EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000007282 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 46230 bases
Position: chrPEQF01099085.1:501798-548027
Accession: 111664823
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000009177	MIF4G	PF02854.19	2.2e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000009488	-	4871	XM_023419602	ENSSLDP00000009177	645 (aa)	XP_023275370	UPI000C6F5076

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.399	ENSG00000134030	CTIF	100	51.667	Homo_sapiens
ENSSLDG00000007282	ctif	100	70.735	ENSAPOG00000020192	ctif	65	87.978	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000007282	ctif	88	53.884	ENSAMEG00000006759	CTIF	54	62.356	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000007282	ctif	100	84.751	ENSACIG00000017099	ctif	55	90.591	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000007282	ctif	100	84.825	ENSAOCG00000014275	ctif	53	87.088	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000007282	ctif	100	90.385	ENSAPEG00000016975	ctif	100	86.095	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000007282	ctif	100	89.435	ENSATEG00000016752	ctif	100	86.161	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	61.997	ENSACAG00000018006	CTIF	55	66.384	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.464	ENSANAG00000024925	CTIF	60	63.889	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000007282	ctif	100	85.947	ENSACLG00000005956	ctif	100	83.432	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000007282	ctif	88	89.583	ENSBTAG00000018901	CTIF	71	89.583	Bos_taurus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.148	ENSCJAG00000004729	CTIF	60	63.536	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000007282	ctif	97	55.789	ENSCAFG00000019076	CTIF	91	63.836	Canis_familiaris
ENSSLDG00000007282	ctif	97	55.673	ENSCAFG00020026482	CTIF	91	64.481	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000007282	ctif	99	55.702	ENSCHIG00000014455	CTIF	91	62.842	Capra_hircus
ENSSLDG00000007282	ctif	81	57.942	ENSTSYG00000030461	CTIF	67	61.813	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000007282	ctif	99	51.387	ENSCAPG00000011865	CTIF	91	63.215	Cavia_aperea
ENSSLDG00000007282	ctif	99	54.769	ENSCPOG00000001049	CTIF	92	60.950	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.000	ENSCCAG00000022758	CTIF	91	63.536	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.399	ENSCATG00000038134	CTIF	62	63.989	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.158	ENSCLAG00000008174	CTIF	60	63.562	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000007282	ctif	99	55.378	ENSCSAG00000018021	CTIF	58	64.345	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000007282	ctif	88	91.667	ENSCPBG00000025654	CTIF	70	91.667	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.231	ENSCANG00000030916	CTIF	71	63.788	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	57.692	ENSCGRG00001020158	Ctif	91	65.014	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000007282	ctif	99	53.275	ENSCGRG00000000052	Ctif	91	56.952	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000007282	ctif	100	80.798	ENSCSEG00000019857	ctif	100	81.241	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000007282	ctif	100	80.355	ENSCVAG00000017158	ctif	100	79.025	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000007282	ctif	53	73.596	ENSDARG00000090617	ctif	50	75.073	Danio_rerio
ENSSLDG00000007282	ctif	67	58.280	ENSDNOG00000037310	CTIF	83	63.836	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.176	ENSDORG00000003221	Ctif	60	63.488	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000007282	ctif	78	89.583	ENSEASG00005016094	CTIF	91	64.067	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.696	ENSECAG00000020473	CTIF	60	63.889	Equus_caballus
ENSSLDG00000007282	ctif	76	59.203	ENSEEUG00000012451	CTIF	66	64.543	Erinaceus_europaeus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	65.995	ENSELUG00000008733	ctif	52	68.146	Esox_lucius
ENSSLDG00000007282	ctif	88	89.583	ENSFCAG00000000664	CTIF	71	89.583	Felis_catus
ENSSLDG00000007282	ctif	97	56.703	ENSFALG00000008943	CTIF	88	66.193	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000007282	ctif	99	55.459	ENSFDAG00000017379	CTIF	61	61.995	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000007282	ctif	100	78.955	ENSFHEG00000004334	ctif	100	73.285	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000007282	ctif	88	91.667	ENSGALG00000035912	-	71	91.667	Gallus_gallus
ENSSLDG00000007282	ctif	91	89.831	ENSGAFG00000011896	ctif	100	89.831	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000007282	ctif	63	55.275	ENSGAGG00000020663	CTIF	86	62.824	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.231	ENSGGOG00000015204	CTIF	62	63.812	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000007282	ctif	100	86.095	ENSHBUG00000018092	ctif	100	83.580	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.380	ENSHGLG00000005663	CTIF	60	64.246	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.231	ENSHGLG00100006976	CTIF	60	64.246	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000007282	ctif	99	63.142	ENSHCOG00000011784	ctif	94	71.739	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000007282	ctif	99	55.341	ENSSTOG00000001967	CTIF	60	62.881	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	55.275	ENSJJAG00000013706	Ctif	91	63.611	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000007282	ctif	100	82.563	ENSKMAG00000014651	ctif	100	81.818	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	68.976	ENSLOCG00000011697	ctif	53	70.893	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	49.719	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	77.652	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.399	ENSMFAG00000037903	CTIF	62	63.989	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.399	ENSMMUG00000020898	CTIF	62	63.989	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.399	ENSMNEG00000039395	CTIF	62	63.989	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.231	ENSMLEG00000041132	CTIF	62	63.989	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000007282	ctif	100	87.870	ENSMAMG00000014741	ctif	100	84.911	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000007282	ctif	89	84.272	ENSMZEG00005019767	ctif	90	81.457	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000007282	ctif	89	41.186	ENSMGAG00000001378	CTIF	61	91.667	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000007282	ctif	99	57.016	ENSMAUG00000000656	Ctif	91	63.760	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.528	ENSMICG00000010167	CTIF	60	63.215	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	57.059	ENSMOCG00000020507	Ctif	60	64.578	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000007282	ctif	100	86.099	ENSMMOG00000000831	ctif	56	87.131	Mola_mola
ENSSLDG00000007282	ctif	99	53.195	ENSMODG00000003464	CTIF	91	63.989	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000007282	ctif	69	89.744	ENSMALG00000020553	ctif	100	89.744	Monopterus_albus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	55.777	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	62	61.340	Mus_caroli
ENSSLDG00000007282	ctif	99	55.761	ENSMUSG00000052928	Ctif	62	61.026	Mus_musculus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	57.732	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	60	65.301	Mus_pahari
ENSSLDG00000007282	ctif	99	55.920	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	88	89.583	Mus_spretus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.305	ENSMPUG00000000844	CTIF	91	63.415	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.195	ENSMLUG00000003025	CTIF	91	63.115	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	57.227	ENSNGAG00000011452	Ctif	60	64.658	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000007282	ctif	100	86.243	ENSNBRG00000008679	ctif	100	83.580	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.231	ENSNLEG00000011503	CTIF	61	63.435	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.296	ENSOPRG00000003558	CTIF	91	64.187	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000007282	ctif	99	54.964	ENSODEG00000018390	CTIF	92	61.680	Octodon_degus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	77.003	ENSONIG00000007750	ctif	61	84.890	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000007282	ctif	79	49.241	ENSOANG00000001337	CTIF	73	48.662	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.203	ENSOCUG00000024842	CTIF	91	63.866	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000007282	ctif	100	82.941	ENSORLG00000005786	ctif	100	80.059	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000007282	ctif	100	82.275	ENSORLG00020005385	ctif	100	79.616	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000007282	ctif	100	82.866	ENSORLG00015011872	ctif	100	68.041	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000007282	ctif	100	82.474	ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.468	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.399	ENSOGAG00000013927	CTIF	60	63.562	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000007282	ctif	99	55.835	ENSOARG00000003754	CTIF	91	62.953	Ovis_aries
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.231	ENSPPAG00000023554	CTIF	76	67.500	Pan_paniscus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.176	ENSPPRG00000002265	CTIF	91	63.215	Panthera_pardus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.324	ENSPTIG00000013761	CTIF	91	63.488	Panthera_tigris_altaica
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.231	ENSPTRG00000010009	CTIF	76	67.500	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.231	ENSPANG00000017087	CTIF	62	63.989	Papio_anubis
ENSSLDG00000007282	ctif	88	89.583	ENSPSIG00000006508	CTIF	70	89.583	Pelodiscus_sinensis
ENSSLDG00000007282	ctif	99	57.206	ENSPEMG00000022746	Ctif	60	64.033	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000007282	ctif	71	57.407	ENSPCIG00000026247	CTIF	81	70.956	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000007282	ctif	100	77.966	ENSPFOG00000009243	ctif	65	77.041	Poecilia_formosa
ENSSLDG00000007282	ctif	100	81.791	ENSPLAG00000019171	ctif	100	69.276	Poecilia_latipinna
ENSSLDG00000007282	ctif	100	81.791	ENSPMEG00000020089	ctif	56	77.582	Poecilia_mexicana
ENSSLDG00000007282	ctif	100	76.312	ENSPREG00000017326	ctif	87	75.292	Poecilia_reticulata
ENSSLDG00000007282	ctif	79	59.480	ENSPPYG00000009147	CTIF	71	63.788	Pongo_abelii
ENSSLDG00000007282	ctif	99	54.142	ENSPCOG00000013391	CTIF	60	60.165	Propithecus_coquereli
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.204	ENSPVAG00000001965	CTIF	60	63.989	Pteropus_vampyrus
ENSSLDG00000007282	ctif	100	86.095	ENSPNYG00000007879	ctif	100	83.580	Pundamilia_nyererei
ENSSLDG00000007282	ctif	99	70.884	ENSPNAG00000029174	ctif	50	75.227	Pygocentrus_nattereri
ENSSLDG00000007282	ctif	99	57.375	ENSRNOG00000018342	Ctif	76	75.758	Rattus_norvegicus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.528	ENSRBIG00000043937	CTIF	61	63.989	Rhinopithecus_bieti
ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.380	ENSRROG00000006039	CTIF	61	63.989	Rhinopithecus_roxellana
ENSSLDG00000007282	ctif	88	88.000	ENSSBOG00000028468	CTIF	71	88.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSLDG00000007282	ctif	99	52.906	ENSSHAG00000016321	CTIF	91	63.788	Sarcophilus_harrisii
ENSSLDG00000007282	ctif	99	71.081	ENSSFOG00015022594	ctif	53	71.261	Scleropages_formosus
ENSSLDG00000007282	ctif	100	89.349	ENSSMAG00000005707	ctif	100	89.349	Scophthalmus_maximus
ENSSLDG00000007282	ctif	100	96.263	ENSSDUG00000016033	ctif	100	96.263	Seriola_dumerili
ENSSLDG00000007282	ctif	99	58.171	ENSSPUG00000014734	CTIF	91	67.232	Sphenodon_punctatus
ENSSLDG00000007282	ctif	100	75.923	ENSSPAG00000003721	ctif	100	76.071	Stegastes_partitus
ENSSLDG00000007282	ctif	99	55.391	ENSSSCG00000004506	CTIF	91	62.810	Sus_scrofa
ENSSLDG00000007282	ctif	99	55.925	ENSTGUG00000000030	CTIF	91	62.069	Taeniopygia_guttata
ENSSLDG00000007282	ctif	99	66.866	ENSTNIG00000018763	ctif	61	75.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSSLDG00000007282	ctif	83	68.750	ENSTBEG00000002613	CTIF	73	68.750	Tupaia_belangeri
ENSSLDG00000007282	ctif	86	51.939	ENSUAMG00000007299	CTIF	79	56.429	Ursus_americanus
ENSSLDG00000007282	ctif	88	89.583	ENSUMAG00000002735	CTIF	71	89.583	Ursus_maritimus
ENSSLDG00000007282	ctif	86	90.625	ENSVVUG00000014347	CTIF	71	87.500	Vulpes_vulpes
ENSSLDG00000007282	ctif	97	46.967	ENSXETG00000026836	ctif	72	70.611	Xenopus_tropicalis
ENSSLDG00000007282	ctif	64	71.332	ENSXCOG00000002477	ctif	95	74.014	Xiphophorus_couchianus
ENSSLDG00000007282	ctif	100	81.241	ENSXMAG00000004236	ctif	100	78.434	Xiphophorus_maculatus