EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSLDG00000014803 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: prpf38a
Alias: fa04h11|fc83e08|wu:fa04h11|wu:fc83e08|zgc:92059
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_lalandi_dorsalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7826 bases
Position: chrPEQF01099363.1:2804044-2811869
Accession: 111671595
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSLDP00000018830	PRP38	PF03371.15	4.1e-63	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSLDT00000019469	-	3845	XM_023428722	ENSSLDP00000018830	309 (aa)	XP_023284490	UPI000BBE68E6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSG00000134748	PRPF38A	71	89.140	Homo_sapiens
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	98.058	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	98.058	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	71	89.140	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	93.204	ENSACIG00000012292	prpf38a	100	93.204	Amphilophus_citrinellus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	98.058	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	98.058	Amphiprion_ocellaris
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	98.058	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	98.058	Amphiprion_percula
ENSSLDG00000014803	prpf38a	72	94.570	ENSATEG00000004608	prpf38a	72	94.570	Anabas_testudineus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	79	77.823	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	85.256	Anas_platyrhynchos
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	81.789	ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	88.688	Anolis_carolinensis
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSANAG00000027839	PRPF38A	71	89.140	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	60.317	ENSANAG00000029204	-	70	56.444	Aotus_nancymaae
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	96.440	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	96.440	Astatotilapia_calliptera
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	94.569	ENSAMXG00000029274	prpf38a	100	94.569	Astyanax_mexicanus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	75	89.140	Bos_taurus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	63	63.590	WBGene00008380	prp-38	68	60.274	Caenorhabditis_elegans
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	74	89.140	Callithrix_jacchus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	71	89.140	Canis_familiaris
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	71	89.140	Canis_lupus_dingo
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	71	89.140	Capra_hircus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSTSYG00000009868	-	71	89.140	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000014803	prpf38a	86	78.519	ENSTSYG00000031994	-	63	85.955	Carlito_syrichta
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	83.601	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	71	89.140	Cavia_porcellus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	75	88.312	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	71	89.140	Cebus_capucinus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	93	53.287	ENSCATG00000044190	-	57	55.851	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSCATG00000032296	PRPF38A	71	89.140	Cercocebus_atys
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	71	89.140	Chinchilla_lanigera
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	81.789	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	71	88.688	Chrysemys_picta_bellii
ENSSLDG00000014803	prpf38a	75	68.831	ENSCSAVG00000009580	-	71	70.968	Ciona_savignyi
ENSSLDG00000014803	prpf38a	75	88.312	ENSCANG00000032608	PRPF38A	74	89.140	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	84	71.648	ENSCGRG00001002557	-	74	75.113	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSCGRG00001018502	-	71	89.140	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	71	89.140	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSLDG00000014803	prpf38a	72	93.665	ENSCSEG00000001269	prpf38a	76	93.665	Cynoglossus_semilaevis
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	97.411	ENSCVAG00000012305	prpf38a	100	97.411	Cyprinodon_variegatus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	85.304	ENSDARG00000039213	prpf38a	71	95.023	Danio_rerio
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	72	89.140	Dasypus_novemcinctus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	84	76.046	ENSDORG00000025371	-	75	81.651	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000014803	prpf38a	84	76.046	ENSDORG00000023691	-	75	81.651	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000014803	prpf38a	85	97.917	ENSDORG00000023857	-	64	97.917	Dipodomys_ordii
ENSSLDG00000014803	prpf38a	77	81.590	ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	81.166	Eptatretus_burgeri
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSEASG00005014427	PRPF38A	71	89.140	Equus_asinus_asinus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSECAG00000022628	PRPF38A	71	89.140	Equus_caballus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	96.764	ENSELUG00000021094	prpf38a	100	96.764	Esox_lucius
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	71	89.140	Felis_catus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	99	75.806	ENSFALG00000003612	-	73	83.486	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000014803	prpf38a	87	79.044	ENSFALG00000005598	-	66	86.111	Ficedula_albicollis
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	83.280	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	72	89.140	Fukomys_damarensis
ENSSLDG00000014803	prpf38a	95	96.271	ENSFHEG00000014317	prpf38a	100	96.271	Fundulus_heteroclitus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	54	98.795	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	98.795	Gadus_morhua
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	81.789	ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	88.688	Gallus_gallus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	96.440	ENSGAFG00000012422	prpf38a	100	96.440	Gambusia_affinis
ENSSLDG00000014803	prpf38a	54	94.706	ENSGACG00000000182	-	100	94.706	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	72	94.619	ENSGACG00000005423	prpf38a	100	95.498	Gasterosteus_aculeatus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	81.789	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	71	88.688	Gopherus_agassizii
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSGGOG00000003940	PRPF38A	71	89.140	Gorilla_gorilla
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ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	71	89.140	Heterocephalus_glaber_female
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	71	89.140	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	74.598	ENSHGLG00100003928	-	71	76.923	Heterocephalus_glaber_male
ENSSLDG00000014803	prpf38a	59	93.956	ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	94.149	Hippocampus_comes
ENSSLDG00000014803	prpf38a	90	80.702	ENSIPUG00000005757	prpf38a	71	94.144	Ictalurus_punctatus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	71	89.140	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	81.470	ENSJJAG00000015811	Prpf38a	71	88.235	Jaculus_jaculus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	97.087	ENSKMAG00000006588	prpf38a	100	97.087	Kryptolebias_marmoratus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	96.764	ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	96.764	Labrus_bergylta
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	81.470	ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	87.330	Latimeria_chalumnae
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	92.903	ENSLOCG00000006262	prpf38a	72	90.991	Lepisosteus_oculatus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSLAFG00000025862	PRPF38A	71	89.140	Loxodonta_africana
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSMFAG00000039449	PRPF38A	74	89.140	Macaca_fascicularis
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ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSMNEG00000031221	PRPF38A	71	89.140	Macaca_nemestrina
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	71	89.140	Mandrillus_leucophaeus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	98.058	ENSMAMG00000015431	prpf38a	100	98.058	Mastacembelus_armatus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	96.440	ENSMZEG00005017838	prpf38a	100	96.440	Maylandia_zebra
ENSSLDG00000014803	prpf38a	75	87.879	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	74	88.688	Meleagris_gallopavo
ENSSLDG00000014803	prpf38a	85	83.333	ENSMAUG00000018029	-	84	84.615	Mesocricetus_auratus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSMICG00000014193	PRPF38A	71	89.140	Microcebus_murinus
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	82.109	ENSMOCG00000013080	Prpf38a	71	89.140	Microtus_ochrogaster
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	94.534	ENSMMOG00000016972	prpf38a	100	94.534	Mola_mola
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	79.936	ENSMODG00000000644	PRPF38A	71	86.036	Monodelphis_domestica
ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	98.382	ENSMALG00000019363	prpf38a	97	98.382	Monopterus_albus
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ENSSLDG00000014803	prpf38a	100	79.233	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	71	85.068	Notamacropus_eugenii
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