EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000000202 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 372 bases
Position: chrPEQF01018852.1:63-434
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000000153	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-14	1	3
ENSSLDP00000000153	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-14	2	3
ENSSLDP00000000153	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-14	3	3
ENSSLDP00000000153	zf-met	PF12874.7	2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000000190	-	372	-	ENSSLDP00000000153	123 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSLDG00000000202	-	73	54.839	ENSSLDG00000008645	-	84	54.839
ENSSLDG00000000202	-	100	56.000	ENSSLDG00000007756	-	92	55.882
ENSSLDG00000000202	-	89	41.667	ENSSLDG00000017718	zbtb48	59	41.667
ENSSLDG00000000202	-	98	50.000	ENSSLDG00000005850	-	97	50.000
ENSSLDG00000000202	-	97	100.000	ENSSLDG00000018033	-	66	100.000
ENSSLDG00000000202	-	81	45.455	ENSSLDG00000016301	-	93	45.455
ENSSLDG00000000202	-	74	62.500	ENSSLDG00000000203	-	85	45.783
ENSSLDG00000000202	-	76	50.617	ENSSLDG00000018273	-	75	50.617
ENSSLDG00000000202	-	65	47.500	ENSSLDG00000017614	-	80	47.500
ENSSLDG00000000202	-	92	50.649	ENSSLDG00000021278	-	65	50.649
ENSSLDG00000000202	-	81	50.000	ENSSLDG00000015049	-	94	50.000
ENSSLDG00000000202	-	93	35.652	ENSSLDG00000025359	-	50	35.652
ENSSLDG00000000202	-	90	47.674	ENSSLDG00000002776	-	70	47.674
ENSSLDG00000000202	-	98	46.377	ENSSLDG00000005868	-	100	46.377
ENSSLDG00000000202	-	60	56.522	ENSSLDG00000002284	-	79	56.522
ENSSLDG00000000202	-	82	46.377	ENSSLDG00000006217	-	86	46.377
ENSSLDG00000000202	-	75	44.304	ENSSLDG00000000859	-	69	43.011
ENSSLDG00000000202	-	83	54.321	ENSSLDG00000021127	-	53	54.321
ENSSLDG00000000202	-	98	36.842	ENSSLDG00000016454	-	52	36.842
ENSSLDG00000000202	-	75	49.383	ENSSLDG00000001850	-	52	49.383
ENSSLDG00000000202	-	89	48.052	ENSSLDG00000000457	-	73	48.052
ENSSLDG00000000202	-	80	43.210	ENSSLDG00000005670	-	70	43.210
ENSSLDG00000000202	-	93	50.633	ENSSLDG00000020727	-	96	57.627
ENSSLDG00000000202	-	67	55.556	ENSSLDG00000009821	-	78	55.556
ENSSLDG00000000202	-	88	50.943	ENSSLDG00000013170	zbtb17	79	50.943
ENSSLDG00000000202	-	75	50.617	ENSSLDG00000020432	-	85	50.617
ENSSLDG00000000202	-	75	44.444	ENSSLDG00000004005	-	62	44.444
ENSSLDG00000000202	-	73	50.633	ENSSLDG00000023661	-	92	50.633
ENSSLDG00000000202	-	66	46.914	ENSSLDG00000010190	-	73	46.914
ENSSLDG00000000202	-	88	54.286	ENSSLDG00000006288	-	95	54.286
ENSSLDG00000000202	-	74	44.211	ENSSLDG00000023060	-	68	44.211
ENSSLDG00000000202	-	94	50.617	ENSSLDG00000001860	-	90	50.617
ENSSLDG00000000202	-	76	44.318	ENSSLDG00000014166	znf319b	64	41.558
ENSSLDG00000000202	-	89	44.156	ENSSLDG00000024295	ZNF319	66	44.156
ENSSLDG00000000202	-	98	54.321	ENSSLDG00000013760	-	95	50.617
ENSSLDG00000000202	-	80	53.086	ENSSLDG00000012133	-	82	53.086
ENSSLDG00000000202	-	76	53.086	ENSSLDG00000016317	-	87	53.086
ENSSLDG00000000202	-	82	48.780	ENSSLDG00000007524	-	79	48.780
ENSSLDG00000000202	-	91	59.740	ENSSLDG00000004485	-	52	59.740
ENSSLDG00000000202	-	67	45.679	ENSSLDG00000000432	-	84	45.679
ENSSLDG00000000202	-	63	41.558	ENSSLDG00000013565	scrt2	51	35.526
ENSSLDG00000000202	-	68	51.282	ENSSLDG00000006724	-	88	51.282
ENSSLDG00000000202	-	82	51.220	ENSSLDG00000005999	-	58	51.220
ENSSLDG00000000202	-	74	55.696	ENSSLDG00000006994	-	77	48.000
ENSSLDG00000000202	-	100	51.220	ENSSLDG00000015116	-	72	48.421
ENSSLDG00000000202	-	80	51.667	ENSSLDG00000013353	prdm5	55	48.101
ENSSLDG00000000202	-	77	54.321	ENSSLDG00000018493	-	78	54.321
ENSSLDG00000000202	-	96	51.282	ENSSLDG00000020455	-	93	51.282
ENSSLDG00000000202	-	85	51.852	ENSSLDG00000017937	-	92	51.948
ENSSLDG00000000202	-	98	49.383	ENSSLDG00000000376	-	82	49.383
ENSSLDG00000000202	-	78	50.000	ENSSLDG00000004098	-	99	50.000
ENSSLDG00000000202	-	96	51.852	ENSSLDG00000009061	-	90	50.000
ENSSLDG00000000202	-	66	54.545	ENSSLDG00000001787	zbtb24	80	54.545
ENSSLDG00000000202	-	97	51.852	ENSSLDG00000020675	-	93	51.948
ENSSLDG00000000202	-	72	42.857	ENSSLDG00000014177	zbtb47b	61	42.857
ENSSLDG00000000202	-	66	54.098	ENSSLDG00000009582	-	89	54.098
ENSSLDG00000000202	-	89	46.914	ENSSLDG00000018598	-	92	46.914
ENSSLDG00000000202	-	72	50.000	ENSSLDG00000012036	-	92	50.000
ENSSLDG00000000202	-	72	52.564	ENSSLDG00000002756	-	76	52.564
ENSSLDG00000000202	-	75	50.633	ENSSLDG00000004756	-	85	50.633
ENSSLDG00000000202	-	76	49.383	ENSSLDG00000010390	-	82	49.383
ENSSLDG00000000202	-	75	48.148	ENSSLDG00000020655	-	54	48.148
ENSSLDG00000000202	-	91	50.617	ENSSLDG00000000352	-	72	50.617
ENSSLDG00000000202	-	72	46.341	ENSSLDG00000012852	snai2	70	46.341
ENSSLDG00000000202	-	87	46.341	ENSSLDG00000012320	-	97	51.899
ENSSLDG00000000202	-	66	49.383	ENSSLDG00000007568	-	73	49.383
ENSSLDG00000000202	-	66	46.835	ENSSLDG00000014436	-	70	46.835
ENSSLDG00000000202	-	75	54.545	ENSSLDG00000020990	-	50	54.545
ENSSLDG00000000202	-	93	54.545	ENSSLDG00000002515	-	87	54.545

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000000202	-	76	48.101	ENSAPOG00000010330	-	82	48.101	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000000202	-	66	53.061	ENSAPOG00000003414	-	99	53.061	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000000202	-	94	47.222	ENSAPOG00000014372	-	76	47.222	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000000202	-	66	57.971	ENSAPOG00000016615	-	76	57.971	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000000202	-	85	49.383	ENSAPOG00000000601	-	73	49.383	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000000202	-	67	46.988	ENSAOCG00000007347	-	60	46.988	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000000202	-	67	49.123	ENSAPEG00000004256	-	63	49.123	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000000202	-	84	52.500	ENSATEG00000007658	-	72	52.500	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000000202	-	97	51.948	ENSAMXG00000013492	-	96	51.948	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000000202	-	85	40.000	ENSCPBG00000015272	-	53	40.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000000202	-	80	46.154	ENSCING00000024717	-	72	46.154	Ciona_intestinalis
ENSSLDG00000000202	-	94	49.383	ENSCVAG00000018383	-	79	49.383	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000000202	-	76	51.923	ENSEBUG00000003232	-	53	51.923	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000000202	-	76	49.351	ENSEBUG00000001569	-	75	49.351	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000000202	-	76	46.835	ENSEBUG00000001308	-	69	46.835	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000000202	-	80	53.846	ENSEBUG00000006666	-	83	53.846	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000000202	-	95	46.053	ENSEBUG00000000436	-	78	46.053	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000000202	-	76	55.696	ENSEBUG00000015472	-	56	55.696	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000000202	-	76	49.351	ENSEBUG00000014768	-	67	49.351	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000000202	-	78	48.052	ENSEBUG00000003418	-	92	48.052	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000000202	-	85	49.367	ENSEBUG00000000422	-	67	49.367	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000000202	-	70	54.717	ENSELUG00000000281	-	55	54.717	Esox_lucius
ENSSLDG00000000202	-	93	53.012	ENSELUG00000022942	-	65	53.012	Esox_lucius
ENSSLDG00000000202	-	75	50.000	ENSELUG00000007694	-	73	50.000	Esox_lucius
ENSSLDG00000000202	-	72	38.947	ENSGMOG00000016007	-	90	38.947	Gadus_morhua
ENSSLDG00000000202	-	75	63.291	ENSGMOG00000005588	-	100	63.291	Gadus_morhua
ENSSLDG00000000202	-	75	46.392	ENSGAFG00000021143	-	55	46.392	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000000202	-	76	55.696	ENSGAFG00000021139	-	84	55.696	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000000202	-	75	51.899	ENSGAGG00000010492	-	72	51.899	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000000202	-	73	51.948	ENSHBUG00000003529	-	77	51.948	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000000202	-	68	52.308	ENSHBUG00000007316	-	67	52.308	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000000202	-	96	50.617	ENSHCOG00000001318	-	99	49.383	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	75	50.588	ENSHCOG00000019454	-	51	50.588	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	71	48.148	ENSHCOG00000008133	-	55	48.148	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	67	54.321	ENSHCOG00000014797	-	56	54.321	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	90	50.617	ENSHCOG00000014792	-	58	50.617	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	71	48.780	ENSHCOG00000001245	-	65	48.780	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	92	53.086	ENSHCOG00000001242	-	72	53.086	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	67	55.556	ENSHCOG00000007358	-	70	55.556	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	80	51.852	ENSHCOG00000015355	-	86	55.556	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	75	58.025	ENSHCOG00000014777	-	65	58.025	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	84	50.000	ENSHCOG00000001300	-	86	50.000	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	75	53.086	ENSHCOG00000020924	-	60	53.086	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	75	51.852	ENSHCOG00000007681	-	82	51.852	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	100	56.790	ENSHCOG00000014781	-	66	56.790	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	99	53.086	ENSHCOG00000001256	-	76	53.086	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	71	47.561	ENSHCOG00000008742	-	74	47.561	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	75	53.012	ENSHCOG00000001238	-	88	53.012	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	66	54.321	ENSHCOG00000001793	-	70	54.321	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	72	49.383	ENSHCOG00000019006	-	50	49.383	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000000202	-	73	54.237	ENSLBEG00000012947	-	80	54.237	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000000202	-	66	51.948	ENSLBEG00000011588	-	60	51.948	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000000202	-	85	40.952	ENSLBEG00000025139	-	72	40.952	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000000202	-	69	69.697	ENSLBEG00000022059	-	77	69.697	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000000202	-	72	50.000	ENSMZEG00005028299	-	82	50.000	Maylandia_zebra
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