EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000012010 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-93h22.8
Alias: fc32h05|fi41c08|im:7140483|wu:fc32h05|wu:fi41c08
Full Name: peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8062 bases
Position: chrPEQF01099157.1:2731765-2739826
Accession: 111666717
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000015069	RRM_1	PF00076.22	2e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000015643	-	4043	XM_023422152	ENSSLDP00000015069	1228 (aa)	XP_023277920	UPI000C6F8842

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	99	60.929	ENSACLG00000019359	-	96	60.706	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	52	65.909	ENSAMXG00000020783	si:dkey-93h22.8	51	67.961	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	70	32.724	ENSELUG00000018785	-	84	68.354	Esox_lucius
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	86	83.544	ENSGAFG00000011120	si:dkey-93h22.8	72	40.511	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	99	61.169	ENSHBUG00000019347	-	96	60.995	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	76	81.081	ENSHCOG00000015325	-	85	81.081	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	99	60.929	ENSMZEG00005008228	-	99	60.706	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	100	64.382	ENSMALG00000005052	-	99	64.382	Monopterus_albus
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	73	75.159	ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	86	75.641	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	80	75.796	ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	87	76.282	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	89	41.924	ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	88	76.923	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	70	76.582	ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	75	76.923	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	91	82.911	ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	91	83.333	Poecilia_formosa
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	91	82.911	ENSPLAG00000001769	si:dkey-93h22.8	90	83.333	Poecilia_latipinna
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	91	82.911	ENSPMEG00000014605	si:dkey-93h22.8	91	83.333	Poecilia_mexicana
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	91	82.278	ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	91	82.692	Poecilia_reticulata
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	99	60.849	ENSPNYG00000002682	-	99	60.706	Pundamilia_nyererei
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	56	63.924	ENSPNAG00000023094	si:dkey-93h22.8	55	63.924	Pygocentrus_nattereri
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	100	96.498	ENSSDUG00000001268	si:dkey-93h22.8	100	96.498	Seriola_dumerili
ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	91	82.911	ENSXMAG00000000243	si:dkey-93h22.8	76	42.122	Xiphophorus_maculatus