EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000001217 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17545 bases
Position: chrPEQF01099274.1:5065915-5083459
Accession: 111669495
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000001537	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.8e-29	1	2
ENSSLDP00000001537	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.8e-29	2	2
ENSSLDP00000001513	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.6e-29	1	2
ENSSLDP00000001513	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.6e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000001595	-	5001	XM_023425816	ENSSLDP00000001513	821 (aa)	XP_023281584	UPI000C6F7F2C
ENSSLDT00000001620	-	2112	-	ENSSLDP00000001537	703 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSLDG00000001217's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSLDG00000001217's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.557	ENSG00000115421	PAPOLG	100	87.607	Homo_sapiens
ENSSLDG00000001217	papolg	100	92.917	ENSAPOG00000004798	papolg	100	92.917	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000001217	papolg	96	71.850	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	72.118	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000001217	papolg	100	84.540	ENSACIG00000010546	papolg	99	85.306	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000001217	papolg	100	93.157	ENSAOCG00000010254	papolg	100	93.157	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000001217	papolg	100	93.157	ENSAPEG00000006944	papolg	100	93.157	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000001217	papolg	100	94.478	ENSATEG00000009007	papolg	100	94.598	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000001217	papolg	98	62.299	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.600	Anas_platyrhynchos
ENSSLDG00000001217	papolg	79	55.665	ENSACAG00000015048	-	100	59.967	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000001217	papolg	99	68.414	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	72.193	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000001217	papolg	100	89.517	ENSACLG00000015592	papolg	100	89.566	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000001217	papolg	99	79.088	ENSAMXG00000004611	papolg	100	78.686	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.510	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	72.377	Bos_taurus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	72.460	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.326	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000001217	papolg	97	71.809	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	72.074	Canis_familiaris
ENSSLDG00000001217	papolg	99	71.011	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	72.193	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.244	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.112	Capra_hircus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	71.448	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	71.315	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000001217	papolg	52	83.967	ENSCAPG00000014901	-	100	83.967	Cavia_aperea
ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.340	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	71.809	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.460	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.326	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000001217	papolg	81	82.251	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	82.251	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.377	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	72.244	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.326	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	72.193	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000001217	papolg	89	70.343	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.162	Choloepus_hoffmanni
ENSSLDG00000001217	papolg	68	59.717	ENSCING00000024664	-	92	64.300	Ciona_intestinalis
ENSSLDG00000001217	papolg	67	60.288	ENSCSAVG00000009085	-	97	64.948	Ciona_savignyi
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.799	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	72.193	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.655	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	72.544	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.655	ENSCGRG00000005552	-	100	72.544	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000001217	papolg	100	84.478	ENSCSEG00000000771	papolg	99	89.163	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000001217	papolg	100	86.251	ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.722	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	79.654	ENSDARG00000012141	papolg	100	79.654	Danio_rerio
ENSSLDG00000001217	papolg	97	70.080	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	69.947	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000001217	papolg	59	80.930	ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000001217	papolg	99	53.795	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	57.540	Echinops_telfairi
ENSSLDG00000001217	papolg	63	55.022	ENSEBUG00000005042	-	78	58.734	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000001217	papolg	60	67.013	ENSEBUG00000004020	papolg	90	72.396	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000001217	papolg	97	71.979	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	72.244	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000001217	papolg	97	71.979	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	72.155	Equus_caballus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	59.492	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.096	Erinaceus_europaeus
ENSSLDG00000001217	papolg	100	77.827	ENSELUG00000014497	papolg	99	80.775	Esox_lucius
ENSSLDG00000001217	papolg	96	71.580	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	71.182	Felis_catus
ENSSLDG00000001217	papolg	98	57.317	ENSFALG00000011079	PAPOLG	96	60.594	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000001217	papolg	99	72.149	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	72.016	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000001217	papolg	63	85.741	ENSFHEG00000019080	papolg	97	85.150	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000001217	papolg	89	88.889	ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.537	Gadus_morhua
ENSSLDG00000001217	papolg	99	59.383	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	62.948	Gallus_gallus
ENSSLDG00000001217	papolg	100	87.044	ENSGAFG00000003263	papolg	100	87.352	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000001217	papolg	89	90.629	ENSGACG00000002718	papolg	100	90.629	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.935	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	72.193	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000001217	papolg	100	89.517	ENSHBUG00000004882	papolg	100	89.566	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.699	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	72.557	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.824	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	72.643	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000001217	papolg	100	90.987	ENSHCOG00000006782	papolg	100	90.987	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000001217	papolg	99	78.989	ENSIPUG00000021642	papolg	100	79.515	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	66.844	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	72.244	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000001217	papolg	59	81.163	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	86.480	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000001217	papolg	100	88.263	ENSKMAG00000016439	papolg	100	88.263	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000001217	papolg	95	93.202	ENSLBEG00000023218	papolg	100	87.385	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000001217	papolg	96	66.176	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	66.176	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000001217	papolg	99	78.524	ENSLOCG00000016130	papolg	100	78.261	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.604	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.781	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.023	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	72.460	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.023	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	72.460	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000001217	papolg	99	59.495	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	64.940	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000001217	papolg	99	72.059	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	72.326	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000001217	papolg	100	91.837	ENSMAMG00000010667	papolg	100	91.957	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000001217	papolg	100	89.517	ENSMZEG00005018140	papolg	100	89.566	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000001217	papolg	96	63.298	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	63.818	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.292	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	72.483	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.244	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	72.289	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.862	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	72.170	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000001217	papolg	99	91.757	ENSMMOG00000008020	papolg	99	91.757	Mola_mola
ENSSLDG00000001217	papolg	96	70.415	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	70.390	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000001217	papolg	100	91.837	ENSMALG00000007012	papolg	100	91.837	Monopterus_albus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	68.414	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	87.089	Mus_caroli
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.596	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	Mus_musculus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	68.011	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.304	Mus_pahari
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.596	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	Mus_spretus
ENSSLDG00000001217	papolg	97	71.809	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	72.074	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000001217	papolg	99	72.102	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	71.968	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.287	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	72.437	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000001217	papolg	100	72.460	ENSNBRG00000011943	papolg	99	80.080	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000001217	papolg	59	80.698	ENSNLEG00000009507	-	100	86.014	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000001217	papolg	66	68.923	ENSMEUG00000013605	-	68	68.923	Notamacropus_eugenii
ENSSLDG00000001217	papolg	99	70.955	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	70.822	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000001217	papolg	58	78.066	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.452	Octodon_degus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	83.740	ENSONIG00000002985	papolg	100	83.423	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000001217	papolg	96	71.829	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	71.296	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.020	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	72.112	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000001217	papolg	100	87.799	ENSORLG00000001577	papolg	100	87.799	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000001217	papolg	100	87.665	ENSORLG00020002482	papolg	100	88.024	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000001217	papolg	100	87.799	ENSORLG00015008836	papolg	100	87.799	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000001217	papolg	100	88.995	ENSOMEG00000001406	papolg	100	88.876	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000001217	papolg	57	59.155	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	60.860	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.112	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	71.979	Ovis_aries
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.935	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	72.460	Pan_paniscus
ENSSLDG00000001217	papolg	96	71.580	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	71.182	Panthera_pardus
ENSSLDG00000001217	papolg	96	71.448	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	71.049	Panthera_tigris_altaica
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.935	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	72.460	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000001217	papolg	99	63.978	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	68.933	Papio_anubis
ENSSLDG00000001217	papolg	95	78.917	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	78.917	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000001217	papolg	98	78.121	ENSPKIG00000003313	papolg	100	77.554	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000001217	papolg	96	68.449	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.449	Pelodiscus_sinensis
ENSSLDG00000001217	papolg	99	66.711	ENSPEMG00000008960	-	100	71.602	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000001217	papolg	68	60.843	ENSPMAG00000004864	-	98	64.185	Petromyzon_marinus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	51.910	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.501	Petromyzon_marinus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	70.619	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	70.596	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000001217	papolg	100	86.941	ENSPFOG00000012909	papolg	100	86.423	Poecilia_formosa
ENSSLDG00000001217	papolg	100	86.926	ENSPLAG00000018445	papolg	100	86.407	Poecilia_latipinna
ENSSLDG00000001217	papolg	100	86.957	ENSPMEG00000003961	papolg	100	87.028	Poecilia_mexicana
ENSSLDG00000001217	papolg	100	86.000	ENSPREG00000010358	papolg	100	86.118	Poecilia_reticulata
ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.059	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	71.925	Pongo_abelii
ENSSLDG00000001217	papolg	96	64.123	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	63.989	Procavia_capensis
ENSSLDG00000001217	papolg	99	62.603	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	66.532	Propithecus_coquereli
ENSSLDG00000001217	papolg	88	77.878	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.982	Pteropus_vampyrus
ENSSLDG00000001217	papolg	100	89.517	ENSPNYG00000006729	papolg	100	89.566	Pundamilia_nyererei
ENSSLDG00000001217	papolg	99	79.011	ENSPNAG00000015521	papolg	100	79.011	Pygocentrus_nattereri
ENSSLDG00000001217	papolg	99	68.414	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	72.969	Rattus_norvegicus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	63.293	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	67.068	Rhinopithecus_bieti
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.891	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	71.754	Rhinopithecus_roxellana
ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.326	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.594	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSLDG00000001217	papolg	92	70.531	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	70.365	Sarcophilus_harrisii
ENSSLDG00000001217	papolg	99	71.330	ENSSFOG00015002383	papolg	100	75.848	Scleropages_formosus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	66.066	ENSSFOG00015011874	papolg	100	67.480	Scleropages_formosus
ENSSLDG00000001217	papolg	92	93.060	ENSSMAG00000015598	papolg	100	89.055	Scophthalmus_maximus
ENSSLDG00000001217	papolg	100	99.513	ENSSDUG00000000912	papolg	100	99.513	Seriola_dumerili
ENSSLDG00000001217	papolg	99	65.421	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	68.504	Sphenodon_punctatus
ENSSLDG00000001217	papolg	100	90.856	ENSSPAG00000009004	papolg	100	90.856	Stegastes_partitus
ENSSLDG00000001217	papolg	99	72.643	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.510	Sus_scrofa
ENSSLDG00000001217	papolg	74	68.831	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	72.862	Taeniopygia_guttata
ENSSLDG00000001217	papolg	100	83.518	ENSTRUG00000006410	papolg	99	84.232	Takifugu_rubripes
ENSSLDG00000001217	papolg	89	84.168	ENSTNIG00000017106	papolg	100	84.168	Tetraodon_nigroviridis
ENSSLDG00000001217	papolg	96	65.863	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	65.730	Tupaia_belangeri
ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.729	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	67.862	Tursiops_truncatus
ENSSLDG00000001217	papolg	97	71.543	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	72.177	Ursus_americanus
ENSSLDG00000001217	papolg	96	71.909	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	72.177	Ursus_maritimus
ENSSLDG00000001217	papolg	96	68.859	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	69.128	Vicugna_pacos
ENSSLDG00000001217	papolg	99	70.745	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	72.207	Vulpes_vulpes
ENSSLDG00000001217	papolg	99	63.311	ENSXETG00000002208	papolg	100	67.942	Xenopus_tropicalis
ENSSLDG00000001217	papolg	69	92.169	ENSXCOG00000006611	papolg	73	96.994	Xiphophorus_couchianus
ENSSLDG00000001217	papolg	74	100.000	ENSXMAG00000007383	papolg	99	94.400	Xiphophorus_maculatus