EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000012391 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RAB7A
Alias: rab7|zgc:64058
Full Name: ras-related protein rab7
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8351 bases
Position: chrPEQF01099343.1:565883-574233
Accession: 111670952
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000015596	MMR_HSR1	PF01926.23	4.5e-07	1	1

Transcripts

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSSLDG00000012391	RAB7A	60	35.484	ENSSLDG00000014812	rab34b	59	35.484
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ENSSLDG00000012391	RAB7A	82	30.058	ENSSLDG00000013333	si:cabz01085950.1	84	30.058
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ENSSLDG00000012391	RAB7A	79	36.310	ENSSLDG00000019214	zgc:101559	70	36.310
ENSSLDG00000012391	RAB7A	84	36.000	ENSSLDG00000008584	rab33ba	79	36.000
ENSSLDG00000012391	RAB7A	78	35.583	ENSSLDG00000010880	rab25a	75	35.583
ENSSLDG00000012391	RAB7A	84	34.286	ENSSLDG00000023317	rab15	80	34.286
ENSSLDG00000012391	RAB7A	81	39.053	ENSSLDG00000003631	si:dkey-16l2.16	78	39.053
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ENSSLDG00000012391	RAB7A	79	41.463	ENSSLDG00000020438	rab22a	82	41.463
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ENSSLDG00000012391	RAB7A	73	33.775	ENSSLDG00000012627	hrasb	83	34.568
ENSSLDG00000012391	RAB7A	96	34.286	ENSSLDG00000009068	-	96	34.286
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ENSSLDG00000012391	RAB7A	90	32.804	ENSSLDG00000015122	rras2	92	33.000
ENSSLDG00000012391	RAB7A	87	54.144	ENSSLDG00000009351	rab9b	89	54.144
ENSSLDG00000012391	RAB7A	57	32.203	ENSSLDG00000014472	-	87	34.884

Orthologs

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ENSSLDG00000012391	RAB7A	100	99.034	ENSAPOG00000016091	-	100	99.034	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000012391	RAB7A	100	97.101	ENSAMEG00000015249	RAB7A	100	97.101	Ailuropoda_melanoleuca
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ENSSLDG00000012391	RAB7A	100	99.034	ENSACIG00000013630	RAB7A	100	99.034	Amphilophus_citrinellus
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ENSSLDG00000012391	RAB7A	100	100.000	ENSACLG00000018847	RAB7A	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
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ENSSLDG00000012391	RAB7A	100	94.686	ENSAMXG00000002254	-	100	94.686	Astyanax_mexicanus
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ENSSLDG00000012391	RAB7A	100	97.101	ENSCAFG00020004847	RAB7A	100	97.101	Canis_lupus_dingo
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ENSSLDG00000012391	RAB7A	100	96.618	ENSCGRG00000011649	Rab7	100	96.618	Cricetulus_griseus_crigri
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