EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000003869 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 36364 bases
Position: chrPEQF01098871.1:280405-316768
Accession: 111657318
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000005071	IBN_N	PF03810.19	3.9e-13	1	1
ENSSLDP00000005014	IBN_N	PF03810.19	6.7e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000005235	-	3207	-	ENSSLDP00000005071	1068 (aa)	-	-
ENSSLDT00000005174	-	5981	XM_023409437	ENSSLDP00000005014	1086 (aa)	XP_023265205	UPI000C6F97E9

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.930	ENSG00000196497	IPO4	99	44.894	Homo_sapiens
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	81.400	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	81.123	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	43.831	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	43.646	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	81.451	ENSACIG00000004246	ipo4	100	81.451	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	85.138	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	85.138	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	85.229	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	85.229	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000003869	ipo4	92	90.429	ENSATEG00000017082	ipo4	99	90.229	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000003869	ipo4	84	46.609	ENSACAG00000003973	-	97	46.912	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.651	ENSANAG00000037973	IPO4	99	44.393	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	82.228	ENSACLG00000019742	ipo4	100	82.228	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	71.363	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	70.810	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.475	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.475	Bos_taurus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.312	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	45.129	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.200	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	45.028	Canis_familiaris
ENSSLDG00000003869	ipo4	98	44.796	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.959	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.734	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	44.843	Capra_hircus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.734	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	44.475	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.120	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	44.936	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.837	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	44.669	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.023	ENSCATG00000040395	IPO4	99	45.037	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.120	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	44.936	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000003869	ipo4	91	45.381	ENSCPBG00000025757	IPO4	97	44.553	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000003869	ipo4	92	37.329	ENSCING00000008639	-	99	36.667	Ciona_intestinalis
ENSSLDG00000003869	ipo4	94	36.433	ENSCSAVG00000011482	-	100	36.564	Ciona_savignyi
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.837	ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.853	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.126	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	43.900	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.126	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	43.900	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	78.716	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	78.532	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	74.700	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	74.658	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	75.298	ENSDARG00000041493	ipo4	100	75.253	Danio_rerio
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.120	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	45.028	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.200	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	45.120	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	43.721	ENSETEG00000018381	IPO4	99	43.355	Echinops_telfairi
ENSSLDG00000003869	ipo4	91	46.660	ENSEASG00005011954	IPO4	96	46.457	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.212	ENSECAG00000009909	IPO4	99	45.028	Equus_caballus
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	74.027	ENSELUG00000020628	ipo4	100	75.596	Esox_lucius
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.212	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	45.028	Felis_catus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	41.705	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	41.522	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000003869	ipo4	89	82.561	ENSFHEG00000009351	ipo4	98	82.561	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	78.105	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	78.105	Gadus_morhua
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	79.927	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	79.927	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	82.228	ENSGACG00000002276	ipo4	99	82.228	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.930	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	44.945	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	82.873	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	82.873	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.120	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	44.936	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.843	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	44.659	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	79.238	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	78.876	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	73.665	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	73.665	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.856	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	45.672	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.879	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	44.894	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	80.992	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	80.900	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	84.361	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	84.361	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	50.401	ENSLACG00000001428	IPO4	100	50.764	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000003869	ipo4	78	68.031	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	68.031	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.005	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	44.495	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.023	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	45.037	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.023	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	45.037	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.930	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	44.945	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.023	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	45.037	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	85.083	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	84.899	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	82.873	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	82.873	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.700	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	44.434	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.573	ENSMICG00000001719	IPO4	99	45.396	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000003869	ipo4	98	44.060	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	44.210	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	82.126	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	82.951	Mola_mola
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	42.831	ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.567	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	83.456	ENSMALG00000001587	ipo4	100	83.640	Monopterus_albus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	43.993	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	45.623	Mus_caroli
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	43.900	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	45.499	Mus_musculus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.126	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	99	45.802	Mus_pahari
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	43.993	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	45.499	Mus_spretus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.672	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	45.672	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.773	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	44.681	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.682	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	45.497	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	85.820	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	85.175	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.522	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	45.429	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.488	ENSODEG00000002609	IPO4	99	45.304	Octodon_degus
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	85.820	ENSONIG00000014574	ipo4	100	85.820	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.628	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	44.720	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	84.444	ENSORLG00000006457	ipo4	99	80.268	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	84.444	ENSORLG00020004286	ipo4	100	79.025	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	84.444	ENSORLG00015021856	ipo4	100	79.209	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	76.859	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	76.524	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.475	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	44.291	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.066	ENSOARG00000019188	IPO4	99	44.066	Ovis_aries
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.558	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	44.577	Pan_paniscus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.396	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	45.212	Panthera_pardus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.304	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	45.120	Panthera_tigris_altaica
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.930	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	44.945	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.116	ENSPANG00000026278	IPO4	99	45.129	Papio_anubis
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	69.509	ENSPKIG00000007683	-	99	68.767	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	67.248	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	67.582	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	74.312	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	74.404	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	43.278	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	43.186	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000003869	ipo4	94	45.686	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	45.463	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	80.459	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	80.459	Poecilia_formosa
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	80.550	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	80.550	Poecilia_latipinna
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	80.459	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	80.459	Poecilia_mexicana
ENSSLDG00000003869	ipo4	100	80.183	ENSPREG00000017605	ipo4	100	80.183	Poecilia_reticulata
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ENSSLDG00000003869	ipo4	99	45.946	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	45.764	Procavia_capensis
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.921	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	44.751	Propithecus_coquereli
ENSSLDG00000003869	ipo4	98	45.225	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	45.143	Pteropus_vampyrus
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ENSSLDG00000003869	ipo4	100	75.138	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	75.414	Pygocentrus_nattereri
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.107	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	43.566	Rattus_norvegicus
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.837	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	44.853	Rhinopithecus_bieti
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.930	ENSRROG00000011492	IPO4	99	44.945	Rhinopithecus_roxellana
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.424	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	44.259	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	44.628	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.546	Sarcophilus_harrisii
ENSSLDG00000003869	ipo4	99	65.714	ENSSFOG00015014437	IPO4	99	65.438	Scleropages_formosus
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