EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000003554 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 59807 bases
Position: chrPEQF01099039.1:777765-837571
Accession: 111662268
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000004553	Wyosine_form	PF08608.12	2.3e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000004705	-	3789	XM_023416069	ENSSLDP00000004553	754 (aa)	XP_023271837	UPI000C6F70A1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.627	ENSG00000198874	TYW1	98	67.901	Homo_sapiens
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	59.366	ENSG00000277149	TYW1B	98	59.780	Homo_sapiens
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	88.212	ENSAPOG00000014391	tyw1	100	88.212	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	83.081	ENSACIG00000007325	tyw1	100	83.151	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	88.874	ENSAOCG00000016792	tyw1	100	88.742	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	89.007	ENSAPEG00000015939	tyw1	100	88.874	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000003554	tyw1	91	87.555	ENSATEG00000006856	tyw1	94	87.555	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.850	ENSANAG00000037051	-	98	66.713	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	85.676	ENSACLG00000018688	tyw1	100	85.544	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	74.931	ENSAMXG00000004157	tyw1	98	76.309	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	68.088	ENSBTAG00000008446	TYW1	98	67.813	Bos_taurus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.758	ENSCJAG00000004295	-	98	66.486	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.442	ENSCAFG00000010867	-	98	67.896	Canis_familiaris
ENSSLDG00000003554	tyw1	92	63.545	ENSCAFG00020005367	-	98	64.173	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.896	ENSCHIG00000019510	-	98	67.906	Capra_hircus
ENSSLDG00000003554	tyw1	86	66.972	ENSTSYG00000008236	-	98	66.972	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000003554	tyw1	85	65.217	ENSCAPG00000013569	-	100	65.217	Cavia_aperea
ENSSLDG00000003554	tyw1	95	66.758	ENSCPOG00000011182	-	99	66.485	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.813	ENSCCAG00000026643	-	98	67.675	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.353	ENSCATG00000043677	-	98	67.490	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.076	ENSCLAG00000006321	-	99	66.621	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000003554	tyw1	87	71.636	ENSCSAG00000018274	-	98	72.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	66.797	ENSCPBG00000014896	-	100	72.578	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000003554	tyw1	79	57.763	ENSCING00000004125	-	97	58.667	Ciona_intestinalis
ENSSLDG00000003554	tyw1	50	70.332	ENSCSAVG00000005712	-	100	55.051	Ciona_savignyi
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.215	ENSCANG00000033209	-	98	67.490	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000003554	tyw1	68	76.888	ENSCGRG00001003679	Tyw1	88	76.577	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	83.201	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	83.311	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000003554	tyw1	91	80.673	ENSCVAG00000001054	tyw1	96	80.966	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000003554	tyw1	99	74.437	ENSDARG00000062987	tyw1	99	75.629	Danio_rerio
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	68.320	ENSDNOG00000024165	-	98	68.320	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000003554	tyw1	83	64.800	ENSDORG00000014772	Tyw1	91	64.800	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000003554	tyw1	51	48.429	ENSETEG00000009904	-	84	48.429	Echinops_telfairi
ENSSLDG00000003554	tyw1	58	74.537	ENSEBUG00000004494	tyw1	91	74.537	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.891	ENSEASG00005008818	-	99	68.182	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	62.810	ENSECAG00000023164	-	99	62.259	Equus_caballus
ENSSLDG00000003554	tyw1	59	80.412	ENSEEUG00000005950	-	57	79.592	Erinaceus_europaeus
ENSSLDG00000003554	tyw1	99	75.899	ENSELUG00000008449	tyw1	100	72.754	Esox_lucius
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.940	ENSFCAG00000014262	-	98	67.940	Felis_catus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	64.835	ENSFALG00000013810	-	99	65.385	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.209	ENSFDAG00000013270	-	98	66.621	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000003554	tyw1	81	81.804	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	81.804	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.438	ENSGALG00000001110	-	98	66.849	Gallus_gallus
ENSSLDG00000003554	tyw1	97	83.243	ENSGACG00000012692	tyw1	99	83.243	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.808	ENSGAGG00000022393	-	98	68.493	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000003554	tyw1	86	59.299	ENSGGOG00000001473	TYW1	98	59.604	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	85.544	ENSHBUG00000002640	tyw1	100	85.411	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000003554	tyw1	86	67.647	ENSHGLG00000012093	-	100	67.492	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.667	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	66.667	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000003554	tyw1	97	67.659	ENSHCOG00000019949	tyw1	97	67.659	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	71.560	ENSIPUG00000016330	tyw1	100	72.870	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.253	ENSSTOG00000004067	-	90	66.391	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000003554	tyw1	95	65.690	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	66.160	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	82.759	ENSKMAG00000018599	tyw1	100	82.759	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	65.937	ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.076	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	73.626	ENSLOCG00000004035	tyw1	95	73.626	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.627	ENSMFAG00000035457	-	98	67.764	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.627	ENSMMUG00000030374	-	98	67.764	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.627	ENSMNEG00000041992	-	98	72.000	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.490	ENSMLEG00000039741	-	98	67.627	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000003554	tyw1	98	89.160	ENSMAMG00000016089	tyw1	99	88.329	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000003554	tyw1	92	86.831	ENSMZEG00005024386	tyw1	99	86.252	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	65.890	ENSMGAG00000002176	-	98	66.301	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.667	ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.667	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	68.082	ENSMICG00000014374	-	99	68.219	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	65.068	ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.529	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000003554	tyw1	97	78.718	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	79.945	Mola_mola
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.033	ENSMODG00000025697	-	98	67.166	Monodelphis_domestica
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ENSSLDG00000003554	tyw1	96	65.890	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	99	66.528	Mus_caroli
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ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.033	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	99	66.758	Mus_pahari
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.025	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	99	66.390	Mus_spretus
ENSSLDG00000003554	tyw1	88	71.084	ENSMPUG00000016191	-	95	71.084	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	65.714	ENSMLUG00000013582	-	99	65.986	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.529	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	66.484	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000003554	tyw1	92	83.647	ENSNBRG00000016996	tyw1	98	83.502	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.804	ENSNLEG00000013210	-	97	66.941	Nomascus_leucogenys
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ENSSLDG00000003554	tyw1	96	60.083	ENSODEG00000014729	-	98	60.083	Octodon_degus
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	84.218	ENSONIG00000005872	tyw1	100	84.085	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000003554	tyw1	95	67.125	ENSOCUG00000003173	-	98	67.080	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	79.603	ENSORLG00000001393	tyw1	99	79.868	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	79.603	ENSORLG00020019361	tyw1	100	79.868	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	79.789	ENSORLG00015008095	tyw1	99	80.053	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000003554	tyw1	88	72.180	ENSOGAG00000016555	-	99	67.258	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.852	ENSOARG00000010673	-	99	67.852	Ovis_aries
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.906	ENSPPRG00000004945	-	98	67.906	Panthera_pardus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.906	ENSPTIG00000019545	-	98	67.906	Panthera_tigris_altaica
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	62.517	ENSPTRG00000023076	TYW1B	97	62.927	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.353	ENSPANG00000019053	-	98	67.490	Papio_anubis
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	70.442	ENSPKIG00000006545	tyw1	96	71.133	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000003554	tyw1	94	80.367	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	80.508	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.712	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	67.121	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	79.369	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	81.992	Poecilia_formosa
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	79.106	ENSPLAG00000000838	tyw1	100	80.158	Poecilia_latipinna
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ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.353	ENSPPYG00000017514	TYW1	98	67.764	Pongo_abelii
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	53.288	ENSPCOG00000015294	-	98	53.562	Propithecus_coquereli
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	85.544	ENSPNYG00000022381	tyw1	100	85.411	Pundamilia_nyererei
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	76.471	ENSPNAG00000009001	tyw1	98	77.049	Pygocentrus_nattereri
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	65.981	ENSRNOG00000024352	Tyw1	98	66.529	Rattus_norvegicus
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.353	ENSRBIG00000039619	-	98	67.490	Rhinopithecus_bieti
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ENSSLDG00000003554	tyw1	91	39.802	YPL207W	-	76	40.085	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.437	ENSSBOG00000025873	-	98	66.300	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	65.265	ENSSHAG00000010346	-	99	66.392	Sarcophilus_harrisii
ENSSLDG00000003554	tyw1	99	70.861	ENSSFOG00015001054	tyw1	98	72.581	Scleropages_formosus
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ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.255	ENSSPUG00000002715	-	98	67.213	Sphenodon_punctatus
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ENSSLDG00000003554	tyw1	87	66.917	ENSTGUG00000003428	-	99	67.368	Taeniopygia_guttata
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ENSSLDG00000003554	tyw1	88	87.202	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	87.387	Tetraodon_nigroviridis
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	67.715	ENSUMAG00000015343	-	98	67.715	Ursus_maritimus
ENSSLDG00000003554	tyw1	95	67.308	ENSVVUG00000016457	-	98	67.305	Vulpes_vulpes
ENSSLDG00000003554	tyw1	96	68.895	ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.441	Xenopus_tropicalis
ENSSLDG00000003554	tyw1	100	79.973	ENSXMAG00000013125	tyw1	100	80.902	Xiphophorus_maculatus