EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000000289 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: im:6912651
Full Name: uncharacterized LOC111671955
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5115 bases
Position: chrPEQF01099368.1:11400-16514
Accession: 111671955
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000000253	Isy1	PF06246.12	1.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000000291	-	3586	XM_023429207	ENSSLDP00000000253	319 (aa)	XP_023284975	UPI000C6FBF15

Gene Model

Click here to download ENSSLDG00000000289's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSLDG00000000289's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	69.497	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	99	69.497	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	63.950	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	63.950	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	58.805	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	99	58.805	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	67.296	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	99	67.296	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	69.620	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	100	69.620	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	97	65.484	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	66.144	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	45.283	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	99	45.283	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	58.491	ENSCSEG00000007482	-	99	58.491	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	57.944	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	99	57.944	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	44.795	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	99	44.795	Danio_rerio
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	50.926	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	100	50.926	Esox_lucius
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	60.188	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	99	60.188	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	75	66.807	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	66.807	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	97	65.484	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	66.144	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	44.937	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	99	44.937	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	66.144	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	99	66.144	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	74	61.667	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	98	53.605	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	37.202	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	99	37.202	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	44.620	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	99	45.570	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	70.219	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	70.219	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	97	65.484	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	66.144	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	58.934	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	100	58.934	Mola_mola
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	73.041	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	91	73.041	Monopterus_albus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	97	57.742	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	100	58.621	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	97	66.129	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	66.771	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	57.321	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	57.321	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	57.994	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	57.994	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	58.621	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	58.621	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	59.937	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	100	59.937	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	40.498	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	99	40.498	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	50.629	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	98	50.629	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	60.625	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	60.625	Poecilia_formosa
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	60.625	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	60.625	Poecilia_latipinna
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	60.938	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	60.938	Poecilia_mexicana
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	54.545	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	100	55.172	Poecilia_reticulata
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	97	65.161	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	65.831	Pundamilia_nyererei
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	48.265	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	99	48.265	Pygocentrus_nattereri
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	99	44.860	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	99	44.860	Scleropages_formosus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	96	74.593	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	100	75.078	Scophthalmus_maximus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	96.552	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	96.552	Seriola_dumerili
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	70.219	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	100	70.219	Stegastes_partitus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	59.062	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	58.750	Takifugu_rubripes
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	52.978	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	100	52.978	Xiphophorus_couchianus
ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	60.625	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	100	60.625	Xiphophorus_maculatus