EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000013952 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: aco1
Alias: IRP1|wu:fo75b03
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16982 bases
Position: chrPEQF01099173.1:1729461-1746442
Accession: 111667953
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000017708	Aconitase	PF00330.20	7.5e-181	1	1
ENSSLDP00000017708	Aconitase_C	PF00694.19	3.6e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000018318	-	2862	XM_023423822	ENSSLDP00000017708	894 (aa)	XP_023279590	UPI000C6FA8BC

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSLDG00000013952	aco1	99	60.425	ENSSLDG00000001705	ireb2	91	60.425

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.883	ENSG00000122729	ACO1	99	82.883	Homo_sapiens
ENSSLDG00000013952	aco1	100	90.268	ENSAPOG00000008670	aco1	100	90.268	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.677	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	82.677	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000013952	aco1	100	91.387	ENSACIG00000014377	aco1	100	91.387	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000013952	aco1	100	91.611	ENSAOCG00000007699	aco1	100	91.611	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000013952	aco1	100	91.499	ENSAPEG00000014370	aco1	100	91.499	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000013952	aco1	100	93.848	ENSATEG00000000560	aco1	100	93.848	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.089	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	83.089	Anas_platyrhynchos
ENSSLDG00000013952	aco1	96	81.490	ENSACAG00000001541	ACO1	99	81.490	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000013952	aco1	99	81.736	ENSANAG00000003359	ACO1	99	81.736	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000013952	aco1	100	91.275	ENSACLG00000007755	aco1	100	91.275	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000013952	aco1	99	87.402	ENSAMXG00000002499	aco1	99	87.402	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.545	ENSBTAG00000000555	ACO1	99	82.545	Bos_taurus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.095	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	82.095	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	81.910	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	81.910	Canis_familiaris
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.095	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	82.095	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.658	ENSCHIG00000007667	ACO1	99	82.658	Capra_hircus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.658	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	82.658	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000013952	aco1	99	67.193	ENSCAPG00000007254	ACO1	99	67.080	Cavia_aperea
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.751	ENSCPOG00000003768	ACO1	99	82.751	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	81.982	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	81.982	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.770	ENSCATG00000045333	ACO1	99	82.770	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000013952	aco1	99	81.962	ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.962	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.432	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	82.432	Chlorocebus_sabaeus
ENSSLDG00000013952	aco1	90	66.218	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	66.066	Choloepus_hoffmanni
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.751	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	82.751	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.432	ENSCANG00000014847	ACO1	99	82.432	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.427	ENSCGRG00001024337	Aco1	99	83.427	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.638	ENSCGRG00000004877	-	99	82.638	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000013952	aco1	100	87.472	ENSCSEG00000018262	aco1	100	87.472	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000013952	aco1	100	82.998	ENSCVAG00000020264	aco1	100	82.998	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	86.712	ENSDARG00000026376	aco1	99	86.712	Danio_rerio
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.883	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	82.883	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.427	ENSDORG00000014246	Aco1	99	83.427	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000013952	aco1	85	64.021	ENSETEG00000012415	-	85	64.021	Echinops_telfairi
ENSSLDG00000013952	aco1	99	58.307	ENSEBUG00000015441	aco1	97	58.519	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.770	ENSEASG00005004602	ACO1	99	82.770	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.658	ENSECAG00000014846	ACO1	99	82.658	Equus_caballus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	71.622	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	71.622	Erinaceus_europaeus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	86.502	ENSELUG00000016812	aco1	97	86.502	Esox_lucius
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.545	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	82.545	Felis_catus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.427	ENSFALG00000001167	ACO1	99	83.427	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.751	ENSFDAG00000016058	ACO1	99	82.751	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000013952	aco1	100	89.262	ENSFHEG00000005619	aco1	100	89.262	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	84.753	ENSGMOG00000005514	aco1	99	84.753	Gadus_morhua
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.202	ENSGALG00000002162	ACO1	99	83.202	Gallus_gallus
ENSSLDG00000013952	aco1	100	91.051	ENSGACG00000001637	aco1	100	91.051	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.638	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.638	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.770	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	82.770	Gorilla_gorilla
ENSSLDG00000013952	aco1	100	91.051	ENSHBUG00000008952	aco1	100	91.051	Haplochromis_burtoni
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.864	ENSHGLG00000018922	Aco1	99	82.864	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.864	ENSHGLG00100000149	Aco1	99	82.864	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000013952	aco1	100	86.577	ENSHCOG00000015881	aco1	100	86.577	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000013952	aco1	99	86.599	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	86.599	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.860	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	83.860	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.864	ENSJJAG00000013824	Aco1	99	82.864	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000013952	aco1	100	91.275	ENSKMAG00000015759	aco1	100	91.275	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000013952	aco1	100	87.263	ENSLBEG00000013866	aco1	100	87.263	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000013952	aco1	75	70.623	ENSLACG00000000936	ACO1	99	70.597	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000013952	aco1	99	84.459	ENSLOCG00000011082	aco1	99	84.459	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	80.743	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	80.743	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.658	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	82.658	Macaca_fascicularis
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.770	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	82.770	Macaca_mulatta
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.545	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	82.545	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.658	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	82.658	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000013952	aco1	100	93.400	ENSMAMG00000002915	aco1	100	93.400	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	87.625	ENSMZEG00005012733	aco1	100	87.291	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000013952	aco1	99	67.481	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	67.481	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.089	ENSMAUG00000021408	Aco1	99	83.089	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.658	ENSMICG00000006540	ACO1	99	82.658	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.315	ENSMOCG00000015393	Aco1	99	83.315	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000013952	aco1	99	91.695	ENSMMOG00000020282	aco1	99	91.695	Mola_mola
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.995	ENSMODG00000004463	ACO1	99	82.995	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000013952	aco1	100	92.170	ENSMALG00000019764	aco1	100	92.170	Monopterus_albus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.766	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	99	83.766	Mus_caroli
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.653	ENSMUSG00000028405	Aco1	99	83.653	Mus_musculus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.427	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	83.427	Mus_pahari
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.766	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	83.766	Mus_spretus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.883	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	82.883	Mustela_putorius_furo
ENSSLDG00000013952	aco1	99	81.081	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	81.081	Myotis_lucifugus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.976	ENSNGAG00000005703	Aco1	99	82.976	Nannospalax_galili
ENSSLDG00000013952	aco1	100	72.525	ENSNBRG00000008973	aco1	100	72.303	Neolamprologus_brichardi
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.432	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	82.432	Nomascus_leucogenys
ENSSLDG00000013952	aco1	89	76.659	ENSMEUG00000014756	ACO1	89	76.659	Notamacropus_eugenii
ENSSLDG00000013952	aco1	99	79.279	ENSOPRG00000016791	ACO1	99	79.279	Ochotona_princeps
ENSSLDG00000013952	aco1	99	80.158	ENSODEG00000001240	-	99	80.158	Octodon_degus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	77.339	ENSODEG00000015432	-	99	76.888	Octodon_degus
ENSSLDG00000013952	aco1	100	91.275	ENSONIG00000019869	aco1	100	91.275	Oreochromis_niloticus
ENSSLDG00000013952	aco1	81	83.956	ENSOANG00000012132	ACO1	100	83.956	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.294	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	82.071	Oryctolagus_cuniculus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	90.090	ENSORLG00000020656	aco1	99	90.090	Oryzias_latipes
ENSSLDG00000013952	aco1	99	89.752	ENSORLG00020010991	aco1	99	89.752	Oryzias_latipes_hni
ENSSLDG00000013952	aco1	100	89.374	ENSORLG00015011785	aco1	100	89.374	Oryzias_latipes_hsok
ENSSLDG00000013952	aco1	99	89.113	ENSOMEG00000000660	aco1	99	89.113	Oryzias_melastigma
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.883	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	82.883	Otolemur_garnettii
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.399	ENSOARG00000014707	ACO1	99	82.399	Ovis_aries
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.883	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	82.883	Pan_paniscus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.432	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	82.432	Panthera_pardus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.063	ENSPTIG00000016606	ACO1	99	82.063	Panthera_tigris_altaica
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.883	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	82.883	Pan_troglodytes
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.658	ENSPANG00000025270	ACO1	99	82.658	Papio_anubis
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.315	ENSPKIG00000023168	aco1	99	83.315	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.751	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	82.751	Pelodiscus_sinensis
ENSSLDG00000013952	aco1	100	90.157	ENSPMGG00000020708	aco1	100	90.157	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.540	ENSPEMG00000018464	Aco1	99	83.540	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSLDG00000013952	aco1	99	81.377	ENSPCIG00000029321	ACO1	99	82.641	Phascolarctos_cinereus
ENSSLDG00000013952	aco1	99	89.651	ENSPFOG00000013405	aco1	99	89.651	Poecilia_formosa
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ENSSLDG00000013952	aco1	99	90.101	ENSPREG00000021791	aco1	99	90.101	Poecilia_reticulata
ENSSLDG00000013952	aco1	99	82.320	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	82.320	Pongo_abelii
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