EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000001705 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ireb2
Alias: IRP2|im:7153062
Full Name: iron responsive element binding protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13000 bases
Position: chrPEQF01096753.1:3084279-3097278
Accession: 111650364
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000002162	Aconitase	PF00330.20	4.6e-153	1	2
ENSSLDP00000002162	Aconitase	PF00330.20	4.6e-153	2	2
ENSSLDP00000002162	Aconitase_C	PF00694.19	4.3e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000002259	-	3001	XM_023400243	ENSSLDP00000002162	973 (aa)	XP_023256011	UPI000C6F7957

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSLDG00000001705	ireb2	91	60.425	ENSSLDG00000013952	aco1	99	60.425

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.692	ENSG00000136381	IREB2	97	75.676	Homo_sapiens
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	92.078	ENSAPOG00000020564	ireb2	99	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	92.078	ENSAPOG00000016684	ireb2	99	92.774	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	92.078	ENSAPOG00000015501	-	99	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.040	ENSAMEG00000012645	IREB2	99	69.040	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	93.057	ENSACIG00000012557	ireb2	99	93.057	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	93.182	ENSAOCG00000000407	ireb2	99	93.182	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	93.217	ENSAPEG00000009121	ireb2	100	93.217	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	89.050	ENSATEG00000021145	ireb2	99	89.050	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	87.190	ENSATEG00000021210	ireb2	99	87.190	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	67.528	ENSAPLG00000016388	IREB2	99	67.528	Anas_platyrhynchos
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.795	ENSANAG00000021994	IREB2	99	68.795	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	91.881	ENSACLG00000024688	ireb2	100	91.881	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	79.346	ENSAMXG00000008756	ireb2	99	79.713	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.001	ENSBTAG00000002504	IREB2	99	69.001	Bos_taurus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.692	ENSCJAG00000010259	IREB2	99	68.692	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.795	ENSCAFG00000001766	IREB2	99	68.795	Canis_familiaris
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.191	ENSCAFG00020021072	IREB2	99	70.204	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.207	ENSCHIG00000023111	IREB2	99	69.207	Capra_hircus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.654	ENSTSYG00000011729	IREB2	99	68.654	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000001705	ireb2	86	65.901	ENSCAPG00000011854	IREB2	99	65.905	Cavia_aperea
ENSSLDG00000001705	ireb2	86	68.881	ENSCPOG00000013905	IREB2	99	68.881	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.795	ENSCCAG00000021202	IREB2	99	68.795	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.104	ENSCATG00000033462	IREB2	99	69.104	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.104	ENSCLAG00000008985	IREB2	99	69.104	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.104	ENSCSAG00000014904	IREB2	99	69.104	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	66.528	ENSCHOG00000004107	IREB2	99	66.528	Choloepus_hoffmanni
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.937	ENSCPBG00000024247	IREB2	99	69.670	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.001	ENSCANG00000029420	IREB2	99	69.001	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.247	ENSCGRG00001019234	Ireb2	99	68.247	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.536	ENSCGRG00000016786	Ireb2	99	68.536	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	87.461	ENSCSEG00000003080	ireb2	100	87.461	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	86.943	ENSCVAG00000010739	ireb2	97	87.565	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	77.551	ENSDARG00000021466	ireb2	99	77.653	Danio_rerio
ENSSLDG00000001705	ireb2	96	68.977	ENSDNOG00000009614	IREB2	99	68.977	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000001705	ireb2	90	65.034	ENSDORG00000014339	Ireb2	99	61.267	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000001705	ireb2	74	69.512	ENSETEG00000012717	IREB2	74	69.512	Echinops_telfairi
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.072	ENSEASG00005015622	IREB2	99	69.072	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.072	ENSECAG00000016731	IREB2	99	72.897	Equus_caballus
ENSSLDG00000001705	ireb2	92	67.111	ENSEEUG00000007999	IREB2	99	67.111	Erinaceus_europaeus
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	84.086	ENSELUG00000023666	ireb2	100	84.292	Esox_lucius
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.589	ENSFCAG00000001921	IREB2	99	68.589	Felis_catus
ENSSLDG00000001705	ireb2	91	69.681	ENSFALG00000010640	IREB2	99	69.681	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.001	ENSFDAG00000009355	IREB2	99	69.001	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	89.106	ENSFHEG00000017905	ireb2	97	89.541	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	81.340	ENSGMOG00000009184	ireb2	99	81.340	Gadus_morhua
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	67.495	ENSGALG00000035462	IREB2	99	67.495	Gallus_gallus
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	86.145	ENSGAFG00000005145	ireb2	98	86.145	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	87.359	ENSGACG00000007341	ireb2	99	87.359	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.388	ENSGAGG00000006117	IREB2	96	68.388	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.692	ENSGGOG00000015650	IREB2	99	68.692	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	91.881	ENSHBUG00000007184	ireb2	100	91.881	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.691	ENSHGLG00000000783	Ireb2	99	69.691	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.691	ENSHGLG00100019429	Ireb2	99	69.691	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000001705	ireb2	98	84.260	ENSHCOG00000007424	ireb2	100	84.260	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	78.039	ENSIPUG00000014808	Ireb2	99	78.351	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.104	ENSSTOG00000009273	IREB2	99	69.104	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	64.382	ENSJJAG00000019768	Ireb2	99	64.382	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	90.134	ENSKMAG00000016020	ireb2	98	90.134	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	92.710	ENSLBEG00000020371	ireb2	100	92.710	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	62.679	ENSLACG00000001182	IREB2	99	62.679	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	76.892	ENSLOCG00000015029	ireb2	99	76.892	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.969	ENSLAFG00000012839	IREB2	99	68.969	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.104	ENSMFAG00000039630	IREB2	99	69.104	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.104	ENSMMUG00000045680	IREB2	99	69.104	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	66.941	ENSMNEG00000039698	IREB2	99	66.941	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.104	ENSMLEG00000031047	IREB2	99	69.104	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	90.956	ENSMAMG00000023095	ireb2	100	90.956	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	91.984	ENSMZEG00005010935	ireb2	100	91.984	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	67.562	ENSMGAG00000003688	IREB2	99	67.562	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.486	ENSMICG00000005757	IREB2	99	68.486	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.328	ENSMOCG00000010784	Ireb2	99	68.328	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	92.746	ENSMMOG00000001385	ireb2	97	92.746	Mola_mola
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.033	ENSMODG00000011768	IREB2	99	69.033	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	89.845	ENSMALG00000015314	ireb2	99	89.845	Monopterus_albus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.654	MGP_CAROLIEiJ_G0032235	Ireb2	100	68.654	Mus_caroli
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.551	ENSMUSG00000032293	Ireb2	100	68.551	Mus_musculus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.756	MGP_PahariEiJ_G0015103	Ireb2	100	68.756	Mus_pahari
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.551	MGP_SPRETEiJ_G0033375	Ireb2	100	68.551	Mus_spretus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.782	ENSMPUG00000010978	IREB2	94	69.782	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.373	ENSMLUG00000006783	IREB2	99	68.373	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.454	ENSNGAG00000017333	Ireb2	99	68.454	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	91.984	ENSNBRG00000017676	ireb2	100	91.984	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.898	ENSNLEG00000008549	IREB2	99	68.898	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000001705	ireb2	74	78.641	ENSMEUG00000001630	-	74	78.641	Notamacropus_eugenii
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	65.464	ENSOPRG00000000340	IREB2	99	65.464	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.597	ENSODEG00000015993	IREB2	99	69.597	Octodon_degus
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	92.189	ENSONIG00000012838	ireb2	100	92.189	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	70.083	ENSOANG00000013218	-	98	70.083	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSLDG00000001705	ireb2	94	70.066	ENSOCUG00000009907	IREB2	99	70.066	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	88.144	ENSORLG00000001943	ireb2	92	88.144	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	88.144	ENSORLG00020000623	ireb2	97	88.144	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	88.284	ENSORLG00015014057	ireb2	98	88.284	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	87.461	ENSOMEG00000005120	ireb2	98	87.461	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	65.811	ENSOGAG00000010622	IREB2	99	65.811	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.782	ENSOARG00000000881	IREB2	99	68.782	Ovis_aries
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.795	ENSPPAG00000038956	IREB2	99	68.795	Pan_paniscus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.692	ENSPPRG00000003145	IREB2	99	68.692	Panthera_pardus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.737	ENSPTIG00000021418	IREB2	86	68.737	Panthera_tigris_altaica
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.795	ENSPTRG00000007342	IREB2	99	68.795	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	69.136	ENSPANG00000015813	IREB2	99	69.104	Papio_anubis
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	76.663	ENSPKIG00000012755	ireb2	99	76.663	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000001705	ireb2	90	70.481	ENSPSIG00000009905	IREB2	98	70.481	Pelodiscus_sinensis
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	84.352	ENSPMGG00000016828	ireb2	99	84.352	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.744	ENSPEMG00000020204	Ireb2	99	68.744	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000001705	ireb2	99	68.718	ENSPCIG00000019022	IREB2	88	68.718	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	89.723	ENSPFOG00000014509	ireb2	98	89.723	Poecilia_formosa
ENSSLDG00000001705	ireb2	100	89.630	ENSPLAG00000002220	ireb2	98	89.630	Poecilia_latipinna
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