EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000008601 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6026 bases
Position: chrPEQF01099121.1:95155-101180
Accession: 111665439
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000010797	SRP54	PF00448.22	2.5e-47	1	1
ENSSLDP00000010797	SRP54_N	PF02881.19	2.6e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000011193	-	2237	XM_023420442	ENSSLDP00000010797	699 (aa)	XP_023276210	-

Gene Model

Click here to download ENSSLDG00000008601's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSLDG00000008601's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.325	ENSG00000182934	SRPRA	100	66.869	Homo_sapiens
ENSSLDG00000008601	srpra	93	91.564	ENSAPOG00000017588	srpra	100	91.564	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.378	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	66.006	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000008601	srpra	93	85.561	ENSACIG00000021588	srpra	100	86.482	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	91.411	ENSAOCG00000018884	srpra	100	91.411	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000008601	srpra	99	87.660	ENSAPEG00000022286	srpra	99	87.660	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000008601	srpra	93	89.755	ENSATEG00000023578	srpra	95	97.264	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000008601	srpra	87	69.094	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	68.650	Anas_platyrhynchos
ENSSLDG00000008601	srpra	93	70.213	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	69.665	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.428	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	66.717	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000008601	srpra	93	87.404	ENSACLG00000000518	srpra	100	87.097	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000008601	srpra	93	72.965	ENSAMXG00000009975	srpra	100	72.504	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.021	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	67.071	Bos_taurus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	47.806	WBGene00009521	F38A1.8	99	47.504	Caenorhabditis_elegans
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.428	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	66.717	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	65.455	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	64.307	Canis_familiaris
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.121	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	65.964	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.428	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	66.717	Capra_hircus
ENSSLDG00000008601	srpra	72	82.659	ENSTSYG00000005187	SRPRA	90	86.984	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000008601	srpra	88	65.056	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	87.970	Cavia_aperea
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.372	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	87.970	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.428	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	66.717	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.477	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	67.021	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.226	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	65.854	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.580	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.869	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	69.697	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	69.138	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000008601	srpra	93	59.174	ENSCING00000008954	-	100	57.594	Ciona_intestinalis
ENSSLDG00000008601	srpra	93	59.299	ENSCSAVG00000005602	-	100	58.436	Ciona_savignyi
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.325	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	66.869	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.275	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	66.159	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.275	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	88.148	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000008601	srpra	93	88.379	ENSCSEG00000002374	srpra	100	88.379	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000008601	srpra	93	85.627	ENSCVAG00000019881	srpra	100	86.239	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	78.082	ENSDARG00000061124	srpra	100	77.626	Danio_rerio
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.470	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	65.414	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.683	ENSDORG00000016719	Srpr	100	66.311	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000008601	srpra	93	52.504	FBgn0010391	Gtp-bp	100	52.888	Drosophila_melanogaster
ENSSLDG00000008601	srpra	93	66.265	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	66.265	Echinops_telfairi
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.678	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	66.616	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.678	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	66.616	Equus_caballus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	62.385	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	61.890	Erinaceus_europaeus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	83.817	ENSELUG00000017643	srpra	100	84.533	Esox_lucius
ENSSLDG00000008601	srpra	75	61.959	ENSFCAG00000030894	-	99	60.829	Felis_catus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.830	ENSFCAG00000011274	-	100	66.920	Felis_catus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.278	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	66.921	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.275	ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000008601	srpra	93	88.037	ENSFHEG00000016959	srpra	100	88.190	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	81.776	ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.776	Gadus_morhua
ENSSLDG00000008601	srpra	93	69.970	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	69.605	Gallus_gallus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	88.018	ENSGAFG00000000453	srpra	100	88.633	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000008601	srpra	93	84.275	ENSGACG00000006550	srpra	100	84.275	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	69.697	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	69.219	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.325	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	66.869	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000008601	srpra	93	87.250	ENSHBUG00000000119	srpra	100	86.943	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000008601	srpra	93	66.921	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000008601	srpra	93	66.921	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000008601	srpra	93	84.251	ENSHCOG00000010749	srpra	100	84.557	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000008601	srpra	88	75.772	ENSIPUG00000000867	srpra	99	75.203	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.580	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	66.869	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.580	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	66.768	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	87.596	ENSKMAG00000002280	srpra	100	88.055	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	90.184	ENSLBEG00000009608	srpra	100	90.337	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000008601	srpra	93	69.985	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	71.171	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000008601	srpra	93	76.818	ENSLOCG00000002733	srpra	100	76.248	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.071	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	66.415	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.732	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	67.021	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.732	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	67.021	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.732	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	66.868	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.477	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	67.021	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	87.711	ENSMAMG00000000473	srpra	100	88.326	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	87.404	ENSMZEG00005013432	srpra	100	87.097	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000008601	srpra	87	69.331	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	68.994	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.275	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	66.159	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.071	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	66.768	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	66.616	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	65.854	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000008601	srpra	93	81.011	ENSMMOG00000005019	srpra	100	81.317	Mola_mola
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.073	ENSMODG00000004576	-	100	66.311	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000008601	srpra	93	91.398	ENSMALG00000011343	srpra	100	91.398	Monopterus_albus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.275	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	89.394	Mus_caroli
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.325	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	88.636	Mus_musculus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	66.768	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	88.636	Mus_pahari
ENSSLDG00000008601	srpra	93	64.731	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	64.203	Mus_spretus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.580	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	65.957	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.073	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	65.701	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	66.417	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	65.507	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000008601	srpra	93	87.865	ENSNBRG00000017311	srpra	100	87.558	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000008601	srpra	93	64.067	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.188	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000008601	srpra	87	64.848	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	65.169	Notamacropus_eugenii
ENSSLDG00000008601	srpra	93	64.134	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.429	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.223	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	66.313	Octodon_degus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	87.250	ENSONIG00000005324	srpra	100	86.943	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.732	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	66.109	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	85.123	ENSORLG00000014676	srpra	100	84.816	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000008601	srpra	93	85.123	ENSORLG00020009240	srpra	100	84.816	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000008601	srpra	93	84.663	ENSORLG00015015405	srpra	100	84.356	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000008601	srpra	93	84.485	ENSOMEG00000005872	srpra	100	84.178	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.226	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	66.616	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000008601	srpra	93	64.231	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	64.590	Ovis_aries
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.325	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	66.869	Pan_paniscus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.830	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	66.920	Panthera_pardus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.678	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	66.768	Panthera_tigris_altaica
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.325	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	66.869	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.732	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	67.021	Papio_anubis
ENSSLDG00000008601	srpra	93	76.758	ENSPKIG00000016106	srpra	100	76.606	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000008601	srpra	87	69.952	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	68.821	Pelodiscus_sinensis
ENSSLDG00000008601	srpra	93	82.722	ENSPMGG00000001393	srpra	100	84.098	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	66.768	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	66.006	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000008601	srpra	93	61.868	ENSPMAG00000009559	srpra	99	62.424	Petromyzon_marinus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.021	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	66.362	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	89.571	ENSPFOG00000003114	srpra	100	89.571	Poecilia_formosa
ENSSLDG00000008601	srpra	93	89.571	ENSPLAG00000007323	srpra	100	89.571	Poecilia_latipinna
ENSSLDG00000008601	srpra	93	89.417	ENSPMEG00000015658	srpra	100	89.417	Poecilia_mexicana
ENSSLDG00000008601	srpra	93	88.940	ENSPREG00000004937	srpra	100	88.940	Poecilia_reticulata
ENSSLDG00000008601	srpra	83	86.842	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	86.842	Pongo_abelii
ENSSLDG00000008601	srpra	57	90.698	ENSPCAG00000003801	-	63	90.698	Procavia_capensis
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.273	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	66.970	Propithecus_coquereli
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.325	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	66.109	Pteropus_vampyrus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	87.404	ENSPNYG00000012371	srpra	100	87.097	Pundamilia_nyererei
ENSSLDG00000008601	srpra	93	79.141	ENSPNAG00000013476	srpra	100	77.676	Pygocentrus_nattereri
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.123	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	66.006	Rattus_norvegicus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.477	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	67.021	Rhinopithecus_bieti
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.629	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	66.920	Rhinopithecus_roxellana
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.275	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.565	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSLDG00000008601	srpra	88	66.613	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.478	Sarcophilus_harrisii
ENSSLDG00000008601	srpra	93	73.313	ENSSFOG00015008837	srpra	100	73.201	Scleropages_formosus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	78.834	ENSSMAG00000002783	srpra	100	78.834	Scophthalmus_maximus
ENSSLDG00000008601	srpra	100	98.864	ENSSDUG00000013920	srpra	100	98.864	Seriola_dumerili
ENSSLDG00000008601	srpra	76	82.927	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	Sorex_araneus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	68.230	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	68.333	Sphenodon_punctatus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	91.284	ENSSPAG00000005103	srpra	100	91.284	Stegastes_partitus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	68.085	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	66.717	Sus_scrofa
ENSSLDG00000008601	srpra	87	67.472	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	67.042	Taeniopygia_guttata
ENSSLDG00000008601	srpra	93	85.736	ENSTRUG00000006856	srpra	100	85.890	Takifugu_rubripes
ENSSLDG00000008601	srpra	93	80.000	ENSTNIG00000010316	srpra	100	80.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.835	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	66.514	Tursiops_truncatus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.629	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	66.261	Ursus_americanus
ENSSLDG00000008601	srpra	89	61.778	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	61.778	Ursus_maritimus
ENSSLDG00000008601	srpra	65	90.698	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	90.698	Vicugna_pacos
ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.121	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	65.964	Vulpes_vulpes
ENSSLDG00000008601	srpra	93	60.896	ENSXETG00000003920	srpra	100	60.597	Xenopus_tropicalis
ENSSLDG00000008601	srpra	81	95.195	ENSXCOG00000001286	srpra	100	95.195	Xiphophorus_couchianus
ENSSLDG00000008601	srpra	93	88.037	ENSXMAG00000028401	srpra	100	88.037	Xiphophorus_maculatus