EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000012677 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8240 bases
Position: chrPEQF01096605.1:81015-89254
Accession: 111650103
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000015971	SYF2	PF08231.12	4.2e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000016566	-	3474	XM_023399901	ENSSLDP00000015971	238 (aa)	XP_023255669	UPI000BBED14C

Gene Model

Click here to download ENSSLDG00000012677's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSLDG00000012677's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.333	ENSG00000117614	SYF2	90	83.028	Homo_sapiens
ENSSLDG00000012677	syf2	100	92.857	ENSAPOG00000001174	syf2	100	92.857	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000012677	syf2	92	82.110	ENSAMEG00000010115	-	90	82.110	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000012677	syf2	82	83.590	ENSAMEG00000010134	-	100	83.590	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000012677	syf2	97	90.000	ENSACIG00000023688	syf2	87	93.119	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	92.017	ENSAOCG00000022046	syf2	93	94.954	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000012677	syf2	93	91.403	ENSAOCG00000010912	syf2	69	91.403	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000012677	syf2	100	92.017	ENSAPEG00000018858	syf2	92	92.017	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000012677	syf2	91	93.548	ENSATEG00000007745	syf2	100	92.017	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000012677	syf2	84	84.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	84.000	Anas_platyrhynchos
ENSSLDG00000012677	syf2	86	82.843	ENSACAG00000013653	-	100	82.843	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000012677	syf2	70	69.461	ENSACAG00000026777	-	100	69.461	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.796	ENSANAG00000032473	SYF2	90	83.486	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.916	ENSACLG00000019916	syf2	100	89.916	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000012677	syf2	100	84.874	ENSAMXG00000004051	syf2	100	84.874	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.486	ENSBTAG00000001651	SYF2	92	83.486	Bos_taurus
ENSSLDG00000012677	syf2	87	53.810	WBGene00019402	syf-2	89	53.333	Caenorhabditis_elegans
ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.796	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	83.486	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000012677	syf2	92	76.364	ENSCAFG00000030331	-	96	76.712	Canis_familiaris
ENSSLDG00000012677	syf2	91	82.407	ENSCAFG00000012895	-	89	82.110	Canis_familiaris
ENSSLDG00000012677	syf2	91	82.407	ENSCAFG00020021091	-	89	82.110	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000012677	syf2	76	74.725	ENSCAFG00020021094	-	95	74.725	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.028	ENSCHIG00000020874	SYF2	90	83.028	Capra_hircus
ENSSLDG00000012677	syf2	99	77.917	ENSTSYG00000005114	SYF2	99	77.500	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000012677	syf2	83	83.333	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	Cavia_aperea
ENSSLDG00000012677	syf2	100	77.049	ENSCPOG00000005326	SYF2	89	83.486	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.796	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	83.486	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000012677	syf2	98	78.059	ENSCATG00000026917	SYF2	90	82.569	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000012677	syf2	100	77.049	ENSCLAG00000008474	SYF2	89	83.486	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000012677	syf2	92	82.569	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	82.569	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000012677	syf2	72	63.218	ENSCHOG00000005273	-	89	65.031	Choloepus_hoffmanni
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.945	ENSCPBG00000025073	SYF2	88	83.945	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000012677	syf2	89	56.338	ENSCING00000003017	-	89	56.808	Ciona_intestinalis
ENSSLDG00000012677	syf2	89	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSSLDG00000012677	syf2	98	68.354	ENSCANG00000037322	SYF2	88	72.018	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000012677	syf2	99	78.243	ENSCGRG00001020733	Syf2	90	83.028	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000012677	syf2	82	83.673	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.417	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000012677	syf2	92	90.411	ENSCSEG00000000117	syf2	92	90.411	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000012677	syf2	93	91.441	ENSCVAG00000019543	syf2	100	88.703	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	86.134	ENSDARG00000004706	syf2	100	86.134	Danio_rerio
ENSSLDG00000012677	syf2	98	78.903	ENSDNOG00000047605	SYF2	89	83.028	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000012677	syf2	97	80.000	ENSDORG00000001274	Syf2	89	83.486	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000012677	syf2	94	55.752	FBgn0033556	CG12343	97	55.909	Drosophila_melanogaster
ENSSLDG00000012677	syf2	94	65.471	ENSETEG00000015729	SYF2	89	68.627	Echinops_telfairi
ENSSLDG00000012677	syf2	88	57.416	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000012677	syf2	92	73.394	ENSEASG00005004232	-	90	73.394	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.945	ENSEASG00005004224	-	89	83.945	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.945	ENSECAG00000010440	-	91	83.945	Equus_caballus
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.486	ENSECAG00000012023	-	89	83.486	Equus_caballus
ENSSLDG00000012677	syf2	73	67.797	ENSEEUG00000015084	SYF2	86	72.611	Erinaceus_europaeus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	86.134	ENSELUG00000003465	syf2	99	86.134	Esox_lucius
ENSSLDG00000012677	syf2	92	82.569	ENSFCAG00000043095	-	89	82.569	Felis_catus
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.945	ENSFCAG00000010324	-	75	83.945	Felis_catus
ENSSLDG00000012677	syf2	86	80.882	ENSFALG00000000460	SYF2	89	80.275	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000012677	syf2	100	77.778	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	83.028	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000012677	syf2	95	77.434	ENSFHEG00000007238	syf2	97	77.626	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000012677	syf2	90	90.698	ENSGMOG00000019138	syf2	96	90.698	Gadus_morhua
ENSSLDG00000012677	syf2	94	81.614	ENSGALG00000013639	SYF2	87	83.486	Gallus_gallus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	87.815	ENSGAFG00000019435	syf2	100	87.815	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000012677	syf2	100	86.611	ENSGACG00000007305	syf2	100	88.285	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.945	ENSGAGG00000010670	SYF2	88	83.945	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.333	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	83.028	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.496	ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.496	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000012677	syf2	92	72.936	ENSHGLG00000004304	-	100	68.487	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000012677	syf2	100	76.639	ENSHGLG00000014393	SYF2	89	83.028	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000012677	syf2	100	76.639	ENSHGLG00100014722	SYF2	89	83.028	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.496	ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.496	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000012677	syf2	100	84.100	ENSIPUG00000019859	syf2	100	82.773	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000012677	syf2	61	78.082	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.082	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000012677	syf2	84	83.920	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.920	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.916	ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.496	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000012677	syf2	91	94.931	ENSLBEG00000014425	syf2	100	92.857	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000012677	syf2	97	78.448	ENSLACG00000012064	SYF2	92	82.569	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000012677	syf2	100	83.613	ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.613	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000012677	syf2	97	79.237	ENSLAFG00000023150	-	89	83.486	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000012677	syf2	77	53.804	ENSLAFG00000030814	-	100	53.804	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000012677	syf2	98	78.059	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	82.569	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000012677	syf2	91	82.870	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	82.569	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000012677	syf2	98	78.059	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	82.569	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000012677	syf2	98	78.059	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	82.569	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	91.597	ENSMAMG00000010403	syf2	98	91.597	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.916	ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.916	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000012677	syf2	84	83.920	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	83.920	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000012677	syf2	100	78.279	ENSMAUG00000018974	Syf2	90	84.404	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000012677	syf2	84	83.920	ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.920	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000012677	syf2	99	79.079	ENSMOCG00000022938	Syf2	90	83.945	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000012677	syf2	95	90.749	ENSMMOG00000002396	syf2	91	92.661	Mola_mola
ENSSLDG00000012677	syf2	92	78.636	ENSMODG00000013951	-	96	78.636	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.212	ENSMALG00000010706	syf2	100	88.797	Monopterus_albus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	78.099	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	90	84.404	Mus_caroli
ENSSLDG00000012677	syf2	100	78.099	ENSMUSG00000028821	Syf2	90	84.404	Mus_musculus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	78.099	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	90	84.404	Mus_pahari
ENSSLDG00000012677	syf2	100	78.099	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	90	84.404	Mus_spretus
ENSSLDG00000012677	syf2	91	82.407	ENSMPUG00000015802	-	89	82.110	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.028	ENSMPUG00000015801	-	89	83.028	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000012677	syf2	99	77.500	ENSMLUG00000001885	SYF2	89	82.110	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	76.016	ENSNGAG00000007912	Syf2	89	83.028	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000012677	syf2	100	80.579	ENSNBRG00000010720	syf2	99	80.579	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.333	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	83.028	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000012677	syf2	100	76.132	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	75.720	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000012677	syf2	92	82.110	ENSODEG00000017664	-	92	82.110	Octodon_degus
ENSSLDG00000012677	syf2	99	68.465	ENSODEG00000014338	-	90	73.394	Octodon_degus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	90.336	ENSONIG00000008213	syf2	100	90.336	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000012677	syf2	85	82.673	ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.673	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.796	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	77.049	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000012677	syf2	98	89.270	ENSORLG00000028820	syf2	94	93.119	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000012677	syf2	100	87.815	ENSORLG00020018333	syf2	92	93.119	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000012677	syf2	100	87.815	ENSORLG00015014665	syf2	92	93.119	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000012677	syf2	100	90.336	ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000012677	syf2	98	81.116	ENSOGAG00000009962	SYF2	89	83.945	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000012677	syf2	82	56.923	ENSOARG00000006269	-	100	56.923	Ovis_aries
ENSSLDG00000012677	syf2	92	82.273	ENSOARG00000006348	-	89	82.273	Ovis_aries
ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.333	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	83.028	Pan_paniscus
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.945	ENSPPRG00000001638	-	89	83.945	Panthera_pardus
ENSSLDG00000012677	syf2	92	82.569	ENSPPRG00000001651	-	89	82.569	Panthera_pardus
ENSSLDG00000012677	syf2	91	84.259	ENSPTIG00000005711	-	80	84.018	Panthera_tigris_altaica
ENSSLDG00000012677	syf2	97	78.970	ENSPTIG00000007036	-	89	82.569	Panthera_tigris_altaica
ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.333	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	83.028	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000012677	syf2	98	78.059	ENSPANG00000008139	SYF2	90	82.569	Papio_anubis
ENSSLDG00000012677	syf2	100	83.613	ENSPKIG00000008130	syf2	93	88.128	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000012677	syf2	99	78.481	ENSPSIG00000011816	SYF2	85	82.569	Pelodiscus_sinensis
ENSSLDG00000012677	syf2	98	89.270	ENSPMGG00000008755	syf2	85	94.037	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	77.459	ENSPEMG00000008283	Syf2	90	83.486	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.028	ENSPCIG00000014235	SYF2	87	83.028	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000012677	syf2	97	89.565	ENSPFOG00000004116	syf2	90	91.743	Poecilia_formosa
ENSSLDG00000012677	syf2	98	88.412	ENSPLAG00000006691	syf2	94	91.284	Poecilia_latipinna
ENSSLDG00000012677	syf2	100	85.294	ENSPMEG00000011684	syf2	100	85.294	Poecilia_mexicana
ENSSLDG00000012677	syf2	100	88.235	ENSPREG00000003009	syf2	100	88.235	Poecilia_reticulata
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.028	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	83.028	Pongo_abelii
ENSSLDG00000012677	syf2	92	56.422	ENSPCOG00000027011	SYF2	85	56.422	Propithecus_coquereli
ENSSLDG00000012677	syf2	91	73.272	ENSPVAG00000005841	SYF2	89	73.272	Pteropus_vampyrus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.916	ENSPNYG00000004979	syf2	100	89.916	Pundamilia_nyererei
ENSSLDG00000012677	syf2	100	85.294	ENSPNAG00000015570	syf2	100	85.294	Pygocentrus_nattereri
ENSSLDG00000012677	syf2	100	78.099	ENSRNOG00000060597	Syf2	90	84.404	Rattus_norvegicus
ENSSLDG00000012677	syf2	98	75.949	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	80.275	Rhinopithecus_bieti
ENSSLDG00000012677	syf2	98	78.059	ENSRROG00000001347	SYF2	90	82.569	Rhinopithecus_roxellana
ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.333	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	83.028	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSLDG00000012677	syf2	92	81.651	ENSSHAG00000015630	-	88	81.651	Sarcophilus_harrisii
ENSSLDG00000012677	syf2	86	82.524	ENSSHAG00000007152	-	100	82.524	Sarcophilus_harrisii
ENSSLDG00000012677	syf2	100	83.613	ENSSFOG00015023647	syf2	92	88.584	Scleropages_formosus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.916	ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.916	Scophthalmus_maximus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	100.000	ENSSDUG00000013072	syf2	100	100.000	Seriola_dumerili
ENSSLDG00000012677	syf2	98	60.924	ENSSARG00000012889	SYF2	89	63.761	Sorex_araneus
ENSSLDG00000012677	syf2	98	79.747	ENSSPUG00000005251	SYF2	86	83.945	Sphenodon_punctatus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	93.697	ENSSPAG00000009626	syf2	100	93.697	Stegastes_partitus
ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.028	ENSSSCG00000037481	SYF2	89	83.028	Sus_scrofa
ENSSLDG00000012677	syf2	63	54.305	ENSTGUG00000001126	SYF2	81	55.758	Taeniopygia_guttata
ENSSLDG00000012677	syf2	100	85.417	ENSTRUG00000001499	syf2	88	90.367	Takifugu_rubripes
ENSSLDG00000012677	syf2	94	88.341	ENSTNIG00000016912	syf2	98	89.498	Tetraodon_nigroviridis
ENSSLDG00000012677	syf2	100	56.379	ENSTBEG00000017370	SYF2	87	60.550	Tupaia_belangeri
ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.333	ENSTTRG00000003550	SYF2	89	83.028	Tursiops_truncatus
ENSSLDG00000012677	syf2	100	75.934	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	82.110	Ursus_americanus
ENSSLDG00000012677	syf2	91	81.944	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.651	Ursus_maritimus
ENSSLDG00000012677	syf2	92	82.569	ENSVPAG00000005705	SYF2	89	82.569	Vicugna_pacos
ENSSLDG00000012677	syf2	86	82.927	ENSVVUG00000027181	-	88	82.110	Vulpes_vulpes
ENSSLDG00000012677	syf2	91	82.407	ENSVVUG00000027175	-	89	82.110	Vulpes_vulpes
ENSSLDG00000012677	syf2	94	79.372	ENSXETG00000022797	syf2	88	80.734	Xenopus_tropicalis
ENSSLDG00000012677	syf2	100	87.815	ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.815	Xiphophorus_maculatus