	95	57.711	ENSORLG00015018715	trit1	86	57.711	Oryzias_latipes_hsok
ENSSHAG00000018363	TRIT1	94	58.942	ENSOMEG00000006569	trit1	85	58.942	Oryzias_melastigma
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	75.418	ENSOGAG00000009571	TRIT1	89	75.418	Otolemur_garnettii
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.458	ENSOARG00000020140	TRIT1	88	77.458	Ovis_aries
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.698	ENSPPAG00000023930	TRIT1	93	74.342	Pan_paniscus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.739	ENSPPRG00000009680	TRIT1	97	70.253	Panthera_pardus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.739	ENSPTIG00000021134	TRIT1	97	70.253	Panthera_tigris_altaica
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.698	ENSPTRG00000000579	TRIT1	93	74.342	Pan_troglodytes
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	75.779	ENSPANG00000018125	TRIT1	88	75.779	Papio_anubis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	89	57.600	ENSPKIG00000024527	trit1	95	57.600	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSHAG00000018363	TRIT1	66	81.250	ENSPSIG00000017073	TRIT1	90	81.250	Pelodiscus_sinensis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	86	61.433	ENSPMGG00000018445	trit1	93	59.326	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.259	ENSPEMG00000022418	Trit1	88	76.259	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSHAG00000018363	TRIT1	93	55.890	ENSPMAG00000008892	trit1	99	55.890	Petromyzon_marinus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	94	90.074	ENSPCIG00000020666	TRIT1	87	90.074	Phascolarctos_cinereus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	92	59.184	ENSPFOG00000014626	trit1	82	59.184	Poecilia_formosa
ENSSHAG00000018363	TRIT1	69	60.274	ENSPLAG00000011669	trit1	84	59.589	Poecilia_latipinna
ENSSHAG00000018363	TRIT1	54	59.471	ENSPMEG00000023788	trit1	80	59.471	Poecilia_mexicana
ENSSHAG00000018363	TRIT1	69	61.034	ENSPREG00000018182	trit1	80	61.034	Poecilia_reticulata
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.698	ENSPPYG00000001499	TRIT1	88	77.698	Pongo_abelii
ENSSHAG00000018363	TRIT1	85	66.295	ENSPCAG00000014680	TRIT1	98	66.295	Procavia_capensis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.938	ENSPCOG00000014150	TRIT1	96	74.522	Propithecus_coquereli
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	67.146	ENSPVAG00000003344	TRIT1	88	67.146	Pteropus_vampyrus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	63	56.458	ENSPNYG00000001003	trit1	86	56.458	Pundamilia_nyererei
ENSSHAG00000018363	TRIT1	92	57.436	ENSPNAG00000009466	trit1	80	59.752	Pygocentrus_nattereri
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	72.261	ENSRNOG00000014274	Trit1	89	72.261	Rattus_norvegicus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.499	ENSRBIG00000043179	TRIT1	88	76.499	Rhinopithecus_bieti
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.499	ENSRROG00000042670	TRIT1	88	76.499	Rhinopithecus_roxellana
ENSSHAG00000018363	TRIT1	90	32.750	YOR274W	-	86	32.750	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	77.458	ENSSBOG00000024417	TRIT1	88	77.458	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	58.854	ENSSFOG00015007284	trit1	75	58.854	Scleropages_formosus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	92	57.841	ENSSMAG00000020730	trit1	81	57.841	Scophthalmus_maximus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	94	57.320	ENSSDUG00000001683	trit1	83	57.320	Seriola_dumerili
ENSSHAG00000018363	TRIT1	87	58.333	ENSSLDG00000008379	trit1	84	56.098	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	74.645	ENSSARG00000004540	TRIT1	88	74.645	Sorex_araneus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	90	72.032	ENSSPUG00000003472	TRIT1	77	72.032	Sphenodon_punctatus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	88	60.106	ENSSPAG00000020745	trit1	82	60.106	Stegastes_partitus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	51	70.833	ENSSSCG00000003667	-	93	78.947	Sus_scrofa
ENSSHAG00000018363	TRIT1	89	72.222	ENSTGUG00000001242	TRIT1	99	72.222	Taeniopygia_guttata
ENSSHAG00000018363	TRIT1	97	57.869	ENSTRUG00000013936	trit1	88	58.647	Takifugu_rubripes
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	54.137	ENSTNIG00000009240	trit1	90	56.098	Tetraodon_nigroviridis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	82	74.823	ENSTBEG00000001317	TRIT1	73	74.823	Tupaia_belangeri
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.499	ENSTTRG00000005064	TRIT1	88	76.499	Tursiops_truncatus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	54	76.211	ENSUAMG00000000522	-	94	79.330	Ursus_americanus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	76.978	ENSUMAG00000017299	TRIT1	79	76.978	Ursus_maritimus
ENSSHAG00000018363	TRIT1	96	78.186	ENSVPAG00000003008	TRIT1	86	78.186	Vicugna_pacos
ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	62.437	ENSXETG00000010952	trit1	85	62.437	Xenopus_tropicalis
ENSSHAG00000018363	TRIT1	69	60.959	ENSXMAG00000016302	trit1	79	60.959	Xiphophorus_maculatus